XL388-C2-amide-PEG9-NH2 hydrochloride

目录号: V76343 纯度: ≥98%
XL388-C2-酰胺-PEG9-NH2 HCl 是一种用于制备/合成 C26 连接的雷帕霉素类似物的中间体。
XL388-C2-amide-PEG9-NH2 hydrochloride 产品类别: Others 13
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产品描述
XL388-C2-酰胺-PEG9-NH2 HCl 是制备/合成 C26 连接的雷帕霉素类似物的有用中间体。
XL388-C2-酰胺-PEG9-NH2盐酸盐是一种合成化学中间体,用于合成C26连接的雷帕霉素类似物。雷帕霉素(西罗莫司)是一种众所周知的环状内酯,可抑制雷帕霉素靶蛋白(mTOR),临床上用作免疫抑制剂和药物洗脱支架。XL388本身也是一种已知的mTOR抑制剂。该化合物包含一个PEG9(由9个乙二醇单元组成的聚乙二醇)连接基、一个酰胺键和一个末端NH2基团,使其适用于与其他分子(例如荧光标签、亲和配体或药物偶联物)偶联。该中间体用于研究目的,尤其是在开发基于雷帕霉素的化学生物学探针和靶向疗法方面。盐酸盐形式可提高溶解度和操作性。
生物活性&实验参考方法
靶点
XL388-C2-amide-PEG9-NH2 hydrochloride itself is not an active drug compound but a chemical intermediate. The intended target of the final synthesized product (C26-linked rapamycin analog) is the mechanistic target of rapamycin (mTOR), a serine/threonine protein kinase that regulates cell growth, proliferation, metabolism, and autophagy. Rapamycin and its analogs (rapalogs) bind to the FK506-binding protein 12 (FKBP12), and the resulting complex binds to and inhibits the mTOR complex 1 (mTORC1). The C26 position of rapamycin is a site that can be chemically modified without losing binding to FKBP12, allowing for the synthesis of novel rapamycin analogs with altered pharmacokinetic or targeting properties. The PEG9 linker in this intermediate provides increased solubility and flexibility, while the terminal NH2 group allows for conjugation to various reporter groups (e.g., biotin, fluorescent dyes, peptides, or antibodies). Thus, the final products derived from this intermediate target mTOR, a central regulator of cell growth and metabolism.
体外研究 (In Vitro)
中间体 XL388-C2-酰胺-PEG9-NH2 盐酸盐本身不具有生物活性,不能直接抑制 mTOR 或其他靶点。其活性在于可作为合成活性分子的结构单元。由该中间体合成的最终 C26 连接的雷帕霉素类似物有望保留雷帕霉素的 mTOR 抑制活性,该活性已得到广泛表征。mTOR 抑制的体外检测方法包括:通过蛋白质印迹法检测细胞裂解液中下游底物(如 p70S6 激酶 (p70S6K) 和 4E-BP1)的磷酸化水平;使用纯化的 mTOR 复合物进行激酶活性测定;或使用基于细胞的增殖测定。从该中间体衍生的最终产物中观察到的任何生物活性均应归因于完整的缀合物,而非中间体本身。出于研究目的,该中间体通常用作化学试剂,无需进一步的生物学表征。
体内研究 (In Vivo)
C57BL/6小鼠。
酶活实验
由于XL388-C2-酰胺-PEG9-NH2盐酸盐是一种不具有固有生物活性的化学中间体,因此没有标准的非细胞酶活性测定方法。该中间体可通过分析化学方法进行表征:高效液相色谱(HPLC)用于纯度评估(典型规格>95%);质谱(MS)用于确认分子量(C43H₆3ClFN₅O13S,精确质量约为944.50 g/mol);核磁共振(NMR)波谱用于确认结构(¹H NMR、¹3C NMR和二维NMR相关实验)。如果需要测试最终合成产物(一种C26连接的雷帕霉素类似物)的mTOR结合亲和力,则可以使用重组mTOR复合物和合适的底物进行标准的mTOR激酶活性测定。例如,体外激酶活性测定会用到纯化的mTOR、ATP和底物肽,并通过发光ADP检测试剂盒测量ADP的生成量,或通过ELISA或Western blot检测磷酸化底物来监测反应进程。然而,这类测定中并不使用中间体本身。
细胞实验
由于 XL388-C2-酰胺-PEG9-NH2 盐酸盐是一种化学中间体,因此目前尚无针对该化合物本身的标准体外细胞检测方法。然而,如果需要测试最终的缀合物(一种 C26 连接的雷帕霉素类似物),则可进行典型的 mTOR 抑制细胞检测。将细胞(例如 HEK293、HeLa、MCF-7 或原代细胞)在添加 10% FBS 的 DMEM 培养基中,于 37℃、5% CO2 条件下培养。将细胞接种于 6 孔板或 96 孔板中,待细胞汇合度达到 70-80% 后,用不同浓度的最终测试化合物(0.1-1000 nM)处理 4-24 小时。处理后,裂解细胞,并使用磷酸化特异性抗体通过蛋白质印迹法检测mTOR下游靶点(Thr389位的p70S6K、Thr37/46位的4E-BP1和Ser473位的AKT)的磷酸化状态。处理48-72小时后,使用MTT法或CellTiter-Glo发光细胞活力检测法检测细胞增殖。流式细胞术可用于评估细胞周期分布(例如,mTOR抑制诱导的G1期阻滞)。使用LDH释放或碘化丙啶染色评估细胞毒性。对于中间体本身,不进行此类检测。
动物实验
由于该中间体并非最终治疗药物,因此未进行体内动物研究。如果要对该中间体合成的最终C26连接的雷帕霉素类似物进行动物试验,则可采用雷帕霉素类似物的常规试验方案。例如,可使用携带皮下肿瘤异种移植瘤(例如HCT116结肠癌细胞或其他雷帕霉素敏感肿瘤)的雌性BALB/c裸鼠。当肿瘤体积达到约100-200 mm³时,将动物随机分组(每组n=5-10)。将测试化合物配制于合适的溶剂(例如5% DMSO、5% Tween-80、90%生理盐水)中,并以1-20 mg/kg的剂量,每日一次或隔日一次,连续给药14-21天,通过腹腔注射(IP)或灌胃给药。每隔2-3天使用游标卡尺测量肿瘤体积,肿瘤生长抑制率(TGI)计算为肿瘤体积相对于载体对照组的减少百分比。监测体重作为毒性指标。研究结束时,切除肿瘤并进行组织学或蛋白质印迹分析,以确认mTOR通路抑制(p-p70S6K和p-4E-BP1水平降低)。所有动物实验均需事先获得机构动物伦理委员会的批准。中间体本身不用于动物。
药代性质 (ADME/PK)
由于XL388-C2-酰胺-PEG9-NH2盐酸盐是一种化学中间体,没有计划用于体内,因此其药代动力学(PK)性质尚未进行研究。由该中间体合成的最终C26连接的雷帕霉素类似物的PK性质可能因缀合物的具体结构而异。雷帕霉素本身水溶性差,口服生物利用度低,需要特殊的制剂(例如纳米颗粒制剂或包合物)。雷帕霉素消除半衰期长(在人体内t1/2约为60小时),组织分布广泛,主要在肝脏中通过CYP3A4代谢。与雷帕霉素相比,引入PEG9连接基和末端NH2基团可能会改变溶解度、组织分布和消除半衰期,从而可能提高水溶性并改变生物分布。然而,目前尚无任何由该中间体衍生的缀合物的具体PK数据。该化合物仅供研究使用。不适用于人类管理。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于XL388-C2-酰胺-PEG9-NH2盐酸盐是一种化学中间体,不适用于体内实验,因此目前尚无其毒理学数据。操作时应遵循有机化合物的标准安全预防措施:穿戴合适的个人防护装备(PPE),包括手套、实验服和护目镜。避免吸入以及与皮肤和眼睛接触。操作应在通风良好的区域进行,最好在通风橱内。该化合物仅供实验室使用,切勿摄入或注射。如果该中间体衍生的最终产品拟用于体内实验,则必须根据相关法规指南进行全面的毒理学评估,包括急性、亚慢性和慢性毒性研究、遗传毒性试验以及生殖/发育毒性研究。仅供研究使用;不可用于人体治疗或诊断。
参考文献
[1]. Christopher Michael Semko, et al. C26-linked rapamycin analogs as mtor inhibitors. WO2019212991A1.
其他信息
XL388-C2-酰胺-PEG9-NH2盐酸盐并非药物,也未获准用于任何人体用途。它是一种合成化学中间体,仅用于合成C26连接的雷帕霉素类似物的研究。其作用机制(就最终产物而言)与合成修饰的雷帕霉素衍生物有关,这些衍生物可与其他分子偶联,用于研究mTOR生物学或开发靶向疗法。PEG9连接基可提高亲水性并减少偶联物的聚集,而末端NH2基团则允许进一步偶联(例如,与生物素、荧光染料、肽或抗体偶联)。该中间体及其任何衍生最终产物均未注册临床试验。仅供研究使用;不得用于人体诊断、治疗或临床应用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C43H63CLFN5O13S
相关CAS号
XL388-C2-amide-PEG9-NH2 TFA
外观&性状
Light yellow to yellow oil
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~250 mg/mL (~264.69 mM)
H2O :~100 mg/mL (~105.88 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 4.17 mg/mL (4.42 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 41.7 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 4.17 mg/mL (4.42 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 41.7 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入 900 μL 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 4.17 mg/mL (4.42 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 41.7 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


配方 4 中的溶解度: 100 mg/mL (105.88 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶.

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们