SNIPER(BRD)-1

目录号: V31757 纯度: ≥98%
SNIPER(BRD)-1 是一种新型、有效的 IAP 拮抗剂
SNIPER(BRD)-1 CAS号: 2095244-54-3
产品类别: New2
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1mg
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产品描述
SNIPER(BRD)-1 是一种新型高效的 BRD4 降解剂,由 IAP 拮抗剂 LCL-161 衍生物和 BET 抑制剂 (+)-JQ-1 通过连接子连接而成。它通过泛素-蛋白酶体途径诱导 BRD4 降解,同时也能降解 cIAP1、cIAP2 和 XIAP,其 IC50 值分别为 6.8 nM、17 nM 和 49 nM。
SNIPER(BRD)-1 是一种新型高效的 BRD4 降解剂,由 IAP 拮抗剂(LCL-161 衍生物)和 BET 抑制剂 (+)-JQ-1 通过连接子连接而成。其分子式为 C₅3H₆₆ClN₉O₈S2,分子量为 1056.73 g/mol,可通过泛素-蛋白酶体途径诱导 BRD4 降解。SNIPER(BRD)-1 还能降解 cIAP1、cIAP2 和 XIAP,其 IC₅0 值分别为 6.8 nM、17 nM 和 49 nM。
生物活性&实验参考方法
靶点
The primary targets of SNIPER(BRD)-1 include BRD4 (a bromodomain and extra-terminal domain protein), cIAP1, cIAP2, and XIAP (inhibitor of apoptosis proteins). The compound functions as a SNIPER (Specific and Non-genetic IAP-dependent Protein Eraser) that simultaneously binds to its target proteins and the E3 ubiquitin ligase activity of IAPs. By bridging BRD4 with IAPs, SNIPER(BRD)-1 induces ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of BRD4. The compound also degrades cIAP1, cIAP2, and XIAP, with IC₅0 values of 6.8 nM, 17 nM, and 49 nM, respectively.
体外研究 (In Vitro)
体外研究表明,SNIPER(BRD)-1 是一种新型高效的 BRD4 降解剂,由 IAP 拮抗剂和 BET 抑制剂连接而成。该化合物通过泛素-蛋白酶体途径诱导 BRD4 降解。它还能降解 cIAP1、cIAP2 和 XIAP,IC₅0 值分别为 6.8 nM、17 nM 和 49 nM。通过降解 BRD4 和 IAP,该化合物通过多种机制发挥强大的抗肿瘤作用,包括抑制 BRD4 依赖性转录和激活细胞凋亡途径。SNIPER(BRD)-1 是研究 BRD4 和 IAP 生物学的重要工具。
体内研究 (In Vivo)
SNIPER(BRD)-1 的体内研究可能主要集中于评估其在 BRD4 和 IAP 发挥重要作用的癌症动物模型中的抗肿瘤疗效。作为一种强效的 BRD4 和 IAP 降解剂,该化合物有望在体内展现出显著的肿瘤生长抑制作用。其双重作用机制,既靶向 BRD4 依赖性转录,又靶向 IAP 介导的细胞凋亡,使其成为一种极具潜力的癌症治疗候选药物。未来需要开展更多体内研究,以全面表征其在各种癌症模型中的药代动力学特性、生物利用度和疗效。
酶活实验
对于体外酶/受体结合实验,可使用结合研究评估 SNIPER(BRD)-1 与 BRD4 和 IAPs 的相互作用。表面等离子共振 (SPR) 或等温滴定量热法 (ITC) 可用于测定结合亲和力。该化合物诱导 BRD4 和 IAPs 形成三元复合物的能力可通过生物物理方法进行评估。泛素化实验可用于测定化合物诱导的 BRD4 和 IAPs 泛素化水平。标准实验条件包括具有适当 pH 值和离子强度的生理缓冲体系。通过绘制剂量-反应曲线来确定结合亲和力和降解效力。
细胞实验
在体外细胞实验中,我们使用表达 BRD4 和 IAP 的细胞系测试 SNIPER(BRD)-1,以评估其降解效率。将细胞培养于合适的培养基中,并用不同浓度的化合物(通常为纳摩尔至微摩尔浓度)处理。通过蛋白质印迹或免疫荧光法检测 BRD4、cIAP1、cIAP2 和 XIAP 的蛋白水平。我们表征了降解的动力学和剂量依赖性,并评估了其对细胞信号传导、基因表达和细胞功能的下游影响。使用标准方法评估细胞活力、增殖和凋亡。由于该化合物具有 IAP 降解活性,因此我们尤其关注其对细胞凋亡通路的影响。
动物实验
在体内动物实验中,SNIPER(BRD)-1 可通过多种途径给药给荷瘤小鼠,包括静脉注射或腹腔注射,具体取决于其溶解度和药代动力学特性。通常使用对 BRD4 或 IAP 抑制剂敏感的人类癌细胞系构建异种移植模型。典型的给药方案为每日或间歇给药,剂量范围为 1 至 50 mg/kg。定期测量肿瘤体积并计算肿瘤生长抑制率。通过免疫组织化学或蛋白质印迹法评估肿瘤中 BRD4 和 IAP 蛋白的表达水平。检测细胞凋亡标志物。监测体重和整体健康状况。
药代性质 (ADME/PK)
公开文献中对SNIPER(BRD)-1的药代动力学特性描述尚不详尽。由于其分子量高达1056.73 g/mol,该化合物的口服生物利用度可能有限,因此在体内研究中可能需要肠外给药。该化合物在生物体液中的溶解度和稳定性会影响其药代动力学特征。需要通过全面的药代动力学研究来确定Cₘₐₓ、Tₘₐₓ、AUC、半衰期和清除率等详细参数。该化合物的代谢和排泄途径仍有待充分阐明。为了实现最佳的体内给药效果,可能需要进行制剂开发。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于 SNIPER(BRD)-1 主要用作研究工具,因此其毒理学数据有限。作为 BRD4 和 IAPs 的降解剂,其毒性取决于这些蛋白对正常细胞功能的重要性。BRD4 是一种关键的表观遗传调控因子,而 IAPs 对细胞存活至关重要。它们的降解可能对正常组织产生显著影响。需要进行全面的毒理学研究以支持其进一步开发。处理该化合物时应采取适当的安全预防措施,包括使用个人防护装备并遵守机构安全指南。
参考文献

[1]. Different Degradation Mechanisms of Inhibitor of Apoptosis Proteins (IAPs) by the Specific and Nongenetic IAP-Dependent Protein Eraser (SNIPER). Chem Pharm Bull (Tokyo). 2019 Mar 1;67(3):203-209.

其他信息
SNIPER(BRD)-1 是一种用于靶向蛋白降解研究的实验化合物。目前尚未有关于该化合物作为治疗药物的临床试验或监管审批报告。该化合物仅供研究用途,可从多家化学品供应商处获得。SNIPER(BRD)-1 是一种新型高效的 BRD4 降解剂,由 IAP 拮抗剂和 BET 抑制剂组成。它通过泛素-蛋白酶体途径诱导 BRD4 降解,并能降解 cIAP1、cIAP2 和 XIAP,其 IC₅₀ 值分别为 6.8 nM、17 nM 和 49 nM。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C53H66CLN9O8S2
分子量
1056.72964906693
精确质量
1055.416
CAS号
2095244-54-3
PubChem CID
138377573
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
LogP
6.8
tPSA
257
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
15
可旋转键数目(RBC)
24
重原子数目
73
分子复杂度/Complexity
1830
定义原子立体中心数目
4
SMILES
ClC1C=CC(=CC=1)C1C2C(C)=C(C)SC=2N2C(C)=NN=C2[C@H](CC(NCCOCCOCCOCCOC2=CC=CC(=C2)C(C2=CSC([C@@H]3CCCN3C([C@H](C3CCCCC3)NC([C@H](C)NC)=O)=O)=N2)=O)=O)N=1
InChi Key
FVDSZRCRCFMYQV-CDYWKMCDSA-N
InChi Code
InChI=1S/C53H66ClN9O8S2/c1-32-34(3)73-53-45(32)46(37-16-18-39(54)19-17-37)57-41(49-61-60-35(4)63(49)53)30-44(64)56-20-22-68-23-24-69-25-26-70-27-28-71-40-14-9-13-38(29-40)48(65)42-31-72-51(58-42)43-15-10-21-62(43)52(67)47(36-11-7-6-8-12-36)59-50(66)33(2)55-5/h9,13-14,16-19,29,31,33,36,41,43,47,55H,6-8,10-12,15,20-28,30H2,1-5H3,(H,56,64)(H,59,66)/t33-,41-,43-,47-/m0/s1
化学名
(2S)-N-[(1S)-2-[(2S)-2-[4-[3-[2-[2-[2-[2-[[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.02,6]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]acetyl]amino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]benzoyl]-1,3-thiazol-2-yl]pyrrolidin-1-yl]-1-cyclohexyl-2-oxoethyl]-2-(methylamino)propanamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~66.67 mg/mL (~63.09 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (2.37 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (2.37 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.9463 mL 4.7316 mL 9.4632 mL
5 mM 0.1893 mL 0.9463 mL 1.8926 mL
10 mM 0.0946 mL 0.4732 mL 0.9463 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们