Samatasvir

别名: Samatasvir IDX-18719 IDX 18719 沙他司韦;选择性抑制感染性HCV和复制子, 在基因型 1至5 复制子中,EC50在 2 至 24 pM 的范围内
目录号: V7289 纯度: ≥98%
Samatasvir (IDX71) 是一种有效的口服生物活性 NS5A HCV(丙型肝炎病毒)复制抑制剂。
Samatasvir CAS号: 1312547-19-5
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
萨玛他韦 (IDX71) 是一种强效的口服生物活性 NS5A HCV(丙型肝炎病毒)复制抑制剂。萨玛他韦对感染性 HCV(丙型肝炎病毒)及其复制子均具有强效和特异性,对基因型 1 至 5 的复制子 EC50 值在 2 至 24 pM 范围内。
生物活性&实验参考方法
靶点
HCV NS5A protein [1].
体外研究 (In Vitro)
萨马他韦 (IDX719) 不会对 HCV 蛋白酶、核苷酸和非核苷类聚合酶抑制剂产生交叉耐药性,并且在 HIV 和乙型肝炎病毒 (HBV) 抗病毒药物存在的情况下仍能保持完全活性 [1]。
萨马他韦 是一种选择性 HCV 复制抑制剂,具有广泛的基因型活性。它以皮摩尔浓度抑制 1a 和 1b 基因型 HCV 复制子,平均 EC50 值分别为 4.1 pM (H1a-luc) 和 2.4 pM (Zluc)。对于携带 1 至 5 基因型 NS5A 序列的复制子或 2a 基因型 JFH-1 感染性病毒,EC50 值范围为 2 至 24 pM。 EC90/EC50 比值较低,为 2.6 [1]。
Samatasvir 在 14 天内以剂量依赖的方式降低了基因型 1a 复制子 RNA。最大降低量为 4 pM (1× EC50) 时 1.5 log10 和 40 nM (10,000× EC50) 时 4.2 log10。根据剂量不同,最大抑制作用在7至14天内出现,且未观察到病毒反弹[1]。
Samatasvir 已针对17种RNA和DNA病毒进行了测试,结果显示其仅对牛病毒性腹泻病毒(EC50 33.4 μM)和黄热病毒(EC50 16.5 μM)具有微弱活性,对其他所有病毒均无活性,表明其对HCV具有高度特异性[1]。
在基因1b型复制子细胞中与其他抗HCV药物联合使用的研究中,Samatasvir 与干扰素α、利巴韦林、HCV蛋白酶抑制剂(西美普韦)、核苷类抑制剂(IDX184)和非核苷类聚合酶抑制剂(TMC647055)联合使用时,根据Bliss独立性和Loewe相加性模型确定,显示出总体相加效应[1]。在浓度为5倍Cmax当量浓度的情况下,即使存在抗HIV和抗HBV药物(克力芝、齐多夫定、依非韦伦、拉替拉韦、拉米夫定、替诺福韦、替比夫定),萨马他韦仍保持完全活性,EC50的倍数变化小于2 [1]。
利用1a基因型复制子进行的耐药性筛选实验发现,NS5A蛋白前100个氨基酸中的M28、Q30、L31、P32和Y93位点的氨基酸替换赋予了萨马他韦耐药性。其中,Y93H替换最为常见,导致活性降低了4400倍。其他氨基酸替换,例如 Q30E(耐药倍数 420 倍)、L31V(耐药倍数 420 倍)和 P32L(耐药倍数 170 倍),也赋予了 1a 基因型病毒高水平的耐药性。在 1b 基因型病毒复制子中,耐药水平通常较低(例如,Y93H:耐药倍数 93 倍,L31M:耐药倍数 3.6 倍)。萨马他韦 与 HCV 蛋白酶抑制剂(例如,R155K、A156T、D168V)、核苷类(S282T)或非核苷类聚合酶抑制剂(C316Y、M414T、M423T)无交叉耐药性[1]。
细胞实验
对于HCV复制活性检测,将Zluc(基因型1b)、NS5A IGT或H1a-luc(基因型1a)细胞接种于96孔板中。至少4小时后,开始药物处理,细胞培养3天。使用ONE-Glo荧光素酶检测试剂盒测定荧光素酶活性,以确定EC50值。对于联合用药检测,将Zluc和Huh-7细胞接种于96孔板中,并以5×5棋盘格设计进行药物稀释处理。同时使用CellTiter-Blue细胞活力检测试剂盒平行测定细胞毒性。使用Bliss独立性模型(MacSynergy II)、Loewe加性模型(CombiTool)和组合指数模型(CalcuSyn)分析数据,以评估协同/拮抗作用[1]。
对于延长处理时间的复制子检测,将H1a细胞接种于含有化合物的培养基中,并进行培养。细胞每3-4天传代一次,使用新鲜的含化合物培养基。分别于第0、3、7、10和14天使用High Pure RNA分离试剂盒提取RNA。采用TaqMan一步法RT-PCR预混液,结合针对复制子5'-UTR的特异性引物和探针,通过实时定量RT-PCR检测复制子RNA,并以人GAPDH内源性对照进行标准化[1]。
对于HCV体外感染核心蛋白ELISA,将HPC细胞接种于96孔板中。4小时后,加入JFH-1 HCV病毒原液和药物系列稀释液。16小时后,移除接种物,并用药物继续培养4天。细胞经固定、封闭后,与抗HCV核心蛋白抗体孵育,随后与HRP标记的二抗孵育。使用 OPD 溶液启动显色反应,并在 490 nm 处测量吸光度 [1]。
对于细胞毒性试验,将各种细胞系(HepG2、HepaRG、CAKI-1、CCRF-CEM、COLO-205、SJCRH30、SNB-78)接种,并用化合物的系列稀释液处理 3 天(HepaRG 细胞处理 14 天)。使用 CellTiter-Blue、CellTiter-Glo、WST-1 或 In Cytotox 毒性测试系统(针对 HepG2 细胞,测量 LDH、葡萄糖消耗、XTT 和酸性磷酸酶)测定细胞活力 [1]。
对于非 HCV 抗病毒活性试验,根据病毒的不同,采用标准细胞保护 (CPE) 试验、报告基因(HIV)试验或噬斑减少试验。将预定滴度的病毒稀释后加入每个孔中。针对每种病毒均使用了适当的病毒抑制阳性对照[1]。
为了筛选耐药细胞系,将H1a-luc细胞在0.25 mg/ml G418和递增浓度的Samatasvir(起始浓度为2× EC50,递增至256× EC50)存在下培养90天,以生成耐药细胞系。对NS3至NS5b基因组区域进行群体测序,并对NS5A氨基末端区域(氨基酸1-100)进行克隆测序[1]。
对于瞬时转染实验,将野生型或突变型复制子RNA电穿孔导入HPC细胞,然后进行铺板。约4小时后,加入药物的系列稀释液,并将细胞孵育4天以确定EC50值[1]。
药代性质 (ADME/PK)
文献指出,在临床研究中,Samatasvir 最初的评估剂量为每日 1 至 100 mg。其药代动力学呈剂量比例关系,末端半衰期约为 24 小时,支持每日一次给药方案 [1]。
蛋白结合实验表明,在 40% 人血清存在下,Samatasvir 在 1b 基因型复制子中的活性降低了 10.4 倍。利用在 10% 至 50% 人血清中获得的 EC50 和 EC90 值,并进行线性回归分析,将 100% 血清校正后的平均 EC50 和 EC90 值分别外推至 55.5 pM 和 214 pM [1]。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
Samatasvir 表现出良好的细胞毒性特征。在 Zluc 基因型 1b 复制子细胞系中,其 CC50 > 100 μM,选择性指数 > 5 × 10⁷。在人肝细胞系(HepG2、HepaRG)和非肝细胞系(CAKI-1、CCRF-CEM、COLO-205、SJCRH30、SNB-78)中,治疗 3 天或 14 天后,CC50 值均 > 50 μM 或 > 100 μM。在 HepG2 细胞中,多参数细胞毒性试验显示,在浓度高达 100 μM 的情况下,四个不同终点指标(LDH 释放、葡萄糖消耗、XTT 代谢、酸性磷酸酶活性)均未观察到可测量的细胞毒性。当Samatasvir与其他抗HCV、抗HIV或抗HBV药物联合使用时,未观察到细胞毒性[1]。
参考文献

[1]. In vitro activity and resistance profile of samatasvir, a novel NS5A replication inhibitor of hepatitis C virus. Antimicrob Agents Chemother. 2014;58(8):4431-4442.

其他信息
Samatasvir 已用于研究丙型肝炎、慢性丙型肝炎病毒和慢性丙型肝炎感染的治疗试验。
Samatasvir (IDX719) 是一种新型、高效且选择性的泛基因型 HCV NS5A 抑制剂,旨在增强对 HCV 基因型 1-5 的活性,且 EC50 值范围较窄 (2-24 pM) [1]。
NS5A 是一种参与 HCV 复制和病毒颗粒成熟的非结构蛋白。尽管其确切功能尚未完全阐明,但它是经临床验证的抗HCV治疗靶点[1]。
在临床研究中,每日服用25至100毫克Samatasvir 3天后,HCV基因型1至4的受试者病毒载量最多可降低4个log10。在基线时携带NS5A M31多态性的HCV基因型2感染者中,观察到抗病毒反应降低。Samatasvir在迄今为止的所有临床试验中均显示出良好的安全性和耐受性[1]。
与其他HCV直接抗病毒药物无交叉耐药性以及体外联合用药的叠加效应数据支持其作为全口服、无干扰素HCV治疗方案的一部分进行持续开发[1]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C47H48N8O6S2
分子量
885.07
精确质量
884.313
CAS号
1312547-19-5
PubChem CID
58310140
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
折射率
1.675
LogP
10.3
tPSA
231
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
13
重原子数目
63
分子复杂度/Complexity
1620
定义原子立体中心数目
4
SMILES
CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C2=NC3=C(N2)C=C(C=C3)C4=CSC5=C4SC=C5C6=CC=C(C=C6)C7=CN=C(N7)[C@@H]8CCCN8C(=O)[C@@H](C9=CC=CC=C9)NC(=O)OC)NC(=O)OC
InChi Key
ATOLIHZIXHZSBA-BTSKBWHGSA-N
InChi Code
InChI=1S/C47H48N8O6S2/c1-26(2)38(52-46(58)60-3)44(56)55-21-9-13-37(55)43-49-33-19-18-30(22-34(33)50-43)32-25-63-40-31(24-62-41(32)40)27-14-16-28(17-15-27)35-23-48-42(51-35)36-12-8-20-54(36)45(57)39(53-47(59)61-4)29-10-6-5-7-11-29/h5-7,10-11,14-19,22-26,36-39H,8-9,12-13,20-21H2,1-4H3,(H,48,51)(H,49,50)(H,52,58)(H,53,59)/t36-,37-,38-,39+/m0/s1
化学名
methyl N-[(1R)-2-[(2S)-2-[5-[4-[6-[2-[(2S)-1-[(2S)-2-(methoxycarbonylamino)-3-methylbutanoyl]pyrrolidin-2-yl]-3H-benzimidazol-5-yl]thieno[3,2-b]thiophen-3-yl]phenyl]-1H-imidazol-2-yl]pyrrolidin-1-yl]-2-oxo-1-phenylethyl]carbamate
别名
Samatasvir IDX-18719 IDX 18719
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~56.49 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (2.82 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (2.82 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.1299 mL 5.6493 mL 11.2985 mL
5 mM 0.2260 mL 1.1299 mL 2.2597 mL
10 mM 0.1130 mL 0.5649 mL 1.1299 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Reduction in genotype 1a HCV replicon RNA during a 14-day treatment with samatasvir. Genotype 1a replicon cells were treated with compound for 14 days, and RNA samples were collected on days 0, 3, 7, 10, and 14 (vertical lines). HCV replicon replication was measured by amplification of the HCV 5′-UTR by real-time quantitative PCR (RT-qPCR) and normalized to the total RNA, as measured by the housekeeping gene GAPDH, over the course of treatment. The log10 reduction value for the HCV replicon was calculated by subtracting the mean log10 HCV replicon copies/ng RNA of the sample from the mean log10 HCV replicon copies/ng RNA of the untreated control at day 0. The results from the replicates were averaged across 2 to 3 independent experiments and the standard deviation determined.[1].Bilello JP, et al. In vitro activity and resistance profile of samatasvir, a novel NS5A replication inhibitor of hepatitis C virus. Antimicrob Agents Chemother. 2014;58(8):4431-4442.
  • Effect of human serum on the in vitro antiviral activity of samatasvir. Genotype 1b replicon cells were exposed to serial dilutions of samatasvir or the reference drug daclatasvir in increasing concentrations of human serum (10% to 50%). One hundred percent serum-adjusted EC50s of 55.5 and 73.1 pM, respectively, were attained by linear regression analysis. Each data point was derived from the mean of the results from three independent experiments. The error bars represent standard deviations.[1].Bilello JP, et al. In vitro activity and resistance profile of samatasvir, a novel NS5A replication inhibitor of hepatitis C virus. Antimicrob Agents Chemother. 2014;58(8):4431-4442.
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