Tridecanedioic acid

别名: 十三碳二元酸; 十三烷二酸;Tridecanedioic Acid 十三烷二酸;十三酸;十三碳二酸;1,11-十一烷二羧酸;十三碳二元酸
目录号: V72634 纯度: ≥98%
十三烷二酸是一种内源性产生的代谢物。
Tridecanedioic acid CAS号: 505-52-2
产品类别: Endogenous Metabolite
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
十三烷二酸是一种内源性代谢产物。
十三烷二酸(巴西酸,1,11-十一烷二羧酸)是一种奇数碳二羧酸,分子式为C13H24O4,分子量为244.33。它是一种内源性代谢产物,出现在新生儿肾上腺脑白质营养不良症和泽尔维格综合征患儿的尿液中,可作为这些过氧化物酶体疾病的标志物。十三烷二酸也是植物抗虫性的生物标志物,以及代谢性疾病的潜在诊断标志物。该化合物与非酒精性脂肪性肝病(NASH)的代谢调控相关,并可能在肠道菌群-宿主代谢相互作用网络中发挥作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
Tridecanedioic acid targets multiple signaling pathways including PI3K/AKT/mTOR, TNF-alpha/NF-kappa B, and JNK-p38. It inhibits pancreatitis by preventing the conversion of fatty acids into prostaglandins, and exhibits broad-spectrum antimicrobial activity against Gram-positive bacteria including Clostridium perfringens and Staphylococcus aureus. It is also used in the synthesis of bis(tetrahydroisoquinolines) that are cytotoxic to cancer cells but less toxic to healthy cells. The compound is an endogenous metabolite involved in fatty acid oxidation and peroxisomal function.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,十三烷二酸可用于合成双(四氢异喹啉)类化合物,该类化合物对癌细胞培养物(例如HCT-116结肠癌细胞)具有高细胞毒性,并且对革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌以及白色念珠菌等真菌菌株具有显著的抗菌活性。该化合物本身是一种内源性代谢产物,已被证明可在细胞模型中抑制胰腺炎,其机制可能是通过抑制脂肪酸转化为前列腺素。此外,它还对产气荚膜梭菌和金黄色葡萄球菌等革兰氏阳性菌具有广谱抗菌活性。
体内研究 (In Vivo)
在体内,十三烷二酸已在临床上用于治疗皮肤萎缩和甲状腺激素抵抗,展现了其在皮肤病学和内分泌学领域的潜在应用价值。它在植物抵御小菜蛾(Plutella xylostella)感染的防御反应中发挥着重要作用。在动物模型中,十三烷二酸被用作代谢性疾病(如泽尔维格综合征和新生儿肾上腺脑白质营养不良)的生物标志物,这些疾病中由于过氧化物酶体功能障碍,十三烷二酸会在尿液中积累。它还与非酒精性脂肪性肝病(NASH)的代谢调控相关,并且可能是肠道菌群-宿主代谢相互作用网络中的一个重要节点分子。
酶活实验
对于非细胞分析(分析定量),十三烷二酸配制成甲醇储备液(1 mg/mL)。对于 GC-MS 分析,样品用 BSTFA(N,O-双(三甲基硅烷基)三氟乙酰胺)衍生化,生成 TMS 衍生物。对于 LC-MS/MS 分析,在人血浆或尿液中制备校准曲线(0.1-1000 ng/mL)。样品制备:500 uL 血浆 + 1 mL 乙腈用于蛋白质沉淀。离心后,蒸发上清液,并用流动相(0.1% 甲酸水溶液和乙腈,70:30,v/v)复溶。分离在 C18 色谱柱上进行。MRM 转换:十三烷二酸 243.3→225.3(失去 H2O)和 243.3→197.3。对于前列腺素合成抑制试验,可以使用无细胞酶系统(环氧合酶),其使用方法与其他二羧酸类似。
细胞实验
对于基于细胞的检测,将胰腺腺泡细胞(例如 AR42J 细胞)或癌细胞(例如 HCT-116 结肠癌细胞)接种于 6 孔板中(1×10⁶ 个细胞/孔),培养基为含 10% FBS 的 DMEM。用十三烷二酸(0.1-100 uM)处理细胞 24-72 小时。采用 MTT 法评估细胞活力。对于胰腺炎研究,先用十三烷二酸预处理细胞 2 小时,然后用胰泌素(100 nM)或脂肪酸刺激以诱导急性胰腺损伤。采用 ELISA 法测定培养上清液中的前列腺素 E2 (PGE2) 水平。对于抗菌研究,将细菌培养物(例如产气荚膜梭菌、金黄色葡萄球菌)培养于 Mueller-Hinton 肉汤中,并通过系列稀释法测定最小抑菌浓度 (MIC)。采用 MTT 法,用由十三烷二酸合成的双(四氢异喹啉)衍生物处理癌细胞后,评估其细胞毒性。
动物实验
在体内动物实验中,通常使用代谢性疾病的啮齿动物模型。例如,在泽尔维格综合征的研究中,使用过氧化物酶体缺陷小鼠(例如,PEX5基因敲除小鼠),并通过液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)检测尿液和血浆中的十三烷二酸水平,作为疾病生物标志物。在胰腺炎的研究中,小鼠在用胰泌素(50 μg/kg,腹腔注射,每小时一次,持续6小时)诱导胰腺炎前1小时,腹腔注射十三烷二酸(10-50 mg/kg)。检测血清淀粉酶和脂肪酶水平,并收集胰腺组织进行组织学分析(苏木精-伊红染色)和通过酶联免疫吸附试验(ELISA)检测炎症细胞因子(IL-6、TNF-α)。在植物研究中,用小菜蛾(Plutella xylostella)感染甘蓝植株,并通过液相色谱-质谱法(LC-MS)检测植物组织中的十三烷二酸水平,以评估植物的防御反应。
药代性质 (ADME/PK)
十三烷二酸的分子量为244.33,熔点为112-114℃,沸点在15 mmHg下约为260℃。它是一种白色至类白色固体粉末。该化合物可溶于DMSO(25 mg/mL)、乙醇(30 mg/mL)和甲醇,但在水中的溶解度有限。其pKa值约为4.5和5.5(两个羧酸基团)。粉末应在-20℃下保存长达3年,溶液应在-80℃下保存长达6个月,或在-20℃下保存长达1个月。该化合物在正常储存条件下稳定,应防潮。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
十三烷二酸急性毒性较低。作为一种内源性代谢产物,它在人体尿液中的浓度很低(微克/升),因此通常认为在生理浓度下无毒。动物研究表明,剂量高达 100 mg/kg 时耐受性良好。该化合物未被列为危险物质。操作有机酸时应遵循标准的实验室安全预防措施,包括使用个人防护装备 (PPE) 和在通风良好的区域工作。目前尚未有关于其严重不良反应的报道。
其他信息
十三烷二酸是一种α,ω-二羧酸,由十一烷在C-1和C-11位被羧酸基团取代而形成。它是一种代谢产物。拟南芥和短角锥虫中均有十三烷二酸的报道,相关数据可供参考。
十三烷二酸是一种研究化合物和内源性代谢产物,并非已获批准的药物。它尚未进行过用于治疗的临床试验。其主要用途包括:在临床环境中用作过氧化物酶体疾病(新生儿肾上腺脑白质营养不良、泽尔维格综合征)的诊断生物标志物;作为研究非酒精性脂肪性肝病 (NASH) 和肠道菌群-宿主代谢的工具;以及作为合成具有细胞毒性和抗菌活性的双(四氢异喹啉)衍生物的结构单元。在植物中,它是一种防御反应生物标志物。该化合物还被用作化妆品和制药行业的原料,用于合成增塑剂和合成润滑剂。仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C13H24O4
分子量
244.33
精确质量
244.167
CAS号
505-52-2
PubChem CID
10458
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.1±0.1 g/cm3
沸点
422.5±18.0 °C at 760 mmHg
熔点
111 °C
闪点
223.5±17.7 °C
蒸汽压
0.0±2.1 mmHg at 25°C
折射率
1.475
LogP
3.46
tPSA
74.6
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
12
重原子数目
17
分子复杂度/Complexity
192
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(CCCCCC(=O)O)CCCCCC(=O)O
InChi Key
DXNCZXXFRKPEPY-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C13H24O4/c14-12(15)10-8-6-4-2-1-3-5-7-9-11-13(16)17/h1-11H2,(H,14,15)(H,16,17)
化学名
tridecanedioic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 100 mg/mL (409.28 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (10.23 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (10.23 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.0928 mL 20.4641 mL 40.9283 mL
5 mM 0.8186 mL 4.0928 mL 8.1857 mL
10 mM 0.4093 mL 2.0464 mL 4.0928 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们