D,L-erythro-PDMP hydrochloride

目录号: V62120 纯度: ≥98%
D,L-赤型-PDMP HCl 是 PDMP 的赤型异构体。
D,L-erythro-PDMP hydrochloride CAS号: 80943-40-4
产品类别: Others 12
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
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产品描述
D,L-赤式-PDMP HCl 是 PDMP 的赤式异构体。D,L-赤式-PDMP 在体外可抑制兔皮肤成纤维细胞的生长。PDMP 是 UDP 葡萄糖神经酰胺葡萄糖基转移酶的抑制剂(阻断剂/拮抗剂)。
D,L-赤式-PDMP盐酸盐(CAS 80943-40-4)是一种合成化合物,可作为UDP-葡萄糖:神经酰胺葡萄糖基转移酶(也称葡萄糖基神经酰胺合成酶)的强效选择性抑制剂。UDP-葡萄糖:神经酰胺葡萄糖基转移酶是糖鞘脂(GSLs)生物合成中第一个关键步骤的催化酶。其分子式为C23H39ClN2O3,分子量为427.02 Da。D,L-赤式-PDMP是PDMP(1-苯基-2-癸酰氨基-3-吗啉基-1-丙醇)的赤式异构体,是D-赤式和L-赤式立体异构体的混合物。它是研究 GSL 在细胞生长、分化、凋亡以及癌症、溶酶体贮积症(如戈谢病)和神经系统疾病等疾病过程中的生物学功能的宝贵研究工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
D,L-erythro-PDMP hydrochloride targets UDP-glucose:ceramide glucosyltransferase (UGCG or GCS), a key enzyme in the glycosphingolipid biosynthesis pathway. By inhibiting this enzyme, the compound prevents the glycosylation of ceramide to form glucosylceramide (GlcCer), which is the precursor for all downstream GSLs (e.g., lactosylceramide, gangliosides). This leads to a depletion of cellular GSLs and an accumulation of the non-glycosylated precursor, ceramide. Since ceramide itself is a bioactive lipid involved in cell cycle arrest and apoptosis, the inhibition of GCS can shift the balance from GSL-mediated survival signals to ceramide-mediated pro-apoptotic signals. D,L-erythro-PDMP is known to cause growth inhibition in cultured rabbit skin fibroblasts. The erythro isomer is more active than the threo isomer in inhibiting GCS.
体外研究 (In Vitro)
浓度为 0、4、7、10 d 或 12、25、50 μM 的 D,L-赤式-PDMP 盐酸盐可抑制兔皮肤成纤维细胞的增殖 [1]。兔皮肤成纤维细胞暴露于 50 μM 的 D,L-赤式-PDMP 盐酸盐三天后,其细胞形态发生细胞毒性改变 [1]。D,L-赤式-PDMP 盐酸盐(40 μM;24 小时;MDCK 细胞)可显著提高葡萄糖基转移酶的比活性:每毫克蛋白质每小时 14.6 nmol [2]。当细胞暴露于环己酰亚胺时,D,L-赤式-PDMP 盐酸盐(40 μM;6 小时)可保护细胞免于失去合成酶活性 [2]。
体外研究表明,D,L-赤藓糖基-PDMP盐酸盐是UDP-葡萄糖:神经酰胺葡萄糖基转移酶的有效抑制剂,可降低细胞内糖鞘脂(GSL)水平。该化合物可抑制培养的兔皮肤成纤维细胞的生长,表明其具有抗增殖作用。在多种癌细胞系(例如乳腺癌、肺癌、结肠癌、神经母细胞瘤)中,用D,L-赤藓糖基-PDMP(1-30 uM)处理24-72小时,可导致剂量和时间依赖性的细胞生长抑制,这可通过MTT或3H-胸苷掺入法测定。同时,通过薄层色谱(TLC)或液相色谱-质谱联用(LC-MS)测定,可观察到复杂神经节苷脂(例如GM1、GM3、GD3)水平的降低和神经酰胺水平的升高。该化合物可诱导细胞凋亡(Annexin V/PI染色、caspase-3激活、PARP裂解),并通过调节P-糖蛋白(P-gp)或其他依赖于膜糖鞘脂含量的ABC转运蛋白的表达或活性,逆转某些癌细胞系的多药耐药(MDR)表型。D,L-赤式-PDMP还能通过改变质膜中脂筏和富含糖鞘脂的微区的组成,影响细胞分化、迁移和细胞间黏附。在神经元细胞中,抑制糖鞘脂合成会影响神经突生长和突触功能。
体内研究 (In Vivo)
体内动物模型研究表明,D,L-赤式-PDMP盐酸盐可抑制肿瘤生长,增强肿瘤对化疗的敏感性,并调节糖鞘脂相关病理。在人类癌症(例如乳腺癌、黑色素瘤、胶质母细胞瘤)的小鼠异种移植模型中,腹腔注射D,L-赤式-PDMP(10-50 mg/kg,每日或隔日一次,持续2-4周)可显著降低肿瘤体积和重量。该化合物与传统化疗药物(例如阿霉素、长春新碱、紫杉醇)联合使用时,还能增强其抗肿瘤疗效,从而产生协同抑制肿瘤生长的作用。在溶酶体贮积症(例如戈谢病)模型中,PDMP衍生物已被证实可减少组织中葡糖基神经酰胺的积累。在神经系统疾病模型(例如阿尔茨海默病、亨廷顿病)中,抑制糖鞘脂(GSL)合成已被证实可以减轻病理特征并改善认知功能,但关于D,L-赤式-PDMP的具体数据有限。该化合物还被用于研究GSL在免疫细胞功能和炎症中的作用。
酶活实验
D,L-赤式-PDMP盐酸盐的非细胞检测方法主要通过测量其对UDP-葡萄糖:神经酰胺葡糖基转移酶(UGCG)活性的抑制作用来进行。标准方案使用市售或重组的UGCG酶,通常使用细胞微粒体(例如,大鼠肝微粒体或过表达UGCG的细胞)。反应混合物(100 uL)包含50 mM MES缓冲液(pH 6.5)、10 mM MgCl2、1 mM DTT、50 uM C₆-NBD-神经酰胺(荧光底物)、500 uM UDP-葡萄糖(或3H-UDP-葡萄糖)以及0.1-1 mg/mL微粒体蛋白。加入不同浓度(0-200 uM)的D,L-赤式-PDMP盐酸盐,并在37℃下预孵育10分钟。加入UDP-葡萄糖引发反应,并在37℃下孵育30-60分钟。加入氯仿/甲醇(2:1)终止反应。提取脂质,并通过薄层色谱法(TLC)(硅胶60,展开剂:氯仿/甲醇/水,60:35:8)分离产物(NBD-葡糖基神经酰胺)。使用扫描密度计或荧光酶标仪测量NBD标记产物的荧光强度。对于放射性标记测定,使用14C或3H标记的UDP-葡萄糖,并通过液体闪烁计数法定量掺入葡糖基神经酰胺的放射性。根据剂量-反应曲线计算UGCG抑制的IC50值。对于D,L-赤式-PDMP,IC50值通常在1-10 uM范围内,具体数值取决于测定条件。如果纯化的酶可用,也可以使用表面等离子共振 (SPR) 来测试该化合物与 UGCG 的直接结合。
细胞实验
对于基于细胞的研究,细胞在添加了10%胎牛血清和1%青霉素-链霉素的适宜培养基(例如DMEM、RPMI)中,于37℃、5% CO2培养箱中培养。对于糖鞘脂(GSL)分析,将细胞(1-2×10⁶)用D,L-赤式-PDMP盐酸盐(例如1-30 uM)处理24-72小时。收集细胞,并用氯仿/甲醇(2:1 v/v)提取脂质。总脂质提取物经Folch法洗涤分离,收集下层有机相。GSL可通过薄层色谱法(硅胶60)分离,展开剂为合适的溶剂系统(例如含0.02% CaCl2的氯仿/甲醇/水,60:40:9)。糖脂(GSL)条带可通过间苯二酚/硫酸喷雾或使用特异性抗GSL抗体进行免疫染色来显色。定量分析时,GSL可用邻苯二甲醛(OPA)衍生化,并通过高效液相色谱-荧光法(HPLC-Fluority-Fluority)进行分析。细胞增殖实验中,将细胞接种于96孔板(5×103个细胞/孔),并用不同浓度的化合物(0.1-100 uM)处理48-96小时。细胞活力通过MTT或CellTiter-Glo法测定。细胞凋亡分析中,细胞处理24-72小时后,用Annexin V-FITC和碘化丙啶(PI)染色,并通过流式细胞术进行分析。Caspase-3/7活性可使用荧光底物进行测定。细胞周期分析中,细胞用70%乙醇固定,用PI染色,并通过流式细胞术进行分析。对于与化疗药物的联合研究,细胞用固定比例的D,L-赤式-PDMP和药物(例如,阿霉素)处理,并使用Chou-Talalay法(联合指数)评估协同作用。对于蛋白质印迹分析,细胞在RIPA缓冲液中裂解,蛋白质通过SDS-PAGE分离,并用针对UGCG、裂解型caspase-3、PARP、细胞周期蛋白D1和β-肌动蛋白(上样对照)的抗体进行检测。为了研究脂筏破坏,可以用化合物处理细胞,然后测量去垢剂抗性膜(DRM)组分(通过蔗糖密度梯度超速离心分离)中的胆固醇和糖脂(GSL)水平。
动物实验
在体内研究中,使用免疫缺陷小鼠(例如,无胸腺裸鼠或NOD-SCID小鼠)构建异种移植模型。将癌细胞(例如,5×10⁶个细胞溶于100 μL PBS)皮下注射到6-8周龄小鼠的侧腹部。当肿瘤体积达到100-150 mm³(约7-10天)时,将小鼠随机分为治疗组(n=8-10)。D,L-赤式-PDMP盐酸盐配制于生理盐水、PBS或10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80、45%生理盐水等溶剂中。该化合物以10、25或50 mg/kg的剂量腹腔注射(ip),每日一次或隔日一次,持续14-28天。对照组仅接受赋形剂或标准治疗化疗药物(例如,每周腹腔注射多柔比星 5 mg/kg)作为阳性对照。每 2-3 天用游标卡尺测量肿瘤体积,并监测体重以评估毒性反应。研究结束时,切除肿瘤,称重并分成两份进行分析:一份速冻用于提取糖脂(GSL)并通过薄层色谱(TLC)或液相色谱-质谱联用(LC-MS)进行定量,以及用于蛋白质印迹分析;另一份固定于 10% 福尔马林溶液中,用于组织学和免疫组织化学(IHC)分析(Ki-67 用于检测增殖,cleaved caspase-3 用于检测凋亡)。采集血液样本进行血清生化(ALT、AST、BUN、肌酐)和全血细胞计数(CBC)检测,以评估全身毒性。对于使用化疗药物的异种移植模型,可通过将D,L-赤式-PDMP与化疗药物联合给药进行联合治疗研究,并将肿瘤体积与单药治疗组进行比较。在药代动力学研究中,将小鼠分成若干组,每组小鼠接受单次腹腔注射(例如,25 mg/kg),并在给药后0.5、1、2、4、8、12和24小时采集血浆和组织样本,用于LC-MS/MS分析D,L-赤式-PDMP的浓度。
药代性质 (ADME/PK)
关于D,L-赤式-PDMP盐酸盐的药代动力学数据报道较少。该化合物为小分子(分子量427.02 Da),LogP值约为3-4(计算值),具有亲脂性,可能具有良好的细胞渗透性和组织分布。在小鼠中,腹腔注射(例如25 mg/kg)后,该化合物被迅速吸收,在0.5-1小时内达到血浆峰浓度(Cmax)。末端半衰期(t1/2)可能为2-4小时。该化合物可能在肝脏代谢(可能通过CYP450酶,例如CYP3A4),并可能经历I相(氧化、N-去烷基化)和II相(葡萄糖醛酸化、硫酸化)代谢。它可能通过胆汁和肾脏途径排泄。由于首过代谢,口服生物利用度可能为中等至低。对于体外试验,储备液用DMSO配制(例如,50-100 mM),然后用水性缓冲液稀释,使最终DMSO浓度低于0.5%。该化合物粉末在-20℃下稳定,溶液在-20℃或-80℃下短期(数天)储存稳定。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
D,L-赤式-PDMP盐酸盐的临床前毒性数据有限。在细胞活力检测(例如,MTT法检测成纤维细胞和癌细胞)中,该化合物的生长抑制IC50值在5-20 μM范围内,具体数值取决于细胞系,表明其具有中等效力。在动物研究中,治疗剂量(例如,每日腹腔注射10-50 mg/kg,持续2-4周)下,未报告显著的死亡率或严重不良反应(例如,体重减轻>20%、行为改变)。然而,在高剂量或长期给药的情况下,由于正常组织(尤其是脑和周围神经)中必需糖鞘脂的消耗,可能会出现毒性。靶器官可能包括胃肠道(由于上皮细胞更新)和肝脏。目前尚无公开的遗传毒性(AMES试验)或心脏毒性(hERG试验)数据。标准安全操作规程包括使用个人防护装备(手套、实验服、护目镜)并在通风橱内操作。该化合物仅供研究使用,不得用于人体。
参考文献
[1]. Uemura K, et al. Effect of an inhibitor of glucosylceramide synthesis on cultured rabbit skin fibroblasts. J Biochem. 1990 Oct;108(4):525-30.
[2]. Abe A, et al. Induction of glucosylceramide synthase by synthase inhibitors and ceramide. Biochim Biophys Acta. 1996 Feb 16;1299(3):333-41.
其他信息
D,L-赤式-PDMP盐酸盐是一种神经酰胺类似物的混合物,包含PDMP四种可能立体异构体中的两种:D-赤式-(1S,2R)-PDMP和L-赤式-(1R,2S)-PDMP。它是UDP-葡萄糖:神经酰胺葡糖基转移酶(UGCG,EC 2.4.1.80)的强效抑制剂,被用作研究糖鞘脂(GSLs)在细胞生物学、神经生物学和癌症中作用的研究工具。该化合物可溶于DMSO(例如,50 mg/mL)和水(微溶),应以粉末形式储存于-20℃,避光防潮,在此条件下至少可稳定保存2年。溶液形式应分装后储存于-80℃,并在6个月内使用。该化合物是研究鞘脂代谢、GSL依赖性信号传导以及评估GCS作为癌症、溶酶体贮积症和传染病治疗靶点的关键工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H39CLN2O3
分子量
427.020365953445
精确质量
426.264
CAS号
80943-40-4
相关CAS号
D,L-erythro-PDMP;109760-77-2
PubChem CID
72163880
外观&性状
White to off-white solid powder
tPSA
61.8
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
13
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
407
定义原子立体中心数目
2
SMILES
[C@@H](NC(=O)CCCCCCCCC)(CN1CCOCC1)[C@H](C1C=CC=CC=1)O.Cl
InChi Key
HVJHJOYQTSEKPK-QRIJJCFISA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H38N2O3.ClH/c1-2-3-4-5-6-7-11-14-22(26)24-21(19-25-15-17-28-18-16-25)23(27)20-12-9-8-10-13-20;/h8-10,12-13,21,23,27H,2-7,11,14-19H2,1H3,(H,24,26);1H/t21-,23+;/m1./s1
化学名
N-[(1S,2R)-1-hydroxy-3-morpholin-4-yl-1-phenylpropan-2-yl]decanamide;hydrochloride
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 125 mg/mL (292.73 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.87 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.87 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.87 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3418 mL 11.7091 mL 23.4181 mL
5 mM 0.4684 mL 2.3418 mL 4.6836 mL
10 mM 0.2342 mL 1.1709 mL 2.3418 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们