HBC620

别名: HBC620; 2530162-07-1; (Z)-4-(1-Cyano-2-(5-((2-hydroxyethyl)(methyl)amino)thieno[3,2-b]thiophen-2-yl)vinyl)benzonitrile; 4-[(~{Z})-1-cyano-2-[5-[2-hydroxyethyl(methyl)amino]thieno[3,2-b]thiophen-2-yl]ethenyl]benzenecarbonitrile; 4-[(Z)-1-cyano-2-[5-[2-hydroxyethyl(methyl)amino]thieno[3,2-b]thiophen-2-yl]ethenyl]benzonitrile; .. HBC-620
目录号: V67092 纯度: ≥98%
HBC620 是一种非荧光 HBC 模拟物。
HBC620 CAS号: 2530162-07-1
产品类别: Fluorescent Dye
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
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产品描述
HBC620 是一种非荧光 HBC 类似物。HBC 在溶液中不发荧光,但与 Pepper RNA 适体形成紧密复合物时会发出强烈的荧光。HBC-Pepper 复合物可用于观察活细胞中 RNA 的动态变化。
HBC620(CAS 编号:2530162-07-1)是一种非荧光 HBC 类似物,与 Pepper RNA 适体形成紧密复合物后会发出强烈的荧光。其分子式为 C₁₉H₁₅N₃OS₂,分子量为 365.47 g/mol。该化合物为固体,在 DMSO 中的溶解度为 16 mg/mL。HBC620 是 HBC 的类似物,HBC 是一种类似 GFP 荧光团的合成染料。HBC-Pepper 复合物可用于可视化活细胞中的 RNA 动态变化。该化合物在溶液中不发荧光,但与 Pepper RNA 适体结合后会发出强烈的荧光。
生物活性&实验参考方法
靶点
HBC620 targets the Pepper RNA aptamer, a fluorogenic RNA aptamer that specifically binds HBC and its analogs. The compound does not target a protein or enzyme but rather serves as a fluorescent ligand that becomes fluorescent upon binding to its cognate RNA aptamer. Upon forming a tight complex with the Pepper RNA aptamer, HBC620 emits strong fluorescence, allowing for the visualization of RNA dynamics in live cells.
体外研究 (In Vitro)
HBC 的荧光可被 Pepper 触发。当暴露于 1 μM HBC 时,表达 Pepper 的哺乳动物细胞会发出强烈的黄绿色荧光 [1]。Pepper 能最大限度地减少对靶 RNA 翻译、定位和转录的干扰,同时实现对活细胞中多种 RNA 的简便可靠的成像 [1]。
HBC620 的体外活性在于其作为 Pepper RNA 适配体的荧光配体的功能。该化合物在溶液中不发荧光。与 Pepper RNA 适配体结合后,它会发出强烈的荧光。这种荧光可以被检测和定量,从而实现对活细胞中 RNA 的成像。HBC-Pepper 复合物可用于可视化活细胞中的 RNA 动态变化。
体内研究 (In Vivo)
HBC620 不用作治疗药物。其体内用途仅限于利用 Pepper 适体系统对活细胞中的 RNA 进行成像的研究应用。该化合物不适用于全身治疗。
酶活实验
HBC620 的体外结合实验包括在合适的缓冲液条件下将荧光配体与 Pepper RNA 适体孵育。通过向含有适体的溶液中滴定 HBC620 并测量荧光强度的增加来确定结合亲和力。荧光强度的增强与结合的 HBC620 的量成正比。
细胞实验
在体外细胞实验中,将表达Pepper RNA适体的细胞与HBC620孵育,HBC620会被细胞摄取并与适体结合。由此产生的荧光可以通过荧光显微镜检测,从而实现对活细胞中RNA的可视化和追踪。
动物实验
HBC620 通常不用于体内动物实验,因为该化合物主要用作细胞培养系统中 RNA 成像的研究工具。
药代性质 (ADME/PK)
由于HBC620是一种研究用荧光配体而非候选药物,因此其药代动力学性质尚未得到表征。该化合物的分子量为365.47 g/mol,应在适当的条件下避光保存。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
HBC620 仅供研究用途,不得用于人体治疗或诊断。处理此化学试剂时,应遵守标准的实验室安全预防措施。
参考文献

[1]. Visualizing RNA dynamics in live cells with bright and stable fluorescent RNAs. Nat Biotechnol. 2019 Nov;37(11):1287-1293.

其他信息
HBC620(CAS#: 2530162-07-1)是一种非荧光的HBC模仿物,在与Pepper RNA适配体形成紧密复合物时发出强荧光。它用于可视化活细胞中的RNA动态。该化合物没有临床或治疗应用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H15N3OS2
分子量
365.47190117836
精确质量
365.065
CAS号
2530162-07-1
PubChem CID
146047141
外观&性状
Red to reddish brown solid powder
LogP
4
tPSA
128
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
25
分子复杂度/Complexity
596
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(C1SC2C=C(N(C)CCO)SC=2C=1)=C(C1C=CC(C#N)=CC=1)C#N
InChi Key
RIGJCKIIBUZTCX-OVCLIPMQSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H15N3OS2/c1-22(6-7-23)19-10-18-17(25-19)9-16(24-18)8-15(12-21)14-4-2-13(11-20)3-5-14/h2-5,8-10,23H,6-7H2,1H3/b15-8+
化学名
4-[(Z)-1-cyano-2-[5-[2-hydroxyethyl(methyl)amino]thieno[3,2-b]thiophen-2-yl]ethenyl]benzonitrile
别名
HBC620; 2530162-07-1; (Z)-4-(1-Cyano-2-(5-((2-hydroxyethyl)(methyl)amino)thieno[3,2-b]thiophen-2-yl)vinyl)benzonitrile; 4-[(~{Z})-1-cyano-2-[5-[2-hydroxyethyl(methyl)amino]thieno[3,2-b]thiophen-2-yl]ethenyl]benzenecarbonitrile; 4-[(Z)-1-cyano-2-[5-[2-hydroxyethyl(methyl)amino]thieno[3,2-b]thiophen-2-yl]ethenyl]benzonitrile; ..
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 该产品在溶液状态不稳定,请现配现用。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 16.67 mg/mL (45.61 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.08 mg/mL (5.69 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80+,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7362 mL 13.6810 mL 27.3620 mL
5 mM 0.5472 mL 2.7362 mL 5.4724 mL
10 mM 0.2736 mL 1.3681 mL 2.7362 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们