| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
Cereblon
The primary molecular target of Pomalidomide-amido-PEG3-C2-NH2 is cereblon (CRBN), an E3 ubiquitin ligase substrate receptor. As a ligand for the E3 ubiquitin ligase complex, this compound binds to CRBN and recruits the ubiquitin-proteasome system. In the context of PROTAC technology, the pomalidomide moiety serves as the E3 ligase recognition element, while the PEG3-C2 linker provides a spacer for conjugation to a target protein ligand. This bifunctional design enables the targeted degradation of specific proteins by bringing the target protein into proximity with the E3 ligase. |
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| 体外研究 (In Vitro) |
BI-3663 可使用泊马度胺-氨基-PEG3-C2-NH2（化合物 5b）合成。在 11 种人肝细胞癌 (HCC) 细胞系中，BI-3663（基于 cereblon）可降解黏着斑酪氨酸激酶 (PTK2)，其中位 DC50 值从 30 nM 提高到 >80%[1]。体外研究表明，泊马度胺-氨基-PEG3-C2-NH2 是 PROTAC 分子中的关键组分。该化合物可用于合成 BI-3663，这是一种基于 cereblon 的 PROTAC，可在 11 种人肝细胞癌 (HCC) 细胞系中降解黏着斑酪氨酸激酶 (PTK2)，其中位 DC50 值从 30 nM 提高到 >80%。 PEG3间隔臂为靶蛋白、PROTAC和E3连接酶之间三元复合物的形成提供了合适的长度和灵活性。该化合物旨在通过泛素-蛋白酶体途径促进细胞系统中靶向蛋白的降解。
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| 体内研究 (In Vivo) |
由于泊马度胺-氨基-PEG3-C2-NH2 并非作为治疗药物本身，而是作为合成中间体或连接子组分用于 PROTAC 设计，因此未报道其作为独立化合物的体内活性数据。含有该泊马度胺基配体和 PEG3-C2 连接子的 PROTAC 分子（例如 BI-3663）的体内疗效取决于特定的靶蛋白配体以及完整 PROTAC 构建体的整体药代动力学特性。作为连接子缀合物，其主要作用是通过募集 E3 连接酶来促进靶向蛋白降解。
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| 酶活实验 |
体外评估泊马度胺-氨基-PEG3-C2-NH2 的方法通常包括结合实验，以评估其与 E3 泛素连接酶底物受体 cereblon (CRBN) 的相互作用。表面等离子共振 (SPR) 或荧光偏振技术可用于测量泊马度胺基配体与 CRBN 之间的结合亲和力 (Kd)。此外，还可以进行三元复合物形成实验，以评估含有该连接子的 PROTAC 分子同时结合 E3 连接酶和靶蛋白的能力。使用荧光标记探针的竞争性结合实验也常用于测定配体与 CRBN 结合的抑制浓度 (IC50)。
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| 细胞实验 |
体外细胞分析中，泊马度胺-氨基-PEG3-C2-NH2 的活性检测通常包括将其整合到 PROTAC 分子中，然后评估培养细胞中靶蛋白的降解情况。用含有该泊马度胺配体和 PEG3-C2 连接子的 PROTAC 处理细胞，并通过蛋白质印迹或免疫荧光法检测靶蛋白水平，以评估降解效率。进行剂量反应实验以确定 PROTAC 构建体的 DC50（半数最大降解浓度）。此外，还可以进行细胞活力和增殖实验，以评估靶蛋白降解的功能后果。
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| 动物实验 |
利用泊马度胺-氨基-PEG3-C2-NH2 进行的体内动物研究是评估包含该泊马度胺基配体和 PEG3-C2 连接子的完整 PROTAC 分子的一部分。典型的研究方案包括将 PROTAC 构建体（例如 BI-3663）给药于小鼠异种移植模型或疾病相关动物模型，然后通过蛋白质印迹或免疫组织化学方法评估收集组织中靶蛋白的降解情况。药效学终点包括靶蛋白水平的测定、下游信号通路调控以及疗效研究中的肿瘤生长抑制情况。给药方案根据特定 PROTAC 构建体的药代动力学特性进行优化。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
作为一种连接剂缀合物而非治疗药物，泊马度胺-酰胺-PEG3-C2-NH2 本身的药代动力学数据十分有限。该化合物的分子式为 C22H28N4O8，分子量为 476.48。其 IUPAC 名称为 3-(2-(2-(2-氨基乙氧基)乙氧基)乙氧基)-N-(2-(2,6-二氧哌啶-3-基)-1,3-二氧异吲哚啉-4-基)丙酰胺。当该化合物被整合到 PROTAC 分子中时，泊马度胺基配体和 PEG3-C2 连接剂共同影响了整个构建体的整体理化性质。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
由于泊马度胺-氨基-PEG3-C2-NH2主要用作PROTAC开发的研究试剂和合成中间体，因此其作为单一化合物的毒性特征尚未得到充分表征。该化合物仅供研究使用，尚未获准用于人体治疗。已知泊马度胺具有免疫调节作用和致畸性，因此在处理该化合物时应采取适当的安全预防措施。建议遵循标准的实验室安全操作规程，包括使用个人防护装备和在通风橱内操作。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
波马利度胺-氨基-PEG3-C2-NH2 (CAS 2328070-52-4) 的分子式为 C22H28N4O8，分子量为 476.48。该化合物的纯度为 ≥98%。它也被称为 Cereblon 配体-连接子 22 和 E3 连接酶配体-连接子 55。该化合物可用于合成 BI-3663，该物质以 30 nM 的中位 DC50 降解 PTK2。它属于 PROTAC 连接子类别，并用于 E3 连接酶配体-连接子复合物的应用。
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| 分子式 |
C22H28N4O8
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|---|---|
| 分子量 |
476.479725837708
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| 精确质量 |
476.19
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| CAS号 |
2328070-52-4
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| PubChem CID |
145712393
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| 外观&性状 |
Off-white to light yellow solid powder
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| LogP |
-1.6
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| tPSA |
166
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| 氢键供体(HBD)数目 |
3
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| 氢键受体(HBA)数目 |
9
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| 可旋转键数目(RBC) |
13
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| 重原子数目 |
34
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| 分子复杂度/Complexity |
776
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
C1CC(=O)NC(=O)C1N2C(=O)C3=C(C2=O)C(=CC=C3)NC(=O)CCOCCOCCOCCN
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| InChi Key |
FEXCPYUYLOFYGF-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C22H28N4O8/c23-7-9-33-11-13-34-12-10-32-8-6-18(28)24-15-3-1-2-14-19(15)22(31)26(21(14)30)16-4-5-17(27)25-20(16)29/h1-3,16H,4-13,23H2,(H,24,28)(H,25,27,29)
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| 化学名 |
3-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethoxy]-N-[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]propanamide
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO :~100 mg/mL (~209.87 mM)
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| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.25 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.25 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.0987 mL | 10.4936 mL | 20.9872 mL | |
| 5 mM | 0.4197 mL | 2.0987 mL | 4.1974 mL | |
| 10 mM | 0.2099 mL | 1.0494 mL | 2.0987 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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