SGC3027

目录号: V41757 纯度: ≥98%
SGC3027 是 SGC8158 的前药,SGC8158 是一种新型、选择性、有效的蛋白精氨酸 N-甲基转移酶 (PRMT7) 抑制剂,具有抗癌活性。
SGC3027 CAS号: 2624313-13-7
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
SGC3027是SGC8158的前药,SGC8158是一种新型、选择性强效的蛋白质精氨酸N-甲基转移酶(PRMT7)抑制剂,具有抗癌活性。
SGC3027 是 SGC8158 的细胞渗透性前药,SGC8158 是一种高效、选择性强且与 SAM 竞争的蛋白精氨酸甲基转移酶 7 (PRMT7) 抑制剂。SGC3027 是首个高效、选择性强且具有细胞活性的 PRMT7 化学探针。SGC3027 被细胞摄取后,会被细胞内还原酶还原,释放出活性部分 SGC8158,后者进而抑制 PRMT7 甲基转移酶的活性。它可用于研究 PRMT7 在表观遗传学和癌症中的功能。
生物活性&实验参考方法
靶点
PRMT7 (protein arginine methyltransferase 7). SGC3027 is a prodrug that is converted intracellularly to its active form SGC8158. SGC8158 is a potent and selective SAM-competitive inhibitor of PRMT7, with an IC50 of less than 2.5 nM for inhibition of histone H2B (23-37) methylation. PRMT7 catalyzes the formation of monomethylated arginine (MMA) on target proteins, particularly symmetric dimethylation of arginine residues. PRMT7 is involved in gene regulation, DNA damage response, and cancer progression.
体外研究 (In Vitro)
SGC8158 的前药 SGC3027 在细胞内被还原酶降低后释放活性成分。在以 C2C12 细胞进行的细胞研究中,SGC3027 可降低 HSP70 的甲基化水平,IC50 值为 1.3 μM[2]。
在无细胞生化分析中,活性代谢物SGC8158能有效抑制PRMT7甲基转移酶的活性,IC50 < 2.5 nM。这种抑制作用是SAM竞争性的,意味着SGC8158与甲基供体S-腺苷甲硫氨酸(SAM)竞争结合PRMT7。SGC8158对PRMT7具有高度选择性,而对其他PRMT(PRMT1、3、4、5、6、8、9)和其他组蛋白甲基转移酶则无明显选择性。前药SGC3027本身在无细胞分析中几乎没有直接活性,因为它需要还原活化才能释放SGC8158。
体内研究 (In Vivo)
SGC3027在细胞内还原为SGC8158后,可抑制细胞内PRMT7的活性。在C2C12小鼠成肌细胞的细胞实验中,SGC3027抑制其底物HSP70的甲基化,IC50值为1.3-2.4 uM。该化合物可降低细胞内对称二甲基精氨酸(SDMA)的整体水平,而不影响不对称二甲基精氨酸(ADMA)的水平,证实了其对PRMT7的选择性。在B16.F10黑色素瘤细胞中,PRMT7的缺失或SGC3027的抑制会导致DNMT表达降低,内源性逆转录病毒元件(ERV)调控区域的DNA甲基化丢失,从而导致ERV表达增加。SGC3027处理还能调节可变剪接,并影响PRMT4、5和7调控的剪接事件。
酶活实验
PRMT7 酶活性采用甲基转移酶活性测定法进行测定。将重组 PRMT7 酶与生物素标记的肽底物(例如组蛋白 H2B 23-37 或 RPS2 肽)、S-腺苷-[3H]-甲硫氨酸 ([3H]-SAM) 和不同浓度 (0.001-10 uM) 的测试化合物 (SGC8158) 在测定缓冲液中孵育。孵育后,将反应混合物转移至链霉亲和素包被的微孔板或闪烁邻近分析 (SPA) 微珠上,并计数掺入的放射性。IC50 值由剂量-反应曲线计算得出。在 SAM 竞争实验中,改变 SAM 的浓度,并使用 Lineweaver-Burk 图分析抑制模式。通过与其他 PRMT 和甲基转移酶的对比测试来评估选择性。
细胞实验
使用 C2C12、HEK293 或 B16.F10 细胞测定 PRMT7 的细胞抑制情况。将细胞用浓度为 0.1-50 uM 的 SGC3027 处理 24-72 小时。对于 HSP70 甲基化,将 C2C12 细胞用 SGC3027 (0.1-50 uM) 处理 2 小时。裂解细胞,并进行 HSP70 免疫沉淀。使用泛甲基精氨酸抗体(可检测单甲基精氨酸和不对称/对称二甲基精氨酸)或 SDMA 特异性抗体,通过蛋白质印迹法检测 HSP70 的甲基化。通过密度分析计算底物甲基化抑制的 IC50 值。使用 SDMA 特异性抗体,通过蛋白质印迹法检测全细胞裂解液中的 SDMA 总水平。 DNA甲基化分析中,SGC3027处理后提取基因组DNA,并采用亚硫酸氢盐测序或甲基化敏感限制性内切酶消化法进行分析。ERV表达水平通过qRT-PCR检测。可变剪接变化通过RT-PCR或RNA-seq进行分析。
动物实验
SGC3027 的体内活性已在小鼠模型中得到证实。在荷 B16.F10 黑色素瘤小鼠中,SGC3027 治疗(通常剂量范围为 50-150 mg/kg,口服或腹腔注射)可抑制肿瘤中的 PRMT7 活性。药效学终点包括肿瘤组织中 SDMA 水平降低、内源性逆转录病毒 (ERV) 表达增加以及抗肿瘤 T 细胞免疫增强。SGC3027 与免疫检查点抑制剂 (ICI) 联合治疗可诱导强烈的抗肿瘤 T 细胞反应,并通过增加免疫细胞浸润来抑制体内肿瘤生长。该化合物已被用于研究 PRMT7 在癌症免疫中的作用以及对免疫疗法的敏感性。典型的给药方案包括每日或隔日给药,持续 1-2 周。
药代性质 (ADME/PK)
作为一种前药,SGC3027 的设计旨在提高其细胞渗透性和口服生物利用度,优于活性母体化合物 SGC8158。给药后,SGC3027 被吸收并分布至组织,进入细胞后,在细胞内还原酶(可能是硫氧还蛋白还原酶或类似酶)的作用下转化为 SGC8158。目前,公开文献中尚未广泛报道 SGC3027 的药代动力学参数。该化合物以固体或 DMSO 溶液的形式用于研究。体内制剂通常使用 DMSO:PEG300:水或类似的溶剂。SGC3027 在临床前模型中具有足够的稳定性和暴露量,能够达到药效学效应。需要进行详细的药代动力学表征以进行进一步的开发。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
SGC3027 的临床前毒理学数据仅限于细胞活力和耐受性研究。在细胞培养中,浓度高达 50 μM 时,SGC3027 对大多数细胞系不会引起明显的细胞毒性。在小鼠研究中,剂量高达 150 mg/kg 的 SGC3027 通常耐受性良好,未见明显的体重减轻、器官毒性或死亡报告。然而,尚未发表正式的毒理学研究。与所有实验性化学品一样,应遵循标准的实验室安全预防措施。该化合物应在通风橱内操作,并佩戴适当的个人防护装备。如果 SGC3027 要进入临床开发阶段,则需要进行长期毒性研究。
参考文献

[1]. Next-Generation Drugs and Probes for Chromatin Biology: From Targeted Protein Degradation to Phase Separation. Molecules. 2018 Aug 6;23(8). pii: E1958.

[2]. SGC3027 for PRMT7.

其他信息
SGC3027 是首个高效、选择性强且具有细胞活性的 PRMT7 化学探针。它由结构基因组学联盟 (SGC) 作为其化学探针项目的一部分开发。该化合物可供学术研究人员免费使用,用于研究 PRMT7 的生物学特性。由于高极性活性抑制剂 SGC8158 无法穿透细胞膜,因此必须采用前药策略。SGC3027 可用于 PRMT7 靶点验证研究、表观遗传学研究和癌症免疫学研究。该化合物已被用于研究 PRMT7 在选择性剪接、DNA 甲基化和内源性逆转录病毒 (ERV) 表达中的作用的相关文献中。SGC3027 尚未获准用于人类治疗。用于研究的 SGC3027 应以粉末形式储存于 -20°C 并避光。它也以其化学名称为人所知,有时也被称为 SGC-3027。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C41H47CLN6O6S
分子量
787.37
精确质量
786.296
CAS号
2624313-13-7
PubChem CID
137333447
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
5.7
tPSA
199
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
14
重原子数目
55
分子复杂度/Complexity
1470
定义原子立体中心数目
4
SMILES
[C@H]1([C@H](O)[C@@H](CSCCCCN(CC2=CC(C3C=CC(Cl)=CC=3)=CC=C2)C(CC(C)(C)C2C(=O)C(C)=C(C)C(C=2C)=O)=O)O[C@H]1N1C=NC2C(N)=NC=NC=21)O
InChi Key
MLJVGAYSVYMPSB-MSUKGTQXSA-N
InChi Code
InChI=1S/C41H47ClN6O6S/c1-23-24(2)35(51)32(25(3)34(23)50)41(4,5)18-31(49)47(19-26-9-8-10-28(17-26)27-11-13-29(42)14-12-27)15-6-7-16-55-20-30-36(52)37(53)40(54-30)48-22-46-33-38(43)44-21-45-39(33)48/h8-14,17,21-22,30,36-37,40,52-53H,6-7,15-16,18-20H2,1-5H3,(H2,43,44,45)/t30-,36-,37-,40-/m1/s1
化学名
N-[4-[[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methylsulfanyl]butyl]-N-[[3-(4-chlorophenyl)phenyl]methyl]-3-methyl-3-(2,4,5-trimethyl-3,6-dioxocyclohexa-1,4-dien-1-yl)butanamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~250 mg/mL (~317.51 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.08 mg/mL (2.64 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80+,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.2701 mL 6.3503 mL 12.7005 mL
5 mM 0.2540 mL 1.2701 mL 2.5401 mL
10 mM 0.1270 mL 0.6350 mL 1.2701 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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