| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
PROTAC BRD9 Degrader-1 targets bromodomain-containing protein 9 (BRD9), a member of the bromodomain and extra-terminal (BET) family, which is a component of the BAF chromatin remodeling complex. The compound functions by simultaneously binding to BRD9 and the E3 ubiquitin ligase Cereblon, thereby inducing ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of BRD9. This targeted degradation approach allows for selective elimination of BRD9 protein, providing a valuable tool for studying its biological functions in chromatin remodeling and transcriptional regulation.
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| 体外研究 (In Vitro) |
BRD9、BRD4 和 CRBN-DDB1 均受到 PROTAC BRD9 降解剂-1（化合物 1）的抑制，其 IC50 值分别为 13.5 nM、3.78 μM 和 48.9 nM[1]。
体外研究表明，PROTAC BRD9 Degrader-1 是一种高效的化学降解剂，IC₅0 为 13.5 nM。它通过 Cereblon 介导的蛋白酶体降解有效降低细胞内 BRD9 蛋白水平。该化合物对 BRD9 降解具有优异的选择性，可作为研究 BAF 复合物生物学的选择性探针。其强大的降解活性使其成为研究 BRD9 依赖性细胞过程以及验证 BRD9 作为多种疾病（尤其是 BRD9 发挥关键作用的癌症）治疗靶点的宝贵工具。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
PROTAC BRD9降解剂-1的体内研究主要集中于评估其在BRD9相关疾病动物模型中的疗效。该化合物是一种高效的BRD9降解剂，IC₅0值为13.5 nM，预计在体内可显著降解靶点并发挥治疗作用。PROTAC机制能够催化降解BRD9，从而可能实现持续的靶点抑制，并具有良好的药代动力学特性。需要开展进一步的体内研究，以全面表征其在相关疾病模型中的疗效、安全性和药代动力学特征。
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| 酶活实验 |
对于体外酶/受体结合试验，可使用生化试验评估 PROTAC BRD9 降解剂-1 与 BRD9 和 Cereblon 的结合亲和力。表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC) 可用于测定结合常数。该化合物诱导 BRD9 和 Cereblon 形成三元复合物的能力可使用生物物理方法（例如 AlphaScreen 或 TR-FRET 试验）进行评估。标准试验条件包括具有适当 pH 值和离子强度的生理缓冲体系。通过生成剂量反应曲线来确定结合亲和力和降解效力。
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| 细胞实验 |
在体外细胞实验中，PROTAC BRD9 Degrader-1 在表达 BRD9 的细胞系中进行测试，以评估其降解效率。将细胞培养于合适的培养基中，并用不同浓度的化合物（通常为纳摩尔至微摩尔浓度）处理。通过蛋白质印迹或免疫荧光法检测 BRD9 蛋白水平，以确定降解程度。表征降解动力学和剂量依赖性。使用 qPCR、RNA 测序或功能分析评估对细胞信号传导、基因表达和细胞功能的下游影响。使用 MTT 或 CellTiter-Glo 等标准检测方法监测细胞毒性和细胞活力。
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| 动物实验 |
对于体内动物实验，PROTAC BRD9 Degrader-1 可通过多种途径给药，包括腹腔注射或灌胃，具体取决于其溶解度和药代动力学特性。该化合物的体内疗效可在异种移植模型或其他相关疾病模型中进行评估。组织中靶蛋白的降解可通过蛋白质印迹或免疫组织化学进行验证。通过测量药效学标志物和生理参数来评估化合物的疗效。典型的给药方案为每日或间歇性给药，剂量范围为 1 至 50 mg/kg。监测肿瘤体积、体重和整体健康状况。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
公开文献中对PROTAC BRD9降解剂-1的药代动力学特性描述尚不详尽。作为一种分子量为903.98 g/mol的PROTAC分子，其口服生物利用度可能有限，因此在体内研究中可能需要肠外给药。该化合物在生物体液中的溶解度和稳定性会影响其药代动力学特征。需要通过全面的药代动力学研究来确定Cₘₐₓ、Tₘₐₓ、AUC、半衰期和清除率等详细参数。该化合物的代谢和排泄途径仍有待充分阐明。为了获得最佳的体内给药效果，可能需要进行制剂开发。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
由于PROTAC BRD9降解剂-1主要是一种研究工具，因此其毒理学数据有限。作为一种通过泛素-蛋白酶体途径诱导BRD9降解的蛋白质降解剂，其毒性取决于BRD9在正常细胞功能中的重要性。BRD9是BAF染色质重塑复合物的组成部分，其降解可能对基因表达和细胞功能产生显著影响。需要进行全面的毒理学研究以支持其进一步开发。处理该化合物时应采取适当的安全预防措施，包括使用个人防护装备并遵守机构安全指南。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
PROTAC BRD9 Degrader-1 是一种用于靶向蛋白降解研究的科研化合物。目前尚未有关于该化合物作为治疗药物的临床试验或监管审批报告。该化合物仅供科研用途，可从多家化学品供应商处购买。PROTAC BRD9 Degrader-1 是一种领先的 PROTAC BRD9 化学降解剂，IC₅₀ 值为 13.5 nM，可用作研究 BAF 复合物生物学的选择性探针。它是研究 BRD9 功能并验证其作为治疗靶点的宝贵工具。
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| 分子式 |
C42H45N7O12S2
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|---|---|
| 分子量 |
903.976407766342
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| 精确质量 |
903.256
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| CAS号 |
2097971-01-0
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| PubChem CID |
137628637
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| 外观&性状 |
Light yellow to yellow solid powder
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| LogP |
0.8
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| tPSA |
299
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| 氢键供体(HBD)数目 |
4
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| 氢键受体(HBA)数目 |
14
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| 可旋转键数目(RBC) |
16
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| 重原子数目 |
63
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| 分子复杂度/Complexity |
1960
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
S1(CCC(CC1)/N=C(/C1=CC2C(N(C)C=C(C3C=CC(=C(C=3)OC)OCC(NCCCCNC(COC3=CC=CC4=C3C(N(C4=O)C3C(NC(CC3)=O)=O)=O)=O)=O)C=2S1)=O)\N)(=O)=O
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| InChi Key |
LOLHUPGCPDURJG-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C42H45N7O12S2/c1-48-20-27(37-26(40(48)54)19-32(62-37)38(43)46-24-12-16-63(57,58)17-13-24)23-8-10-29(31(18-23)59-2)60-21-34(51)44-14-3-4-15-45-35(52)22-61-30-7-5-6-25-36(30)42(56)49(41(25)55)28-9-11-33(50)47-39(28)53/h5-8,10,18-20,24,28H,3-4,9,11-17,21-22H2,1-2H3,(H2,43,46)(H,44,51)(H,45,52)(H,47,50,53)
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| 化学名 |
N-[4-[[2-[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]oxyacetyl]amino]butyl]-2-[4-[2-[N'-(1,1-dioxothian-4-yl)carbamimidoyl]-5-methyl-4-oxothieno[3,2-c]pyridin-7-yl]-2-methoxyphenoxy]acetamide
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： 请将本产品存放在密封且受保护的环境中（例如氮气保护），避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~150 mg/mL (~165.93 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (2.77 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (2.77 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.1062 mL | 5.5311 mL | 11.0622 mL | |
| 5 mM | 0.2212 mL | 1.1062 mL | 2.2124 mL | |
| 10 mM | 0.1106 mL | 0.5531 mL | 1.1062 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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