| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
|---|---|---|---|
| 5mg |
|
||
| 10mg |
|
||
| 25mg |
|
||
| 50mg |
|
||
| Other Sizes |
|
| 靶点 |
KDM5-C49 hydrochloride targets KDM5A, KDM5B, and KDM5C with IC50 values of 40 nM, 160 nM, and 100 nM respectively. It binds to the active site of these JmjC-domain demethylases, chelating the Fe(II) ion and competing with the 2-oxoglutarate cofactor, thereby inhibiting demethylase activity. It shows selectivity over other JmjC family demethylases, including KDM6A/UTX and KDM4C. The compound has low cell permeability, but it is a valuable tool for in vitro biochemical studies.
|
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
KDM5-C49盐酸盐的渗透性较低。通过将KDM5-C49的羧基转化为乙酯,制备了一种细胞渗透性前药(KDM5-C70)。
在无细胞实验中,KDM5-C49 盐酸盐对重组 KDM5A、KDM5B 和 KDM5C 具有很高的抑制活性(IC50 值分别为:KDM5A 为 40 nM,KDM5B 为 160 nM,KDM5C 为 100 nM)。通过对其他 KDM 家族成员的测试,证实了其选择性。该化合物是 2-酮戊二酸辅因子的竞争性抑制剂。KDM5-C49 的细胞渗透性较低,这限制了其在基于细胞的实验中的应用。为了克服这一限制,研究人员开发了一种细胞渗透性前药(KDM5-C70)。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
由于其细胞渗透性低,KDM5-C49 盐酸盐主要用于无细胞实验。然而,其细胞渗透性前药 KDM5-C70(通过将羧基转化为乙酯而生成)则用于细胞实验。在用该前药处理的癌细胞中,通过蛋白质印迹法观察到 H3K4me3 水平升高(KDM5 抑制的产物)。该化合物可能抑制 KDM5 依赖性癌症类型的癌细胞增殖,例如多发性骨髓瘤和 MLL 重排白血病。
|
| 酶活实验 |
采用无细胞去甲基化酶活性测定法测定KDM5A的酶活性。将重组KDM5A酶与生物素标记的H3K4me3肽底物(0.5 uM)在含有Tris-HCl(50 mM,pH 7.5)、NaCl(50 mM)、2-酮戊二酸(10 uM)、抗坏血酸(2 mM)、FeSO4(2 uM)和DTT(1 mM)的测定缓冲液中孵育。加入不同浓度(0.1-1000 nM)的KDM5-C49盐酸盐。在30℃下孵育60分钟后,用EDTA终止反应。使用抗H3K4me3抗体和HRP标记的二抗,通过ELISA定量剩余的H3K4me3。IC50值由剂量反应曲线计算得出。
|
| 细胞实验 |
KDM5-C49 盐酸盐主要用于无细胞实验;由于其渗透性低,未经衍生化处理不适用于大多数细胞实验。对于基于细胞的研究,通常使用前药 KDM5-C70。然而,KDM5-C49 盐酸盐可用作 LC-MS/MS 检测中的参考标准,用于定量生化样品中 KDM5 抑制剂的含量。典型的检测方法是将化合物与重组 KDM5 酶在无细胞体系中孵育,如上所述。
|
| 动物实验 |
KDM5-C49盐酸盐通常使用其前药形式在小鼠异种移植模型中进行评估。例如,将携带KDM5依赖性肿瘤异种移植瘤(例如多发性骨髓瘤)的小鼠用KDM5-C70(乙酯前药)治疗,剂量为10-50 mg/kg,每日腹腔注射,持续2-3周。使用游标卡尺测量肿瘤生长情况,并收集肿瘤组织用于分析H3K4me3水平(Western blot或免疫组织化学)、增殖标志物(Ki67)和细胞凋亡标志物(cleaved caspase-3)。
|
| 药代性质 (ADME/PK) |
由于KDM5-C49盐酸盐的细胞渗透性低,因此不能直接用于体内研究。通过将KDM5-C49的羧基转化为乙酯,可以制备出一种细胞渗透性前药(KDM5-C70)。该前药能够穿过细胞膜,并在细胞内转化回活性化合物。该前药通常配制成含有DMSO、PEG300、Tween 80和生理盐水的溶液,用于腹腔注射或口服给药。在小鼠体内,其半衰期约为2-6小时。
|
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
KDM5-C49 盐酸盐是一种研究用化合物;目前尚无公开的全面毒性数据。根据其化学类别(JmjC 去甲基酶抑制剂),预计其在体外低微摩尔浓度下具有良好的耐受性。该化合物目前未发现具有遗传毒性或急性毒性。操作时应遵循标准的实验室安全防护措施(佩戴手套、实验服、护目镜,并在通风橱内处理粉末)。该化合物仅供研究使用,不得用于人体治疗。
|
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
KDM5-C49 盐酸盐是一种研究用化合物,尚未获准用于临床。KDM5 家族(也称为 JARID1)在某些癌症(包括耐药性癌症)中过度表达。KDM5 抑制剂(例如 KDM5-C49)正被研究作为潜在的抗癌药物,以期逆转耐药性(例如,对酪氨酸激酶抑制剂的耐药性)。该化合物也称为 KDOAM-20。CAS 编号:3026728-26-4。盐酸盐是其稳定性和易操作性的优选形式。
|
| 分子式 |
C15H25CLN4O3
|
|---|---|
| 分子量 |
344.84
|
| 精确质量 |
344.162
|
| CAS号 |
3026728-26-4
|
| 相关CAS号 |
KDM5-C49;1596348-16-1
|
| PubChem CID |
169553387
|
| 外观&性状 |
Colorless to light yellow solid-liquid Mixture
|
| 氢键供体(HBD)数目 |
3
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
6
|
| 可旋转键数目(RBC) |
9
|
| 重原子数目 |
23
|
| 分子复杂度/Complexity |
363
|
| 定义原子立体中心数目 |
0
|
| SMILES |
CCN(CCN(C)C)C(=O)CNCC1=NC=CC(=C1)C(=O)O.Cl
|
| HS Tariff Code |
2934.99.9001
|
| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
|
| 溶解度 (体外实验) |
DMSO :~125 mg/mL (~362.49 mM)
|
|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (6.03 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (6.03 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.8999 mL | 14.4995 mL | 28.9990 mL | |
| 5 mM | 0.5800 mL | 2.8999 mL | 5.7998 mL | |
| 10 mM | 0.2900 mL | 1.4499 mL | 2.8999 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。