Thalidomide-O-amido-PEG3-C2-NH2 HCl

目录号: V38776 纯度: ≥98%
Thalidomide-O-amido-PEG3-C2-NH2 HCl 是一种配体(用于 E3 连接酶)-连接体缀合物,含有基于 Thalidomide 的 cereblon 配体和 3 单元 PEG 连接体。
Thalidomide-O-amido-PEG3-C2-NH2 HCl CAS号: 2245697-84-9
产品类别: New2
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产品描述
沙利度胺-O-氨基-PEG3-C2-NH2 HCl 是一种配体(用于 E3 连接酶)-连接子缀合物,包含基于沙利度胺的 cereblon 配体和 3 个单元的 PEG 连接子。
沙利度胺-O-氨基-PEG3-C2-NH2 HCl 是一种合成的 E3 连接酶配体-连接子偶联物,用于 PROTAC 技术。它包含一个基于沙利度胺的 cereblon (CRBN) E3 连接酶配体和一个 3 单元的 PEG 连接子,末端带有游离氨基 (C2-NH2),可进一步与靶蛋白配体偶联。用于靶向蛋白降解研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
Cereblon (CRBN), a substrate receptor for the CRL4 E3 ubiquitin ligase complex. The Thalidomide moiety binds CRBN, recruiting the E3 ligase to neosubstrates. No direct target activity in the absence of a target protein ligand.
体外研究 (In Vitro)
沙利度胺-O-氨基-PEG3-C2-NH2 盐酸盐用于 PROTAC 技术,由连接子和降解子(E3 泛素连接酶)组成。当沙利度胺-O-氨基-PEG3-C2-NH2 与靶向配体结合时,靶蛋白(如 BRD4、BRD2 和 BRD3)会被降解[1]。
不适用(PROTAC 构建单元)。作为配体-连接子缀合物,它本身不具有活性。它通过游离胺基(C2-NH2)与靶蛋白配体偶联,用于合成 PROTAC。生成的 PROTAC 可诱导靶蛋白的泛素化和蛋白酶体降解。
体内研究 (In Vivo)
不适用;作为单一药物时无体内活性。当整合到PROTAC复合物中时,其体内疗效取决于PROTAC复合物的结构。连接基团会影响药代动力学性质(例如溶解度、代谢稳定性),但本身不具有直接的药理活性。
酶活实验
不适用(化学偶联验证):连接子偶联物是一种化学试剂;不进行酶/受体结合试验。质量控制可能包括核磁共振(NMR)和液相色谱-质谱联用(LC-MS)以确认其结构和纯度(>98%)。可进行在二甲基亚砜(DMSO)和水中的溶解度测试,但这些并非生物学检测。
细胞实验
不适用(无直接细胞活性);使用以此连接子合成的PROTAC处理细胞,以检测靶蛋白降解。免疫印迹(Western blot)检测PROTAC处理后(通常4-24小时,0.1-10 μM)靶蛋白水平,以确认降解。可进行细胞毒性试验(MTT/CCK-8)以排除非特异性毒性。
动物实验
不适用(并非单一药物);连接子偶联物不单独给药。体内研究使用完整的PROTAC分子,通常通过腹腔注射(IP)或口服(PO)给药于小鼠(例如,异种移植模型)。药效学终点包括肿瘤组织中靶蛋白的敲低以及肿瘤生长抑制的评估。
药代性质 (ADME/PK)
不适用;作为PROTAC的化学结构单元,连接基团会影响最终PROTAC的理化性质(溶解度、渗透性和代谢稳定性)。PEG3间隔基团可提高水溶性并减少聚集。游离胺基可通过酰胺键的形成与各种靶配体偶联。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
作为连接分子,其毒性较低;MSDS报告显示,在正常操作条件下,它不属于危险物质或混合物。在火灾条件下,可能会分解并释放有毒烟雾。沙利度胺类化合物可能具有致畸性风险(因为沙利度胺本身已知具有致畸性),因此应采取适当的预防措施。建议使用标准实验室个人防护装备。
参考文献

[1]. Methods to induce targeted protein degradation through bifunctional molecules. WO2017007612A1.

其他信息
该化合物是PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)合成的关键构建模块。它已被用于生成靶向BRD4、BRD2和BRD3的PROTAC。cereblon-配体相互作用的可逆性使其能够催化蛋白质降解。常用于靶向蛋白质降解作为治疗手段的研究。该化合物不可用于人体;目前尚无针对该特定构建模块的临床试验。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H31CLN4O9
分子量
542.9666
精确质量
542.177
CAS号
2245697-84-9
PubChem CID
134160246
外观&性状
Off-white to yellow solid powder
tPSA
176
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
15
重原子数目
37
分子复杂度/Complexity
809
定义原子立体中心数目
0
SMILES
Cl[H].O=C1C([H])(C([H])([H])C([H])([H])C(N1[H])=O)N1C(C2C([H])=C([H])C([H])=C(C=2C1=O)OC([H])([H])C(N([H])C([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C([H])([H])N([H])[H])=O)=O
InChi Key
ORRMBTUTYKQYQU-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H30N4O9.ClH/c24-6-8-33-10-12-35-13-11-34-9-7-25-19(29)14-36-17-3-1-2-15-20(17)23(32)27(22(15)31)16-4-5-18(28)26-21(16)30;/h1-3,16H,4-14,24H2,(H,25,29)(H,26,28,30);1H
化学名
N-[2-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethyl]-2-[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]oxyacetamide;hydrochloride
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~125 mg/mL (~230.22 mM)
H2O : ~100 mg/mL (~184.17 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.83 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.83 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (3.83 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8417 mL 9.2086 mL 18.4172 mL
5 mM 0.3683 mL 1.8417 mL 3.6834 mL
10 mM 0.1842 mL 0.9209 mL 1.8417 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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