Propargyl-PEG5-NHS ester

别名: 丙炔基-四聚乙二醇-丙烯酸琥珀酰亚胺酯;炔丙基-PEG5-NHS酯;4,7,10,13,16-五氧十九-18-炔酸N-琥珀酰亚胺酯
目录号: V6257 纯度: ≥98%
Propargyl-PEG5-NHS 酯是一种 PROTAC 桥,属于聚乙二醇 (PEG) 类别和烷基/醚类别。
Propargyl-PEG5-NHS ester CAS号: 1393330-40-9
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
50mg
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产品描述
丙炔基-PEG5-NHS酯是一种PROTAC桥联剂,属于聚乙二醇(PEG)类烷基/醚类化合物。丙炔基-PEG5-NHS酯可用于制备多种PROTAC蛋白降解剂。丙炔基-PEG5-NHS酯是一种可裂解的ADC桥联剂,用于合成抗体活性分子偶联物(ADC)。丙炔基-PEG5-NHS酯也是一种点击化学试剂。它含有炔基,可与含叠氮基团的化合物发生铜催化叠氮-炔环加成反应(CuAAC)。
丙炔基-PEG5-NHS酯(CAS号:1393330-40-9)是一种单分散的异双功能聚乙二醇(PEG)连接剂,其特征在于末端带有丙炔基和N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)酯基团,二者之间由五单元PEG间隔链(PEG5)隔开。它是一种可裂解的ADC连接剂,用于合成抗体药物偶联物(ADC)。NHS酯基团与伯胺反应形成稳定的酰胺键,而丙炔基则可与含叠氮基团的分子发生铜催化叠氮-炔环加成反应(CuAAC)。PEG5链可提高溶解度并降低空间位阻。丙炔基-PEG5-NHS酯是一种仅供研究使用的连接剂,不是一种治疗药物。
生物活性&实验参考方法
靶点
Propargyl-PEG5-NHS ester does not have a specific biological target, as it is a chemical linker. Its function is to serve as a covalent connector between molecular components in the synthesis of ADCs and PROTACs. The NHS ester group targets primary amines, forming stable amide bonds. The propargyl group targets azides in click chemistry reactions, forming a stable 1,2,3-triazole linkage. The hydrophilic PEG5 spacer enhances solubility and reduces steric hindrance between the conjugated components.
体外研究 (In Vitro)
PROTAC 中含有两种不同的配体,一种与 E3 泛素连接酶结合,另一种与靶蛋白结合,二者通过连接子连接。PROTAC 通过细胞内泛素-蛋白酶体系统靶向并选择性降解靶蛋白。抗体药物偶联物 (ADC) 细胞毒素通过 ADC 连接子与抗体连接形成 ADC。丙炔基-PEG5-NHS 酯作为连接子,本身不具有任何直接的体外生物活性。它的作用是促进生物活性偶联物的合成。该连接子的体外活性是通过对其所合成的最终偶联物的表征来间接评估的。例如,当用于合成 ADC 时,偶联物的活性通过基于细胞的靶点结合、内化和细胞毒性检测来评估。PEG5 连接子通过提高偶联物的溶解度并在抗体和药物之间提供必要的间隔来增强偶联物的整体活性。
体内研究 (In Vivo)
丙炔基-PEG5-NHS酯不适用于单独使用。其在体内的应用价值在于作为大型偶联物(例如抗体药物偶联物 (ADC) 或靶向抗体偶联物 (PROTAC))的组成部分。在这些情况下,亲水性PEG5间隔基通过提高溶解度和减少聚集来改善偶联物的整体药代动力学特性。然而,具体的体内活性(例如肿瘤消退或靶蛋白降解)取决于偶联物的活性基团和靶向配体,而非连接基本身。连接基的作用是稳定连接各个功能组分。
酶活实验
由于丙炔基-PEG5-NHS酯是一种化学试剂,因此目前尚无针对该酯的特定体外酶或受体结合试验。其表征主要采用核磁共振(NMR)、高效液相色谱(HPLC)和质谱(MS)等分析化学技术,以验证其结构和纯度。NHS酯的功能性可通过与模型胺反应,并利用HPLC监测酰胺键的形成来确认。炔丙基的反应活性可通过与含叠氮化合物反应,并利用HPLC或液相色谱-质谱联用(LC-MS)监测三唑键的形成来确认。这些步骤属于质量控制,而非生物学检测。
细胞实验
由于丙炔基-PEG5-NHS酯本身不具有生物活性,因此目前尚无针对该酯的标准体外细胞检测方法。它在细胞生物学中的应用是间接的,主要作为构建生物偶联物的试剂。例如,当用于构建抗体药物偶联物(ADC)时,ADC杀伤癌细胞的能力需要在细胞检测中进行评估。连接子的作用是确保ADC的功能性和稳定性。然而,目前尚无针对该连接子在细胞中的直接检测方法。在使用前,必须通过化学分析来确认其纯度和反应活性。
动物实验
丙炔基-PEG5-NHS酯不作为独立化合物用于体内动物实验。它是合成生物偶联物(例如抗体药物偶联物 (ADC) 或 PROTAC)的合成砌块。动物实验将使用包含该连接子的最终较大偶联物进行。在这些研究中,可以通过将其与使用不同连接子制备的偶联物进行比较,来评估该连接子对偶联物整体药代动力学和药效学特征的影响。然而,目前尚无针对该连接子本身的标准动物实验方案。其用途仅限于研发阶段,用于合成测试样品。
药代性质 (ADME/PK)
丙炔基-PEG5-NHS酯的CAS号为1393330-40-9。它是一种无色至黄色至橙色的透明液体。建议将该化合物冷藏于0-10℃保存。由于该化合物是一种连接剂而非治疗剂,因此无需进行详细的药代动力学研究。作为研究用化学品,其稳定性可通过适当的储存条件来维持。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
丙炔基-PEG5-NHS酯被认为毒性较低,与其他基于PEG的连接剂一致。PEG聚合物被广泛认为具有生物相容性、无毒且无免疫原性。该化合物被归类为研究用试剂,操作时应遵循标准的实验室安全预防措施。其毒性特征尚未得到广泛研究,但鉴于其预期用途和化学类别,预计不会产生急性毒性。与所有化学品一样,应在通风良好的区域使用适当的个人防护装备进行操作。
参考文献

[1]. Polyfluoreno[4,5-cde]oxepine Conjugates and Their Use in Methods of Analyte Detection. US20170275418A1.

其他信息
丙炔基-PEG5-NHS酯是一种仅供研究使用的试剂,并非药物,也未获准用于任何临床或治疗用途。它是一种单分散的异双功能PEG连接剂,其特征在于末端带有一个丙炔基和一个NHS酯基团。它是一种可裂解的ADC连接剂,用于抗体药物偶联物(ADC)的合成。NHS酯基团与伯胺反应形成稳定的酰胺键,而丙炔基则可与含叠氮基团的分子发生CuAAC反应。PEG5链可提高溶解度并降低空间位阻。它还可用作PROTAC设计中的连接剂。对于从事靶向药物递送和蛋白质降解研究的药物化学家和化学生物学家而言,它是一种非常有价值的工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H27NO9
分子量
401.4083
精确质量
401.168
CAS号
1393330-40-9
PubChem CID
60146234
外观&性状
Colorless to light yellow viscous liquid
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
497.6±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
254.8±31.5 °C
蒸汽压
0.0±1.3 mmHg at 25°C
折射率
1.502
LogP
-2.68
tPSA
110
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
18
重原子数目
28
分子复杂度/Complexity
512
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O(C(C([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C#C[H])=O)N1C(C([H])([H])C([H])([H])C1=O)=O
InChi Key
ACZDUKRWTPZVRP-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H27NO9/c1-2-6-23-8-10-25-12-14-27-15-13-26-11-9-24-7-5-18(22)28-19-16(20)3-4-17(19)21/h1H,3-15H2
化学名
(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3-[2-[2-[2-(2-prop-2-ynoxyethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]propanoate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~249.12 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.23 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.23 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.23 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4912 mL 12.4561 mL 24.9122 mL
5 mM 0.4982 mL 2.4912 mL 4.9824 mL
10 mM 0.2491 mL 1.2456 mL 2.4912 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们