TNF-α-IN-6

别名: 3-[[6-[2-[(8aR)-六氢-3-氧代咪唑[1,5-a]吡嗪-7(1H)-基]-5-嘧啶基]-2,3-二氢 -2,2-二甲基-3-氧代-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-1-基]甲基]-2-吡啶甲腈
目录号: V76008 纯度: ≥98%
TNF-α-IN-6 是一种口服生物可利用的 TNFα 变构抑制剂 (KD = 6.8 nM)。
TNF-α-IN-6 CAS号: 2699704-20-4
产品类别: TNF Receptor
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
TNF-α-IN-6 是一种口服生物利用度高的 TNFα 变构抑制剂(KD = 6.8 nM)。
TNF-alpha-IN-6(CAS号:2699704-20-4)是一种口服有效的肿瘤坏死因子alpha(TNFalpha)变构抑制剂。它是一种小分子,能以高亲和力与TNFalpha结合,其解离常数(KD)为6.8 nM。该化合物通过与TNFalpha三聚体上的变构位点结合,诱导构象变化,从而改变其与受体的相互作用,最终产生强效的抗炎作用。TNF-alpha-IN-6被归类为TNF受体调节剂,并被用作炎症和自身免疫性疾病研究的工具,尤其适用于类风湿性关节炎和银屑病等TNFalpha是关键致病介质的疾病。
生物活性&实验参考方法
靶点
TNF-alpha-IN-6 targets the TNFalpha protein directly, but through an allosteric mechanism. The compound binds to the TNFalpha homotrimer at a site distinct from the receptor-binding interface. This allosteric binding induces conformational changes within the TNFalpha trimer, which ultimately leads to a reduced ability of the cytokine to bind and activate its receptors, TNFR1 and TNFR2. The KD value of 6.8 nM indicates a very high binding affinity. This allosteric inhibition is distinct from orthosteric inhibitors that directly compete for the receptor-binding site, offering a novel mode of pharmacological intervention for TNFalpha-mediated diseases.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,TNF-α-IN-6 是一种高效的 TNFα 抑制剂。通过表面等离子共振 (SPR) 测定,其解离常数 (KD) 为 6.8 nM,表明该化合物具有很强的结合亲和力。该化合物表现出变构作用模式,即它与 TNFα 三聚体上一个不同于主要受体结合界面的位点结合。这种结合导致构象变化,从而降低 TNFα 激活其下游信号通路的能力。体外抗炎活性评估显示,该化合物能显著降低脂多糖 (LPS) 刺激的外周血单核细胞 (PBMC) 产生的促炎细胞因子。这些细胞实验的确切 IC₅0 值尚未公开,但可能在低纳摩尔范围内。
体内研究 (In Vivo)
在体内,TNF-α-IN-6 被描述为一种口服有效的变构 TNFα 抑制剂。它已在多种炎症动物模型中进行了测试,例如胶原诱导性关节炎 (CIA) 小鼠模型(一种标准的类风湿性关节炎模型)。预计口服该化合物可降低这些模型中的临床评分、爪肿胀和关节破坏。该化合物还在脓毒症和急性炎症模型中进行了评估,预计可降低 TNFα 水平并提高生存率。该化合物在体内与 TNFα 高亲和力结合并改变其构象的能力是其抗炎活性的基础,为治疗 TNFα 驱动的疾病提供了一种独特的药理学策略。
酶活实验
用于检测 TNF-α-IN-6 与 TNF-α 结合亲和力的典型非细胞结合分析方法是表面等离子共振 (SPR)。本实验使用 Biacore SPR 仪器。重组人 TNF-α 通过标准胺偶联化学方法固定在 CM5 传感器芯片上。TNF-α-IN-6 配制于运行缓冲液(10 mM HEPES,pH 7.4,150 mM NaCl,0.005% Tween-20)中,浓度范围为 0.1 - 100 nM。将分析物以 30 uL/min 的流速注入到 TNF-α 包被的芯片表面,持续 120 秒以进行结合,随后进行 300 秒的解离。在每个循环之间,用 10 uL 10 mM 甘氨酸-HCl 溶液(pH 2.0)再生芯片表面。传感器图谱采用空白表面和仅含缓冲液的注射液进行双重参考。稳态响应单位 (RU) 拟合到 1:1 结合模型,以计算结合速率常数 (ka)、解离速率常数 (kd) 和平衡解离常数 (KD)。已报道的 TNF-α-IN-6 的 KD 为 6.8 nM。
细胞实验
典型的体外细胞TNF-α-IN-6检测方法使用人单核细胞系THP-1。细胞在添加了10%胎牛血清(FBS)和1%青霉素-链霉素的RPMI-1640培养基中,于37℃、5% CO2条件下培养。检测时,将THP-1细胞以1 × 10⁵个细胞/孔的密度接种于96孔板中,并用100 nM佛波醇酯(PMA)处理48小时,诱导其分化为巨噬细胞样细胞。之后更换不含PMA的新鲜培养基,细胞静置24小时。加入不同浓度(0.1 nM - 10 uM)的TNF-α-IN-6,预孵育1小时。最后,用1 ug/mL脂多糖(LPS)刺激细胞24小时。刺激后,收集培养上清液,并使用市售高灵敏度TNFα ELISA试剂盒测定人TNFα的浓度。EC₅0是指与仅用LPS处理的对照组相比,使TNFα产生量降低50%的化合物浓度。细胞活力采用MTT法或CellTiter-Glo法进行评估。
动物实验
TNF-α-IN-6 的体内动物研究通常采用胶原诱导性关节炎 (CIA) 模型,以 8 周龄雄性 DBA/1J 小鼠为模型。在第 0 天,小鼠尾根部皮内注射 100 μL 含有 100 μg 牛 II 型胶原蛋白和弗氏完全佐剂 (CFA) 的乳剂进行免疫。在第 21 天,注射 100 μg 胶原蛋白和弗氏不完全佐剂 (IFA) 进行加强免疫。从第 21 天起,将 TNF-α-IN-6 配制成赋形剂(例如,0.5% 甲基纤维素或 10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80、45% 生理盐水),并以 1、3 和 10 mg/kg 的剂量每日口服一次。每日监测小鼠的关节炎临床症状,根据肿胀和发红程度对每只爪子进行0至4分的评分。每周两次使用游标卡尺测量爪子厚度。研究结束时(第42天),处死小鼠,收集爪子进行组织病理学分析(苏木精-伊红染色和番红O染色),以评估关节炎症、滑膜形成和软骨损伤。采集血液样本,通过ELISA法分析血清细胞因子(TNFα、IL-1β、IL-6)。所有动物实验均需事先获得IACUC批准。
药代性质 (ADME/PK)
TNF-α-IN-6 的详细药代动力学特性尚未公开。由于该化合物在动物模型中被描述为“口服有效”,预计其在小鼠体内具有可接受的口服生物利用度。该化合物的分子量为 495.54 g/mol,预计具有亲脂性,这可能有助于其良好的膜渗透性。在典型的变构 TNFα 抑制剂药代动力学研究中,该化合物将通过静脉注射 (IV) 和口服 (PO) 两种途径给药于小鼠。将在多个时间点(例如,给药后 0、0.25、0.5、1、2、4、6、8、12 和 24 小时)采集血样。血浆浓度将通过液相色谱-串联质谱法 (LC-MS/MS) 进行分析。关键参数,包括血浆峰浓度 (Cmax)、达峰时间 (Tmax)、末端半衰期 (t1/2)、清除率 (CL)、分布容积 (Vd) 和口服生物利用度 (F),将采用非房室模型分析进行计算。目前尚无人体药代动力学数据。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚未有关于TNF-α-IN-6的毒理学数据报道。作为一种研究化合物,它尚未经过全面的监管毒理学研究。在已报道的疗效研究中,该化合物在测试剂量下可能具有良好的耐受性,因为未提及明显的毒性迹象。其肝毒性、肾毒性或其他器官特异性毒性的可能性仍不清楚。研究人员在处理该化合物时应遵循标准安全规程。建议在通风橱内操作,并使用个人防护装备(PPE),包括丁腈手套、实验服和护目镜。如接触皮肤,请立即用肥皂和水清洗。如接触眼睛,请用清水彻底冲洗15分钟,必要时就医。仅供研究使用;不得用于人体治疗。
参考文献

[1]. Development of Orally Efficacious Allosteric Inhibitors of TNFα via Fragment-Based Drug Design. J Med Chem. 2021 Jan 14;64(1):417-429.

其他信息
TNF-α-IN-6 并非已获批准的药物,也未进行临床开发。它是一种研究级小分子,是研究 TNFα 生物学及其在炎症性疾病中作用的重要工具。其独特的变构作用机制,使其与 TNFα 的结合亲和力 (KD) 为 6.8 nM,与传统的 TNFα 抑制剂相比,具有独特的药理学特征。它被用于药理学研究,以探索调节 TNFα 信号通路的新策略,这有望开发出用于治疗类风湿性关节炎、炎症性肠病 (IBD) 和银屑病等疾病的新型口服疗法。仅供研究使用;不得用于人体诊断或治疗。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C26H25N9O2
分子量
495.54
精确质量
495.213
CAS号
2699704-20-4
PubChem CID
162641389
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
1.3
tPSA
131
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
37
分子复杂度/Complexity
942
定义原子立体中心数目
1
SMILES
C1(C#N)=NC=CC=C1CN1C2=NC(C3=CN=C(N4CCN5C(=O)NC[C@]5([H])C4)N=C3)=CC=C2C(=O)C1(C)C
InChi Key
RUVSMFOFQJDXHE-GOSISDBHSA-N
InChi Code
InChI=1S/C26H25N9O2/c1-26(2)22(36)19-5-6-20(32-23(19)35(26)14-16-4-3-7-28-21(16)10-27)17-11-29-24(30-12-17)33-8-9-34-18(15-33)13-31-25(34)37/h3-7,11-12,18H,8-9,13-15H2,1-2H3,(H,31,37)/t18-/m1/s1
化学名
3-[[6-[2-[(8aR)-3-oxo-1,2,5,6,8,8a-hexahydroimidazo[1,5-a]pyrazin-7-yl]pyrimidin-5-yl]-2,2-dimethyl-3-oxopyrrolo[2,3-b]pyridin-1-yl]methyl]pyridine-2-carbonitrile
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 100 mg/mL (201.80 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.05 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80+,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0180 mL 10.0900 mL 20.1800 mL
5 mM 0.4036 mL 2.0180 mL 4.0360 mL
10 mM 0.2018 mL 1.0090 mL 2.0180 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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