Bacterial Sortase Substrate III, Abz/DNP TFA

目录号: V77215 纯度: ≥95%
Bacterial Sortase Substrate III, Abz/DNP TFA 是一种内部猝灭的荧光肽底物。
Bacterial Sortase Substrate III, Abz/DNP TFA 产品类别: Bacterial
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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5mg
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50mg
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产品描述
细菌分选酶底物 III,Abz/DNP TFA 是一种内部淬灭的荧光肽底物。金黄色葡萄球菌转肽酶分选酶 A (SrtA) 与细菌分选酶底物 III,Abz/DNP 反应,裂解并催化苏氨酸羧基与细胞壁交联桥氨基之间酰胺键的形成。该底物的裂解可在激发/发射波长为 320 nm/420 nm 处检测。
细菌分选酶底物 III,Abz/DNP TFA 是一种内部淬灭荧光肽底物,旨在监测金黄色葡萄球菌转肽酶分选酶 A (SrtA) 的活性。TFA 盐形式可提高溶解度和操作性。
生物活性&实验参考方法
靶点
This substrate targets the Gram‑positive bacterial transpeptidase sortase A (SrtA), a membrane‑bound cysteine enzyme that anchors virulence and colonisation‑associated surface proteins to the bacterial cell wall. It serves as a tool for studying sortase‑mediated protein anchoring and for screening sortase inhibitors.
体外研究 (In Vitro)
在基于 FRET 的检测中,完整的底物由于 Abz 荧光团被 Dnp 基团猝灭而呈现极低的荧光。当 SrtA 特异性地切割苏氨酸-甘氨酸键时,猝灭基团被释放,导致在 Ex/Em=320/420 nm 处荧光强度显著增加。Km ~5.5 mM,kcat ~0.27 s-¹。
体内研究 (In Vivo)
由于该底物是为体外酶活性测定而设计的,因此未描述其直接的体内活性。然而,了解SrtA在体内的活性对于开发抗感染药物至关重要,而该底物可用于评估化合物在基于细胞或离体细菌感染模型中的疗效。
酶活实验
标准SrtA酶活性检测方案:将纯化的SrtA酶稀释于检测缓冲液(50 mM HEPES,150 mM NaCl,5 mM CaCl2,pH 7.5)中。加入细菌分选酶底物III、Abz/DNP TFA(终浓度10-200 uM)以启动反应。于37℃孵育30-60分钟。使用酶标仪实时监测激发波长320 nm/发射波长420 nm处的荧光强度变化。设置不含酶的对照组用于背景扣除。
细胞实验
对于细胞测定,将表达 SrtA 的金黄色葡萄球菌细胞培养在合适的培养基中,并与底物(10-50 uM)孵育 1-4 小时。孵育后,裂解细胞或收集上清液,并在 Ex/Em=320/420 nm 处测量荧光,以评估细菌环境中 SrtA 的活性。
动物实验
感染研究的一般动物实验方案:BALB/c小鼠(每组n=6)经静脉注射感染金黄色葡萄球菌(1-5×10⁷ CFU)。测试用分选酶抑制剂经口服或腹腔注射给药。24-48小时后,通过菌落计数法(CFU平板计数)定量器官(肾脏、脾脏)中的细菌载量。底物不直接给药,而是用于从分离的细菌或组织匀浆中进行体外活性测定。
药代性质 (ADME/PK)
作为肽底物,细菌分选酶底物 III,Abz/DNP TFA 不适用于药代动力学研究。它用作检测试剂,而非治疗剂。该化合物通常溶于 DMSO 配制成储备液,使用前立即用水性缓冲液稀释;应以冻干粉末形式避光储存于 -20℃。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
该底物本身在检测浓度(≤200 μM)下无毒。它仅供研究使用,不得用于人类或动物治疗。Dnp 基团是 FRET 肽底物中一种成熟的猝灭剂,在酶促反应所用浓度下不具有显著毒性。
参考文献
[1]. Zhang J, et al. Antiinfective therapy with a small molecule inhibitor of Staphylococcus aureus sortase. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Sep 16;111(37):13517-22.
其他信息
该底物包含一个LPETG分选信号基序,模拟SrtA的天然识别序列。切割发生在苏氨酸和甘氨酸残基之间,释放出Dnp标记的C端片段。基于FRET的检测方法能够对转肽酶活性进行连续、实时的监测,使其适用于高通量筛选分选酶抑制剂,从而用于抗感染药物的研发。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C41H57N11O14.XC2HF3O2
相关CAS号
Bacterial Sortase Substrate III, Abz/DNP;2857862-12-3
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~50 mg/mL
H2O :< 0.1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (Infinity mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 12.5 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (Infinity mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 12.5 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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