SI-109

别名: SI109
目录号: V69152 纯度: ≥98%
SI-109 是一种有效的 STAT3 SH2 结构域抑制剂 (Ki=9 nM),具有抗肿瘤活性。
SI-109 CAS号: 2429877-30-3
产品类别: Ligands for Target Protein for PROTAC
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
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产品描述
SI-109 是一种强效的 STAT3 SH2 结构域抑制剂(Ki=9 nM),具有抗肿瘤活性。SI-109 能有效抑制 STAT3 的转录活性(IC50=3 μM)。SI-109 和 CRBN 类似物来那度胺配体被用于设计 PROTAC STAT3 降解剂 SD-36。
SI-109(CAS#: 2429877-30-3)是一种强效的 STAT3 SH2 结构域抑制剂,Ki 值为 9 nM,并具有抗肿瘤活性。它能有效抑制 STAT3 的转录活性,IC50 值为 3 μM。SI-109 已与 CRBN 配体来那度胺联合用于设计 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)STAT3 降解剂,例如 SD-36。这凸显了它不仅作为直接抑制剂的用途,而且作为靶向蛋白质降解策略的构建模块的用途。
生物活性&实验参考方法
靶点
STAT3 9 nM (Ki)
SI-109 targets the SH2 domain of STAT3 (Signal Transducer and Activator of Transcription 3), a key transcription factor involved in cell proliferation, survival, and oncogenesis. It binds to the STAT3 SH2 domain with high affinity (Ki = 9 nM), blocking the interaction between STAT3 and its phosphorylated tyrosine motifs on activated receptors. This prevents STAT3 dimerization, nuclear translocation, and subsequent transcriptional activation of downstream target genes involved in tumor growth and survival.
体外研究 (In Vitro)
在MOLM-16细胞中,SI-109具有中等的生长抑制作用(IC50=3 μM)[1]。即使浓度高达10 μM,SI-109也无法抑制STAT3 Y705的磷酸化和c-Myc的表达[1]。SI-109对STAT3 SH2结构域的结合具有强效抑制作用,Ki值为9 nM。它能有效抑制STAT3的转录活性,IC50值为3 μM。在MOLM-16细胞中,SI-109表现出中等的生长抑制活性,IC50值为3 μM。有趣的是,即使浓度高达10 μM,SI-109也无法抑制STAT3 Y705的磷酸化和c-Myc的表达,这表明其作用机制是通过直接结合SH2结构域而非抑制上游激酶。
体内研究 (In Vivo)
现有文献中关于SI-109体内活性的报道并不多。该化合物的主要用途是作为体外研究STAT3抑制的工具以及PROTAC设计的配体。在体内研究中,研究人员通常使用SI-109衍生物或PROTAC分子(例如SD-36),这些分子以SI-109作为STAT3结合部分。这些下游分子已在动物模型中展现出抗肿瘤功效。但仍需进一步研究以明确SI-109本身的直接体内活性。
酶活实验
SI-109 的体外酶/受体结合(无细胞)检测采用基于荧光偏振的竞争性检测方法,以测定其与 STAT3 SH2 结构域的结合亲和力。将一种与 STAT3 SH2 结构域结合的荧光标记磷酸肽探针与重组 STAT3 蛋白和不同浓度的 SI-109 孵育。化合物对探针的置换会导致荧光偏振信号的降低,由此计算 Ki 值。此外,也可使用表面等离子共振 (SPR) 直接测量结合动力学。
细胞实验
SI-109 的体外细胞活性检测通常使用 STAT3 依赖性报告基因细胞系,例如携带 STAT3 反应性荧光素酶构建体的细胞系。将细胞用不同浓度的 SI-109 处理,并通过检测荧光素酶活性来量化 STAT3 介导的转录抑制情况。在 MOLM-16 细胞中,使用 MTT 或 CellTiter-Glo 等标准细胞活力检测方法评估该化合物的生长抑制活性,报道的 IC50 值为 3 μM。STAT3 Y705 磷酸化和 c-Myc 表达可通过蛋白质印迹法进行评估。
动物实验
SI-109 的体内动物研究资料尚不完善。作为一种主要用于体外研究和 PROTAC 设计的研究工具,目前尚无针对 SI-109 的详细体内研究方案。对于含有 SI-109 的 PROTAC 分子,典型的体内研究采用小鼠异种移植瘤模型,在给药后评估肿瘤生长抑制情况。然而,这些研究反映的是 PROTAC 分子的特性,而非 SI-109 本身的特性。研究人员应查阅相关文献以获取具体的研究方案。
药代性质 (ADME/PK)
SI-109 的药代动力学数据报道较少。该化合物可溶于二甲基亚砜 (DMSO),分子量为 835.79。作为一种研究工具,其详细的 ADME 参数,包括口服生物利用度、半衰期和清除率,尚未得到充分表征。该化合物主要用于体外研究。如果计划进行体内应用,研究人员应自行开展药代动力学研究,以确定合适的给药方案和制剂。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
SI-109 的毒性数据未公开。与大多数研究化合物一样,尚未进行全面的毒理学研究。该化合物仅供实验室研究使用,操作时应采取适当的安全预防措施。应遵循标准的实验室安全操作规程,包括佩戴手套、实验服和护目镜。有关具体的操作和处置信息,请参阅材料安全数据表 (MSDS)。
参考文献

[1]. A Potent and Selective Small-Molecule Degrader of STAT3 Achieves Complete Tumor Regression In Vivo. Cancer Cell. 2019 Nov 11;36(5):498-511.e17.

其他信息
((2-(((5S,8S,10aR)-3-乙酰-8-(((S)-5-氨基-1-(苯基氨基)-1,5-二氧戊酸-2-基)氨基)-6-氧代十氢吡咯[1,2-a][1,5]二氮杂环-5-基)氨基)-1H-吲哚-5-基)二氟甲基)磷酸是一种强效的小分子STAT3 SH2结构域抑制剂。
SI-109是一种强效的STAT3 SH2结构域抑制剂(Ki = 9 nM),具有抗肿瘤活性。它以3 μM的IC50抑制STAT3转录活性。SI-109的一个关键特征是作为STAT3结合配体用于设计PROTAC STAT3降解剂,如SD-36,结合CRBN配体来那度胺。这使得SI-109成为直接抑制和靶向降解STAT3的宝贵工具。该化合物未进入临床试验,也未获得治疗使用的批准。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C40H44F2N7O9P
分子量
835.79
精确质量
835.29
CAS号
2429877-30-3
PubChem CID
139600322
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.49±0.1 g/cm3(Predicted)
LogP
1.3
tPSA
244
氢键供体(HBD)数目
7
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
13
重原子数目
59
分子复杂度/Complexity
1610
定义原子立体中心数目
4
SMILES
CC(=O)N1CC[C@H]2CC[C@H](N2C(=O)[C@H](C1)NC(=O)C3=CC4=C(N3)C=CC(=C4)C(F)(F)P(=O)(O)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)NC(C5=CC=CC=C5)C6=CC=CC=C6
InChi Key
HBICZHLVBCLHSV-VUCLUUCHSA-N
InChi Code
InChI=1S/C40H44F2N7O9P/c1-23(50)48-19-18-28-13-16-33(38(54)45-30(15-17-34(43)51)36(52)47-35(24-8-4-2-5-9-24)25-10-6-3-7-11-25)49(28)39(55)32(22-48)46-37(53)31-21-26-20-27(12-14-29(26)44-31)40(41,42)59(56,57)58/h2-12,14,20-21,28,30,32-33,35,44H,13,15-19,22H2,1H3,(H2,43,51)(H,45,54)(H,46,53)(H,47,52)(H2,56,57,58)/t28-,30+,32+,33+/m1/s1
化学名
[[2-[[(5S,8S,10aR)-3-acetyl-8-[[(2S)-5-amino-1-(benzhydrylamino)-1,5-dioxopentan-2-yl]carbamoyl]-6-oxo-1,2,4,5,8,9,10,10a-octahydropyrrolo[1,2-a][1,5]diazocin-5-yl]carbamoyl]-1H-indol-5-yl]-difluoromethyl]phosphonic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 150 mg/mL (179.47 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 7.5 mg/mL (8.97 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 75.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 7.5 mg/mL (8.97 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 75.0mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 7.5 mg/mL (8.97 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 75.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.1965 mL 5.9824 mL 11.9647 mL
5 mM 0.2393 mL 1.1965 mL 2.3929 mL
10 mM 0.1196 mL 0.5982 mL 1.1965 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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