NS2B/NS3-IN-3

目录号: V76097 纯度: ≥98%
NS2B/NS3-IN-3 (Compd 66) 是黄病毒 NS2B-NS3 蛋白酶的抑制剂(阻断剂/拮抗剂)。
NS2B/NS3-IN-3 CAS号: 2832876-90-9
产品类别: Virus Protease
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
50mg
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  • NS2B/NS3-IN-3 hydrochloride
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产品描述
NS2B/NS3-IN-3(化合物 66)是黄病毒 NS2B-NS3 蛋白酶的抑制剂(阻断剂/拮抗剂)。
NS2B/NS3-IN-3(CAS号:2832876-90-9)是一种寨卡病毒(ZIKV)NS2B/NS3蛋白酶的小分子抑制剂。该化合物已被证实是一种有效的抗病毒药物,能够抑制寨卡病毒的细胞复制。它是一系列旨在靶向病毒蛋白酶复合物的化合物之一,该复合物对病毒的生命周期至关重要。NS2B/NS3蛋白酶是黄病毒家族(包括登革病毒(DENV)、西尼罗河病毒(WNV)和黄热病毒(YFV))中保守的靶点,因此NS2B/NS3-IN-3是研究寨卡病毒生物学和其他黄病毒的重要研究工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary molecular target of NS2B/NS3-IN-3 is the NS2B/NS3 protease complex of the Zika virus. This protease is a serine protease (catalytic triad His, Asp, Ser) essential for processing the viral polyprotein. The viral RNA genome is translated as a single polyprotein that must be cleaved into individual viral proteins by host and viral proteases. The NS2B/NS3 protease complex is responsible for cleaving at several sites within the non-structural region. Inhibition of this protease blocks viral maturation and replication. NS2B/NS3-IN-3 is a competitive inhibitor that binds to the active site, preventing substrate cleavage. The compound shows selectivity for the viral protease over host proteases and is expected to have activity against other flaviviruses due to active site conservation.
体外研究 (In Vitro)
在 EC68 值为 1-3 μM 的细胞中,NS2B/NS3-IN-3(化合物 66)对寨卡病毒的细胞复制表现出强大的抗病毒作用[1]。
体外实验表明,NS2B/NS3-IN-3(化合物66)对寨卡病毒具有强效抗病毒活性。在细胞实验中,该化合物能有效抑制寨卡病毒复制,其EC₆₈值(达到最大抑制效果68%所需的浓度)为1-3 uM。虽然EC₅0值未明确列出,但该EC₆₈值范围表明其活性浓度在低微摩尔范围内。预计该化合物在有效浓度下对哺乳动物细胞无毒。通过使用纯化的NS2B/NS3蛋白酶进行的酶学实验证实了其确切的作用机制,结果表明该化合物能够抑制蛋白酶的活性。此外,该化合物预计对其他黄病毒(例如登革病毒(DENV))也具有活性。该化合物有望作为开发新型黄病毒抑制剂的阳性对照。
酶活实验
典型的非细胞蛋白酶抑制实验采用基于荧光共振能量转移(FRET)的方法,使用纯化的寨卡病毒(ZIKV)NS2B/NS3蛋白酶。该实验在96孔黑色板中进行。反应混合物(100 uL)包含50 mM Tris-HCl(pH 9.0)、20%甘油、1 mM CHAPS和200 nM纯化的ZIKV NS2B/NS3蛋白酶。加入不同浓度的NS2B/NS3-IN-3(0.01-100 uM),并在室温下预孵育15分钟。加入荧光底物(例如Boc-GRR-AMC,20 uM)启动反应。在37℃下,每30秒测量一次荧光强度(激发/发射波长380/460 nm),持续30分钟。计算初始线性速率(V0)。通过非线性回归,利用相对于 DMSO 对照的抑制百分比来确定 IC₅0。
细胞实验
一种标准的体外细胞抗病毒检测方法是使用感染寨卡病毒的Vero细胞。Vero细胞在含10%胎牛血清(FBS)的DMEM培养基中,于37℃、5% CO2条件下培养。将细胞以1 × 10⁴个/孔的密度接种于96孔板中。次日,更换培养基为含2% FBS的DMEM培养基。以0.1的感染复数(MOI)用寨卡病毒(例如MR766毒株)感染细胞1小时。去除未结合的病毒后,加入含有不同浓度(0.1-100 uM)待测化合物的新鲜培养基。48-72小时后,通过RT-qPCR定量上清液中的病毒RNA拷贝数来评估抗病毒活性。计算EC₅0值;报道的EC₆₈值为1-3 uM。未感染细胞的细胞活力(CC₅0)通过MTT法测定。
动物实验
可在AG129小鼠寨卡病毒感染模型中开展NS2B/NS3-IN-3的体内动物研究。将6-8周龄的雌性AG129小鼠腹腔注射(IP)10²-10³ PFU的鼠适应性寨卡病毒株(例如ZIKV-Dakar)。感染两小时后,将小鼠随机分组(n=10)。将NS2B/NS3-IN-3配制于溶剂(例如10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80、45%生理盐水)中,并以10、30和100 mg/kg的剂量,每日两次腹腔注射,连续5天。对照组注射溶剂。每日监测小鼠体重。第6天,处死部分小鼠;采集血液、脑、脊髓和睾丸组织,通过噬斑试验测定病毒滴度,并通过RT-qPCR定量RNA。剩余小鼠的存活情况将观察21天。所有操作均需获得IACUC批准。
药代性质 (ADME/PK)
NS2B/NS3-IN-3 的药代动力学 (PK) 特性尚未见报道。该化合物为小分子,分子量为 323.39 g/mol (C1₉H21N3O2),其分子量范围有利于口服吸收。其预测的 logP 值表明其具有中等亲脂性,有利于细胞膜渗透。目前尚无实验药代动力学数据,也缺乏人体药代动力学数据。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无NS2B/NS3-IN-3的毒理学数据。在基于细胞的试验中,该化合物在有效抗病毒浓度(EC₆₈ 1-3 μM)下预计具有良好的耐受性,表明其具有合理的治疗窗口。然而,尚未公布正式的细胞毒性数据(CC₅₀)。应遵循处理研究用化学品的标准安全预防措施。
参考文献

[1]. Synthesis, structure-activity relationship and antiviral activity of indole-containing inhibitors of Flavivirus NS2B-NS3 protease. Eur J Med Chem. 2021 Dec 5;225:113767.

其他信息
NS2B/NS3-IN-3 并非获批药物,也未进入临床试验阶段。它是一种研究工具,用于研究寨卡病毒和其他黄病毒的 NS2B/NS3 蛋白酶。其作用机制是抑制病毒蛋白酶,该蛋白酶是病毒复制所必需的酶。该化合物用于验证该蛋白酶作为药物靶点的有效性,并作为开发针对寨卡病毒及相关病毒的新型抗病毒药物的先导化合物。目前尚未注册任何临床试验。仅供研究使用;不得用于诊断或治疗用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H21N3O2
分子量
323.388944387436
精确质量
323.163
CAS号
2832876-90-9
相关CAS号
NS2B/NS3-IN-3 hydrochloride;2832876-91-0
PubChem CID
163409029
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
2.7
tPSA
70.1
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
24
分子复杂度/Complexity
438
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1CNCCC1CNC(=O)C2=CC3=C(N2)C=C(C=C3)C4=COC=C4
InChi Key
WTTOXJPIYYZQSP-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H21N3O2/c23-19(21-11-13-3-6-20-7-4-13)18-10-15-2-1-14(9-17(15)22-18)16-5-8-24-12-16/h1-2,5,8-10,12-13,20,22H,3-4,6-7,11H2,(H,21,23)
化学名
6-(furan-3-yl)-N-(piperidin-4-ylmethyl)-1H-indole-2-carboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 65 mg/mL (201.00 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 3 mg/mL (9.28 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 30.0 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80 +,混匀;然后加入450 μL 生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.0922 mL 15.4612 mL 30.9224 mL
5 mM 0.6184 mL 3.0922 mL 6.1845 mL
10 mM 0.3092 mL 1.5461 mL 3.0922 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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