Thalidomide-5-NH2-C8-NH2 TFA

目录号: V65969 纯度: ≥98%
沙利度胺-5-NH2-C8-NH2 TFA可用于化合物的制备/合成。
Thalidomide-5-NH2-C8-NH2 TFA CAS号: 2097509-49-2
产品类别: Biochemical Assay Reagents
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
50mg
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产品描述
沙利度胺-5-NH2-C8-NH2 TFA 可用于化合物的制备/合成。
沙利度胺-5-NH2-C8-NH2 TFA 是一种聚乙二醇化(8 个氨基连接基)的沙利度胺衍生物,含有两个胺基。它可用作合成 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)分子的功能化中间体,其中一个胺基用于与 cereblon (CRBN) 配体(沙利度胺)偶联,另一个胺基用于与 E3 连接酶配体或靶蛋白配体偶联。
生物活性&实验参考方法
靶点
Cereblon (CRBN), a component of the E3 ubiquitin ligase complex, is the primary molecular target. This compound retains the thalidomide core that binds to CRBN, recruiting it to neo-substrates for ubiquitination and degradation.
体外研究 (In Vitro)
目前尚无该连接子本身的具体体外活性数据。作为一种结构单元,它用于合成PROTAC,后者可在无细胞泛素化实验中降解靶蛋白。母体化合物沙利度胺与CRBN结合的IC50约为200 nM。
体内研究 (In Vivo)
目前尚无该连接子的具体体内活性数据。含有该连接子的PROTACs已在动物癌症、炎症和神经退行性疾病模型中展现出体内降解靶标的功效,具体效果取决于所使用的靶蛋白配体。
酶活实验
在标准的CRBN结合实验中,将沙利度胺衍生物或其PROTAC偶联物与纯化的CRBN-DDB1复合物在缓冲液(50 mM Tris,pH 8.0,100 mM NaCl,1 mM DTT)中于4℃孵育1-2小时。结合反应通过荧光偏振或表面等离子共振(SPR)检测。目前尚无针对该连接子的特定实验方案。
细胞实验
目前尚无针对该连接子的特定细胞实验方案。然而,对于由该连接子合成的PROTAC,可将细胞(例如HEK293T细胞或癌细胞系)用PROTAC(0.1 nM - 10 uM)处理4-48小时。通过Western blot检测靶蛋白的降解情况。该连接子本身不具有细胞活性。
动物实验
尚无针对该连接子的标准体内实验方案。对于含有该连接子的PROTACs,典型的实验方案包括将药物(例如,10-100 mg/kg)静脉或腹腔注射到荷瘤小鼠体内。在不同时间点采集血液和组织样本,通过Western blot或IHC检测靶标降解情况。
药代性质 (ADME/PK)
PK特性不适用于连接子本身。对于含有该连接子的PROTAC,它们通常表现出中等至高的血浆蛋白结合率、短至中等的半衰期(啮齿动物中为1-6小时),并由CYP450酶代谢。制剂中通常使用10% DMSO、40% PEG300和50%生理盐水。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
沙利度胺核心的一般毒性包括致畸性和潜在的静脉血栓栓塞风险。然而,PROTAC合成中使用的低浓度连接子本身被认为风险较低。应采取标准的实验室安全预防措施。该化合物不可用于人体。
参考文献
[1]. Michael Bruno Plewe, et al. Compounds and methods of treating diseases. Patent WO2022068933A1.
其他信息
沙利度胺-5-NH2-C8-NH2 TFA 是一种用于 PROTAC 设计的研究级中间体。C8 烷基连接基为三元复合物的形成提供了最佳间距。两个 NH2 基团允许进行正交保护和顺序偶联。本产品仅供研究使用,不得用于诊断或治疗用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H29F3N4O6
分子量
514.49477648735
精确质量
514.203
CAS号
2097509-49-2
PubChem CID
132260585
外观&性状
Light yellow to green yellow solid powder
tPSA
159
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
10
重原子数目
36
分子复杂度/Complexity
722
定义原子立体中心数目
0
SMILES
FC(C(=O)O)(F)F.O=C1C2C=C(C=CC=2C(N1C1C(NC(CC1)=O)=O)=O)NCCCCCCCCN
InChi Key
NVUSVLWAQSTODF-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H28N4O4.C2HF3O2/c22-11-5-3-1-2-4-6-12-23-14-7-8-15-16(13-14)21(29)25(20(15)28)17-9-10-18(26)24-19(17)27;3-2(4,5)1(6)7/h7-8,13,17,23H,1-6,9-12,22H2,(H,24,26,27);(H,6,7)
化学名
5-(8-aminooctylamino)-2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)isoindole-1,3-dione;2,2,2-trifluoroacetic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 100 mg/mL (194.37 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.86 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.86 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9437 mL 9.7184 mL 19.4367 mL
5 mM 0.3887 mL 1.9437 mL 3.8873 mL
10 mM 0.1944 mL 0.9718 mL 1.9437 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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