Pomalidomide-PEG2-azide

目录号: V82954 纯度: ≥98%
Pomalidomide-PEG2-azide 是一种合成的 E3 连接酶(例如 CRBN)配体-连接子缀合物,含有基于 Pomalidomide 的 cereblon 配体和 2 单元 PEG 连接子。
Pomalidomide-PEG2-azide CAS号: 2267306-14-7
产品类别: PROTAC Linkers
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
50mg
100mg
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产品描述
泊马度胺-PEG2-叠氮化物是一种合成的E3连接酶(例如CRBN)配体-连接子缀合物,包含一个基于泊马度胺的cereblon配体和一个双单元PEG连接子。泊马度胺-PEG2-叠氮化物是一种点击化学试剂。它含有叠氮(N3)基团,可以与带有炔基的化合物发生CuAAc(铜催化叠氮-炔环加成反应)。对于带有BCN或DBCO基团的化合物,也可以发生SPAAC(应变促进的炔-叠氮环加成反应)。
泊马度胺-PEG2-叠氮化物是一种合成缀合物,由源自泊马度胺的Cereblon (CRBN)配体和末端带有叠氮基团的2单元PEG连接子组成。它被设计用于PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)技术,作为E3连接酶的配体-连接子缀合物,从而实现蛋白质的靶向降解。作为E3连接酶配体-连接子缀合物,它是合成靶向蛋白质降解分子的关键构建模块。该产品为固体粉末,熔点为188degC,是PROTAC功能化构建模块系列产品之一。
生物活性&实验参考方法
靶点
Cereblon
CRBN (Cereblon), an E3 ubiquitin ligase.
体外研究 (In Vitro)
其中一个配体与E3泛素连接酶结合,另一个配体与靶蛋白结合;这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[1]。
作为一种脑蛋白结合配体-连接子缀合物,泊马度胺-PEG2-叠氮化物本身不具有内在的生物活性;其功能是募集E3泛素连接酶复合物。最终的PROTAC分子是通过点击化学将该结构单元与靶蛋白配体偶联而形成的,它能够与靶蛋白结合,促进其泛素化和随后的蛋白酶体降解。
体内研究 (In Vivo)
目前尚未报道该缀合物本身具有特定的体内活性;其体内降解活性仅在与靶蛋白配体缀合形成完整的PROTAC分子时才能观察到。PROTAC的体内疗效通常在靶向驱动型癌症的小鼠异种移植模型中进行评估。
酶活实验
不适用;该化合物未在分离的酶/受体结合试验中进行评估。其与cereblon的结合亲和力可通过生物物理方法进行验证,例如表面等离子共振(SPR)或等温滴定量热法(ITC),作为完整PROTAC构建的一部分。叠氮基团是一个生物正交基团,可与含炔烃分子发生铜催化叠氮-炔环加成反应(CuAAC)或应变促进叠氮-炔环加成反应(SPAAC)。
细胞实验
不适用;该缀合物本身未在细胞实验中进行测试,但可用作构建PROTAC的构建模块。在典型的细胞实验中,将由该缀合物合成的完整PROTAC与表达靶标的癌细胞孵育4-24小时,之后通过Western blotting检测靶蛋白水平以确定DC50(半数最大降解浓度)。
动物实验
不适用;未对单独的配体-连接子偶联物进行动物研究。对于体内研究,通常将完整的PROTAC分子配制在载体中,例如10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80和45%生理盐水,并通过腹腔注射(IP)或静脉注射(IV)给药于荷瘤小鼠。疗效通过肿瘤生长抑制率(TGI)和肿瘤组织中靶蛋白的敲低来衡量。
药代性质 (ADME/PK)
该化合物的分子量为444.40。通常以粉末形式在-20℃下保存长达3年,或在溶剂中于-80℃下保存长达1年。它可溶于DMSO,并在推荐的储存条件下稳定。叠氮官能团使其能够通过点击化学进行多种偶联反应。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
本产品仅供研究使用,不可用于人类或兽医用途。使用实验室化学试剂时,应遵循标准安全操作规程。PROTAC是Arvinas Operations, Inc.的注册商标,经授权使用。
参考文献

[1]. Discovery of a new class of PROTAC BRD4 degraders based on a dihydroquinazolinone derivative and lenalidomide/pomalidomide. Bioorg Med Chem. 2020 Jan 1;28(1):115228.

其他信息
末端叠氮基(N3)可实现生物正交偶联,从而能够温和且选择性地将cereblon配体连接到炔基功能化的靶蛋白配体上。这种点击化学方法有助于并行合成PROTAC文库,以筛选出能够高效形成三元复合物并降解靶标的最佳连接子和配体。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H20N6O7
分子量
444.398103713989
精确质量
444.139
CAS号
2267306-14-7
PubChem CID
155292127
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
0.5
tPSA
146
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
10
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
827
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1CC(=O)NC(=O)C1N2C(=O)C3=C(C2=O)C(=CC=C3)NC(=O)COCCOCCN=[N+]=[N-]
InChi Key
QMQAWNMGKYQDLT-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H20N6O7/c20-24-21-6-7-31-8-9-32-10-15(27)22-12-3-1-2-11-16(12)19(30)25(18(11)29)13-4-5-14(26)23-17(13)28/h1-3,13H,4-10H2,(H,22,27)(H,23,26,28)
化学名
2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]-N-[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]acetamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~90 mg/mL (~202.52 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (11.25 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 50.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2502 mL 11.2511 mL 22.5023 mL
5 mM 0.4500 mL 2.2502 mL 4.5005 mL
10 mM 0.2250 mL 1.1251 mL 2.2502 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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