PYZD-4409

别名: PYZD4409 PYZD-4409 PYZD 4409 1-(3-氯-4-氟苯基)-4-[(5-硝基-2-呋喃基)亚甲基]-3,5-吡唑烷二酮;PYZD-4409
目录号: V6191 纯度: ≥98%
PYZD-4409 是泛素激活酶 UBA1 的特异性抑制剂,IC50 为 20 μM。
PYZD-4409 CAS号: 423148-78-1
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
PYZD-4409 是泛素激活酶 UBA1 的特异性抑制剂,IC50 为 20 μM。 PYZD-4409 诱导恶性细胞死亡并优先抑制原发性急性髓系白血病细胞的生长。
生物活性&实验参考方法
体外研究 (In Vitro)
在 8 种白血病和骨髓瘤细胞系中的 5 种中,低于 10 μM 的 PYZD-4409(10–40 μM;72 小时;骨髓瘤、白血病和实体瘤细胞系、原代 AML 细胞和正常造血细胞)会导致细胞死亡,或 LD50。另一方面,实体瘤细胞系的 LD50 约为 15 至 20 μM,使其不易受影响。与正常造血细胞相比,PYZD-4409 主要对恶性细胞产生细胞毒性[1]。 PYZD-4409(50 μM;4 小时;K562 白血病细胞)处理可防止泛素以 E1 依赖性方式与 E2 酶 cdc34 结合 [1]。 PYZD-4409(0-25 μM;24 小时;K562 白血病细胞)显着增强 Grp78 和 Hsp70 mRNA 和蛋白质水平。此外,PYZD-4409 也会升高磷酸化 JNK 和磷酸化 p38 丝裂原激活蛋白激酶(与 ER 应激和未折叠蛋白反应相关)[1]。
体内研究 (In Vivo)
PYZD-4409(10 mg/kg;腹膜内注射;每天一次,每隔一天一次,持续 16 天;雄性严重联合免疫缺陷小鼠)可减少肿瘤重量和体积,且无副作用[1]。
细胞实验
细胞毒性测定[1]
细胞类型:骨髓瘤、白血病和实体瘤细胞系、原代 AML 细胞和正常造血细胞
测试浓度: 10 μM, 20 μM、30 μM、40 μM
孵育持续时间: 72 小时
实验结果: 诱导细胞死亡 八种白血病中的五种骨髓瘤细胞系的 LD50 低于 10 μM。相比之下,实体瘤细胞系的敏感性较低,LD50 约为 15 至 20 μM。

蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: K562 白血病细胞
测试浓度: 50 μM
孵育持续时间: 4 小时
实验结果: 阻断泛素与 E2 酶 cdc34 的 E1 依赖性缀合。

RT-PCR[1]
细胞类型: K562 细胞
测试浓度: 0 μM、10 μM、25 μM
孵育时间:24小时
实验结果:Grp78和Hsp70的mRNA和蛋白水平显着增加。
动物实验
动物/疾病模型: 雄性重症联合免疫缺陷 (SCID) 小鼠,携带 MDAY-D2 鼠白血病细胞 [1]
剂量: 10 mg/kg
给药途径: 腹腔注射 (ip);每日一次,隔日一次;持续 16 天
实验结果: 肿瘤生长延迟,肿瘤重量减轻,且无不良毒性。
小鼠白血病异种移植疗效研究:** 将 1 x 10^5 个 MDAY-D2 小鼠白血病细胞皮下注射到雄性 SCID 小鼠体内。次日开始治疗。小鼠接受腹腔注射 PYZD-4409(剂量为 10 mg/kg,溶于生理盐水中),或注射等体积的生理盐水作为对照。每隔一天给药一次,共 8 天。一旦肿瘤可触及,至少每隔一天使用游标卡尺监测肿瘤生长情况。肿瘤接种 16 天后,用二氧化碳窒息法处死小鼠。然后切除肿瘤并称重。[1]
参考文献

[1]. The ubiquitin-activating enzyme E1 as a therapeutic target for the treatment of leukemia and multiple myeloma. Blood. 2010 Mar 18;115(11):2251-9.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
精确质量
351.006
CAS号
423148-78-1
PubChem CID
60111983
外观&性状
Light brown to black solid powder
LogP
3.305
tPSA
111.86
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
24
分子复杂度/Complexity
595
定义原子立体中心数目
0
SMILES
FC1=CC=C(N2C(/C(C(N2)=O)=C\C3=CC=C([N+]([O-])=O)O3)=O)C=C1Cl
InChi Key
MSYMKEYWUWVZQY-TWGQIWQCSA-N
InChi Code
InChI=1S/C14H7ClFN3O5/c15-10-5-7(1-3-11(10)16)18-14(21)9(13(20)17-18)6-8-2-4-12(24-8)19(22)23/h1-6H,(H,17,20)/b9-6-
化学名
(4Z)-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-4-[(5-nitrofuran-2-yl)methylidene]pyrazolidine-3,5-dione
别名
PYZD4409 PYZD-4409 PYZD 4409
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 35 mg/mL (~99.53 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.11 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80+,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • PYZD-4409 inhibits the E1 enzyme. (A) Chemical structure of the E1 inhibitor PYZD-4409 and the inactive control PYZDmut. (B) GST-tagged human E1 (0.5μM) and fluorescein-labeled ubiquitin (1μM) were coincubated with increasing concentrations of PYZD-4409 or PYZDmut for 30 minutes and resolved on SDS-PAGE under nonreducing conditions. Formation of E1-Ub conjugates were assessed by visualization of fluorescent signals using a gel imager. (C) GST-tagged human E1 (1μM), His6-tagged human E2 (UbcH5A; 5μM), ubiquitin (20μM), and ATP (1mM) were coincubated with or without increasing concentrations of PYZD-4409 or PYZDmut for 30 minutes at 30°C. The reactions were then fractionated on 4% to 20% gradient SDS-PAGE followed by immunoblotting with anti-His antibodies and fluorescent dye–labeled secondary antibodies. Fluorescent signals were detected with an infrared imaging system. (D) Recombinant His-tagged human E1 (1μM) was incubated with the His-tagged human UbcH5A E2 enzyme (10μM), ubiquitin (20μM), and ATP (1mM) in the presence of increasing concentrations of PYZD-4409 for 30 minutes at 30°C. Inorganic pyrophosphate resulting from ATP hydrolysis in E1-catalyzed ubiquitin activation was quantified with the use of a fluorogenic pyrophosphate assay kit and a fluorescence microplate reader as described in “E1 enzymatic assays.” Data represent the mean percentage ± SD of E1 enzyme activity compared with buffer-treated controls (n = 3). A representative experiment is shown. [1].Xu GW, et al. The ubiquitin-activating enzyme E1 as a therapeutic target for the treatment of leukemia and multiple myeloma. Blood. 2010 Mar 18;115(11):2251-9.
  • Inhibition of the E1 enzyme with PYZD-4409 preferentially induces cell death in malignant cell lines and primary AML cells over normal hematopoietic cells. (A) Myeloma, leukemia, and solid tumor cell lines were treated with increasing concentrations of PYZD-4409 for 72 hours. After incubation, cell growth and viability was measured by the Alamar Blue assay. Data represent the mean percentage ± SD of viable cells relative to control. Representative experiments are shown. (B) Mononuclear cells from patients with AML (n = 2) and the PBSCs of donors for allotransplantation (n = 4) were treated with PYZD-4409 (10μM) for 24 hours and then plated in duplicate for clonogenic growth in media containing 1% methylcellulose and cytokines. The numbers of colonies were counted after incubation for 7 days (AML) or 2 weeks (normal). Data represent the mean percentage ± SD of colonies relative to buffer-treated controls.[1].Xu GW, et al. The ubiquitin-activating enzyme E1 as a therapeutic target for the treatment of leukemia and multiple myeloma. Blood. 2010 Mar 18;115(11):2251-9.
  • E1 inhibition increases short half-life proteins and induces ER stress. (A) K562 cells were infected with an E1 shRNA lentiviral vector or control sequences and selected as described in Figure 2. Total cell lysates were prepared and analyzed by SDS-PAGE immunoblotting with anti-E1, anti-GRP78, anti-cyclin D3, and anti–α-tubulin antibodies. (B) K562 cells were treated with PYZD-4409 or PYZDmut (50μM) for 4 hours. After incubation, total cellular proteins were isolated and analyzed by SDS-PAGE immunoblotting with anti-cyclin D3 and anti–α-tubulin antibodies. (C) HCT116 cells were treated with PYZD-4409 or PYZDmut (50μM) for 2 hours. After incubation, total cellular proteins were isolated and analyzed by SDS-PAGE immunoblotting with anti-p53 and anti–α-tubulin antibodies. (D) K562 cells were treated with PYZD-4409 at the concentrations indicated for 24 hours, and total cellular RNA was isolated. GRP78 and HSP70 mRNA expression was measured relative to 18S RNA by real-time RT-PCR. Data points represent the mean ± SD fold increase of GRP78 and HSP70/18S expression relative to controls (ΔΔCT normalization). (E) K562 cells were treated with PYZD-4409 (50μM), PYZDmut (50μM), or DMSO for 2.5 hours. [1].Xu GW, et al. The ubiquitin-activating enzyme E1 as a therapeutic target for the treatment of leukemia and multiple myeloma. Blood. 2010 Mar 18;115(11):2251-9.
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