BPK-25

别名: BPK25
目录号: V64255 纯度: ≥98%
BPK-25 是一种活性丙烯酰胺,通过涉及共价蛋白参与的翻译后机制促进核小体重塑和脱乙酰化 (NuRD) 复合蛋白的降解。
BPK-25 CAS号: 2305052-86-0
产品类别: Others 12
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
BPK-25 是一种活性丙烯酰胺,它通过涉及共价蛋白参与的翻译后机制促进核小体重塑和去乙酰化 (NuRD) 复合物蛋白的降解。BPK-25 通过环状二核苷酸配体 cGAMP 抑制 TMEM173 的活化。
BPK-25 是一种高效、选择性的小分子抑制剂,能够降解核小体重塑和去乙酰化 (NuRD) 复合物蛋白。作为一种活性丙烯酰胺,它通过涉及共价蛋白结合的翻译后机制促进 NuRD 复合物组分的降解。此外,它还能抑制 cGAMP 激活干扰素基因刺激因子 (STING) 通路。
生物活性&实验参考方法
靶点
BPK-25 has multiple reported targets: (1) The NuRD complex, a multi-protein chromatin remodeling complex (including CHD3/4, HDAC1/2, MTA1/2/3, MBD2/3). BPK-25 promotes the degradation of NuRD complex proteins. (2) It inhibits TMEM173 (STING) activation by the cyclic dinucleotide ligand cGAMP, thereby suppressing NF-kappaB activation. It also has been reported to inhibit CDK9.
体外研究 (In Vitro)
BPK-25(10 μM;5 小时)通过环状二核苷酸配体 cGAMP 抑制 TMEM173 的活化 [2]。如 IκBα 磷酸化水平降低 50% 以上所示,BPK-25(10 μM;24 小时)抑制活化 T 细胞核因子 (NFAT) 和 NF-κB 的活化 [1]。T 细胞 NFATc2 的表达同样被 BPK-25(10 μM;4 小时)降低 [1]。BPK-25(0.1、1、5、10、20 μM;24 小时)以浓度和时间依赖的方式促进核小体重塑和去乙酰化 (NuRD) 复合物中多种蛋白质的显著且选择性降低。BPK-25 的 mRNA 表达未发生类似变化 [1]。 BPK-25-ctrl 是 BPK-25 的非亲电丙酰胺类似物,它不会改变 T 细胞中的 NuRD 复合物蛋白,也不会限制 T 细胞活化 [1]。
体外实验表明,BPK-25 可抑制环状二核苷酸配体 cGAMP 对 TMEM173 的激活,进而抑制 NF-κB 的激活。此外,它还能促进核小体重塑和去乙酰化 (NuRD) 复合物蛋白的降解。据报道,在低微摩尔浓度下,BPK-25 可抑制 T 细胞活化而不产生细胞毒性。该化合物是一种活性丙烯酰胺,提示其可能作为共价抑制剂发挥作用,从而导致靶蛋白降解。
体内研究 (In Vivo)
体内研究表明,BPK-25 可用于研究 NuRD 复合物的生物学特性和免疫调节。它通过促进 NuRD 复合物的降解,影响 T 细胞功能和染色质重塑。研究发现,BPK-25 在低微摩尔浓度下即可抑制 T 细胞活化,提示其具有潜在的免疫抑制活性。然而,目前标准文献中缺乏动物模型提供的详细体内疗效数据,其主要用途是作为靶点验证的研究工具。
酶活实验
由于 BPK-25 的作用机制是降解(可能通过蛋白酶体途径),因此目前尚无标准的无细胞检测方法。研究人员可能会使用体外泛素化实验来观察 BPK-25 是否能增强 NuRD 复合物组分的泛素化,但这并非常规实验方案。结合实验,例如表面等离子共振(SPR),可以用于确认 BPK-25 与靶蛋白的直接结合,但其主要活性(降解)仍需在细胞内进行测定。
细胞实验
BPK-25 的标准细胞检测方法是评估其对 NuRD 复合物蛋白和 T 细胞活化的影响。将 Jurkat T 细胞或原代人 T 细胞用 BPK-25 处理。24-48 小时后,收集细胞并裂解,通过蛋白质印迹法分析 NuRD 复合物蛋白(例如 CHD4、HDAC1/2)的水平,以确认其降解。使用抗 CD3/CD28 抗体诱导 T 细胞活化,并通过流式细胞术检测活化标志物(例如 CD25、CD69),并通过 ELISA 检测细胞因子(例如 IL-2、IFN-γ)的产生。在表达 STING 的报告细胞系中可以评估 TMEM173 活化的抑制情况。
动物实验
在体内研究中,通常使用动物模型(通常是小鼠)来研究T细胞介导的免疫疾病。小鼠可通过腹腔注射或灌胃给予BPK-25。可采用移植物抗宿主病(GvHD)模型或T细胞介导的炎症性疾病模型。研究终点包括脾脏和淋巴结中的T细胞活化标志物、血清中的细胞因子水平以及靶器官(例如结肠、肝脏、皮肤)的组织病理学评估。标准文献中未详细描述具体的给药方案。
药代性质 (ADME/PK)
BPK-25 的分子量为 392.84,分子式为 C21H17ClN4O2。它是一种活性丙烯酰胺,具有反应活性。它在 DMSO 中的溶解度很高(150 mg/mL)。为了确保其溶解性和稳定性,在体内应用中,通常将其配制成 DMSO:PEG300:Tween80:生理盐水等载体。标准文献中未详细列出具体的药代动力学参数(例如半衰期、生物利用度)。丙烯酰胺活性基团的存在表明它是一种共价抑制剂,这可能会影响其药效持续时间。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
参考文献中没有关于 BPK-25 的具体毒理学数据。作为一种活性丙烯酰胺,该化合物可能与含有半胱氨酸残基的细胞蛋白发生脱靶反应,这既是其作用机制的基础,也可能导致非特异性毒性。该化合物的设计初衷是选择性地抑制 T 细胞活化而不引起体外细胞毒性,但目前尚无完整的毒理学数据。应将其作为潜在危险化学品处理。
参考文献
[1]. Ekaterina V Vinogradova, et al. An Activity-Guided Map of Electrophile-Cysteine Interactions in Primary Human T Cells. Cell. 2020 Aug 20;182(4):1009-1026.e29.
其他信息
BPK-25 是一种用于研究 NuRD(核小体重塑和去乙酰化)复合物的化学研究工具。NuRD 复合物是一种多亚基复合物,在转录调控、发育和癌症中发挥着关键作用。它也被用于研究 cGAS-STING 通路和 CDK9 生物学。该化合物是一种降解剂,这是药物研发领域一种新兴的策略。通过促进靶蛋白的降解,它具有与传统抑制剂不同的药理学特性。BPK-25 尚未获批上市,仅用于临床前研究。检索结果中存在相互矛盾的报道(一些报道将其描述为 CDK9 抑制剂,另一些报道则将其描述为 NuRD 降解剂和 STING 抑制剂),这表明它可能具有多种活性,或者相关文献存在歧义。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H17CLN4O2
分子量
392.84
精确质量
392.104
CAS号
2305052-86-0
PubChem CID
138506238
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
3.4
tPSA
75.2
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
28
分子复杂度/Complexity
553
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C=CC(=O)N(CC1=NC(=CC=C1)Cl)C2=CN=C(C=C2)C(=O)NC3=CC=CC=C3
InChi Key
MHPBTJANPDDCPH-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H17ClN4O2/c1-2-20(27)26(14-16-9-6-10-19(22)24-16)17-11-12-18(23-13-17)21(28)25-15-7-4-3-5-8-15/h2-13H,1,14H2,(H,25,28)
化学名
5-[(6-chloropyridin-2-yl)methyl-prop-2-enoylamino]-N-phenylpyridine-2-carboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 150 mg/mL (381.83 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 3.75 mg/mL (9.55 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 37.5 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL 生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 3.75 mg/mL (9.55 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 37.5 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入 900 μL 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 3.75 mg/mL (9.55 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 37.5 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.5456 mL 12.7278 mL 25.4557 mL
5 mM 0.5091 mL 2.5456 mL 5.0911 mL
10 mM 0.2546 mL 1.2728 mL 2.5456 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们