Romidepsin (FK228, FR901228, Depsipeptide, NSC630176)

别名: NSC 630176;FK228; FK 228; FK-228; FR901228; FR-901228; FR 901228; NSC-630176; NSC-630176; depsipeptide; US trade name: Istodax. 罗米地辛;2,2',3,4,4',5,5'-七溴联苯;Romidepsin (FK228, Depsipeptide) 抑制剂;罗米迪司肽;罗米地辛标准品;FK228 罗米地辛;罗米地辛, 一种有效的HDAC1和HDAC2抑制剂
目录号: V0261 纯度: ≥98%
Romidepsin(以前称为 FK-228、FR-901228、Depsipeptide、NSC-630176;商品名 Istodax)是一种新型、有效、天然存在的双环缩酚肽抗生素,从紫色色杆菌中分离出来,具有潜在的抗癌活性。
Romidepsin (FK228, FR901228, Depsipeptide, NSC630176) CAS号: 128517-07-7
产品类别: HDAC
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
2mg
5mg
10mg
25mg
50mg
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
Romidepsin(以前称为 FK-228、FR-901228、Depsipeptide、NSC-630176;商品名 Istodax)是一种新型、有效、天然存在的双环缩酚肽抗生素,从紫色色杆菌中分离出来,具有潜在的抗癌活性。 Romidepsin 是一种有效的组蛋白脱乙酰酶 (HDAC1/2) 抑制剂,在无细胞测定中 IC50 分别为 36 nM 和 47 nM。细胞内激活后,罗米地辛结合并抑制 HDAC,导致基因表达改变并诱导细胞分化、细胞周期停滞和凋亡。美国FDA于2009年11月批准罗米地辛用于治疗皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL),并于2011年6月批准罗米地辛用于治疗其他外周T细胞淋巴瘤(PTCL)。
生物活性&实验参考方法
靶点
HDAC1 ( IC50 = 36 nM ); HDAC2 ( IC50 = 47 nM ); HDAC4 ( IC50 = 510 nM ); HDAC6 ( IC50 = 14000 nM )
体外研究 (In Vitro)
体外活性:与TSA不同,罗米地辛的活性形式redFK强烈抑制HDAC1和HDAC2,IC50分别为1.6 nM和3.9 nM,但抑制HDAC4和HDAC6相对较弱,IC50分别为25 nM和790 nM。 Romidepsin 对这些 HDAC 的抑制作用比 redFK 弱 17-23 倍,IC50 分别为 36 nM、47 nM、510 nM 和 14 μM。 Romidepsin 在 HeLa 细胞中的处理可诱导组蛋白乙酰化和 p21 表达,EC50 为 3.0 nM,由于 redFK 的不稳定性,其 EC50 为 11 nM,比 redFK 更强。除了 G2/M 停滞之外,Romidepsin 治疗还会导致细胞周期蛋白 D1 下调和 p53 独立的 p21 诱导,从而抑制 CDK 和 Rb 去磷酸化,从而导致 G1 早期生长停滞。罗米地辛抑制 A549 细胞增殖的作用比 TSA 强 100 倍,比丁酸盐强 1,000,000 倍。 Romidepsin 抑制 U-937、K562 和 CCRF-CEM 细胞的生长,IC50 分别为 5.92 nM、8.36 nM 和 6.95 nM。 Romidepsin 在与 H3 和 H4 乙酰化和 HDAC 抑制发生相对应的浓度下促进慢性淋巴细胞白血病 (CLL) 细胞凋亡,选择性涉及 caspase 8 和效应 caspase 3 的激活以及 c-FLIP 蛋白的下调。在 13 种肾细胞癌细胞系中的 11 种 (85%) 和 37 种其他癌细胞系中的 16 种 (43%) 中,罗米地辛治疗上调肿瘤死亡受体,并增强自然杀伤 (NK) 介导的肿瘤杀伤作用。罗米地辛对一组套细胞淋巴瘤 (MCL) 细胞系表现出浓度依赖性细胞毒性 激酶测定:对于酶测定,将 10 μL [3H]乙酰基标记的组蛋白 (25,000 cpm/10 μg) 添加到 90 μL 的在浓度不断增加的罗米地辛存在下,从过表达 HDAC1 或 HDAC2 的 293T 细胞中提取 HDAC 酶组分,并将混合物在 37°C 下孵育 15 分钟。酶反应至少 1 小时呈线性。加入 10 μL 浓 HCl 终止反应。释放出的[3H]乙酸用1mL乙酸乙酯萃取,取0.9mL溶剂层加入5mL计数闪烁液II水溶液中,测定放射性。 IC50值由至少三个独立的剂量反应曲线确定。细胞测定:将细胞在 96 孔板中暴露于不同浓度的罗米地辛 72 小时。将 20 μL 5 mg/mL MTT 溶液的 PBS 添加到每个孔中,持续 4 小时。除去培养基后,向每孔中添加 170 μL DMSO 以溶解甲臜晶体。测定 540 nm 处的吸光度。此外,将细胞与台盼蓝一起孵育,并在血细胞计数器中计数蓝色(死)细胞和透明(活)细胞的数量。对于细胞周期分析,将细胞在含有 0.05 mg/mL 碘化丙啶、1 mM EDTA、0.1% Triton X-100 和 1 mg/mL RNase A 的 PBS 溶液的碘化丙啶染色溶液中孵育 30 分钟。然后使悬浮液通过尼龙网过滤器并在 Becton Dickinson FACScan 上进行分析。
体内研究 (In Vivo)
在基质胶塞测定中,罗米地辛治疗可有效抑制鸡胚和成年小鼠的新血管形成。每周两次给予罗米地辛 0.1-1 mg/kg 可显着延长患有 U-937 淋巴瘤的小鼠的生存期,中位生存时间分别为 30.5 天(0.56 mg/kg)和 33 天(0.32 mg/kg)(对比. 对照小鼠 20 天)。
酶活实验
在酶测定中,在浓度不断增加的罗米地辛存在下,从过表达 HDAC1 或 HDAC2 的 293T 细胞中提取的 90 μL HDAC 酶组分与 10 μL [3H]乙酰基标记的组蛋白混合( 25,000 cpm/10 微克)。然后将混合物在 37°C 下孵育 15 分钟。在至少 60 分钟内,酶反应呈线性。加入 10 μL 浓 HCl 终止反应。为了测定放射性,用 1 mL 乙酸乙酯萃取释放的 [3H]乙酸后,将 0.9 mL 溶剂层添加到 5 mL 计数闪烁剂 II 水溶液中。至少使用三个单独的独立剂量反应曲线来计算IC50值。
细胞实验
在 96 孔板中,细胞暴露于不同剂量的罗米地辛,持续 72 小时。在 4 小时内,向每个孔中添加 20 μL 5 mg/mL MTT 的 PBS 溶液。为了溶解甲臜晶体,在除去培养基后向每个孔中添加 170 μL DMSO。在 540 nm 处,计算吸光度。此外,将台盼蓝添加到细胞中,并在血细胞计数器中计数透明(活)和蓝色(死)细胞的数量。将细胞在含有 0.05 mg/mL 碘化丙啶、1 mM EDTA、0.1% Triton X-100 和 1 mg/mL RNase A 的 PBS 溶液的碘化丙啶染色溶液中孵育 30 分钟,以进行细胞周期分析。然后,悬浮液通过尼龙网过滤器后,使用 Becton Dickinson FACScan 进行检查。
动物实验
Male scid mice inoculated i.p. with U-937 cells
~1 mg/kg once or twice a week
Treated i.p.
参考文献

[1]. Cancer Res . 2002 Sep 1;62(17):4916-21.

[2]. Br J Cancer . 2000 Sep;83(6):817-25.

[3]. Mol Cancer Ther . 2002 Sep;1(11):937-41.

[4]. Int J Cancer . 2002 Jan 20;97(3):290-6.

[5]. Biochem Pharmacol . 2002 Oct 1;64(7):1079-90.

[6]. Blood . 2003 Jul 15;102(2):652-8.

[7]. Cancer Res . 2006 Jul 15;66(14):7317-25.

[8]. Clin Cancer Res . 2008 Jan 15;14(2):549-58.

[9]. Clin Cancer Res . 2010 Jan 15;16(2):554-65.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C24H36N4O6S2
分子量
540.7
精确质量
540.207
元素分析
C, 53.31; H, 6.71; N, 10.36; O, 17.75; S, 11.86
CAS号
128517-07-7
相关CAS号
128517-07-7
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
942.8±65.0 °C at 760 mmHg
熔点
219-224°C
闪点
524.0±34.3 °C
蒸汽压
0.0±0.3 mmHg at 25°C
折射率
1.529
LogP
0.95
tPSA
193.3
SMILES
S1C([H])([H])[C@]2([H])C(N([H])/C(=C(/[H])\C([H])([H])[H])/C(N([H])C([H])(C(=O)O[C@]([H])(C([H])=C([H])C([H])([H])C([H])([H])S1)C([H])([H])C(N([H])[C@@]([H])(C(N2[H])=O)C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H])=O)C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H])=O)=O |c:27|
InChi Key
OHRURASPPZQGQM-GCCNXGTGSA-N
InChi Code
InChI=1S/C24H36N4O6S2/c1-6-16-21(30)28-20(14(4)5)24(33)34-15-9-7-8-10-35-36-12-17(22(31)25-16)26-23(32)19(13(2)3)27-18(29)11-15/h6-7,9,13-15,17,19-20H,8,10-12H2,1-5H3,(H,25,31)(H,26,32)(H,27,29)(H,28,30)/b9-7+,16-6-/t15-,17-,19-,20+/m1/s1
化学名
(1S,4S,7Z,10S,16E,21R)-7-ethylidene-4,21-di(propan-2-yl)-2-oxa-12,13-dithia-5,8,20,23-tetrazabicyclo[8.7.6]tricos-16-ene-3,6,9,19,22-pentone
别名
NSC 630176;FK228; FK 228; FK-228; FR901228; FR-901228; FR 901228; NSC-630176; NSC-630176; depsipeptide; US trade name: Istodax.
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

Note: This product is not stable in solution, please use freshly prepared working solution for optimal results.
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~10 mg/mL (~18.5 mM)
Water: <1 mg/mL
Ethanol: <1 mg/mL
溶解度 (体外实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.85 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.08 mg/mL (3.85 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.85 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。


配方 4 中的溶解度: 1% DMSO+30% polyethylene glycol+1% Tween 80: 18mg/mL

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8495 mL 9.2473 mL 18.4945 mL
5 mM 0.3699 mL 1.8495 mL 3.6989 mL
10 mM 0.1849 mL 0.9247 mL 1.8495 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
NCT Number Recruitment interventions Conditions Sponsor/Collaborators Start Date Phases
NCT03547700 Active
Recruiting
Drug: Romidepsin
Drug: Ixazomib
Lymphoma, T-Cell, Peripheral Ryan Wilcox November 18, 2021 Phase 1
Phase 2
NCT01638533 Active
Recruiting
Other: Pharmacological Study
Drug: Romidepsin
Glioma
Lymphoma
National Cancer Institute
(NCI)
June 12, 2012 Phase 1
NCT02393794 Active
Recruiting
Drug: Romidepsin
Drug: Cisplatin
Drug: Nivolumab
Breast Cancer
Triple-Negative Breast Cancer
Priyanka Sharma July 17, 2015 Phase 1
Phase 2
NCT02616965 Active
Recruiting
Drug: Brentuximab vedotin
Drug: Romidepsin
Cutaneous T-cell Lymphoma
(CTCL)
Fox Chase Cancer Center February 22, 2017 Phase 1
NCT04747236 Recruiting Drug: Romidepsin
Drug: Azacytidine
PTCL University of Virginia February 19, 2021 Phase 2
生物数据图片
  • Dose response of FK228 on endothelial cells. Int J Cancer . 2002 Jan 20;97(3):290-6.
  • Antiangiogenic activity of FK228 in vitro. Int J Cancer . 2002 Jan 20;97(3):290-6.
  • Effects of FK228 on neovascularization of chick embryo. Int J Cancer . 2002 Jan 20;97(3):290-6.
  • Bortezomib interacts synergistically with romidepsin and belinostat in MCL cell lines. Clin Cancer Res . 2010 Jan 15;16(2):554-65.
  • Bortezomib interacts synergistically with romidepsin and belinostat in MCL cell lines. Clin Cancer Res . 2010 Jan 15;16(2):554-65.
  • Treatment with belinostat but not romidepsin results in increased α-tubulin acetylation, whereas coadministration of bortezomib does not affect this event but blocks proteasomal process of NF-κB components. Clin Cancer Res . 2008 Jan 15;14(2):549-58.
  • Depsipeptide induction of lysine-specific changes in histone acetylation. Blood . 2003 Jul 15;102(2):652-8.
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