Cy3 NHS ester (Cyanine3 NHS ester)

目录号: V67096 纯度: ≥98%
Cy3 NHS 酯是一种 CY 染料。
Cy3 NHS ester (Cyanine3 NHS ester) CAS号: 1393363-07-9
产品类别: Fluorescent Dye
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
Cy3 NHS酯是一种CY染料。CY是花菁的缩写,花菁是由两个氮原子通过奇数个甲基单元连接而成的化合物。花菁化合物具有长波长、吸收和发射可调、消光系数高、水溶性好、合成相对简单等特点。CY染料常用于标记蛋白质、抗体和小分子化合物。对于蛋白质抗体的标记,可通过简单的混合反应完成结合。下面介绍蛋白质抗体的标记方法,具有一定的参考意义。
Cy3 NHS酯(花菁3 NHS酯)(CAS号:1393363-07-9)是一种胺反应性橙红色荧光染料,属于花菁染料家族。其分子式为C₃₄H₄₀ClN₃O₄,分子量为590.15 g/mol。该化合物为红色固体,应避光储存于-20°C。NHS酯基团在中性至弱碱性条件下与蛋白质、抗体和核酸上的伯胺反应,形成稳定的酰胺键。Cy3 NHS酯常用于标记蛋白质、抗体和核酸,从而应用于荧光显微镜、流式细胞术和FRET等基于荧光的检测和成像技术。
生物活性&实验参考方法
靶点
The NHS ester functional group on Cy3 NHS ester targets primary amines (-NH₂) on proteins, antibodies, peptides, and nucleic acids. The compound does not target a specific protein or enzyme but rather serves as a covalent labeling reagent that attaches the Cy3 fluorophore to amine-containing biomolecules. Cy3 is a cyanine dye consisting of two nitrogen atoms connected by an odd number of methyl units. Cyanine compounds have long wavelength, adjustable absorption and emission, high extinction coefficient, good water solubility, and relatively simple synthesis.
体外研究 (In Vitro)
第一步骤。蛋白质制备:请将蛋白质(抗体)浓度配制至 2 mg/mL,以获得最佳标记效果。2) 蛋白质溶液的 pH 值为 8.5±0.5。如果 pH 值低于 8.0,则需加入 1 mg 碳酸氢钠 (1M) 调节 pH 值。3) 如果蛋白质浓度低于 2 mg/mL,标记效率将显著降低。建议最终蛋白质浓度范围为 2–10 mg/mL,以获得最佳标记效率。4) 为确保最佳标记效果,蛋白质需要溶于不含铵离子和伯胺的缓冲液中,例如 Tris 或甘氨酸缓冲液。2. 制备染料(以 CY3-NHS 酯为例)。用无水 DMSO 填充含有 CY3-NHS 酯的小瓶,配制成 10 mM 的储备液。使用移液器或涡旋振荡器充分混匀。3. 计算染料剂量。 CY3-NHS酯与蛋白质的理想摩尔比约为10,反应所需的CY3-NHS酯的量取决于待标记蛋白质的量。例如:假设所需的标记蛋白为500 μL浓度为2 mg/mL的IgG(分子量=150,000),则将1 mg CY3-NHS酯溶解于100 μL DMSO中。这样即可得到所需的5.05 μL CY3-NHS酯。具体的计算步骤如下:1) mmol (IgG) = mg/mL (IgG) × mL (IgG)/MW (IgG) = 2 mg/mL × 0.5 mL/150,000 mg/mmol = 6.7×10⁻⁶ mmol 2) mmol (CY3-NHS酯) = mmol (IgG) × 10 = 6.7×10⁻⁶ mmol × 10 = 6.7 × 10⁻⁵ mmol 3) μL (CY3-NHS酯) = mmol (CY3-NHS酯) × MW (CY3-NHS酯)/mg/μL (CY3-NHS酯) = 6.7 × 10⁻⁵ mmol × 753.88 mg/mmol/0.01 mg/μL = 5.05 μL (CY3-NHS酯) 4. 1) 进行偶联反应:取0.5 mL蛋白质溶液,加入适量的……将新鲜配制的 10 mg/mL CY3-NHS 酯轻轻摇匀,然后短暂离心,使样品沉淀在反应管底部。为防止蛋白质样品变性或失活,请勿等量混合。2) 将反应管置于避光处,室温下轻轻孵育 60 分钟。10 至 15 分钟后,小心地反向重复步骤五。纯化偶联物:使用 SepHadex G-25 柱,以下步骤演示了如何纯化染料-蛋白质偶联物。1) 根据制造商的说明组装 SepHadex G-25 柱。2) 将反应混合物(来自“运行偶联反应”)加满 SepHadex G-25 柱。3) 当样品流过树脂表面时,立即加入 PBS(pH 7.2–7.4)。为了完成所选样品的纯化,加入额外的PBS缓冲液(pH 7.2–7.4)。将含有相应染料-蛋白偶联物的组分合并。
Cy3 NHS酯的体外活性在于其作为荧光标记试剂的功能。NHS酯与伯胺反应形成稳定的酰胺键。Cy3荧光团发出明亮的橙红色荧光,使得标记的偶联物可通过荧光显微镜、流式细胞术和FRET研究进行检测。Cy3常被用作FRET应用中的供体。该标记高效,可通过简单的混合反应完成。
体内研究 (In Vivo)
Cy3 NHS酯不用作治疗剂。其体内用途仅限于生物分子荧光标记成像和检测等研究应用。该化合物不适用于全身治疗。
酶活实验
Cy3 NHS酯的体外标记实验是将NHS酯与含胺生物分子在合适的缓冲条件下(通常pH 7-9)孵育。该反应通过伯胺对NHS酯羰基的亲核攻击进行,形成稳定的酰胺键,并释放出N-羟基琥珀酰亚胺作为副产物。标记效率可通过荧光光谱法测量偶联产物的荧光强度或测定染料与蛋白质的比例来评估。
细胞实验
在体外细胞实验中,首先通过NHS酯-胺反应将Cy3 NHS酯与抗体、蛋白质或其他靶向配体偶联。然后纯化标记的偶联物,并将其添加到细胞培养基中与靶细胞孵育。洗涤后,使用荧光显微镜或流式细胞仪分析细胞。橙红色荧光可提供明亮且光稳定的标记,适用于细胞成像。
动物实验
在动物体内实验中,通常不使用Cy3 NHS酯本身进行实验。然而,用该染料制备的缀合物可用于动物模型的成像应用。
药代性质 (ADME/PK)
由于Cy3 NHS酯是一种研究用荧光标记试剂而非候选药物,因此其药代动力学性质尚未得到表征。该化合物的分子量为590.15 g/mol,应在-20°C避光保存。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
Cy3 NHS酯仅供研究用途,不得用于人体治疗或诊断。处理此化学试剂时,应遵守标准的实验室安全预防措施。
参考文献

[1]. Ptaszek M. Rational design of fluorophores for in vivo applications. Prog Mol Biol Transl Sci. 2013;113:59-108.

[2]. Shindy, H. A. (2017). Fundamentals in the chemistry of cyanine dyes: A review. Dyes and Pigments, 145, 505–513. doi:10.1016/j.dyepig.2017.06.029.

其他信息
Cy3 NHS酯(CAS#: 1393363-07-9)是一种氨基反应性橙红色荧光染料,用于标记蛋白质、抗体和核酸。它用于荧光显微镜、流式细胞术和FRET研究。该化合物没有临床或治疗应用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C34H40CLN3O4
分子量
590.1521
精确质量
589.27
CAS号
1393363-07-9
PubChem CID
155487015
外观&性状
Light yellow to green yellow solid powder
tPSA
69.9
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
10
重原子数目
42
分子复杂度/Complexity
1120
定义原子立体中心数目
0
SMILES
[Cl-].O(C(CCCCCN1C2=CC=CC=C2C(C)(C)/C/1=C/C=C/C1C(C)(C)C2=CC=CC=C2[N+]=1C)=O)N1C(CCC1=O)=O
InChi Key
KWDMHANYPGHTLW-UHFFFAOYSA-M
InChi Code
InChI=1S/C34H40N3O4.ClH/c1-33(2)24-14-8-10-16-26(24)35(5)28(33)18-13-19-29-34(3,4)25-15-9-11-17-27(25)36(29)23-12-6-7-20-32(40)41-37-30(38)21-22-31(37)39;/h8-11,13-19H,6-7,12,20-23H2,1-5H3;1H/q+1;/p-1
化学名
(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 6-[(2Z)-3,3-dimethyl-2-[(E)-3-(1,3,3-trimethylindol-1-ium-2-yl)prop-2-enylidene]indol-1-yl]hexanoate;chloride
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 125 mg/mL (211.81 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.52 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.52 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6945 mL 8.4724 mL 16.9448 mL
5 mM 0.3389 mL 1.6945 mL 3.3890 mL
10 mM 0.1694 mL 0.8472 mL 1.6945 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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