R1479

别名: R-1479 R1479 R 1479 4-叠氮基胞苷;4''-叠氮基胞嘧啶核苷;4'-叠氮基胞嘧啶核苷;4-叠氮基胞嘧啶核苷
目录号: V7887 纯度: ≥98%
R-1479(4'-叠氮胞苷)是一种核苷类似物,是一种特异性 HCV(丙型肝炎病毒)RNA 依赖性 RNA 聚合酶 (RdRp) 抑制剂。
R1479 CAS号: 478182-28-4
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
R-1479(4'-叠氮胞苷)是一种核苷类似物,是丙型肝炎病毒(HCV)RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)的特异性抑制剂。R-1479抑制HCV亚基因组复制系统中的HCV复制,IC50值为1.28 μM。R-1479是一种点击化学试剂。它含有叠氮(N3)基团,可以与含有炔基的化合物发生CuAAc(铜催化叠氮-炔环加成反应)。此外,它还可以与含有BCN或DBCO基团的化合物发生SPAAC(应变促进的炔-叠氮环加成反应)。
生物活性&实验参考方法
靶点
Dengue Virus RNA-dependent RNA Polymerase: R1479 is a nucleoside analogue that inhibits DENV replication. The active form, R1479 triphosphate, inhibits the viral polymerase. No direct IC50/Ki values for enzyme inhibition are provided. [3]
Hepatitis C Virus NS5B Polymerase: R1479 was originally developed as an inhibitor of HCV replication. [3]
体外研究 (In Vitro)
将增殖的复制子细胞孵育72小时后,R-1479 (R1479) 可抑制HCV RNA复制,并表现出剂量依赖性的Renilla荧光素酶活性降低,平均IC50值为1.28 μM。浓度高达2 mM时,R-1479对Huh-7或HCV复制子的活力或增殖没有影响[1]。在HCV复制子系统中,R-1479的IC50值为1.28 μM,使其成为最有效且无细胞毒性的衍生物。R-1479三磷酸盐的制备证实了其对NS5B(HCV编码的RNA聚合酶)介导的RNA合成具有抑制作用(IC50=320 nM)。在复制子实验中,R-1479 表现出强效活性,且未检测到细胞毒性或细胞抑制作用[2]。
在 Huh-7 细胞中抑制 DENV 复制:R1479 可抑制 Huh-7 细胞中 DENV 参考毒株和临床分离株的复制,平均 EC50 值范围为 1.9 至 11 μM。作为比较,已知的 DENV 聚合酶抑制剂 NITD008 的平均 IC50 值为 0.1-0.6 μM。[3]
在原代人细胞中抑制 DENV 复制:R1479 对原代人巨噬细胞(平均 EC50 范围:1.3-3.2 μM)和树突状细胞(平均 EC50 范围:5.2-6.0 μM)中的 DENV-1、DENV-2 和 DENV-4 均有活性。未在这些细胞类型中测试 DENV-3。 [3]
这些数据表明,R1479 在体外具有抗登革病毒活性,其浓度在接受每日两次≥1500毫克巴拉匹韦治疗的人体中可达到的药理学浓度范围内。[3]
体内研究 (In Vivo)
本文档报告了一项针对 64 名成年男性登革热患者的随机、双盲、安慰剂对照试验,试验药物为巴拉匹韦(R1479 的前药)。主要体内研究结果包括:
药代动力学:每日两次服用 1500 mg 或 3000 mg 巴拉匹韦的患者,其血浆中 R1479 的浓度呈剂量依赖性。第 1 天,Cmax 值:1500 mg 组(中位数 4.5 μM,范围 2.7-19.8 μM);3000 mg 组(中位数 23.8 μM,范围 8.7-90.6 μM)。Cmin 值:1500 mg 组(中位数 3.5 μM,范围 2.7-4.9 μM);3000 mg 组(中位数 5.8 μM,范围 2.1-15.7 μM)。 [3]
病毒学疗效:尽管大多数患者的血浆浓度超过了体外EC50值,但巴拉匹韦治疗并未显著影响任何预先设定的病毒学终点:病毒血症曲线下面积、首次病毒血症水平<1000拷贝/mL的时间或首次NS1检测结果转阴的时间。无论治疗分配如何,所有治疗组的病毒血症在入组后24小时内均出现相似程度的下降。[3]
临床疗效:巴拉匹韦治疗未影响退热时间、血细胞比容、血小板计数最低值、肝转氨酶、凝血标志物或生活质量评分。[3]
免疫学效应:治疗未改变血浆细胞因子浓度(包括IFN-γ和IL-10)或全血转录谱。[3]
病毒遗传学:巴拉匹韦组和安慰剂组的病毒基因组序列突变率无显著差异。[3]
酶活实验
天然HCV复制酶活性测定:从HCV复制子细胞中分离出膜结合的天然HCV复制酶复合物。R1479-TP抑制野生型复制酶的RNA合成,IC50 = 0.79 ± 0.12 μM。对于含有S282T突变的复制酶,IC50 = 0.71 ± 0.15 μM,表明不存在交叉耐药性。[2]
重组HCV聚合酶(NS5B)活性测定:R1479-TP以模板依赖的方式抑制NS5B介导的RNA合成。IC50值随模板而异:poly(I) RNA(指导poly(C)合成)IC50 = 0.02 ± 0.002 μM; HCV cIRES RNA IC50 = 0.29 ± 0.13 μM(UTP 标记)和 0.21 ± 0.12 μM(ATP 标记);HCV 3'-UTR RNA IC50 = 0.67 ± 0.21 μM(UTP 标记)和 1.43 ± 0.37 μM(ATP 标记);poly(A) RNA(指导 poly(U) 合成)IC50 = 173 ± 25 μM。[2]
动力学分析:R1479-TP 被鉴定为 CMP 掺入的竞争性抑制剂。CTP 浓度的增加降低了 R1479-TP 的效力(IC50 曲线发生偏移),而 ATP 浓度没有影响。基于 CTP 的 Km(app) 为 81.4 ± 10.5 nM,R1479-TP 的 Ki 为 40 ± 25 nM。 [2]
核苷酸掺入实验(凝胶电泳):使用19个核苷酸的RNA模板和标记的GG引物,HCV聚合酶可将R1479-TP掺入新生RNA中。掺入后,UTP的进一步延伸被阻断,与必需的链终止剂3'-dCTP类似。[2]
与其他抑制剂的比较:R1479-TP对NS5B的抑制效力与3'-dCTP相似。利巴韦林三磷酸的抑制效力则弱得多(IC50 = 255 ± 59 μM)。[2]
细胞实验
Huh-7细胞检测:将人肝癌Huh-7细胞感染登革病毒参考毒株和临床分离株。用R1479处理细胞,并检测病毒复制情况。EC50值定义为抑制50%病毒复制的浓度。[3]
原代人细胞检测:将原代人巨噬细胞和树突状细胞感染登革病毒1型、2型和4型,用R1479处理,并检测病毒复制情况以确定EC50值。[3]
药代性质 (ADME/PK)
前药激活:巴拉匹韦是R1479的前药。R1479需要细胞内磷酸化为活性三磷酸形式(R1479三磷酸)才能抑制登革病毒聚合酶。[3]
人体药代动力学(第1天):每日两次服用1500 mg巴拉匹韦:Tmax中位数为4小时(范围2-8小时);Cmax中位数为4.5 μM(范围2.7-19.8 μM);Cmin中位数为3.5 μM(范围2.7-4.9 μM);AUClast中位数为10.6 h×μM(范围2.6-30.7 h×μM)。每日两次服用3000 mg巴拉匹韦:Tmax中位数为4小时(范围2-12小时);Cmax中位数为23.8 μM(范围8.7-90.6 μM); Cmin 中位数为 5.8 μM(范围 2.1-15.7 μM);AUClast 中位数为 67.0 h×μM(范围 27.1-608.1 h×μM)。第 5 天观察到类似的剂量依赖性药代动力学。[3]
达标率:在治疗的前 12 小时内,接受 3000 mg 巴拉匹韦治疗的患者中,95% 的患者血浆 Cmax 值 R1479 > 6 μM,该浓度在体外可抑制登革病毒 (DENV)。[3]
药代动力学-药效学关系:基于丙型肝炎病毒 (HCV) 研究,平均 Cmin 浓度超过 6.7-39 μM 或 Cmax 超过 25-145 μM 可能需要达到可观察到的抗登革病毒 (DENV) 作用。所测试的剂量可能不足以达到这些阈值。[3]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
临床安全性概况:巴拉匹韦在每日两次,每次1500毫克和3000毫克的剂量下,连续服用5天,耐受性良好。临床和实验室不良事件的范围与登革热的典型不良事件相似,巴拉匹韦组和安慰剂组之间也存在相似之处。[3]
严重不良事件:报告了4例严重不良事件(安慰剂组2例,1500毫克组1例,3000毫克组1例),均为登革热的典型不良事件(持续性血小板减少症、短暂性视力丧失、脉压降低)。所有不良事件均被认为与巴拉匹韦的剂量无关。[3]
研发终止:由于接受巴拉匹韦联合聚乙二醇干扰素和利巴韦林治疗的患者在接受延长疗程(2-3个月)治疗后出现安全性问题,巴拉匹韦用于治疗丙型肝炎的临床研发被终止。[3]
参考文献

[1]. The novel nucleoside analog R1479 (4'-azidocytidine) is a potent inhibitor of NS5B-dependent RNA synthesis and hepatitis C virus replication in cell culture. J Biol Chem. 2006 Feb 17;281(7):3793-9.

[2]. Design, synthesis, and antiviral properties of 4'-substituted ribonucleosides as inhibitors of hepatitis C virus replication: the discovery of R1479. Bioorg Med Chem Lett. 2007 May 1;17(9):2570-6.

[3]. A randomized, double-blind placebo controlled trial of balapiravir, a polymerase inhibitor, in adult dengue patients. J Infect Dis. 2013 May 1;207(9):1442-1450.

其他信息
4'-叠氮胞苷是一种N-糖苷化合物。
背景:R1479(4'-叠氮胞苷)是一种核苷类似物,最初开发用于抑制丙型肝炎病毒复制。它是前药巴拉匹韦释放的活性部分。[3]
作用机制:R1479在细胞内磷酸化为R1479三磷酸,后者抑制包括登革热病毒(DENV)和丙型肝炎病毒(HCV)在内的黄病毒的RNA依赖性RNA聚合酶。[3]
临床试验背景:这是首个针对登革热抗病毒药物的随机对照试验。由于登革热传播季节结束,且申办方和研究者审查认为其效力不足以支持进一步研究,因此在纳入64名患者后提前终止了该研究。 [3]
阴性试验:尽管巴拉匹韦在体外活性方面表现良好,且达到了目标血浆浓度,但在登革热症状出现后48小时内接受治疗的患者中,巴拉匹韦并未显示出可测量的抗病毒或临床疗效。[3]
疗效不佳的可能原因:(1)血浆浓度不足(可能需要更高的Cmin);(2)鉴于宿主免疫反应会导致病毒血症迅速下降,治疗时机可能过晚;(3)相关靶细胞内磷酸化效率低下;(4)蛋白质结合或分布问题。[3]
研究效能:事后模拟估计,该研究有80%的把握度检测到高剂量组每日病毒血症降低0.25 log10。由于未观察到任何趋势,因此实际疗效(如果有的话)小于此值。 [3]意义:尽管巴拉匹韦疗效不佳,但这项试验为未来登革热抗病毒治疗试验奠定了基础,并提供了一种经过临床评估的基准分子。[3]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C9H12N6O5
分子量
284.232
精确质量
284.086
CAS号
478182-28-4
PubChem CID
457388
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
-0.2
tPSA
181.57
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
20
分子复杂度/Complexity
529
定义原子立体中心数目
4
SMILES
C1=CN(C(=O)N=C1N)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@](O2)(CO)N=[N+]=[N-])O)O
InChi Key
ODLGMSQBFONGNG-JVZYCSMKSA-N
InChi Code
InChI=1S/C9H12N6O5/c10-4-1-2-15(8(19)12-4)7-5(17)6(18)9(3-16,20-7)13-14-11/h1-2,5-7,16-18H,3H2,(H2,10,12,19)/t5-,6+,7-,9-/m1/s1
化学名
4-amino-1-[(2R,3R,4S,5R)-5-azido-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
别名
R-1479 R1479 R 1479
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~351.83 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.80 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.80 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.80 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.5183 mL 17.5914 mL 35.1828 mL
5 mM 0.7037 mL 3.5183 mL 7.0366 mL
10 mM 0.3518 mL 1.7591 mL 3.5183 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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