PROTAC BET degrader-2

别名: PROTAC BET降解剂-2
目录号: V31768 纯度: ≥98%
PROTAC BET degrader-2 是由 Cereblon 配体和 BET 配体连接的 PROTAC 蛋白降解剂。
PROTAC BET degrader-2 CAS号: 2093388-33-9
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
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产品描述
PROTAC BET降解剂-2是一种PROTAC蛋白降解剂,由Cereblon配体和BET配体连接而成。在RS4;11细胞中测得其抑制细胞生长的IC50值为9.6 nM,并且能够抑制肿瘤生长。
PROTAC BET降解剂-2(化合物25)是一种高效的溴结构域和末端结构域(BET)蛋白降解剂。其分子式为C41H42N10O₆,分子量为770.84 g/mol,是一种基于PROTAC的BET蛋白降解剂,可通过募集E3泛素连接酶诱导BRD2/3/4蛋白的泛素化和降解。PROTAC BET降解剂-2对RS4;11细胞的生长具有抑制作用,IC₅0值为9.6 nM,并可导致肿瘤消退。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary targets of PROTAC BET degrader-2 are BET (bromodomain and extra-terminal) proteins, including BRD2, BRD3, and BRD4. BET proteins are epigenetic readers that regulate gene expression by binding to acetylated lysines on histones. They play critical roles in cancer by driving the expression of oncogenes such as MYC. PROTAC BET degrader-2 functions as a PROTAC molecule that simultaneously binds to BET proteins and an E3 ubiquitin ligase, promoting BET ubiquitination and subsequent proteasomal degradation. This targeted degradation approach provides sustained suppression of BET protein levels and their downstream transcriptional programs.
体外研究 (In Vitro)
PROTAC BET 降解剂-2(化合物 25)是一种非常有效的 BET(溴结构域和末端外结构域)蛋白降解剂。它能引起肿瘤消退,并抑制 RS4;11 细胞的生长,IC50 值为 9.6 nM [1]。
体外研究表明,PROTAC BET降解剂-2是一种高效的BET蛋白降解剂。它能抑制RS4;11细胞的生长,IC₅0值为9.6 nM,并能导致肿瘤消退。该化合物通过募集E3泛素连接酶诱导BRD2/3/4蛋白的泛素化和降解,从而抑制相关的转录程序并发挥抗肿瘤作用。其强大的降解活性使其成为研究BET蛋白生物学和验证BET蛋白作为癌症治疗靶点的宝贵工具。
体内研究 (In Vivo)
PROTAC BET降解剂-2的体内研究主要集中于评估其在BET依赖性癌症动物模型中的抗肿瘤疗效。该化合物是一种高效的BET降解剂,其细胞生长抑制IC₅0值为9.6 nM,能够实现肿瘤消退。其PROTAC机制能够催化降解BET蛋白,从而可能实现持续的靶点抑制,并具有良好的药代动力学特性。需要开展进一步的体内研究,以全面表征其在各种癌症模型中的疗效、安全性和药代动力学特征。
酶活实验
对于体外酶/受体结合实验,可使用结合实验评估 PROTAC BET 降解剂-2 与 BET 蛋白和 E3 泛素连接酶的相互作用。表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC) 可用于测定结合亲和力。该化合物诱导 BET 蛋白与 E3 连接酶形成三元复合物的能力可通过生物物理方法(例如 AlphaScreen 或 TR-FRET)进行评估。泛素化实验可用于测定化合物诱导的 BET 蛋白泛素化水平。标准实验条件包括具有适当 pH 值和离子强度的生理缓冲体系。
细胞实验
在体外细胞实验中,PROTAC BET降解剂-2在RS4;11等细胞系中进行测试,以评估其降解效率和抗增殖作用。将细胞培养于合适的培养基中,并用不同浓度的化合物(通常为纳摩尔至微摩尔浓度)处理。通过Western blotting或免疫荧光法检测BET蛋白(BRD2、BRD3、BRD4)水平。表征降解动力学和剂量依赖性。使用MTT或CellTiter-Glo等标准检测方法评估细胞活力和增殖情况。通过qPCR或RNA测序分析基因表达变化,以确认BET依赖性转录程序的抑制情况。
动物实验
在体内动物实验中,PROTAC BET降解剂-2可根据其溶解度和药代动力学特性,通过多种途径(包括静脉注射或腹腔注射)给药于荷瘤小鼠。通常使用BET依赖性癌细胞系的异种移植模型。典型的给药方案为每日或间歇性给药,剂量范围为1至50 mg/kg。定期测量肿瘤体积并评估肿瘤消退情况。采用免疫组织化学或蛋白质印迹法检测肿瘤中BET蛋白的水平。检测药效学标志物和基因表达变化。监测体重和整体健康状况。
药代性质 (ADME/PK)
公开文献中对PROTAC BET降解剂-2的药代动力学特性描述尚不详尽。作为一种分子量为770.84 g/mol的PROTAC分子,其口服生物利用度可能有限,因此在体内研究中可能需要肠外给药。该化合物在生物体液中的溶解度和稳定性会影响其药代动力学特征。需要通过全面的药代动力学研究来确定Cₘₐₓ、Tₘₐₓ、AUC、半衰期和清除率等详细参数。该化合物的代谢和排泄途径仍有待充分阐明。为了获得最佳的体内给药效果,可能需要进行制剂开发。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于PROTAC BET降解剂-2主要是一种研究工具,因此其毒理学数据有限。作为一种BET蛋白降解剂,其毒性取决于BET蛋白对正常细胞功能的重要性。BET蛋白是参与基因表达的关键表观遗传调控因子,其降解可能对正常组织产生显著影响。因此,需要开展全面的毒理学研究以支持其进一步开发。处理该化合物时应采取适当的安全预防措施,包括使用个人防护装备并遵守机构安全指南。
参考文献

[1]. Discovery of a Small-Molecule Degrader of Bromodomain and Extra-Terminal (BET) Proteins with Picomolar Cellular Potencies and Capable of Achieving Tumor Regression. J Med Chem. 2018 Jan 25;61(2):462-481.

其他信息
PROTAC BET降解剂-2是一种用于靶向蛋白降解研究的科研化合物。目前尚未有关于该化合物作为治疗药物的临床试验或监管审批报告。该化合物仅供科研用途,可从多家化学品供应商处购买。该化合物是一种高效的BET降解剂,其细胞生长抑制IC₅₀值为9.6 nM,并可导致肿瘤消退。它通过募集E3泛素连接酶来降解BRD2/3/4蛋白。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C41H42N10O6
分子量
770.835587978363
精确质量
770.328
CAS号
2093388-33-9
PubChem CID
137319718
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
4.4
tPSA
202
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
12
重原子数目
57
分子复杂度/Complexity
1520
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CCN1C(=CC(=N1)C2CC2)NC3=NC(=NC4=C3C5=CC(=C(C=C5N4)C6=C(ON=C6C)C)OC)C(=O)NCCCC7=C8CN(C(=O)C8=CC=C7)C9CCC(=O)NC9=O
InChi Key
LKCUEUQTTCOYPW-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C41H42N10O6/c1-5-51-32(18-28(48-51)23-11-12-23)44-37-35-25-17-31(56-4)26(34-20(2)49-57-21(34)3)16-29(25)43-36(35)46-38(47-37)40(54)42-15-7-9-22-8-6-10-24-27(22)19-50(41(24)55)30-13-14-33(52)45-39(30)53/h6,8,10,16-18,23,30H,5,7,9,11-15,19H2,1-4H3,(H,42,54)(H,45,52,53)(H2,43,44,46,47)
化学名
4-[(5-cyclopropyl-2-ethylpyrazol-3-yl)amino]-7-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-N-[3-[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1-oxo-3H-isoindol-4-yl]propyl]-6-methoxy-9H-pyrimido[4,5-b]indole-2-carboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~64.86 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.24 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.24 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.2973 mL 6.4864 mL 12.9729 mL
5 mM 0.2595 mL 1.2973 mL 2.5946 mL
10 mM 0.1297 mL 0.6486 mL 1.2973 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们