PROTAC BRD9-binding moiety 1 hydrochloride

目录号: V82873 纯度: ≥98%

COA 产品数据产品说明书 SDS

PROTAC BRD9结合部分1 HCl是基于PROTAC技术的一种可以与BRD9结合并抑制BRD9活性的结构。

PROTAC BRD9-binding moiety 1 hydrochloride CAS号: 2448414-41-1
产品类别: PROTAC Linkers

产品仅用于科学研究，不针对患者销售

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Other Forms of PROTAC BRD9-binding moiety 1 hydrochloride:

PROTAC BRD9-binding moiety 1

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Nature 2025, 643(8070):192-200.

Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

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Science Adv 2025, 11(33):eadr5199.

Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

Cell Stem Cell 2024, 31:106-126.e13.

Nature 597, 119–125 (2021)

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Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

STTT 2023,8(1):91.

Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

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J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

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Science Adv 2022:8,eabm9427.

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Cell 2020,183:1202-1218.e25.

PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

产品描述
生物活性&实验参考方法
化学信息
溶解度数据
计算器
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产品描述

PROTAC BRD9 结合部分 1 HCl 是一种基于 PROTAC 技术，能够与 BRD9 结合并抑制 BRD9 活性的结构。
PROTAC BRD9结合部分1盐酸盐是一种选择性结合溴结构域蛋白BRD9的化合物。BRD9是参与转录调控的非经典BAF (ncBAF)染色质重塑复合物的组成部分。该配体旨在用于蛋白水解靶向嵌合体（PROTAC）的开发，以促进BRD9的靶向降解。盐酸盐形式可提高其溶解度和稳定性。BRD9是滑膜肉瘤、急性髓系白血病（AML）以及其他ncBAF复合物发挥致病作用的恶性肿瘤等癌症的新兴治疗靶点。其分子式为C23H26ClN3O7S2，分子量约为556.05。标准纯度≥98%，外观为浅黄色至黄色固体粉末。应以粉末形式储存在-20degC下，避光保存，最长可达3年。

生物活性&实验参考方法

靶点	BRD9 (bromodomain-containing protein 9).
体外研究 (In Vitro)	PROTAC BRD9结合部分1盐酸盐本身并不诱导降解；它是一种选择性结合BRD9的配体。当通过合适的连接子与E3泛素连接酶配体（例如，cereblon或VHL配体）偶联后，所得PROTAC可以募集E3泛素连接酶至BRD9，从而导致BRD9泛素化并随后被蛋白酶体降解。该配体与BRD9的结合促进了BRD9蛋白的靶向降解，为研究其生物学功能和验证其作为治疗靶点提供了一种工具。BRD9降解的效力（DC50）取决于包含该结合部分的完整PROTAC构建体。
体内研究 (In Vivo)	目前尚未报道该结合基团本身具有特定的体内活性；只有当其被整合到完整的靶向BRD9的PROTAC分子中时，才能观察到其体内降解活性。此类PROTAC的体内疗效将在BRD9驱动的癌症动物模型（例如，滑膜肉瘤或AML异种移植瘤）中进行评估。
酶活实验	不适用；该化合物未作为独立试剂进行分离酶/受体结合试验的评估。其与BRD9的结合亲和力通常使用生化分析方法测定，例如荧光偏振（FP）、AlphaScreen或表面等离子共振（SPR），作为完整PROTAC构建体验证的一部分。该化合物的纯度通常通过高效液相色谱（HPLC）进行确认，标准纯度≥98%。
细胞实验	不适用；该结合基团未在基于细胞的实验中单独进行测试，而是用作构建靶向BRD9的PROTAC的构建模块。在典型的完整BRD9 PROTAC细胞实验中，将表达BRD9的癌细胞（例如，滑膜肉瘤或急性髓系白血病细胞系）用PROTAC分子处理4-24小时，之后通过Western印迹或定量蛋白质组学检测BRD9蛋白水平，以确定DC50（半数最大降解浓度）。可通过检测其他含溴结构域的蛋白质来评估降解的选择性。
动物实验	不适用；未对单独的结合部分进行动物研究。完整的 BRD9 PROTAC 的体内疗效研究通常会在 BRD9 驱动型癌症的小鼠异种移植模型中进行。PROTAC 将配制在合适的载体中（例如，10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80、45% 生理盐水），并通过腹腔注射 (IP) 或静脉注射 (IV) 给药。将监测肿瘤生长抑制情况、肿瘤组织中 BRD9 的降解情况以及动物的整体健康状况。
药代性质 (ADME/PK)	该化合物的分子量约为556.05，分子式为C23H26ClN3O7S2，标准纯度≥98%。外观为浅黄色至黄色固体粉末。储存时，应以粉末形式于-20℃保存长达3年，或以溶剂形式于-80℃保存6个月。该化合物可溶于DMSO。产品应储存于密封容器中，并避光保存。关于该产品稳定性（尤其是在溶液中的稳定性）的信息鲜有报道，大多数情况下只能提供一般性指导。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)	本产品仅供研究使用，不得用于人类或兽医用途。操作时应遵循标准化学品安全预防措施。本产品尚未经过全面的医疗应用验证。它并非获批的治疗药物，也未获准用于临床。PROTAC 是 Arvinas Operations, Inc. 的注册商标，经许可使用。
参考文献	[1]. Degradation of the BAF Complex Factor BRD9 by Heterobifunctional Ligands. Angew Chem Int Ed Engl. 2017 May 15;56(21):5738-5743.
其他信息	BRD9 是一种含溴结构域的蛋白质，是非经典 BAF (ncBAF) 染色质重塑复合物的组成部分，在基因调控中发挥着关键作用。BRD9 是滑膜肉瘤（其在滑膜肉瘤中经常过表达）、急性髓系白血病 (AML) 和其他癌症中新兴的治疗靶点。该结合基团可用于开发靶向 BRD9 的 PROTAC 降解剂，这些降解剂通过降解 BRD9 蛋白而非仅仅抑制其溴结构域功能，为治疗 BRD9 驱动的癌症提供了一种新的策略。盐酸盐形式可提高 PROTAC 合成和下游应用的溶解度。

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式	C23H26CLN3O7S2
分子量	556.051442623138
精确质量	555.09
CAS号	2448414-41-1
相关CAS号	PROTAC BRD9-binding moiety 1;2097512-23-5
PubChem CID	137333441
外观&性状	Light yellow to yellow solid powder
tPSA	185
氢键供体(HBD)数目	3
氢键受体(HBA)数目	9
可旋转键数目(RBC)	7
重原子数目	36
分子复杂度/Complexity	980
定义原子立体中心数目	0
SMILES	CN1C=C(C2=C(C1=O)C=C(S2)C(=NC3CCS(=O)(=O)CC3)N)C4=CC(=C(C=C4)OCC(=O)O)OC.Cl
InChi Key	CHHQBFXRODFSBF-UHFFFAOYSA-N
InChi Code	InChI=1S/C23H25N3O7S2.ClH/c1-26-11-16(13-3-4-17(18(9-13)32-2)33-12-20(27)28)21-15(23(26)29)10-19(34-21)22(24)25-14-5-7-35(30,31)8-6-14;/h3-4,9-11,14H,5-8,12H2,1-2H3,(H2,24,25)(H,27,28);1H
化学名	2-[4-[2-[N'-(1,1-dioxothian-4-yl)carbamimidoyl]-5-methyl-4-oxothieno[3,2-c]pyridin-7-yl]-2-methoxyphenoxy]acetic acid;hydrochloride
HS Tariff Code	2934.99.9001
存储方式	Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意：请将本产品存放在密封且受保护的环境中，避免吸湿/受潮。
运输条件	Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)	DMSO :~20.83 mg/mL (~37.46 mM) H2O :~2.5 mg/mL (~4.50 mM)
溶解度 (体内实验)	配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.74 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。配方 2 中的溶解度:* ≥ 2.08 mg/mL (3.74 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More* 配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.74 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

溶解度 (体外实验)

DMSO :~20.83 mg/mL (~37.46 mM)
H2O :~2.5 mg/mL (~4.50 mM)

溶解度 (体内实验)

配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.74 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.74 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.74 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	1.7984 mL	8.9920 mL	17.9840 mL
	5 mM	0.3597 mL	1.7984 mL	3.5968 mL
	10 mM	0.1798 mL	0.8992 mL	1.7984 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。