Ibacitabine (5-Iodo-2'-deoxycytidine)

别名: 5-碘-2'-脱氧胞苷;5-碘-2-脱氧胞苷; 5-Iodo-2'-deoxycytidine 5-碘-2'-脱氧胞苷;5-碘-2\'-脱氧胞苷;碘脱氧胞苷;5-碘-2’-脱氧胞苷
目录号: V68875 纯度: ≥98%
伊巴西他滨是一种可用于基因测序的抗病毒化合物。
Ibacitabine (5-Iodo-2'-deoxycytidine) CAS号: 611-53-0
产品类别: Biochemical Assay Reagents
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
伊巴西他滨是一种可用于基因测序的抗病毒化合物。
伊巴西他滨(5-碘-2'-脱氧胞苷)(CAS 611-53-0)是一种嘧啶2'-脱氧核苷,是脱氧胞苷的碘化类似物。它为固体,是一种可用于基因测序的抗病毒化合物。伊巴西他滨外用于治疗唇疱疹(冷疮)。该化合物具有独特的作用机制,通常作为病毒聚合酶抑制剂发挥作用,从而干扰病毒核酸的合成。
生物活性&实验参考方法
靶点
Ibacitabine is an inhibitor of viral polymerases, disrupting the synthesis of viral nucleic acids. The compound works by inhibiting viral replication or disrupting cellular DNA synthesis in cancer cells. It is specifically designed to interfere with the activity of enzymes like reverse transcriptase in viruses and DNA polymerases in cancer cells, preventing their proliferation. The primary target is viral DNA polymerase.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,伊巴西他滨对非洲绿猴Vero细胞中的HSV1病毒具有显著的抗病毒活性,在10 µg/ml浓度下抑制率超过99.9%,且对小鼠L5178Y和P815细胞的细胞毒性极低(96小时后ID₅₀ > 100.0 µg/ml)。该化合物可用作细胞实验中的抗病毒药物,但也可能对宿主细胞产生细胞毒性作用。
体内研究 (In Vivo)
在体内,伊巴西他滨用于局部治疗唇疱疹(冷疮)。它是一种局部抗疱疹药物。该化合物的药理学特性包括抗病毒活性,但它也可能对宿主细胞产生细胞毒性作用,这是核苷类似物常见的担忧。目前已有临床应用数据提供了局部给药的具体体内药代动力学信息。
酶活实验
在体外抗病毒试验中,伊巴西他滨在Vero细胞中针对HSV1进行了评估。将细胞接种于96孔板中,并用HSV1感染,然后用不同浓度(通常为0.1-100 µg/mL)的化合物处理。通过噬斑减少试验或病毒DNA定量来检测病毒复制。该化合物在10 µg/mL浓度下显示出>99.9%的抑制率。同时,使用MTT法在L5178Y和P815细胞中评估了其细胞毒性。
细胞实验
在体外细胞实验中,可评估伊巴西他滨对HSV1和其他病毒的抗病毒活性。将细胞感染病毒后,用不同浓度的化合物处理24-72小时。病毒滴度可通过噬斑试验或qPCR检测病毒DNA来确定。细胞毒性可通过MTT或刃天青法进行评估。该化合物作为病毒聚合酶抑制剂的作用机制可在无细胞实验中得到验证。
动物实验
伊巴西他滨的体内动物研究通常在单纯疱疹病毒(HSV)感染模型中进行。该化合物局部应用于感染动物(例如豚鼠或小鼠),并测量病灶大小的缩小、病毒脱落和愈合时间。局部抗疱疹药物的标准体内研究方案包括每日多次将化合物涂抹于感染部位,并评估临床终点。
药代性质 (ADME/PK)
本文对伊巴西他滨局部给药的药代动力学特性进行了表征。作为一种核苷类似物,它预计会在细胞内磷酸化为活性三磷酸形式。局部应用时,其全身吸收极少,从而限制了全身毒性。临床应用已证实该化合物局部治疗唇疱疹的安全性和有效性。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
伊巴西他滨局部用于治疗唇疱疹时通常耐受性良好。作为一种核苷类似物,它可能会刺激局部皮肤。由于吸收有限,全身毒性极低。该化合物已获准用于局部治疗,并具有良好的安全性。具体的毒性数据可从临床研究和安全数据表中获取。
参考文献

[1]. A Serpentier-Daude, Contact dermatitis to topical antiviral drugs. Ann Dermatol Venereol. 2000 Feb;127(2):191-3.

其他信息
Ibacitabine是一种嘧啶2'-脱氧核苷。Ibacitabine是脱氧胞苷的碘化类似物,主要用于局部治疗唇疱疹。
Ibacitabine (5-碘-2'-脱氧胞苷, CAS 611-53-0) 是一种FDA批准的抗病毒药物,用于局部治疗唇疱疹(冷疮)。它是一种嘧啶2'-脱氧核苷和脱氧胞苷的碘化类似物。该化合物作为病毒聚合酶的抑制剂,显示出对HSV1的显著抗病毒活性。它还用于基因测序研究。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C9H12IN3O4
分子量
353.11
精确质量
352.987
CAS号
611-53-0
PubChem CID
65050
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
2.4±0.1 g/cm3
沸点
522.1±60.0 °C at 760 mmHg
熔点
185 °C
闪点
269.6±32.9 °C
蒸汽压
0.0±3.1 mmHg at 25°C
折射率
1.815
LogP
-0.69
tPSA
110.6
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
17
分子复杂度/Complexity
398
定义原子立体中心数目
3
SMILES
IC1C(N([H])[H])=NC(N(C=1[H])[C@@]1([H])C([H])([H])[C@@]([H])([C@@]([H])(C([H])([H])O[H])O1)O[H])=O
InChi Key
WEVJJMPVVFNAHZ-RRKCRQDMSA-N
InChi Code
InChI=1S/C9H12IN3O4/c10-4-2-13(9(16)12-8(4)11)7-1-5(15)6(3-14)17-7/h2,5-7,14-15H,1,3H2,(H2,11,12,16)/t5-,6+,7+/m0/s1
化学名
4-amino-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-iodopyrimidin-2-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 100 mg/mL (283.20 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (3.54 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 12.5 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (3.54 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 12.5 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (3.54 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 12.5 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.8320 mL 14.1599 mL 28.3198 mL
5 mM 0.5664 mL 2.8320 mL 5.6640 mL
10 mM 0.2832 mL 1.4160 mL 2.8320 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们