PROTAC BET Degrader-1

别名: PROTAC BET降解剂-1
目录号: V31770 纯度: ≥98%
PROTAC BET Degrader-1是一种由Cereblon配体和BET配体连接的PROTAC蛋白降解剂,可以在低浓度下降低BRD2、BRD3和BRD4的蛋白水平。
PROTAC BET Degrader-1 CAS号: 2093386-22-0
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
Other Sizes
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
PROTAC BET Degrader-1 是一种 PROTAC 蛋白降解剂,由 Cereblon 配体和 BET 配体连接而成,可在低浓度下降低 BRD2、BRD3 和 BRD4 的蛋白水平。
PROTAC BET 降解剂-1(化合物 9)是一种基于 PROTAC 机制的强效 BET 降解剂。其分子式为 C44H4₅N11O₉,分子量为 871.90 g/mol,是由 Cereblon 和 BET 配体连接的 PROTAC 结构。PROTAC BET 降解剂-1 在 3-10 nM 浓度下可降低 RS4;11 细胞中 BRD2、BRD3 和 BRD4 蛋白的水平,并以 4.3 nM 的 IC₅0 值抑制该细胞系的生长,对 MOLM-13 细胞的 IC₅0 值为 45.5 nM。该化合物可募集 BET 蛋白和 E3 泛素连接酶,从而促进 BET 的泛素化和蛋白酶体降解。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary targets of PROTAC BET Degrader-1 are BET (bromodomain and extra-terminal) proteins, including BRD2, BRD3, and BRD4. BET proteins are epigenetic readers that regulate gene expression by binding to acetylated lysines on histones. They play critical roles in cancer by driving the expression of oncogenes. PROTAC BET Degrader-1 functions as a PROTAC molecule that simultaneously binds to BET proteins and the E3 ubiquitin ligase Cereblon. This brings BET proteins into proximity with the ubiquitin-proteasome system, leading to their ubiquitination and subsequent proteasomal degradation. By degrading BET proteins, the compound inhibits downstream transcriptional regulation and tumor cell proliferation.
体外研究 (In Vitro)
RS4;11 细胞的 BRD2、BRD3 和 BRD4 蛋白水平被 PROTAC BET 降解剂-1(化合物 9)降低,这是一种强效的基于 PROTAC 的 BET 降解剂,其对 MOLM-13 细胞的 IC50 也为 4.3 nM 和 45.5 nM[1]。
体外研究表明,PROTAC BET Degrader-1 是一种强效的 BET 降解剂。在 3-10 nM 的浓度下,它能降低 RS4;11 细胞中 BRD2、BRD3 和 BRD4 蛋白的水平。该化合物对 RS4;11 细胞的生长具有抑制作用,IC₅0 为 4.3 nM,对 MOLM-13 细胞也具有活性,IC₅0 为 45.5 nM。通过降解 BET 蛋白,该化合物抑制 BET 依赖性转录程序,从而发挥抗肿瘤作用。其强大的降解活性使其成为研究 BET 蛋白生物学和验证 BET 蛋白作为癌症治疗靶点的宝贵工具。
体内研究 (In Vivo)
PROTAC BET Degrader-1 的体内研究主要集中于评估其在 BET 依赖性癌症动物模型中的抗肿瘤疗效。该化合物是一种强效的 BET 降解剂,在 RS4;11 细胞中的 IC₅0 值为 4.3 nM,预计在体内可显著抑制肿瘤生长。其 PROTAC 机制能够催化降解 BET 蛋白,从而实现持续的靶点抑制,并具有良好的药代动力学特性。需要开展进一步的体内研究,以全面表征其在各种癌症模型中的疗效、安全性和药代动力学特征。
酶活实验
对于体外酶/受体结合实验,可使用结合实验评估 PROTAC BET Degrader-1 与 BET 蛋白和 Cereblon 的相互作用。表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC) 可用于测定结合亲和力。该化合物诱导 BET 蛋白与 Cereblon 形成三元复合物的能力可通过 AlphaScreen 或 TR-FRET 等生物物理方法进行评估。泛素化实验可用于测定化合物诱导的 BET 蛋白泛素化水平。标准实验条件包括具有适当 pH 值和离子强度的生理缓冲体系。
细胞实验
在体外细胞实验中,PROTAC BET Degrader-1 在 RS4;11 和 MOLM-13 等细胞系中进行测试,以评估其降解效率和抗增殖作用。将细胞培养于合适的培养基中,并用不同浓度的化合物(通常为纳摩尔至微摩尔浓度)处理。通过蛋白质印迹或免疫荧光法检测 BET 蛋白(BRD2、BRD3、BRD4)的水平。表征降解动力学和剂量依赖性。使用 MTT 或 CellTiter-Glo 等标准检测方法评估细胞活力和增殖情况。通过 qPCR 或 RNA 测序分析基因表达变化,以确认 BET 依赖性转录程序的抑制情况。
动物实验
在体内动物实验中,PROTAC BET Degrader-1 可通过多种途径给药于荷瘤小鼠,包括静脉注射或腹腔注射,具体取决于其溶解度和药代动力学特性。常用的异种移植模型采用 BET 依赖性癌细胞系,例如 RS4;11。典型的给药方案为每日或间歇给药,剂量范围为 1 至 50 mg/kg。定期测量肿瘤体积并计算肿瘤生长抑制率。通过免疫组织化学或蛋白质印迹法评估肿瘤中 BET 蛋白的水平。检测药效学标志物和基因表达变化。监测体重和整体健康状况。
药代性质 (ADME/PK)
公开文献中对PROTAC BET降解剂-1的药代动力学特性描述并不详尽。作为一种分子量为871.90 g/mol的PROTAC分子,其口服生物利用度可能有限,因此在体内研究中可能需要肠外给药。该化合物在生物体液中的溶解度和稳定性会影响其药代动力学特征。需要通过全面的药代动力学研究来确定Cₘₐₓ、Tₘₐₓ、AUC、半衰期和清除率等详细参数。该化合物的代谢和排泄途径仍有待充分阐明。为了获得最佳的体内给药效果,可能需要进行制剂开发。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于PROTAC BET Degrader-1主要是一种研究工具,因此其毒理学数据有限。作为一种BET蛋白降解剂,其毒性取决于BET蛋白对正常细胞功能的重要性。BET蛋白是参与基因表达的关键表观遗传调控因子,其降解可能对正常组织产生显著影响。需要进行全面的毒理学研究以支持其进一步开发。处理该化合物时应采取适当的安全预防措施,包括使用个人防护装备并遵守机构安全指南。
参考文献

[1]. Discovery of a Small-Molecule Degrader of Bromodomain and Extra-Terminal (BET) Proteins with Picomolar Cellular Potencies and Capable of Achieving Tumor Regression. J Med Chem. 2018 Jan 25;61(2):462-481.

其他信息
PROTAC BET Degrader-1 是一种用于靶向蛋白降解研究的实验化合物。目前尚未有关于该化合物作为治疗药物的临床试验或监管批准报告。该化合物仅供研究用途,可从多家化学品供应商处获得。该化合物是一种强效的 BET 降解剂,可在低浓度下降低 BRD2、BRD3 和 BRD4 蛋白的水平。它对 RS4;11 细胞的抑制 IC₅₀ 为 4.3 nM,对 MOLM-13 细胞的抑制 IC₅₀ 为 45.5 nM。它通过募集 Cereblon 来促进 BET 的泛素化和降解。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C44H45N11O9
分子量
871.89640879631
精确质量
871.34
CAS号
2093386-22-0
PubChem CID
134691733
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
3.8
tPSA
258
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
14
可旋转键数目(RBC)
16
重原子数目
64
分子复杂度/Complexity
1770
定义原子立体中心数目
0
SMILES
N1C2=C(C=C(OC)C(C3=C(C)ON=C3C)=C2)C2=C(NC3N(CC)N=C(C4CC4)C=3)N=C(C(NCCCCNC(COC3=CC=CC4=C3C(=O)N(C3CCC(=O)NC3=O)C4=O)=O)=O)N=C12
InChi Key
TXLUZGFDBDQACL-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C44H45N11O9/c1-5-54-32(19-27(52-54)23-11-12-23)48-39-37-25-18-31(62-4)26(35-21(2)53-64-22(35)3)17-28(25)47-38(37)50-40(51-39)42(59)46-16-7-6-15-45-34(57)20-63-30-10-8-9-24-36(30)44(61)55(43(24)60)29-13-14-33(56)49-41(29)58/h8-10,17-19,23,29H,5-7,11-16,20H2,1-4H3,(H,45,57)(H,46,59)(H,49,56,58)(H2,47,48,50,51)
化学名
4-[(5-cyclopropyl-2-ethylpyrazol-3-yl)amino]-7-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-N-[4-[[2-[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]oxyacetyl]amino]butyl]-6-methoxy-9H-pyrimido[4,5-b]indole-2-carboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 50 mg/mL (~57.35 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1.67 mg/mL (1.92 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 16.7 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 1.67 mg/mL (1.92 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 16.7 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.1469 mL 5.7346 mL 11.4692 mL
5 mM 0.2294 mL 1.1469 mL 2.2938 mL
10 mM 0.1147 mL 0.5735 mL 1.1469 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们