Py-BODIPY-NHS ester

别名: PyBODIPYNHS ester; Py BODIPY NHS ester
目录号: V39665 纯度: ≥98%
BODIPY染料是一种小分子染料,具有很强的紫外线吸收能力。
Py-BODIPY-NHS ester CAS号: 201998-61-0
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
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产品描述
BODIPY染料是一种具有强紫外吸收能力的小分子染料。其荧光峰相对尖锐,量子产率高。它对环境的极性和pH值相对不敏感,因此在不同的生理条件下都比较稳定。由于其结构的不对称性,BODIPY具有多种结构类似物。BODIPY脂滴染料能够很好地穿透细胞膜进入细胞内部,并通过定位在细胞内的极性脂质上进行特异性染色。因此,该染料可用于标记活细胞和固定细胞。
Py-BODIPY-NHS酯(CAS号:201998-61-0)是一种属于BODIPY家族的小分子荧光染料,以其强紫外吸收和明亮的红色荧光而闻名。该化合物的分子式为C20H17BF2N4O4,分子量为426.18,其结构中包含一个NHS酯官能团,可与蛋白质、肽或其他生物分子上的伯胺基团共价结合。BODIPY核心结构具有较高的消光系数和荧光量子产率,且对溶剂极性和pH值变化相对不敏感,因此在各种生理条件下均保持稳定。Py-BODIPY-NHS酯具有细胞渗透性,能够特异性地对含有极性脂质的脂滴进行染色。
生物活性&实验参考方法
靶点
Py-BODIPY-NHS ester does not have a specific biological target in the traditional sense, as it is a fluorescent dye used for labeling rather than a pharmacologically active compound. However, it has been reported to be optimal for MET kinase studies, suggesting potential utility in kinase research. The compound's primary function is to serve as a fluorescent probe for labeling living cells and immobilizing cells. Its ability to penetrate cell membranes allows it to enter cells and specifically stain lipid droplets. The NHS ester group reacts with primary amines to form stable amide bonds, enabling the attachment of the fluorescent dye to proteins and other amine-containing molecules.
体外研究 (In Vitro)
1. Py-BODIPY NHS酯工作液的组成 1.1:储备液的制备 取1毫克Py-BODIPY NHS酯,加入382 μL无水DMSO,提取10 mM储备液。注:若要配制浓度为1–10 μM的Py-BODIPY NHS酯工作液,建议分装Py-BODIPY NHS酯储备液,并将步骤1.2中的工作液替换为预先配制的无血清细胞培养基或PBS。注:请根据实际情况调整Py-BODIPY NHS酯工作液的浓度。2. 悬浮细胞染色(2.1):离心细胞,加入PBS,然后洗涤两次,每次5分钟。在细胞密度达到 1×10⁶/2.2 后,加入 1 mL Py-BODIPY NHS 酯工作液,孵育 5 至 30 分钟。2.3 以 400 g 离心 3 至 4 分钟后,去除上清液。2.4 加入 PBS 后,用 PBS 洗涤细胞两次,每次 5 分钟。2.5 将细胞重悬于 1 mL 无血清细胞悬液或 PBS 中,使用荧光细胞仪或流式细胞仪观察细胞。3. 基于贴壁的细胞染色 3.1 将贴壁细胞培养于透明载玻片上。3.2 轻轻摇晃,使细胞与 100 μL 3.3 中得到的染料工作液完全接触,静置 5 至 30 分钟。 3.4 吸出染料工作液,用培养基冲洗两到三次,每次五分钟,然后使用流式细胞仪或荧光显微镜进行观察。
Py-BODIPY-NHS酯在体外表现出优异的荧光特性,包括强紫外吸收、明亮的红色荧光、高消光系数和高量子产率。其荧光峰相对尖锐,且在各种生理条件下稳定。该化合物具有细胞渗透性,能够有效穿过细胞膜进入细胞,并特异性地对含有极性脂质的脂滴进行染色。NHS酯基团能够有效地与蛋白质、肽或小分子上的伯胺基团偶联,使其成为一种用途广泛的荧光标记工具。
体内研究 (In Vivo)
由于Py-BODIPY-NHS酯主要用作体外标记应用的研究工具,因此其体内活性数据有限。该化合物具有细胞渗透性,提示其可能适用于体内成像研究,但目前尚未有大量关于其体内研究的报道。该化合物的荧光特性,包括其明亮的红色发射和光稳定性,使其成为体内成像应用的候选化合物。然而,仍需进一步研究以评估其在动物模型中的生物分布、清除率和安全性。
酶活实验
由于Py-BODIPY-NHS酯是一种荧光染料而非药理活性化合物,因此通常不用于体外酶/受体结合实验。然而,NHS酯基团可以与含有伯胺的蛋白质、肽或小分子进行共价偶联,从而构建荧光标记探针。这些标记探针可用于结合实验,以研究蛋白质-蛋白质相互作用、受体-配体结合或酶活性。该化合物的荧光特性,包括其高量子产率和光稳定性,使其适用于此类应用。
细胞实验
Py-BODIPY-NHS酯的体外细胞分析通常包括用荧光染料标记细胞,以观察细胞结构或蛋白质。将细胞与化合物在培养基中孵育一定时间,使染料穿透细胞膜并对特定的细胞结构(例如脂滴)进行染色。洗涤去除未结合的染料后,通过荧光显微镜或流式细胞仪分析细胞。NHS酯基团也可用于将染料与抗体或其他靶向分子偶联,以用于特定的标记应用。同时评估细胞毒性,以确保标记不会对细胞活力产生不利影响。
动物实验
Py-BODIPY-NHS酯的体内动物实验通常涉及将该化合物注射到动物体内进行成像应用。该化合物的荧光特性,包括其明亮的红色发射和光稳定性,使其适用于体内成像。然而,目前尚未有大量关于该化合物的全面体内研究报道。研究人员若要将该化合物用于体内应用,需要评估其在动物模型中的生物分布、清除率和安全性。该化合物的细胞渗透性和对脂滴的染色能力可能有助于研究体内脂质代谢。
药代性质 (ADME/PK)
由于Py-BODIPY-NHS酯主要用作体外标记应用的研究工具而非治疗药物,因此其药代动力学性质尚未得到充分表征。该化合物的分子量(426.18)和化学性质表明其可能具有中等生物利用度,但对其吸收、分布、代谢和排泄的详细研究有限。NHS酯基团具有反应活性,预计在体内会与含胺生物分子形成共价键,这可能会影响其药代动力学特征。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于Py-BODIPY-NHS酯主要用作标记应用的研究工具而非治疗剂,因此其毒理学数据有限。通常会进行体外细胞毒性试验,以确保该化合物在标记浓度下不会对细胞活力产生不利影响。目前尚未有全面的体内毒理学研究报道。研究人员在处理该化合物时应遵循处理荧光染料和NHS酯试剂的标准安全规程,包括使用个人防护装备并在通风良好的区域工作。
参考文献

[1]. BODIPY dyes in photodynamic therapy. Chem Soc Rev. 2013 Jan 7;42(1):77-88.

[2]. Quantitative, Wide-Spectrum Kinase Profiling in Live Cells for Assessing the Effect of CellularATP on Target Engagement. Cell Chem Biol. 2018 Feb 15;25(2):206-214.e11.

[3]. Fluopack screening platform for unbiased cellular phenotype profiling. Sci Rep. 2020 Feb 7;10(1):2097.

[4]. Quantitative, Real-Time Measurements of Intracellular Target Engagement Using Energy Transfer. Methods Mol Biol. 2019;1888:45-71.

[5]. Fluorescent and radiolabeled triphenylphosphonium probes for imaging mitochondria. Chem Commun (Camb). 2013 Nov 14;49(88):10361-3.

其他信息
Py-BODIPY-NHS酯是一种研究试剂,尚未进入临床试验或获得监管部门批准用于治疗用途。它主要用作荧光探针,用于标记活细胞、固定细胞和染色脂滴。该化合物的NHS酯基团可与蛋白质、肽或其他生物分子上的伯胺基团偶联,使其成为生物偶联和荧光标记应用的多功能工具。其明亮的红色荧光、高光稳定性和细胞渗透性使其在细胞生物学研究中具有重要价值。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C??H??BF?N?O?
分子量
426.18
精确质量
426.131
CAS号
201998-61-0
PubChem CID
138115341
外观&性状
Brown to black solid powder
tPSA
87.4
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
31
分子复杂度/Complexity
918
定义原子立体中心数目
0
SMILES
[F-][B+3]1([N-]2C(=CC=C2C=C2C=CC(C3NC=CC=3)=N12)CCC(=O)ON1C(CCC1=O)=O)[F-]
InChi Key
CRGDXALGAHKHRS-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H17BF2N4O4/c22-21(23)25-13(6-10-20(30)31-27-18(28)8-9-19(27)29)3-4-14(25)12-15-5-7-17(26(15)21)16-2-1-11-24-16/h1-5,7,11-12,24H,6,8-10H2
化学名
(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3-[2,2-difluoro-12-(1H-pyrrol-2-yl)-3-aza-1-azonia-2-boranuidatricyclo[7.3.0.03,7]dodeca-1(12),4,6,8,10-pentaen-4-yl]propanoate
别名
PyBODIPYNHS ester; Py BODIPY NHS ester
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~25 mg/mL (~58.66 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.88 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.88 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3464 mL 11.7321 mL 23.4643 mL
5 mM 0.4693 mL 2.3464 mL 4.6929 mL
10 mM 0.2346 mL 1.1732 mL 2.3464 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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