PROTAC RAR Degrader-1

目录号: V33145 纯度: ≥98%
PROTAC RAR Degrader-1 包含 IAP 配体结合基团、接头和 RAR 配体结合基团。
PROTAC RAR Degrader-1 CAS号: 1351169-27-1
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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1mg
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产品描述
PROTAC RAR 降解剂-1 包含 IAP 配体结合基团、连接基团和 RAR 配体结合基团。在 HT1080 细胞中,PROTAC RAR 降解剂-1 可降低 RAR 水平,在 30 μM 浓度下达到最大降解效果。同时,基于 cIAP1 的降解剂也被称为 SNIPER。
PROTAC RAR Degrader-1 是一种靶向蛋白降解化合物,它采用 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)技术降解视黄酸受体 (RAR)。该化合物由 cIAP1 配体结合基团、连接基团和 RAR 配体结合基团组成。在 HT1080 细胞中,PROTAC RAR Degrader-1 可降低 RAR 水平,在 30 microM 浓度下达到最大降解效果。基于 cIAP1 的降解诱导剂被称为特异性非遗传性 IAP 依赖性蛋白清除剂 (SNIPER)。该化合物的分子式为 C51H72N4O11,分子量为 917.14 g/mol。本品仅供实验室研究使用。
生物活性&实验参考方法
靶点
PROTAC RAR Degrader-1 targets retinoic acid receptors (RARs), nuclear receptors that are activated by retinoic acid and play critical roles in development, differentiation, and cancer. RARs are transcription factors that regulate the expression of genes involved in cell growth, differentiation, and apoptosis. The compound uses PROTAC technology to recruit RAR to an E3 ubiquitin ligase (cIAP1), inducing its ubiquitination and subsequent proteasomal degradation. The compound consists of a RAR ligand binding group, a linker, and a cIAP1 ligand binding group. By degrading RAR, the compound reduces RAR levels and inhibits RAR-mediated signaling pathways.
体外研究 (In Vitro)
PROTAC RAR降解剂-1在体外展现出强大的RAR降解活性。在HT1080细胞中,该化合物可降低RAR水平,并在30 uM浓度下达到最大降解效果。该化合物的活性呈浓度依赖性,在适当浓度下即可观察到降解作用。作为一种PROTAC(SNIPER)化合物,该化合物通过募集cIAP1 E3泛素连接酶诱导RAR的泛素化和降解。该化合物降解RAR的能力使其成为研究RAR生物学和评估RAR降解作为治疗策略的宝贵工具。完整的体外活性数据可从已发表的研究论文中获取。
体内研究 (In Vivo)
PROTAC RAR Degrader-1 的体内活性尚未在公开领域得到充分表征。作为一种 RAR 降解剂,该化合物预计会对细胞分化和增殖产生影响。RAR 调节剂已在多种癌症和其他疾病的动物模型中进行了研究。然而,专门使用 PROTAC RAR Degrader-1 进行的全面体内疗效研究尚未广泛发表。该化合物主要用作体外 RAR 降解研究的工具。需要进一步研究以确定该化合物的体内活性。
细胞实验
PROTAC RAR Degrader-1 的体外细胞实验采用表达 RAR 的细胞系,例如 HT1080 纤维肉瘤细胞。将细胞用不同浓度的化合物处理一定时间。使用 RAR 特异性抗体通过 Western blot 检测 RAR 蛋白水平。在 30 μM 浓度下观察到最大降解。RAR 靶基因表达通过 qRT-PCR 检测。细胞增殖和活力通过 MTT 或 CellTiter-Glo 检测进行评估。细胞分化可通过检测分化标志物进行评估。细胞凋亡通过 Annexin V/碘化丙啶染色或 caspase 活性检测进行评估。同时评估细胞毒性,以确保观察到的效应并非由细胞死亡引起。降解效率以 RAR 水平相对于载体对照组的降低百分比表示。
动物实验
关于PROTAC RAR降解剂-1的体内动物研究,公开报道并不多。作为一种RAR降解剂,该化合物有望在小鼠异种移植瘤模型或其他RAR参与的疾病模型中进行评估。在这些研究中,该化合物可通过腹腔注射或灌胃给药,研究终点包括肿瘤生长、肿瘤组织中RAR的降解以及生物标志物分析。然而,目前尚未有大量关于其体内疗效的全面研究发表。该化合物主要用作体外研究的工具。
药代性质 (ADME/PK)
PROTAC RAR 降解剂-1 的药代动力学性质尚未在公开领域得到充分表征。该化合物的分子式为 C51H72N4O11,分子量为 917.14 g/mol。其化学名称为 2-(3-{2-[2-(2-{2-[(2S)-2-[(2S,3R)-3-氨基-2-羟基-4-苯基丁酰胺基]-4-甲基戊酰胺基]乙氧基}乙氧基)乙氧基]乙酰胺基}丙氧基)-4-[(1E)-3-(3,5-二叔丁基苯基)-3-氧代丙-1-烯-1-基]苯甲酸。作为一种分子量相对较大的 PROTAC,该化合物的口服生物利用度预计有限。目前尚未报道其全面的药代动力学参数。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
PROTAC RAR Degrader-1 仅供实验室研究使用,尚未进行全面的毒理学测试。作为一种诱导蛋白质降解的化合物,该化合物预计会对 RAR 信号通路和细胞分化产生影响。通常会在进行功效研究的同时,进行标准的体外细胞毒性试验(针对细胞系),以排除非特异性毒性。如果该化合物用于动物研究,则需监测动物的体内毒性反应。目前尚未有关于该化合物的全面毒理学表征(包括遗传毒性和重复给药毒性研究)的报道。该化合物未获准用于人体,仅供研究用途。
参考文献

[1]. Bivalent Ligands for Protein Degradation in Drug Discovery. Comput Struct Biotechnol J. 2019 Jan 25;17:160-176.

其他信息
PROTAC RAR Degrader-1 是一种 PROTAC(SNIPER)衍生物,它通过募集 cIAP1 E3 连接酶来降解视黄酸受体 (RAR)。在 HT1080 细胞中,其浓度为 30 μM 时可达到 RAR 降解的最大值。该化合物的分子式为 C51H72N4O11,分子量为 917.14 g/mol。PROTAC RAR Degrader-1 尚未进入临床试验阶段,仅供研究用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C51H72N4O11
分子量
917.137595176697
精确质量
916.52
CAS号
1351169-27-1
PubChem CID
54764325
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
7.261
tPSA
224.84
氢键供体(HBD)数目
6
氢键受体(HBA)数目
12
可旋转键数目(RBC)
30
重原子数目
66
分子复杂度/Complexity
1480
定义原子立体中心数目
3
SMILES
CC(C)C[C@@H](C(=O)NCCOCCOCCOCC(=O)NCCCOC1=C(C=CC(=C1)/C=C/C(=O)C2=CC(=CC(=C2)C(C)(C)C)C(C)(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H]([C@@H](CC3=CC=CC=C3)N)O
InChi Key
ZAOSGDCLGNWLSI-ACALULJJSA-N
InChi Code
InChI=1S/C51H72N4O11/c1-34(2)27-42(55-48(60)46(58)41(52)28-35-13-10-9-11-14-35)47(59)54-20-22-63-23-24-64-25-26-65-33-45(57)53-19-12-21-66-44-29-36(15-17-40(44)49(61)62)16-18-43(56)37-30-38(50(3,4)5)32-39(31-37)51(6,7)8/h9-11,13-18,29-32,34,41-42,46,58H,12,19-28,33,52H2,1-8H3,(H,53,57)(H,54,59)(H,55,60)(H,61,62)/b18-16+/t41-,42+,46+/m1/s1
化学名
2-[3-[[2-[2-[2-[2-[[(2S)-2-[[(2S,3R)-3-amino-2-hydroxy-4-phenylbutanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]acetyl]amino]propoxy]-4-[(E)-3-(3,5-ditert-butylphenyl)-3-oxoprop-1-enyl]benzoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 80 mg/mL (~87.23 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2 mg/mL (2.18 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2 mg/mL (2.18 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.0mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2 mg/mL (2.18 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.0903 mL 5.4517 mL 10.9035 mL
5 mM 0.2181 mL 1.0903 mL 2.1807 mL
10 mM 0.1090 mL 0.5452 mL 1.0903 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们