E6 Berbamine 中文名称: 3,4,4aS,5,16aR,17,18,19-octahydro-21,22,26-trimethoxy-4,17-dimethyl-16H-1,24:6,9-dietheno-11,15-metheno-2H-pyrido[2’,3’:17,18][1,11]dioxacycloeicosino[2,3,4-ij]isoquinolin-12-ol-4-nitrobenzoate

别名: E6 berbamine; 114784-59-7; CHEMBL405686; [(1S,14R)-20,21,25-trimethoxy-15,30-dimethyl-7,23-dioxa-15,30-diazaheptacyclo[22.6.2.23,6.18,12.114,18.027,31.022,33]hexatriaconta-3(36),4,6(35),8,10,12(34),18,20,22(33),24,26,31-dodecaen-9-yl] 4-nitrobenzoate; 3,4,4aS,5,16aR,17,18,19-octahydro-21,22,26-trimethoxy-4,17-dimethyl-16H-1,24:6,9-dietheno-11,15-metheno-2H-pyrido[2',3':17,18][1,11]dioxacycloeicosino[2,3,4-ij]isoquinolin-12-ol-4-nitrobenzoate; Bio1_000778; Calmodulin inhibitor; CBiol_002003;

目录号: V92507 纯度: ≥98%

COA 产品数据产品说明书 SDS

E6 小檗胺是钙调蛋白 (CaM) 的强效拮抗剂（小檗胺对硝基苯甲酸酯）。

E6 Berbamine CAS号: 114784-59-7
产品类别: Calmodulin

产品仅用于科学研究，不针对患者销售

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Nature 2025, 643(8070):192-200.

Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

Nat Neurosci 2024, 27:1468-1474.

Science Adv 2025, 11(33):eadr5199.

Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

Cell Stem Cell 2024, 31:106-126.e13.

Nature 597, 119–125 (2021)

Cell Stem Cell 2020,26(6):845-861.e12.

Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

STTT 2023,8(1):91.

Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

Immunity 2024,57:2651-2668.e12.

J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022:8,eabm9427.

Nature 2021,597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

产品描述
生物活性&实验参考方法
化学信息
溶解度数据
计算器
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产品描述

E6 小檗胺是钙调蛋白 (CaM) 的强效拮抗剂（小檗胺对硝基苯甲酸酯）。E6 小檗胺的 Ki 值为 0.95 μM，可抑制依赖于钙调蛋白 (CaM) 的肌球蛋白轻链激酶 (MLCK) 活性。在 K562 细胞中，E6 小檗胺同样表现出抗白血病活性，IC50 为 2.13 μM。

生物活性&实验参考方法

靶点	CaM (calmodulin)
体外研究 (In Vitro)	研究了小檗碱化合物E6与钙调素（CaM）依赖性肌球蛋白轻链激酶（MLCK）的相互作用。实验结果表明，随着E6添加量的增加，对MLCK活性的抑制作用增强，过量添加CaM可完全克服对MLCK活性的抑制作用。随着化合物E6浓度的增加，CaM对MLCK的刺激活性逐渐被抑制，表明化合物E6对MLCK活性的抑制具有浓度依赖性；Ki为0.95微米。化合物E6使丹酚标记的CaM的荧光强度减弱，随着添加不同量的CaM，荧光强度逐渐增强。化合物E6对有限胰蛋白酶化产生的MLCK片段的活性没有影响，是一种新型且相当有效的钙调素拮抗剂。[1]
参考文献	[1]. Interaction of berbamine compound E6 and calmodulin-dependent myosin light chain kinase. Biochem Pharmacol. 1992 Oct 20;44(8):1543-7. [2]. Berbamine derivatives: a novel class of compounds for anti-leukemia activity. Eur J Med Chem. 2009 Aug;44(8):3293-8.
其他信息	我们之前的研究表明，源自中药小檗（Berberis amurensis）的天然化合物小檗碱能够选择性地诱导伊马替尼（IM）耐药的K562细胞系和慢性粒细胞白血病（CML）患者的Bcr/Abl阳性白血病细胞凋亡。本研究通过合成获得了一系列新的小檗碱衍生物。该系列化合物在体外表现出高至极高的活性。化合物2e、2g、3f、3k、3q和3u对伊马替尼耐药的K562白血病细胞表现出一致的高抗肿瘤活性。它们在48小时的IC50值为0.36-0.55 μM，而小檗碱的IC50值为8.9 μM。细胞周期分析结果表明，化合物3h能够降低G0/G1期细胞的比例。特别是，这些化合物对NF-κB p65从细胞质向细胞核的转位表现出强效抑制作用，而NF-κB p65在白血病干细胞的存活中起着关键作用。这些结果表明，小檗碱可能是开发对抗白血病的新型先导化合物的良好起点。[2]

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式	C44H43N3O9
分子量	757.83
精确质量	757.2999
CAS号	114784-59-7
PubChem CID	6610268
外观&性状	Typically exists as solid at room temperature
密度	1.3±0.1 g/cm3
折射率	1.613
LogP	7.6
tPSA	125Å²
氢键受体(HBA)数目	11
可旋转键数目(RBC)	6
重原子数目	56
分子复杂度/Complexity	1320
定义原子立体中心数目	2
SMILES	O1C2C(=CC3CCN(C)[C@@H](CC4C=CC(=CC=4)OC4C(=CC=C(C=4)C[C@@H]4C5C1=C(C(=CC=5CCN4C)OC)OC)OC(C1C=CC(=CC=1)[N+](=O)[O-])=O)C=3C=2)OC
InChi Key	PUAVTDKYTXNVBU-OIDHKYIRSA-N
InChi Code	InChI=1S/C44H43N3O9/c1-45-18-16-29-23-37(51-3)39-25-33(29)34(45)20-26-6-13-32(14-7-26)54-38-22-27(8-15-36(38)56-44(48)28-9-11-31(12-10-28)47(49)50)21-35-41-30(17-19-46(35)2)24-40(52-4)42(53-5)43(41)55-39/h6-15,22-25,34-35H,16-21H2,1-5H3/t34-,35+/m0/s1
化学名	[(1S,14R)-20,21,25-trimethoxy-15,30-dimethyl-7,23-dioxa-15,30-diazaheptacyclo[22.6.2.23,6.18,12.114,18.027,31.022,33]hexatriaconta-3(36),4,6(35),8,10,12(34),18,20,22(33),24,26,31-dodecaen-9-yl] 4-nitrobenzoate
别名	E6 berbamine; 114784-59-7; CHEMBL405686; [(1S,14R)-20,21,25-trimethoxy-15,30-dimethyl-7,23-dioxa-15,30-diazaheptacyclo[22.6.2.23,6.18,12.114,18.027,31.022,33]hexatriaconta-3(36),4,6(35),8,10,12(34),18,20,22(33),24,26,31-dodecaen-9-yl] 4-nitrobenzoate; 3,4,4aS,5,16aR,17,18,19-octahydro-21,22,26-trimethoxy-4,17-dimethyl-16H-1,24:6,9-dietheno-11,15-metheno-2H-pyrido[2',3':17,18][1,11]dioxacycloeicosino[2,3,4-ij]isoquinolin-12-ol-4-nitrobenzoate; Bio1_000778; Calmodulin inhibitor; CBiol_002003;
存储方式	Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month

溶解度数据

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	1.3196 mL	6.5978 mL	13.1956 mL
	5 mM	0.2639 mL	1.3196 mL	2.6391 mL
	10 mM	0.1320 mL	0.6598 mL	1.3196 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。