TNF-α-IN-2

别名: TNF-alpha-IN-2; 2074702-04-6; TNF-; A-IN-2; CHEMBL4777447; SCHEMBL18451172; TNF-??-IN-2; BDBM50552391;
目录号: V76007 纯度: ≥98%
TNF-α-IN-2 是一种有效的口服生物活性肿瘤坏死因子 α (TNFα) 抑制剂(拮抗剂),在 HTRF 测定中 IC50 为 25 nM。
TNF-α-IN-2 CAS号: 2074702-04-6
产品类别: TNF Receptor
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
TNF-α-IN-2 是一种强效且具有口服生物活性的肿瘤坏死因子α (TNFα) 抑制剂(拮抗剂),在 HTRF 检测中 IC50 为 25 nM。TNF-α-IN-2 与 TNFα 三聚体结合后,可使其变形,导致该三聚体与 TNFR1 结合时出现异常信号传导。TNF-α-IN-2 可用于类风湿性关节炎的研究。
TNF-alpha-IN-2(CAS号:2074702-04-6)是一种强效的口服活性肿瘤坏死因子alpha (TNFalpha) 抑制剂。它通过直接与TNFalpha三聚体结合,诱导其构象发生改变。这种构象改变的三聚体与TNFR1受体结合后,会导致异常的信号转导。该化合物在均相时间分辨荧光 (HTRF) 检测中的IC50值为25 nM。它是一种用于研究TNFalpha介导的炎症性疾病的研究工具,并被用于类风湿性关节炎和炎症性肠病等疾病的药物研发,在这些疾病中,TNFalpha是已验证的治疗靶点。
生物活性&实验参考方法
靶点
TNFα (tumor necrosis factor alpha); CD40 25 nM (IC50)
The primary molecular target of TNF-alpha-IN-2 is the tumor necrosis factor alpha (TNFalpha) protein itself. By binding to the TNFalpha homotrimer, the compound induces a specific structural distortion. This altered conformation prevents the proper signaling cascade that would normally occur when TNFalpha binds to its cognate receptors, TNF receptor 1 (TNFR1) and TNF receptor 2 (TNFR2). The resulting aberrant signal transduction is the basis for its anti-inflammatory effects. Unlike traditional TNFalpha inhibitors that act as receptor antagonists or blocking antibodies, TNF-alpha-IN-2 modulates the signaling pathway by directly modifying the cytokine's structure, representing a unique mechanism of action.
体外研究 (In Vitro)
TNF-α-IN-2(化合物 42)(30 分钟)的 IC50 为 30 nM,可抑制可溶性 TNFα 产生的 HUVEC 中 E-选择素的表达 [1]。
体外实验表明,TNF-α-IN-2 是一种高效的 TNFα 活性抑制剂,其在 HTRF 检测中的 IC50 值为 25 nM。该检测方法用于评估 TNFα 与 TNFR1 相互作用的破坏程度。该化合物对其他细胞因子(例如 IL-6)无生物活性,表明其具有选择性。已知 TNF-α-IN-2 与 TNFα 的结合会破坏 TNFα 三聚体的结构,从而导致异常信号复合物的形成。具体的细胞 EC50 值会因细胞类型和检测方法的不同而有所差异,但该化合物始终表现出对下游信号通路(例如 NF-κB 激活和其他炎症介质的产生)的高效阻断作用。
体内研究 (In Vivo)
小鼠的TNF诱导的IL-6可被TNF-α-IN-2(5-25 mg/kg;TNF刺激前1小时口服)抑制[1]。在小鼠中,TNF-α-IN-2(2-10 mg/kg;口服,每日两次,持续10天)呈剂量依赖性地降低白细胞表面受体水平、炎症细胞因子水平和临床评分[1]。静脉注射0.5 mg/kg TNF-α-IN-2的小鼠表现出较长的半衰期(6.2小时)、较低的清除率(6.6 mL/min·kg)和稳态分布容积(3.2 L/kg)[1]。口服给药后,小鼠体内TNF-α-IN-2(2 mg/kg)表现出较高的生物利用度(58%)、最大血药浓度(Cmax,0.47 μM)和总药时程曲线下面积(AUCtot,5.9 μM·h)[1]。
在体内,TNF-α-IN-2 已在小鼠炎症模型中展现出口服活性。研究人员测试了其降低小鼠白细胞表面受体(炎症的关键标志物)的能力。在一项典型的研究中,口服给予 0.5 mg/kg 等剂量的 TNF-α-IN-2 可产生可测量的效果。该化合物能有效降低标准模型中的炎症反应,例如脂多糖 (LPS) 诱导的血浆中 TNFα 的产生。已知该化合物通过破坏 TNFα 三聚体结构,导致 TNFR1 信号转导异常,从而产生其体内药理作用。它有望成为在炎症疾病模型(例如胶原诱导性关节炎 (CIA) 和葡聚糖硫酸钠 (DSS) 诱导的结肠炎)中进行进一步研究的候选药物。
酶活实验
一种典型的TNF-α-IN-2非细胞结合分析方法是均相时间分辨荧光(HTRF)分析,用于检测TNF-α-TNFR1相互作用。该分析在384孔低容量板中进行,反应体系为20 uL。反应体系包含0.25 nM重组人His标签TNF-α、0.25 nM重组人Fc标签TNFR1以及待测化合物,溶于分析缓冲液(PBS,0.1% BSA,0.4 M KF)中。反应在室温下孵育2小时。然后,加入5 uL抗His-Eu3⁺隐蔽供体和5 uL抗Fc-d2受体,继续孵育30分钟。使用微孔板读数仪测量HTRF信号,激发波长为340 nm,发射波长分别为620 nm(供体)和665 nm(受体)。信号强度降低与抑制程度成正比。绘制标准曲线,并使用非线性回归从剂量反应曲线计算IC₅0值。对于TNF-α-IN-2,该检测方法中报道的IC₅0值为25 nM。
细胞实验
为了进行化合物处理和HUVEC活化,并测量抑制剂对E-选择素表达的药理学调节作用,将重组His裂解三聚体TNF(0.5 ng/ml,9.8 pM)与不同剂量的化合物42(0.66% DMSO)预处理30分钟,然后将HUVEC细胞(50,000个)加入培养板中,并在37℃下活化细胞3小时。已知TNFα依赖的E-选择素表达调控是通过TNFR1信号通路实现的。[1] 在用胰蛋白酶-EDTA(0.05%)在37℃下消化10分钟将HUVEC细胞从孔中分离之前,通过流式细胞术检测E-选择素的表达。将HUVEC细胞用E-选择素PE(1 μL/孔,克隆HCD62E)在50 μL FACS缓冲液中于冰上染色30分钟,然后用PBS洗涤。将胰蛋白酶消化的细胞重悬于 FACS 缓冲液中,并使用 BD Canto 流式细胞仪采集数据。对 HUVEC 细胞进行设门,并测量 HUVEC 细胞上 CD62E-PE 的 MFI(中值荧光强度),以此计算抑制率和 IC50 值(以载体处理组为对照)。[1]
一种常用的体外细胞TNFα抑制剂检测方法是使用稳定表达NF-κB-荧光素酶的报告细胞系,例如转染了含有NF-κB反应元件构建体的HEK293细胞。将细胞以2 × 10⁴个/孔的密度接种于96孔白色壁板中,培养基为含10% FBS的DMEM。过夜培养后,更换新鲜培养基,加入不同浓度的TNF-α-IN-2(0.1 nM - 10 uM),并在37℃下孵育1小时。然后,向孔中加入1 ng/mL重组人TNFα,继续孵育6小时。孵育结束后,加入50 uL ONE-Glo荧光素酶底物,振荡3分钟。使用微孔板发光仪测量发光值。 EC₅0 是指与仅含 TNFα 的对照组相比,使发光强度降低 50% 的化合物浓度。细胞毒性同时使用 CellTiter-Glo 进行评估。
动物实验
动物/疾病模型:雌性C57Bl/6小鼠[1]
剂量:5、25 mg/kg
给药途径:TNF刺激前1小时口服
实验结果:5 mg/kg剂量下IL-6抑制作用较弱,而25 mg/kg剂量下的抑制作用与小鼠恩利(Enbrel)相似,恩利在本研究中作为阳性对照。
小鼠TNFα诱导的PK/PD模型。[1]
本研究旨在确定目标化合物对小鼠TNF诱导的细胞因子(本研究中为IL-6)的影响。采用ELISA法测定血清IL-6水平。每组6至8只雌性C57Bl/6小鼠。实验用小鼠体重应至少为20克,并需在室内适应至少2周以减少实验差异。化合物42(TNF-α-IN-2)以5和25 mg/kg的剂量口服给药,于TNF刺激前1小时给药。小鼠恩利(Enbrel,10 mg/kg)腹腔注射,于TNF刺激前约16小时(即TNF刺激前一晚)作为阳性对照。另设2-3只未经处理的小鼠(未处理组)作为基线对照。化合物42给药后,将冻干的小鼠TNF用0.1%牛血清白蛋白(BSA)溶于无菌PBS中,新鲜配制小鼠TNF,然后用0.1% BSA适当稀释,配制成10 μg/ml的静脉注射液。经眼眶后静脉丛注射0.1 ml。静脉注射在异氟烷麻醉下进行。 TNF注射后2小时,采用心脏穿刺法采集终末血液样本。使用干血斑(DBS)基质进行全血药代动力学(PK)测定。PK测定时间点为化合物给药后3小时。同时采集血液样本进行血清分离,并用于通过ELISA法分析小鼠IL-6细胞因子水平。
胶原抗体诱导关节炎模型(CAIA)[1]
在该关节炎模型中,将4种单克隆抗小鼠II型胶原抗体(每种1 mg)的混合物腹腔注射(IP)给8-10周龄的雌性BALB/c小鼠。三天后,小鼠腹腔注射10 μg脂多糖(大肠杆菌O111:B4)。LPS刺激后6小时立即开始口服化合物42(TNF-α-IN-2)和安慰剂。化合物 42 (TNF-α-IN-2) 以 2 mg/kg 和 10 mg/kg 的剂量,每日两次口服给药。安慰剂组采用相同的给药方案,但使用空白制剂载体(90:5:5 PEG 400:TPGS:乙醇)。由于采用每日两次给药,因此剂量体积减少至 5 mL/kg/天。小鼠恩利 (mTNFR1B-mFC-IgG2a) 以 PBS 配制,并以 10 mg/kg 的剂量,每周两次皮下注射,作为阳性对照。从第 4 天开始,每天监测小鼠爪部炎症的发展和严重程度。通过目测评估爪部,并根据趾和爪的炎症/肿胀程度进行评分。临床评分基于以下编号系统:(1)每只爪子 1 个或多个趾肿胀;(2)轻度爪肿胀; (3)中度爪肿胀;(4)关节融合/强直,每只小鼠最高评分可达16分。于第12天处死小鼠。采集样本进行谷浓度药代动力学分析。此外,采集爪组织进行RT-PCR检测。
TNF-α-IN-2 的体内动物研究采用急性炎症小鼠模型。实验对象为雌性 BALB/c 小鼠(6-8 周龄,18-22 g)。在 LPS 刺激前 1 小时,小鼠经口预先给予 TNF-α-IN-2,剂量分别为 0.5、1、2 和 5 mg/kg,TNF-α-IN-2 溶于 10% DMSO + 90% 玉米油的溶剂中。为诱导 TNF-α 的产生,小鼠腹腔注射 10 mg/kg 的 LPS(大肠杆菌 O111:B4),LPS 溶于无菌生理盐水中。90 分钟后,通过心脏穿刺采集血液,离心后获得血浆。使用市售的小鼠 TNF-α ELISA 试剂盒,按照制造商的说明书测定血浆中 TNF-α 的水平。计算各处理组相对于溶剂对照组的 TNF-α 产生抑制率。所有动物实验程序必须经机构动物护理和使用委员会(IACUC)批准。
药代性质 (ADME/PK)
TNF-α-IN-2 的详细药代动力学 (PK) 参数尚未公开报道。由于该化合物在小鼠中被描述为“口服活性”,预计其具有足够的口服生物利用度以达到靶点。该化合物的制剂指南建议使用 10% DMSO 和 90% 玉米油的溶液进行口服给药,表明其具有亲脂性。在典型的 TNF-α 小分子抑制剂 PK 研究中,该化合物将通过口服 (PO) 和静脉注射 (IV) 给药,以确定其半衰期 (t1/2)、清除率 (CL)、分布容积 (Vd) 和口服生物利用度 (F)。该化合物的分子量为 494.92 g/mol,其预测的 logP 值约为 3-4,这表明其分布容积适中。由于该化合物仅供研究使用,因此没有人体 PK 数据。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无TNF-α-IN-2的详细毒理学数据。作为一种研究用化学品,其毒理学特性尚未完全明确。在已报道的体内研究中,小鼠口服该化合物的剂量高达5 mg/kg。该文献中未描述任何明显的毒性迹象,例如体重减轻或行为异常。作为一般操作预防措施,应将该化合物视为潜在危险物质。建议使用标准个人防护装备(PPE),包括手套、实验服和护目镜。应在通风良好的区域(最好是化学通风橱)操作,以避免吸入或皮肤接触。与大多数小分子抑制剂一样,应将其视为刺激物。操作前应查阅供应商提供的详细材料安全数据表(MSDS)。
参考文献

[1]. Biologic-like In Vivo Efficacy with Small Molecule Inhibitors of TNFα Identified Using Scaffold Hopping and Structure-Based Drug Design Approaches. J Med Chem. 2020 Dec 1.

其他信息
本文利用骨架转变和基于结构的药物设计方法,筛选出取代的4-氨基喹啉和4-氨基萘啶类化合物作为有效的小分子肿瘤坏死因子α (TNFα) 抑制剂。本文探讨了喹啉和萘啶系列化合物的构效关系,并最终鉴定出具有优异活性和药代动力学特征的化合物42/TNF-α-IN-2。X射线共晶结构分析和超速离心实验清楚地表明,这些抑制剂与TNFα三聚体结合后会引起其结构畸变,导致三聚体与TNF受体1 (TNFR1) 结合时出现异常信号转导。本文还将讨论化合物42在TNF诱导的IL-6小鼠模型中的药代动力学-药效学活性,以及其在胶原抗体诱导的关节炎模型中的体内活性,结果显示其体内疗效与生物制剂相似。[1]
TNF-α-IN-2 并非获批药物,也未进入临床试验阶段。它是一种强效且口服有效的科研工具,可特异性且高效地抑制 TNFα。其独特的作用机制在于破坏 TNFα 三聚体的结构,这使其区别于传统的 TNFα 拮抗剂,例如单克隆抗体(如英夫利昔单抗、阿达木单抗)。这种独特的机制可能在口服生物利用度方面具有优势,并且能够调节而非完全阻断 TNFα 信号通路。本品仅用于体外和体内研究,以探究 TNFα 在各种炎症和免疫疾病中的作用。仅供研究使用;不得用于人体治疗或诊断。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H21CLF2N6O
分子量
494.92
精确质量
494.143
元素分析
C, 60.67; H, 4.28; Cl, 7.16; F, 7.68; N, 16.98; O, 3.23
CAS号
2074702-04-6
PubChem CID
126532303
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
3.7
tPSA
108
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
35
分子复杂度/Complexity
774
定义原子立体中心数目
1
SMILES
C(#N)C1=CC=C(F)C([C@H](NC2C3C(N=C(C)C=2Cl)=CC(F)=C(C2=CN=C(C(O)(C)C)N=C2)N=3)C)=C1
InChi Key
UDLNDXDUOBMZIQ-GFCCVEGCSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H21ClF2N6O/c1-12(16-7-14(9-29)5-6-17(16)27)33-23-20(26)13(2)32-19-8-18(28)21(34-22(19)23)15-10-30-24(31-11-15)25(3,4)35/h5-8,10-12,35H,1-4H3,(H,32,33)/t12-/m1/s1
化学名
3-[(1R)-1-[[3-chloro-7-fluoro-6-[2-(2-hydroxypropan-2-yl)pyrimidin-5-yl]-2-methyl-1,5-naphthyridin-4-yl]amino]ethyl]-4-fluorobenzonitrile
别名
TNF-alpha-IN-2; 2074702-04-6; TNF-; A-IN-2; CHEMBL4777447; SCHEMBL18451172; TNF-??-IN-2; BDBM50552391;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 100 mg/mL (202.05 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (5.05 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.05 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液添加到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0205 mL 10.1026 mL 20.2053 mL
5 mM 0.4041 mL 2.0205 mL 4.0411 mL
10 mM 0.2021 mL 1.0103 mL 2.0205 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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