GGGYK-Biotin

目录号: V99655
GGGYK-Biotin 是一种底物肽,旨在研究 Sortase A 的底物特异性。
GGGYK-Biotin 产品类别: Others 16
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
GGGYK-生物素是一种底物肽,旨在研究A型分选酶的底物特异性。GGGYK-生物素可用于开发具有不同底物特异性的A型分选酶变体。
GGGYK-生物素(CAS号:未分配,分子量706.81,分子式C31H4₆N₈O₉S)是一种合成的生物素化肽,由N端三甘氨酸亲核序列(GGG)与酪氨酸-赖氨酸核心(YK)融合而成,C端带有生物素标签。它被专门设计为Sortase A (SrtA)的底物,SrtA是一种广泛用于蛋白质标记和偶联应用的细菌转肽酶。该肽通过其生物素部分提供了一个高亲和力的链霉亲和素连接位点,可用于检测或固定。与通用的寡聚甘氨酸受体不同,GGGYK-生物素引入了一个酪氨酸残基,使其在280 nm处具有紫外吸收,无需额外的发色团即可方便地测定浓度;此外,赖氨酸残基将生物素标签定位在远离催化位点的位置,从而最大限度地减少空间位阻。该化合物经验证纯度为99.82%,适用于Sortase A底物特异性研究、酶动力学测定以及Sortase A变体的定向进化等研究用途。
生物活性&实验参考方法
靶点
GGGYK-Biotin targets the bacterial transpeptidase Sortase A (SrtA), specifically recognizing the enzyme's active site and serving as a nucleophile acceptor. Sortase A is a cysteine protease that cleaves donor proteins at an LPXTG recognition motif and covalently attaches them to the N-terminal glycine residues of acceptor peptides. The tri-glycine sequence (GGG) of this peptide acts as the essential nucleophile for the transpeptidation reaction. The compound does not target host mammalian enzymes; its applications are confined to in vitro enzymatic assays and bacterial or engineered systems. The biotin tag enables downstream detection via streptavidin-based affinity purification, pull-down assays, and surface immobilization, while the tyrosine residue provides a convenient spectroscopic handle for concentration normalization.
体外研究 (In Vitro)
在体外,GGGYK-生物素可作为Sortase A (SrtA) 的模型底物用于酶动力学研究。该肽段能被SrtA高效识别,SrtA催化其三甘氨酸亲核基团与含有LPXTG识别基序的供体肽段之间形成酰胺键。该实验通常将SrtA与荧光标记的LPETG供体肽段以及不同浓度的GGGYK-生物素孵育。反应进程可通过凝胶迁移分析、荧光偏振或液相色谱-质谱联用(LC-MS)进行监测。该肽段已在GFP-LPETG报告系统中得到验证,可用于活细胞标记和酵母展示应用。其生物素标签可用于将反应产物捕获在链霉亲和素包被的微孔板或磁珠上,从而实现Sortase A变体的高通量筛选。该肽段无细胞毒性,在浓度高达100 uM时不会干扰哺乳动物细胞培养的细胞活力。
体内研究 (In Vivo)
由于 GGGYK-Biotin 肽段设计用于体外生化分析,而非用于动物治疗,因此不适用于体内研究。该化合物可用于离体标记实验,其中使用 Sortase A 对活细胞或组织切片进行位点特异性蛋白偶联。在此类应用中,通常将该肽段与 Sortase A 和 LPXTG 修饰的目标蛋白孵育,从而使生物素标签转移到细胞表面的目标蛋白上。然后通过链霉亲和素-荧光染料偶联物,利用流式细胞术或荧光显微镜检测标记的细胞。这些实验在细胞培养系统中进行,而非在活体动物中进行。该肽段不进行全身给药,也未在动物模型中进行生物利用度、组织分布或疗效研究。
酶活实验
对于 Sortase A 酶动力学测定,典型的反应混合物(总体积 50 uL)包含 50 mM Tris-HCl(pH 7.5)、150 mM NaCl、10 mM CaCl2、1-5 uM Sortase A(重组,来自金黄色葡萄球菌)、0-500 uM GGGYK-生物素和 10-50 uM 荧光供体肽(例如 Dabcyl-LPETG-Edans 或 FAM-LPETG)。加入 Sortase A 启动反应,并在 37°C 下孵育 0-120 分钟。在不同时间点,取样并用 0.5% TFA 终止反应,然后使用 C18 色谱柱进行高效液相色谱 (HPLC) 分析(FAM 标记底物的激发/发射波长为 485/535 nm),或使用液相色谱-质谱联用 (LC-MS) 分析。或者,反应产物可以捕获在链霉亲和素包被的96孔板上:孵育后,将反应混合物转移至链霉亲和素包被的孔中,孵育30分钟,洗涤后测量结合的荧光。对于米氏动力学分析,初始反应速率(v0)由产物生成的线性阶段计算得出,Km和Vmax值则通过非线性回归,利用米氏方程确定。为了进行质量控制,使用酪氨酸残基的消光系数(ε2₈0 ≈ 1490 M-¹cm-¹)计算280 nm处的吸光度对肽进行定量。纯度(>99%)通过高效液相色谱(HPLC)和质谱分析确认。
细胞实验
在细胞标记实验中,将哺乳动物细胞(例如 HEK293、HeLa 或 CHO 细胞,每种条件下使用 1 × 10⁵-5 × 10⁵ 个细胞)瞬时或稳定转染,使其表达与 LPXTG Sortase A 识别基序融合的细胞表面蛋白(例如 LPETG)。24-48 小时后,收集细胞,用 Sortase 缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 7.5、150 mM NaCl、10 mM CaCl2、1% BSA)洗涤,并重悬于相同的缓冲液中。将细胞与 1-5 uM 重组 Sortase A 和 10-100 uM GGGYK-生物素在 4°C 或室温下孵育 15-60 分钟,并轻柔摇动。标记后,用含1% BSA和10 mM EDTA的PBS缓冲液洗涤细胞两次以终止反应。检测时,将细胞与荧光染料标记的链霉亲和素(例如,链霉亲和素-Alexa Fluor 488,1:200稀释)在冰上孵育20-30分钟,洗涤后,通过流式细胞仪(每个样本10,000个事件)进行分析,或通过共聚焦荧光显微镜进行观察。对于活细胞标记,可在4℃下进行反应以防止标记蛋白的内吞作用。对于免疫沉淀或下拉实验,将含有生物素化蛋白的细胞裂解液与链霉亲和素-琼脂糖珠在4℃下孵育过夜,洗涤后,用SDS-PAGE上样缓冲液煮沸洗脱。洗脱的蛋白通过SDS-PAGE分离,并用Western blot或考马斯亮蓝染色进行检测。对照组应包括不添加A型分选酶、不添加供体肽以及添加失活的A型分选酶突变体(例如C184A),以验证实验特异性。每项实验条件均应设置三个重复,且实验至少重复三次。
动物实验
GGGYK-生物素的体内给药不适用于研究用途,且尚未进行动物药效研究。该肽专为体外生化分析而设计,可用于离体组织的标记。如果需要进行药代动力学评估,由于其分子量较低(706 Da),预计该肽会迅速发生蛋白水解降解并通过肾脏清除。然而,此类研究并非标准流程。该化合物并非注射剂,目前尚无注射剂量建议。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
GGGYK-生物素的毒性极低,因为它是一种用于体外研究的肽,用量极少(微克至毫克级)。目前尚无急性或慢性毒性数据。该化合物应按照标准实验室安全预防措施进行操作。避免吸入、摄入以及皮肤/眼睛接触。GGGYK-生物素并非药物,也无任何治疗适应症。
参考文献

[1]. Meng Mei, et al. "Application of modified yeast surface display technologies for non-Antibody protein engineering." Microbiological research 196 (2017): 118-128.

其他信息
GGGYK-生物素是一种专门用于Sortase A介导的蛋白质标记的工具。与通用GGG-生物素相比,该肽段引入了一个酪氨酸残基用于紫外定量,并引入了一个赖氨酸间隔基以优化生物素标签的空间可及性。三甘氨酸基序对于Sortase A的识别至关重要,因为该酶至少需要两个甘氨酸残基才能有效进行转肽反应。其应用包括酶动力学研究、底物特异性分析、Sortase A变体的高通量筛选、位点特异性蛋白质固定以及活细胞标记。该化合物尚未获得FDA批准,不适用于临床用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C31H46N8O9S
分子量
706.81
外观&性状
White to off-white solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 请将本产品存放在密封保护的环境中,避免受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~70.74 mM; with ultrasonication)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.54 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO +40% PEG300 +5% Tween-80 +45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀;再向上述体系中加入 50 μL Tween-80,混合均匀;然后再继续加入 450 μL 生理盐水 定容至 1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.54 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO +90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 900 μL 20% 的 SBE-β-CD 生理盐水水溶液 中,混合均匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.54 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO +90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 900 μL玉米油中,混合均匀。


" 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.4148 mL 7.0740 mL 14.1481 mL
5 mM 0.2830 mL 1.4148 mL 2.8296 mL
10 mM 0.1415 mL 0.7074 mL 1.4148 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们