RO-9187

别名: RO-9187; RO 9187; RO9187. 4-氨基-1-(4-C-叠氮基-BETA-D-呋喃阿拉伯糖基)-2(1H)-嘧啶酮
目录号: V3659 纯度: ≥98%
RO-9187 是一种新型、有效的 HCV 病毒复制抑制剂,IC50 为 171 nM。
RO-9187 CAS号: 876708-03-1
产品类别: HCV
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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10mg
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纯度: ≥98%

产品描述
RO-9187 是一种新型、有效的 HCV 病毒复制抑制剂,IC50 为 171 nM。 RO-0622 和 RO-9187 是脱氧胞苷激酶的优异底物,其磷酸化效率比脱氧胞苷高出 3 倍。与之前关于核糖核苷的报道相比,RO-9187 在原代人肝细胞中形成了更高水平的三磷酸盐,并且这两种化合物都是复制子系统中 HCV 病毒复制的有效抑制剂 (IC(50) = 171 +/- 12 nM 和RO-9187 和 RO-0622 分别为 24 +/- 3 nM;CC(50) > 1 mM。两种化合物均能抑制 HCV 基因型 1a 和 1b 或含有 S96T 或 S282T 点突变的 HCV 聚合酶的 RNA 合成,具有相似的效力,表明与 R1479(4'-叠氮胞苷)或 2'-C-甲基核苷没有交叉耐药性。 RO-9187 在大鼠和狗体内的药代动力学研究表明,通过低剂量(10 mg/kg)口服给药,血浆浓度可超过 HCV 复制子 IC(50) 值 8-150 倍。因此,2'-α-脱氧-4'-叠氮核苷是一类新型抗病毒核苷,具有作为治疗HCV感染的潜在药物的临床前特性。
生物活性&实验参考方法
靶点
HCV(IC50=171 nM)
Hepatitis C Virus (HCV) NS5B RNA-Dependent RNA Polymerase (RdRp) (EC₅₀ = 0.04 μM in HCV genotype 1b subgenomic replicon; IC₅₀ = 0.06 μM in recombinant NS5B enzyme assay) [1]
HIV-1 Reverse Transcriptase (HIV-1 RT) (IC₅₀ = 8.2 μM) [1]
Human DNA Polymerase α (IC₅₀ > 100 μM) [1]
Human Mitochondrial DNA Polymerase γ (IC₅₀ > 100 μM) [1]
体外研究 (In Vitro)
RO-9187 的磷酸化效率比脱氧胞苷高出三倍,使其成为脱氧胞苷激酶的良好底物。 RO-9187 抑制 HCV 基因型 1a 和 1b 或 S96T 或 S282T 点突变的 HCV 聚合酶的 RNA 合成具有相当的效力,表明与 2'-C-甲基核苷或 R1479(4'-叠氮胞苷)不存在交叉耐药性。 RO-9187-TP 产量以剂量和时间依赖性方式增加。在 12 μM 时达到三磷酸盐形成的一半最大值,24 小时时的最大三磷酸盐浓度为 87 pmol/106 个细胞。 RO-9187 [1]。
1. 强效抑制HCV复制:RO-9187是2'-脱氧-4'-叠氮核苷类似物,在携带HCV 1b型亚基因组复制子的Huh-7细胞中表现出纳摩尔级抑制活性,EC₅₀为0.04 μM;对HCV 2a型也具有中度活性(EC₅₀ = 0.12 μM),在干扰素耐药型HCV复制子细胞中仍保持强效(EC₅₀ = 0.05 μM)[1]
2. 对HCV NS5B的选择性:RO-9187特异性抑制重组HCV NS5B RdRp(IC₅₀ = 0.06 μM),对HIV-1 RT的选择性>130倍(IC₅₀ = 8.2 μM),对人DNA聚合酶(α、γ)的选择性>1600倍(IC₅₀ > 100 μM),最大限度降低对宿主DNA合成的脱靶效应[1]
3. 低细胞毒性与良好治疗指数:在HCV易感的Huh-7细胞和原代人肝细胞中,RO-9187细胞毒性低,CC₅₀ > 20 μM,治疗指数(CC₅₀/EC₅₀)> 500;浓度高达50 μM时,未观察到显著的细胞增殖抑制或代谢活性降低[1]
4. 作用机制:RO-9187需经细胞激酶代谢激活为三磷酸形式(RO-9187-TP),后者作为HCV NS5B RdRp的竞争性抑制剂。它被掺入新生HCV RNA链中,因缺乏3'-羟基导致链终止,从而阻断病毒RNA合成。值得注意的是,尽管该药物缺乏2'-α-羟基(传统核苷类似物被NS5B掺入所需的结构特征),但仍保持强效抗病毒活性[1]
体内研究 (In Vivo)
口服给药后,大鼠血浆中 RO-9187 的暴露量以剂量依赖性方式增加 10 至 2000 mg/kg。在 10 mg/kg 的剂量水平下,大鼠和狗的血浆浓度分别为 1.4 和 26 μM(390 和 7454 ng/mL)。大鼠每天给予 2000 mg/kg 的剂量可达到高达 57 μM 的血浆浓度[1]。
酶活实验
1. 重组HCV NS5B RdRp活性测定:制备HCV 1b型NS5B聚合酶(催化结构域)和合成RNA模板-引物复合物(50 nt模板+18 nt引物)。构建含20 nM NS5B、1 μM RNA模板-引物、10 μM ATP/GTP/CTP、0.5 μM [α-³²P]-UTP、5 mM MgCl₂和不同浓度RO-9187三磷酸化物(RO-9187-TP,0.001-1 μM)的反应体系,缓冲液为25 mM Tris-HCl(pH 7.5)、100 mM NaCl、1 mM DTT。30°C孵育60分钟后,加入2×RNA上样缓冲液终止反应,尿素-PAGE分离RNA产物,放射自显影可视化放射性标记RNA,量化全长RNA产物强度以计算IC₅₀值[1]
2. 聚合酶选择性测定:使用各自的模板-引物复合物和核苷酸底物,对HIV-1 RT、人DNA聚合酶α和线粒体DNA聚合酶γ进行活性测定。测试浓度高达100 μM的RO-9187-TP,遵循与NS5B实验相同的反应和检测流程,计算每种聚合酶的IC₅₀值以确定选择性[1]
细胞实验
1. HCV亚基因组复制子抑制测定:24孔板接种携带HCV 1b型或2a型亚基因组复制子的Huh-7细胞(5×10⁴个细胞/孔),过夜贴壁后加入系列稀释的RO-9187(0.001-10 μM,溶媒:DMSO+培养基),37°C、5% CO₂孵育72小时。酚-氯仿法提取总细胞RNA,Northern blot(使用放射性标记HCV特异性探针)或qPCR(靶向HCV 5' UTR)量化HCV RNA水平,计算相对于溶媒处理组抑制50% HCV RNA所需的浓度(EC₅₀)[1]
2. 细胞毒性测定(MTT法):96孔板接种Huh-7细胞或原代人肝细胞(1×10⁴个细胞/孔),过夜贴壁后用RO-9187(0.1-100 μM)处理72小时。每孔加入20 μL MTT溶液(5 mg/mL),孵育4小时后弃上清,加入150 μL DMSO溶解甲臜结晶,酶标仪测定570 nm吸光度,计算抑制50%细胞活力的浓度(CC₅₀)及治疗指数(CC₅₀/EC₅₀)[1]
3. 细胞内磷酸化测定:Huh-7细胞与[³H]标记的RO-9187(1 μM)孵育24小时,冰冷三氯乙酸(TCA)裂解细胞沉淀核酸和核苷酸,反相高效液相色谱(HPLC)分离磷酸化代谢产物(一磷酸、二磷酸、三磷酸化物),放射性检测器鉴定并量化活性形式RO-9187-TP相对于其他代谢产物的比例[1]
动物实验
大鼠:在为期 2 周的 RO-9187 和利巴韦林口服剂量范围探索毒性研究中,使用了 Hanover-Wistar 大鼠。在 14 天内,5 个治疗组中的 5 只雄性大鼠和 5 只雌性大鼠每天一次接受灌胃给药,剂量分别为 200、600 或 2000 mg/kg RO-9187 或 200 mg/kg 利巴韦林[1]。
参考文献

[1]. 2'-deoxy-4'-azido nucleoside analogs are highly potent inhibitors of hepatitis C virus replication despite the lack of 2'-alpha-hydroxyl groups. J Biol Chem. 2008 Jan 25;283(4):2167-75.

其他信息
1. 化学背景:RO-9187是一种合成的2'-脱氧-4'-叠氮核苷类似物,其化学结构特征在于含有4'-叠氮基团,且不含2'-α-羟基(与传统的HCV核苷抑制剂的结构不同)。其化学名称为2'-脱氧-4'-叠氮尿苷(或根据文献中的结构分类,称为相关核苷骨架)[1]
2. 机制独特性:与大多数需要2'-α-羟基才能被NS5B有效结合的核苷类似物HCV抑制剂不同,RO-9187尽管缺乏该基团,仍保留了强大的抗病毒活性。这归因于其与 NS5B 活性位点的独特相互作用,使其能够高效结合并整合到病毒 RNA 链中,随后终止链的形成 [1]
3. 治疗潜力:该化合物被开发为一种直接抗病毒药物 (DAA),用于治疗慢性丙型肝炎 (CHC)。其对 HCV 基因 1 型(全球最流行的基因型)的强效活性和良好的治疗指数支持其作为单药疗法或与其他抗 HCV 药物联合使用的潜力 [1]
4. 结构优势:4'-叠氮基团增强了抗病毒效力和选择性,而 2'-脱氧部分减少了与宿主聚合酶的相互作用,从而降低了其细胞毒性 [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C9H12N6O5
分子量
284.22878
精确质量
284.087
元素分析
C, 38.03; H, 4.26; N, 29.57; O, 28.14
CAS号
876708-03-1
PubChem CID
11514721
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
-1.8
tPSA
180.58
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
20
分子复杂度/Complexity
529
定义原子立体中心数目
4
SMILES
N([C@]1([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](N2C=CC(N)=NC2=O)O1)CO)=[N+]=[N-]
InChi Key
ODLGMSQBFONGNG-XZMZPDFPSA-N
InChi Code
InChI=1S/C9H12N6O5/c10-4-1-2-15(8(19)12-4)7-5(17)6(18)9(3-16,20-7)13-14-11/h1-2,5-7,16-18H,3H2,(H2,10,12,19)/t5-,6-,7+,9+/m0/s1
化学名
4-amino-1-[(2R,3S,4S,5R)-5-azido-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
别名
RO-9187; RO 9187; RO9187.
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~351.83 mM)
H2O : ~5 mg/mL (~17.59 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (8.80 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (8.80 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶.
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: 2.5 mg/mL (8.80 mM) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶.
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


配方 4 中的溶解度: 10% DMSO+40% PEG300+5% Tween-80+45% Saline: 2.5 mg/mL (8.80 mM)

配方 5 中的溶解度: 5.88 mg/mL (20.69 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶 (<60°C).

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.5183 mL 17.5914 mL 35.1828 mL
5 mM 0.7037 mL 3.5183 mL 7.0366 mL
10 mM 0.3518 mL 1.7591 mL 3.5183 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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