| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| 250mg |
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| 500mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
HDAC11 ( IC50 = 0.83 μM )
SIS17 is a potent and selective inhibitor of Histone Deacetylase 11 (HDAC11). (IC₅₀ = 0.83 µM when measured using a myristoyl-H3K9 peptide as substrate; IC₅₀ = 270 nM when measured using a myristoyl-SHMT2 peptide as substrate). [1] |
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| 体外研究 (In Vitro) |
在 MCF7 细胞中,SIS17(0-50 μM,6 小时)可提高 SHMT2 的脂肪酰化水平 [1]。在 K562 细胞中,SIS17(48 小时)与奥沙利铂联合显示出良好的细胞毒性 [2]。
在体外酶活性实验中,以肉豆蔻酰化H3K9肽段为底物时,SIS17 抑制HDAC11的IC₅₀为0.83 µM。当使用生理性底物肉豆蔻酰化SHMT2肽段进行测试时,其效力提高,IC₅₀为270 nM。[1] SIS17 对HDAC11表现出高选择性。在100 µM浓度下,它对其他HDAC亚型及sirtuin均无显著抑制,包括I类HDAC(HDAC1, HDAC8)、II类HDAC(HDAC4)和III类sirtuin(SIRT1, SIRT2, SIRT3, SIRT6)。相比之下,参考化合物FT895在相同条件下抑制了HDAC4(IC₅₀ = 25 µM)和HDAC8(IC₅₀ = 9.2 µM)。[1] SIS17 是基于HDAC11独特的去脂肪酰化酶活性特征设计的。它包含一个长的疏水烷基链,旨在利用HDAC11对长链脂肪酰化赖氨酸底物的偏好来赋予选择性,同时包含一个对抑制活性至关重要的锌离子螯合羟肟酸基团。[1] |
| 酶活实验 |
使用基于HPLC的方法测定HDAC11酶活性。将重组HDAC11与肽底物(肉豆蔻酰化H3K9或肉豆蔻酰化SHMT2)在适当的反应缓冲液中孵育。反应进行指定时间后终止。通过反相HPLC分析混合物,以分离并定量底物和产物(去酰化肽段)。通过计算剩余底物或形成产物的百分比来确定酶活性。对于抑制实验,将不同浓度的SIS17 与HDAC11预孵育,然后加入底物。通过绘制剩余酶活性百分比与抑制剂浓度的关系图来确定IC₅₀值。[1]
针对其他HDAC和sirtuin的选择性分析使用类似的活性测定法进行,使用各自的特征性底物(例如,用于去乙酰化酶活性的乙酰化或三氟乙酰化赖氨酸肽段,用于去脂肪酰化酶活性的酰化H3K9肽段)。SIS17 以单一高浓度(100 µM)针对每种酶进行测试以评估选择性。[1] |
| 细胞实验 |
为评估细胞内的靶点结合,用棕榈酸类似物(Alk14, 50 µM)处理MCF7细胞,以代谢标记脂肪酰化蛋白。同时,用递增浓度的SIS17(0, 12.5, 25.0, 50.0 µM)在37°C处理细胞6小时。然后裂解细胞。通过点击化学反应将带有炔基标记的蛋白与生物素标签连接,随后使用链霉亲和素珠进行下拉。使用SHMT2抗体对沉淀的蛋白进行Western blot分析,以特异性检测脂肪酰化SHMT2的水平。SIS17 处理以剂量依赖的方式显著增加了内源性SHMT2的脂肪酰化水平,表明其具有有效的细胞渗透性和对HDAC11活性的抑制能力。[1]
为确认细胞选择性,用SIS17(最高50 µM)处理HEK 293T细胞6小时。然后对细胞裂解物进行Western blot分析,使用抗乙酰化-α-微管蛋白(K40)和抗乙酰化-组蛋白H3的抗体,这些是其他HDAC的常见底物。与泛HDAC抑制剂SAHA不同,SIS17 并未增加这些蛋白的乙酰化水平,证实了其在细胞内对HDAC11的选择性作用。[1] 通过基于LC-MS的检测推断细胞通透性/代谢稳定性。在处理后的细胞裂解物中可以检测到SIS17,而其类似物SIS7则无法检测到,这表明SIS17 具有更好的细胞可利用性。[1] |
| 药代性质 (ADME/PK) |
采用基于液相色谱-质谱联用(LC-MS)的检测方法,在处理后的细胞裂解液中检测到了SIS17,证实了其能够进入细胞。相比之下,在相同条件下未检测到相关抑制剂SIS7,表明SIS17具有更强的细胞渗透性和/或代谢稳定性。[1]
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
SIS17 是采用活性导向的理性设计策略开发的,利用了 HDAC11 对长链脂肪酰赖氨酸修饰而非乙酰赖氨酸的独特水解偏好。[1]
据称,它是首个展现细胞效应的 HDAC11 选择性抑制剂,能够特异性地提高生理性 HDAC11 底物 SHMT2 的脂肪酰化水平。[1] 抑制 HDAC11 介导的 SHMT2 去脂肪酰化被认为可以调节 I 型干扰素受体信号传导,提示其在病毒感染、多发性硬化症和代谢性疾病中具有潜在的治疗价值,尽管在本研究的背景下,这些应用仍属推测。[1] 该化合物是进一步研究 HDAC11 生物学功能的宝贵化学工具。[1] |
| 分子式 |
C21H38N2OS
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|---|---|
| 分子量 |
366.604224681854
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| 精确质量 |
366.27
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| 元素分析 |
C, 68.80; H, 10.45; N, 7.64; O, 4.36; S, 8.75
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| CAS号 |
2374313-54-7
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| PubChem CID |
139035087
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| LogP |
8.7
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| tPSA |
69.4
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
3
|
| 可旋转键数目(RBC) |
17
|
| 重原子数目 |
25
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| 分子复杂度/Complexity |
312
|
| 定义原子立体中心数目 |
0
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| InChi Key |
HSHXDCVZWHOWCS-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C21H38N2OS/c1-2-3-4-5-6-7-8-9-10-11-12-13-14-15-18-22-23-21(24)20-17-16-19-25-20/h16-17,19,22H,2-15,18H2,1H3,(H,23,24)
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| 化学名 |
N'-hexadecylthiophene-2-carbohydrazide
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| 别名 |
SIS17; SIS-17; SIS 17
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意: 该产品在溶液状态不稳定,请现配现用。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO: 73~100 mg/mL (199.1~272.8 mM)
Ethanol: 18 mg/mL |
|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.67 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2 mg/mL (5.46 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.7278 mL | 13.6388 mL | 27.2777 mL | |
| 5 mM | 0.5456 mL | 2.7278 mL | 5.4555 mL | |
| 10 mM | 0.2728 mL | 1.3639 mL | 2.7278 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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