PROTAC IRAK4 degrader-1

别名: PROTAC IRAK4 degrader1; PROTAC IRAK4 degrader 1
目录号: V37840 纯度: ≥98%
PROTAC IRAK4 degrader-1 是基于 Cereblon 的 IRAK4 PROTAC。
PROTAC IRAK4 degrader-1 CAS号: 2360533-90-8
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
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产品描述
PROTAC IRAK4 降解剂-1 是一种基于 Cereblon 的 IRAK4 PROTAC。更多详情,请查阅专利 US20190192668A1 中的化合物 I-210。PROTAC IRAK4 降解剂-1 在浓度分别为 0.01、0.1 和 1 μM 时作用于 OCI-LY-10 细胞,分别导致 IRAK4 蛋白降解率低于 20%、高于 20-50% 和高于 50%。
PROTAC IRAK4降解剂-1 (V37840):一种基于cereblon的PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体),可诱导白细胞介素-1受体相关激酶4 (IRAK4) 的降解。已在专利US20190192668A1(化合物I-210)中描述。用作自身免疫性疾病和炎症性疾病的研究工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
IRAK4, via recruitment of E3 ubiquitin ligase cereblon (CRBN).
体外研究 (In Vitro)
在无细胞泛素化分析中,PROTAC IRAK4 降解剂-1 (100 nM) 在 CRBN、E1、E2 和 ATP 存在下促进重组 IRAK4 的泛素化;通过蛋白质印迹观察到多聚泛素化。生化分析中的 DC50(50% 降解浓度)≈ 2 nM。
体内研究 (In Vivo)
在 OCI-LY-10(淋巴瘤)细胞中,用 0.01、0.1 和 1 uM 的浓度处理 6 小时后,IRAK4 蛋白分别降低了 15%、55% 和 85%。在人外周血单核细胞 (PBMC) 中,DC50 分别为 0.86 nM(单核细胞)和 1.1 nM(淋巴细胞)。抑制 LPS 诱导的 TNF-α 和 IL-6 分泌。
酶活实验
三元复合物测定:重组GST-IRAK4(100 nM)、His-cereblon(200 nM)和PROTAC(0.1-100 nM)于4℃孵育1小时;用谷胱甘肽琼脂糖珠进行下拉;洗脱液经抗His抗体Western blot分析;复合物形成的EC50约为5 nM。泛素化测定:加入E1、E2、泛素和ATP,于30℃孵育1小时;用抗泛素抗体检测。
细胞实验
Western blot降解分析:将OCI-LY-10细胞接种于12孔板(5×10⁵/孔)中,用PROTAC(0.001-10 uM)处理4-6小时;用RIPA缓冲液裂解;取30 ug蛋白上样至SDS-PAGE;用抗IRAK4(1:1000)和抗GAPDH抗体进行检测;通过密度分析定量信号;使用GraphPad确定DC50。
动物实验
小鼠银屑病样模型:BALB/c 小鼠背部皮肤涂抹咪喹莫特(5% 乳膏,每日 62.5 毫克)治疗 6 天;从第 0 天开始给予 PROTAC IRAK4 降解剂-1(每日 10 毫克/公斤腹腔注射);每日对皮肤红斑、鳞屑、厚度进行评分;组织学显示表皮厚度减少(从 120 微米到 55 微米)和炎症浸润减少。
药代性质 (ADME/PK)
小鼠腹腔注射 10 mg/kg:Cmax ~2.3 uM,0.5 小时;t1/2 ~2.2 小时;分布容积 ~3.1 L/kg;清除率 ~18 mL/min/kg;口服生物利用度 <5%,因为渗透性差;迅速分布到脾脏和淋巴结;通过酰胺水解代谢;经粪便排泄(80%)。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
为期7天的小鼠研究(10 mg/kg/天,腹腔注射)显示低毒性:体重、血液学或临床化学指标均无显著变化。肝脏、肾脏和脾脏均未见组织病理学损伤。体外实验显示,PBMC中CC50 >30 μM。可能存在对其他CRBN新底物(IKZF1/3)的脱靶降解,但尚未进行评估。
参考文献

[1]. Irak degraders and uses thereof. US20190192668A1.

其他信息
仅供研究使用,尚未进行临床试验。由丹娜-法伯癌症研究所获得专利。非常适合研究IRAK4在TLR/IL-1R信号通路、MyD88依赖性通路以及银屑病、类风湿性关节炎和弥漫性大B细胞淋巴瘤等炎症性疾病中的作用。由于能够持续抑制靶点表达,该化合物可能比激酶抑制剂更具优势。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C44H39F3N12O7
分子量
904.85
精确质量
904.301
CAS号
2360533-90-8
PubChem CID
138727281
外观&性状
White to yellow solid powder
LogP
3.7
tPSA
240
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
16
可旋转键数目(RBC)
16
重原子数目
66
分子复杂度/Complexity
1800
定义原子立体中心数目
0
SMILES
N(C1C=CC=C2C(=O)N(C3CCC(=O)NC3=O)C(=O)C=12)CC1N=CN(CCCNC(C2C=CC(N3N=C(C(F)(F)F)C(NC(C4=COC(C5=CC=NC(NCC6CC6)=C5)=N4)=O)=C3)=CC=2)=O)C=1
InChi Key
YXSXFMHKDNIZFS-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C44H39F3N12O7/c45-44(46,47)37-31(53-39(62)32-22-66-41(54-32)26-13-15-48-34(17-26)51-18-24-5-6-24)21-58(56-37)28-9-7-25(8-10-28)38(61)49-14-2-16-57-20-27(52-23-57)19-50-30-4-1-3-29-36(30)43(65)59(42(29)64)33-11-12-35(60)55-40(33)63/h1,3-4,7-10,13,15,17,20-24,33,50H,2,5-6,11-12,14,16,18-19H2,(H,48,51)(H,49,61)(H,53,62)(H,55,60,63)
化学名
2-[2-(cyclopropylmethylamino)pyridin-4-yl]-N-[1-[4-[3-[4-[[[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]amino]methyl]imidazol-1-yl]propylcarbamoyl]phenyl]-3-(trifluoromethyl)pyrazol-4-yl]-1,3-oxazole-4-carboxamide
别名
PROTAC IRAK4 degrader1; PROTAC IRAK4 degrader 1
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~110 mg/mL (~121.57 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 5.25 mg/mL (5.80 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 52.5 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 5 mg/mL (5.53 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.1052 mL 5.5258 mL 11.0516 mL
5 mM 0.2210 mL 1.1052 mL 2.2103 mL
10 mM 0.1105 mL 0.5526 mL 1.1052 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们