RN-1 dihydrochloride

别名: RN1 RN 1 RN-1 Dihydrochloride
目录号: V6011 纯度: ≥98%
RN-1 diHCl 是一种有效的 BBB(血脑屏障)可渗透/穿透、不可逆、选择性赖氨酸特异性去甲基化酶 1 (LSD1) 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 70 nM。
RN-1 dihydrochloride CAS号: 1781835-13-9
产品类别: New1
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纯度: ≥98%

产品描述
RN-1 diHCl 是一种强效的、可透过血脑屏障的、不可逆的、选择性的赖氨酸特异性去甲基化酶 1 (LSD1) 抑制剂(拮抗剂),其 IC50 为 70 nM。RN-1 diHCl 对 LSD1 的选择性高于 MAO-A 和 MAO-B,后两者的 IC50 分别为 0.51 μM 和 2.785 μM。
生物活性&实验参考方法
靶点
LSD1 (lysine specific demethylase 1) – IC50 = 0.07 μM (HRP-coupled assay), 0.01 μM (TR-FRET assay), 0.02 μM (MS assay)
MAO-A (monoamine oxidase A) – IC50 = 0.51 μM
MAO-B (monoamine oxidase B) – IC50 = 2.785 μM [1]
体外研究 (In Vitro)
RN-1二盐酸盐的IC50值约为100–200 μM,对卵巢癌细胞(SKOV3、OVCAR3、A2780和顺铂抑制剂A2780cis)具有细胞毒性[3]。
RN-1是一种高效且选择性的LSD1抑制剂。在三种正交的生化分析方法(HRP偶联、TR-FRET和直接质谱)中,RN-1对重组人LSD1的IC50值均达到纳摩尔级。它是一种基于机制的不可逆抑制剂,与酶结合的FAD辅因子形成共价加合物。稀释实验证实了这种抑制作用是不可逆的。 RN-1也对MAO-A和MAO-B表现出抑制活性,但效力较低,对LSD1的选择性高于MAO(例如,根据检测方法不同,选择性高约6至400倍)。[1]
体内研究 (In Vivo)
RN-1二盐酸盐(3–10 mg/kg;腹腔注射;每日一次;持续2或4周)可有效诱导红细胞中胎儿血红蛋白(HbF)水平,并降低镰状细胞病(SCD)的病理损伤[2]。在1/6大鼠中,腹腔注射RN-1二盐酸盐(10 mg/kg)24小时后,脑/动脉暴露比为88.9。
训练后立即全身注射RN-1(10 mg/kg,腹腔注射)可完全消除小鼠在新物体识别(NOR)任务中的长期记忆形成,该结果在24小时后进行测试时显示。然而,在训练后90分钟进行测试时,该药物对短期记忆形成没有影响。[1]
酶活实验
HRP偶联检测:将重组人LSD1(Δ1-157)与二甲基化的H3K4肽底物孵育。LSD1的去甲基化作用产生H2O2,H2O2在辣根过氧化物酶(HRP)存在下与ADHP(10-乙酰基-3,7-二羟基吩恶嗪)反应生成荧光氧化产物。荧光强度与酶活性成正比。抑制剂在加入底物前与酶预孵育10分钟,反应进行20分钟。IC50值由剂量反应曲线确定。
TR-FRET检测:该检测方法利用时间分辨荧光能量转移(TR-FRET)直接检测LSD1对H3K4Me2肽底物去甲基化产生的H3K4Me1产物。该检测采用多标记酶标仪进行。
直接质谱(RapidFire MS)检测:LSD1 去甲基化反应在与 HRP 检测相同的条件下进行。反应用甲酸终止,并使用与三重四极杆质谱仪联用的自动质谱系统(RapidFire-MS)直接定量 H3K4Me2 向 H3K4Me1 和 H3K4Me0 产物的转化。监测产物离子峰进行定量。[1]
细胞实验
将来自镰状细胞贫血症 (SCD) 小鼠的谱系标记阴性 (Lin⁻) 骨髓细胞进行培养,并诱导其发生终末红系分化。培养一天后,用表达 PGC-1α (Ad-PGC-1α) 或 GFP (Ad-GFP) 的腺病毒(作为对照)感染细胞。在指定时间点收集感染细胞,用于 QRT-PCR、Western blot 和流式细胞术分析。PGC-1α 的过表达导致人胎儿 γ-珠蛋白和鼠胚胎 εγ- 和 βh1-珠蛋白 mRNA 水平升高。[2]
在体外红系分化实验中,将动员的 CD34⁺ 祖细胞分化为人原代红系细胞,并用 RN-1 (0.5 µM) 处理,同时加入对照药物 (HU、TC、DAC)。评估 γ-珠蛋白的积累。[2]
动物实验
动物/疾病模型:镰状细胞病 (SCD) 小鼠 [2]
剂量:3mg/kg 或 10mg/kg
给药途径:腹腔注射;1 二盐酸盐显著损害长期记忆,但不损害短期记忆 [1]。常规;连续 2 或 4 周
实验结果:有效诱导红细胞中 HbF 水平,并减轻 SCD 小鼠的疾病病理。
记忆形成(新物体识别):** C57BL/6 雄性小鼠在包含两个相同物体的场地中接受 10 分钟的训练。训练结束后,立即对小鼠进行单次腹腔注射 RN-1 (10 mg/kg) 或载体。为了进行长期记忆测试,24小时后将小鼠放回实验场地,场地内放置一个熟悉的物体和一个新物体,并记录小鼠10分钟的探索时间。为了进行短期记忆测试,另一组小鼠接受类似的训练,并在训练后90分钟进行测试。[1]
**药代动力学研究:** C57BL/6雄性小鼠单次腹腔注射RN-1(10 mg/kg)。在给药后24小时内的多个时间点采集血液和脑组织。使用LC-MS/MS分析血浆和脑匀浆中RN-1的浓度。[1]

记忆形成(新物体识别):C57BL/6雄性小鼠在放置两个相同物体的实验场地中接受10分钟的训练。训练结束后,立即对小鼠进行单次腹腔注射RN-1(10 mg/kg)或载体。为了进行长期记忆测试,24小时后将小鼠放回实验场地,并放入一个熟悉的物体和一个新奇的物体,记录其10分钟的探索时间。为了进行短期记忆测试,另一组小鼠接受类似的训练,并在训练后90分钟进行测试。[1]
药代动力学研究:C57BL/6雄性小鼠单次腹腔注射RN-1(10 mg/kg)。在给药后24小时内的多个时间点采集血液和脑组织。使用液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)分析血浆和脑匀浆中RN-1的浓度。[1]
药代性质 (ADME/PK)
在雄性C57BL/6小鼠腹腔单次注射RN-1(10 mg/kg)后,血浆最大浓度(Cmax)为541.7 ng/mL,达峰时间(Tmax)为0.08小时。血浆浓度-时间曲线下面积(AUCinf)为17,661.2 h/ng/mL。在脑组织中,Cmax为11,390.5 ng/mL,Tmax为2.0小时,AUCinf为157,682.4 h/ng/mL。脑组织与血浆的暴露比(脑组织AUCinf/血浆AUCinf)为88.9。RN-1在脑组织匀浆中的结合率为95.5%。[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
在接受每日剂量高达 10 µg/g 的 RN-1 治疗 4 周的 SCD 小鼠中,未观察到明显的副作用。血清化学分析显示,总胆红素、乳酸脱氢酶、天冬氨酸转氨酶和丙氨酸转氨酶的水平呈剂量和时间依赖性降低,表明溶血和肝脏应激减轻。尿液分析参数显示,治疗后蛋白质和胆红素清除,未观察到其他与治疗相关的影响。[2]
参考文献

[1]. Brain-penetrant LSD1 inhibitors can block memory consolidation. ACS Chem Neurosci. 2012 Feb 15;3(2):120-128.

[2]. The LSD1 inhibitor RN-1 induces fetal hemoglobin synthesis and reduces disease pathology in sickle cell mice. Blood. 2015 Jul 16;126(3):386-96.

[3]. Analysis of the levels of lysine-specific demethylase 1 (LSD1) mRNA in human ovarian tumors and the effects of chemical LSD1 inhibitors in ovarian cancer cell lines. J Ovarian Res. 2013 Oct 29;6(1):75.

其他信息
RN-1是一种源自帕纳特(反苯环丙胺)骨架的、可穿透血脑屏障的不可逆LSD1抑制剂。与MAO-A和MAO-B相比,它是一种高效且选择性的LSD1抑制剂。研究表明,RN-1对LSD1的抑制作用可以阻断小鼠的长期记忆巩固,而不影响短期记忆,这凸显了LSD1介导的组蛋白去甲基化在记忆形成中的作用。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
精确质量
451.179
CAS号
1781835-13-9
PubChem CID
129626553
外观&性状
White to off-white solid powder
tPSA
44.8
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
492
定义原子立体中心数目
2
SMILES
Cl.Cl.O=C(CNC1CC1C1C=CC(=CC=1)OCC1C=CC=CC=1)N1CCN(C)CC1
InChi Key
WMHAFZOOUBPQRX-VSIGASKDSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H29N3O2.2ClH/c1-25-11-13-26(14-12-25)23(27)16-24-22-15-21(22)19-7-9-20(10-8-19)28-17-18-5-3-2-4-6-18/h2-10,21-22,24H,11-17H2,1H32*1H/t21-,22+/m0../s1
化学名
2-(((trans)-2-(4-(Benzyloxy)phenyl)cyclopropyl)amino)-1-(4-methylpiperazin-1-yl)ethanone Dihydrochloride
别名
RN1 RN 1 RN-1 Dihydrochloride
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O : ~20 mg/mL (~44.21 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 20 mg/mL (44.21 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶。 (<60°C).

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Covalent inhibition assays. (A) LSD1 enzyme was incubated with the inhibitor RN-1 and then diluted to determine if inhibitor dissociation occurs. DMSO was used as the control in this reaction. RN-1 inhibited the enzyme at high dilutions indicating that inhibition was not reversible. (B) Representative progress curves for LSD1 activity in the presence of varying concentrations of RN-1. LSD1 enzyme was incubated with the inhibitor RN-1 and then serially diluted at 1 min time intervals to determine if the inhibitor would dissociate. DMSO was used as the control in this reaction. RN-1 can be diluted and enzyme activity partially restored up to 4 min after initial incubation. After this time, LSD1 remains fully inhibited even after a 1:100 dilution.[1].Ramesh Neelamegam, et al. Brain-penetrant LSD1 inhibitors can block memory consolidation. ACS Chem Neurosci. 2012 Feb 15;3(2):120-128.
  • Mean plasma and brain concentration–time profiles of RN-1 following a single intraperitoneal administration to C57BL/6 male mice, 10 mg/kg (n = 3) × (9 time points).[1].Ramesh Neelamegam, et al. Brain-penetrant LSD1 inhibitors can block memory consolidation. ACS Chem Neurosci. 2012 Feb 15;3(2):120-128.
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