| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
CDK2 (Cyclin-Dependent Kinase 2) and CDK9 (Cyclin-Dependent Kinase 9). PROTAC CDK2/9 Degrader-1 is a PROTAC that recruits CDK2 and CDK9 to the Cereblon (CRBN) E3 ubiquitin ligase complex. This leads to the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of both CDK2 and CDK9. CDK2 is a key regulator of the G1/S cell cycle transition, while CDK9 is a regulator of transcriptional elongation via phosphorylation of RNA polymerase II (Ser2). Simultaneous degradation of both kinases results in cell cycle arrest (G2/M phase) and downregulation of anti-apoptotic proteins (e.g., Mcl-1), leading to potent anti-proliferative activity in cancer cells.
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| 体外研究 (In Vitro) |
在 G2/M 期，PROTAC CDK2/9 降解剂-1（0.25-3 μM；48 小时）可刺激细胞周期循环 [1]。DETAC CDK2/9 降解剂-1（500 nM；2-24 小时）可有效降解 CDK2/9 高表达细胞（包括 MCF-7、HCT-116 和 22Rv1）中的 CDK2/9 [1]。它还能启动 PC-3 细胞的周期循环。CDK2 和 CDK9 均被 CDK2/9 降解剂-1 抑制，其 IC50 值分别为 7.42 nM 和 14.50 nM [1]。
PROTAC CDK2/9 降解剂-1 的半数最大降解浓度 (DC50) 分别为：CDK2 为 62 nM，CDK9 为 33 nM。该化合物能抑制前列腺癌 PC-3 细胞的增殖（IC50 为 0.12 uM (120 nM)）。它能诱导 PC-3 细胞周期阻滞于 G2/M 期，并下调 Mcl-1 蛋白水平。降解具有时间依赖性（4-8 小时达到最大降解）和浓度依赖性。添加蛋白酶体抑制剂（例如 MG132）可逆转该作用。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
在小鼠前列腺癌异种移植模型（PC-3）中，全身性给予PROTAC CDK2/9降解剂-1（20-50 mg/kg，腹腔或静脉注射）可显著抑制肿瘤生长（TGI > 70%）。治疗可降低肿瘤组织中CDK2和CDK9蛋白的水平（经Western blot证实）。下游效应包括RNA聚合酶II磷酸化（pSer2）降低、Mcl-1表达减少以及细胞凋亡（cleaved caspase-3）增加。在有效剂量下，未见明显的体重减轻或急性毒性反应。
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| 酶活实验 |
通过表面等离子共振 (SPR) 或时间分辨荧光共振能量转移 (TR-FRET) 测定 Cereblon (CRBN) E3 连接酶复合物的结合亲和力。将 CRBN-DDB1 复合物 (20-50 nM) 固定在传感器芯片上。将不同浓度的 PROTAC CDK2/9 降解剂-1 (0.1-1000 nM) 流过芯片，并测量其结合动力学 (ka, kd)。CRBN 结合的 Kd 值通常在低纳摩尔范围内，这是由类似来那度胺的结构单元驱动的。
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| 细胞实验 |
细胞周期分析[1]
细胞类型： PC-3 细胞 测试浓度： 500 nM 孵育时间： 2、4、8、16、24 小时 实验结果： PC-3 细胞中 Mcl-1 蛋白水平下调。 蛋白质印迹分析[1] 细胞类型： PC-3 细胞 测试浓度： 0.25、1、3 μM 孵育时间： 48 小时 实验结果： 诱导细胞周期阻滞于 G2/M 期。 将PC-3人前列腺癌细胞（1 × 10⁶个细胞）接种于6孔板中，并使其过夜贴壁。用不同浓度的PROTAC CDK2/9降解剂-1（0.001-10 μM）或DMSO溶剂处理细胞4-24小时。用胰蛋白酶消化收集细胞，用PBS洗涤，并在含有蛋白酶和磷酸酶抑制剂的RIPA裂解缓冲液中裂解。取20-50 μg蛋白裂解液进行SDS-PAGE电泳分离，转移至PVDF膜上，并用针对CDK2、CDK9、Mcl-1、裂解型PARP、裂解型caspase-3和β-actin（内参）的一抗进行检测。最后，用化学发光法（ECL）显色。 DC50（50% 降解浓度）是通过 CDK2/CDK9 条带强度与 DMSO 对照 (100%) 的密度分析计算得出的。 |
| 动物实验 |
将携带皮下PC-3前列腺癌异种移植瘤（肿瘤体积100-150 mm³）的雌性无胸腺裸鼠（6-8周龄，18-22 g）随机分为治疗组（n=8-10）。分别腹腔注射（ip）或静脉注射（iv）PROTAC CDK2/9降解剂-1（20-50 mg/kg）或赋形剂（例如，10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween 80 + 45%生理盐水），每日一次或隔日一次，持续14-21天。每周两次用游标卡尺测量肿瘤体积。监测体重作为一般毒性指标。研究结束时，切除肿瘤组织，称重，并进行蛋白质印迹分析（CDK2、CDK9、裂解型PARP、Mcl-1）和免疫组织化学分析（Ki67增殖指数、裂解型caspase-3凋亡）。同时采集血液样本进行药代动力学（PK）分析。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
PROTAC CDK2/9 降解剂-1 是一种分子量约为 816-820 道尔顿的 PROTAC 类化合物。由于其分子量高且渗透性差，口服生物利用度较低（<10%）。在体内研究中，通常采用腹腔注射 (ip) 或静脉注射 (iv) 给药。该化合物在小鼠体内具有中等血浆蛋白结合率和相对较短的半衰期（t½ ~ 1-3 小时），这符合异双功能小分子降解剂的典型特征。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
本PROTAC仅供研究使用，不可用于临床治疗。毒性数据仅限于体外细胞毒性筛选和体内耐受性研究。在PC-3细胞中，该化合物的GI50（50%生长抑制）为0.12 μM，且在较低浓度（<1 μM）下对非癌细胞无显著细胞毒性。在小鼠中，重复给药（14天），剂量≤50 mg/kg，通常耐受性良好，未出现明显的死亡或体重减轻。较高剂量（>75 mg/kg）时，可能出现轻度胃肠道不适（腹泻）和肝转氨酶（ALT/AST）轻度升高。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
利用PROTAC进行靶向蛋白降解是一种新兴的治疗方式，它不同于传统酶抑制剂基于占据率的药理学机制。PROTAC CDK2/9降解剂-1是一种化学生物学工具，用于研究癌细胞中CDK2和CDK9快速且持续耗竭的后果。它为克服耐药性（例如，对CDK4/6抑制剂的耐药性）以及靶向目前尚无药物靶向的蛋白提供了一种策略。该化合物尚未获得FDA批准，仅供实验室研究使用。它对于研究CDK2和CDK9在转录、细胞周期和癌症生物学中的作用具有重要价值。
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| 分子式 |
C₄₀H₄₁N₁₃O₇
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|---|---|
| 分子量 |
815.84
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| 精确质量 |
815.325
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| CAS号 |
2408641-24-5
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| PubChem CID |
145925673
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| 外观&性状 |
White to yellow solid powder
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| 密度 |
1.5±0.1 g/cm3
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| 折射率 |
1.749
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| LogP |
0.75
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| tPSA |
260
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| 氢键供体(HBD)数目 |
7
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| 氢键受体(HBA)数目 |
13
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| 可旋转键数目(RBC) |
14
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| 重原子数目 |
60
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| 分子复杂度/Complexity |
1620
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
C1CC(=O)NC(=O)C1N2C(=O)C3=C(C2=O)C(=CC=C3)NCCNC(=O)CCC(=O)N4CCN(CC4)CC5=CC=C(C=C5)NC(=O)C6=C(C=NN6)NC7=NC=NC8=C7C=CN8
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| InChi Key |
BRYMZSSAIDEFEM-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C40H41N13O7/c54-30(42-15-14-41-27-3-1-2-25-33(27)40(60)53(39(25)59)29-8-9-31(55)49-37(29)57)10-11-32(56)52-18-16-51(17-19-52)21-23-4-6-24(7-5-23)47-38(58)34-28(20-46-50-34)48-36-26-12-13-43-35(26)44-22-45-36/h1-7,12-13,20,22,29,41H,8-11,14-19,21H2,(H,42,54)(H,46,50)(H,47,58)(H,49,55,57)(H2,43,44,45,48)
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| 化学名 |
N-[4-[[4-[4-[2-[[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]amino]ethylamino]-4-oxobutanoyl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]-4-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-ylamino)-1H-pyrazole-5-carboxamide
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| 别名 |
PROTAC CDK2/9 Degrader1; PROTAC CDK2/9 Degrader 1
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~55 mg/mL (~67.42 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: 5 mg/mL (6.13 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 50.0 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；再向上述溶液中加入50 μL Tween-80 +，混匀；然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.2257 mL | 6.1287 mL | 12.2573 mL | |
| 5 mM | 0.2451 mL | 1.2257 mL | 2.4515 mL | |
| 10 mM | 0.1226 mL | 0.6129 mL | 1.2257 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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