| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 10 mM * 1 mL in DMSO |
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| 2mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| 250mg |
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| 500mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
HDAC9 ( IC50 = 23 nM ); HDAC7 ( IC50 = 43 nM ); HDAC5 ( IC50 = 97 nM ); HDAC4 ( IC50 = 157 nM ); HDAC8 ( IC50 = 42000 nM ); HDAC6 ( IC50 = 82000 nM )
Target: The target of TMP269 is class IIa histone deacetylases (HDACs), including HDAC4, HDAC5, HDAC7, and HDAC9. It shows minimal inhibition of class I HDACs (e.g., HDAC1, IC50 > 100 μM) [1] |
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| 体外研究 (In Vitro) |
体外活性：10 μM 的 TMP269 对线粒体活性和/或人 CD4+ T 细胞的活力没有影响，可用作鉴定 IIa 类 HDAC 酶的内源底物的工具。在 IEC-18 肠上皮细胞中，TMP269 可防止 G 蛋白偶联受体/PKD1 激活引起的细胞周期进程、DNA 合成和增殖。 激酶测定：剂量反应研究采用 10 个浓度的三倍稀释系列进行。反应混合物中的最大最终化合物浓度为 100 μM，并在 Reaction Biology Corp 进行。所有测定均基于与上述 HDAC9 测定相同的原理：通过 HDAC 对荧光肽底物上的乙酰化或三氟乙酰化赖氨酸残基进行脱乙酰化。 HDAC1、HDAC2、HDAC3、HDAC6、HDAC10 和 HDAC11 使用基于 p53 残基 379-382 (Arg-His-Lys-Lys(Ac)) 的底物。对于 HDAC8，使用基于 p53 残基 379-382 (Arg-His-Lys(Ac)-Lys(Ac)) 的二乙酰化肽底物。 HDAC4、HDAC5、HDAC7 和 HDAC9 检测使用 IIa 类 HDAC 特异性荧光底物 (Boc-Lys(三氟乙酰基)-AMC)。所有反应均使用含有 1% DMSO 终浓度的测定缓冲液（50 mM Tris-HCl，pH 8.0，137 mM NaCl，2.7 mM KCl，1 mM MgCl2，1 mg/mL BSA）中的 50 μM HDAC 底物进行； 30℃孵育2小时；并用曲古抑菌素 A 和胰蛋白酶开发。细胞测定：根据制造商说明（RosetteSep 人 CD4+ T 细胞富集试剂盒）通过阴性选择从全血中分离人 CD4+ T 细胞，重悬于 T 细胞培养基（10% FBS、2 mM L-谷氨酰胺、1 mM 丙酮酸盐、10 mM HEPES、10 U/10 mg 青霉素/链霉素、RPMI 中的 0.5% DMSO），并以 50,000 个细胞/孔与 IL-2（10 BRMP 单位/mL）和 100,000 个人 T 扩张器 Dynabeads 铺板 72 小时。线粒体功能或细胞活力的测定根据制造商的说明（细胞增殖测定试剂盒 I (MTT)）进行，并表示为对照（无抑制剂）孔的百分比。
TMP269选择性抑制IIa类HDACs，导致细胞内组蛋白乙酰化水平升高。在多种细胞系中，用TMP269（1-10 μM）处理可上调与分化和抗增殖相关的基因表达，通过PCR和western blot分析证实[1] 在肠上皮细胞中，TMP269（5 μM）可阻断蛋白激酶D1（PKD1）诱导的IIa类HDACs磷酸化和核外排，从而使HDACs保留在细胞核内并抑制有丝分裂信号。通过细胞计数和BrdU掺入实验显示，这与细胞增殖减少相关[2] 在多发性骨髓瘤细胞中，TMP269（2.5-10 μM）增强内质网（ER）应激介导的细胞死亡。它增加ER应激标志物（如CHOP、GRP78）的表达并激活caspase-3/7，导致凋亡。通过流式细胞术和活力测定显示，与ER应激诱导剂（如硼替佐米）联合使用可协同增加细胞死亡[3] 在三阴性乳腺癌细胞中，TMP269（5 μM）下调HDAC9表达，进而上调microRNA-206。通过transwell侵袭实验和内皮细胞管形成实验证实，这导致侵袭和血管生成潜力降低[4] 在经历氧糖剥夺/复氧（OGD/R）以模拟缺血/再灌注损伤的神经细胞中，TMP269（1-5 μM）减少细胞死亡和氧化应激。通过western blot和ROS检测实验显示，它增加神经保护因子（如Bcl-2）的表达并减少促凋亡蛋白（如Bax）[5] |
| 体内研究 (In Vivo) |
在通过大脑中动脉闭塞（MCAO）诱导的小鼠脑缺血/再灌注损伤模型中，腹腔注射TMP269（10 mg/kg）减少梗死体积和神经功能缺损评分。它还降低脑组织中的氧化应激标志物（如MDA）并增加抗氧化酶活性（如SOD）。此外，通过免疫组织化学和western blot显示，TMP269上调缺血皮质中Bcl-2的表达并下调Bax[5]
注射TMP269后，运动皮层中组蛋白H2A乙酰化水平升高[5] 组蛋白H2A乙酰化通过蛋白质印迹法测定。与I/R组相比，TMP269上调了H2A乙酰化（P<0.001），最佳浓度为4 mg/kg（图1A）。此外，免疫组织化学显示，与I/R组相比，4 mg/kg TMP269组梗死区的阳性细胞数量增加，细胞核染色更深（图1B）。定量分析证实，与I/R组相比，4 mg/kg TMP269组的乙酰基-H2A显著上调（P<0.001；图1B）。 不同浓度的TMP269对缺血性脑卒中后脑损伤有不同程度的改善[5] 通过大脑中动脉闭塞诱导左半球缺血，并在再灌注后24小时确定梗死面积。TTC测定结果表明，与I/R组相比，TMP269减少了梗死体积（P<0.001），4 mg/kg TMP269对梗死面积的减少最大（图2）。 TMP269对抗异常的内皮细胞通透性[5] 与I/R组相比，TMP269增加了紧密连接蛋白ZO-1、Occludin和Claudin-5的表达（P<0.01；图3A）。通过观察当血脑屏障不完整时在大脑中发现的伊文思蓝外渗来评估血脑屏障的完整性（图3B）。在绿色激发下，伊文思蓝产生明亮的红色荧光。假手术组几乎没有观察到红色荧光。I/R组具有最高的荧光强度，TMP269组与I/R组相比荧光强度降低。 免疫组织化学显示I/R后神经丝染色阳性，与I/R组相比，TMP269组仍存在神经丝染色，但较弱（图3C）（P<0.001）。 TMP269调节组织激肽释放酶表达[5] 与I/R组相比，TMP269组的组织激肽释放酶表达增加（P<0.01；图4A）。此外，免疫组织化学显示，4 mg/kg TMP269组梗死区阳性细胞数量增加，血浆深度染色（图4B）。定量分析表明，与I/R组相比，4 mg/kg TMP269组的组织激肽释放酶显著上调（P<0.001；图4B）。 |
| 酶活实验 |
为测量HDAC抑制活性，将重组IIa类HDACs（HDAC4、HDAC5、HDAC7、HDAC9）和I类HDACs（HDAC1）与荧光底物在不同浓度的TMP269存在下共同孵育。监测荧光产物随时间的释放，IC50值定义为使酶活性降低50%所需的浓度[1]
在 Reaction Biology Corp.，剂量反应研究是使用十个浓度的三次稀释系列进行的，从反应混合物中最大最终化合物浓度 100 μM 开始。所有测定的基本原理相同，包括前面提到的 HDAC9 测定：HDAC 使荧光肽底物上的乙酰化或三氟乙酰化赖氨酸残基脱乙酰化。 HDAC1、HDAC2、HDAC3、HDAC6、HDAC10 和 HDAC11 使用的底物基于 p53 残基 379–382 (Arg–His–Lys–Lys(Ac))。 HDAC8 的二乙酰化肽底物是 Arg-His-Lys(Ac)-Lys(Ac)，基于 p53 的残基 379-382。 IIa 类 HDAC 特异性荧光底物 Boc-Lys(三氟乙酰基)-AMC 用于 HDAC4、HDAC5、HDAC7 和 HDAC9 测定。所有反应均使用含有 1% DMSO 最终浓度的测定缓冲液（50 mM Tris-HCl，pH 8.0，137 mM NaCl，2.7 mM KCl，1 mM MgCl2，1 mg/mL BSA）。这些反应中使用 50 μM HDAC 底物，然后在 30 °C 下孵育两小时，并使用曲古抑菌素 A 和胰蛋白酶进行显色。 |
| 细胞实验 |
为评估组蛋白乙酰化，用TMP269（1-10 μM）处理细胞24-48小时，然后使用抗乙酰化组蛋白的抗体（如H3K9ac）进行western blot分析[1]
在肠上皮细胞中，在PKD1激活前用TMP269（5 μM）预处理细胞。分离核和细胞质组分，通过western blot分析IIa类HDACs的定位。通过在24和48小时计数细胞以及测量BrdU掺入来评估细胞增殖[2] 在多发性骨髓瘤细胞中，用TMP269（2.5-10 μM）单独或与硼替佐米联合处理细胞。通过MTT测定细胞活力，通过膜联蛋白V/PI染色流式细胞术检测凋亡，通过western blot检测ER应激标志物[3] 在三阴性乳腺癌细胞中，用TMP269（5 μM）处理细胞48小时。通过western blot测量HDAC9表达，通过qPCR测量microRNA-206。使用含Matrigel的transwell小室评估侵袭能力，通过与内皮细胞共培养进行管形成实验评估血管生成潜力[4] 在OGD/R处理的神经细胞中，在复氧期间暴露于TMP269（1-5 μM）。通过CCK-8测定细胞活力，通过DCFH-DA染色检测ROS水平，通过western blot检测蛋白表达[5] 按照 RosetteSep 人 CD4+ T 细胞富集试剂盒制造商的说明，通过阴性选择从全血中分离人 CD4+ T 细胞。然后将细胞重悬于 T 细胞培养基（10% FBS、2 mM L-谷氨酰胺、1 mM 丙酮酸盐、10 mM HEPES、10 U/10 mg 青霉素/链霉素、0.5% DMSO 的 RPMI）中并在50,000 个细胞/孔，含有 IL-2（10 BRMP 单位/mL）和 100,000 个人 T 扩展剂 Dynabead，持续 72 小时。根据制造商的说明（细胞增殖测定试剂盒 I (MTT)），测定线粒体功能或细胞活力，并表示为对照（无抑制剂）孔的百分比。 |
| 动物实验 |
在小鼠大脑中动脉闭塞（MCAO）模型中，小鼠被随机分为假手术组、载体组和TMP269组。TMP269在再灌注后立即以10 mg/kg的剂量腹腔注射，并每日一次，连续3天。每日对神经功能缺损进行评分，并在损伤后72小时通过TTC染色测量梗死体积。收集脑组织进行生化和分子分析[5]
分组和TMP269给药[5] 大鼠随机分为假手术组（n = 24）、脑缺血/再灌注组（I/R，n = 24）、1 mg/kg TMP269组（脑缺血/再灌注联合1 mg/kg TMP269，n = 12）、4 mg/kg TMP269组（脑缺血/再灌注联合4 mg/kg TMP269，n = 24）、10 mg/kg TMP269组（脑缺血/再灌注联合10 mg/kg TMP269，n = 12）和16 mg/kg TMP269组（脑缺血/再灌注联合16 mg/kg TMP269，n = 12）。在诱导缺血前30分钟腹腔注射TMP269。 |
| 参考文献 |
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| 其他信息 |
TMP269 是一种选择性 IIa 类 HDAC 抑制剂，其锌结合基团不螯合，这使其区别于其他螯合锌的 HDAC 抑制剂。它对 IIa 类 HDAC 的选择性使其成为研究这些酶在细胞信号传导、分化和疾病中特定作用的宝贵工具 [1]。TMP269 通过调节 IIa 类 HDAC 依赖性基因表达，发挥多种生物学效应，包括抑制细胞增殖、增强内质网应激介导的细胞凋亡、抑制肿瘤侵袭/血管生成以及对缺血/再灌注损伤的神经保护作用。TMP269 是一种新型的选择性 IIa 类组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 抑制剂。
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| 分子式 |
C25H21F3N4O3S
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|---|---|---|
| 分子量 |
514.52
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| 精确质量 |
514.128
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| 元素分析 |
C, 58.36; H, 4.11; F, 11.08; N, 10.89; O, 9.33; S, 6.23
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| CAS号 |
1314890-29-3
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| 相关CAS号 |
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| PubChem CID |
53344908
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| 密度 |
1.3±0.1 g/cm3
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| 折射率 |
1.574
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| LogP |
5.81
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| tPSA |
121.87
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| 氢键供体(HBD)数目 |
1
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| 氢键受体(HBA)数目 |
10
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| 可旋转键数目(RBC) |
6
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| 重原子数目 |
36
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| 分子复杂度/Complexity |
749
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
S1C([H])=C(C2C([H])=C([H])C([H])=C([H])C=2[H])N=C1C1(C([H])([H])N([H])C(C2=C([H])C([H])=C([H])C(C3=NOC(C(F)(F)F)=N3)=C2[H])=O)C([H])([H])C([H])([H])OC([H])([H])C1([H])[H]
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| InChi Key |
HORXBWNTEDOVKN-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C25H21F3N4O3S/c26-25(27,28)22-31-20(32-35-22)17-7-4-8-18(13-17)21(33)29-15-24(9-11-34-12-10-24)23-30-19(14-36-23)16-5-2-1-3-6-16/h1-8,13-14H,9-12,15H2,(H,29,33)
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| 化学名 |
N-[[4-(4-phenyl-1,3-thiazol-2-yl)oxan-4-yl]methyl]-3-[5-(trifluoromethyl)-1,2,4-oxadiazol-3-yl]benzamide
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| 别名 |
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
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| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
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|---|---|---|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.86 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80+，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.9436 mL | 9.7178 mL | 19.4356 mL | |
| 5 mM | 0.3887 mL | 1.9436 mL | 3.8871 mL | |
| 10 mM | 0.1944 mL | 0.9718 mL | 1.9436 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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HDAC6-IN-18
Mz325
WW437
PI3Kα/HDAC6-IN-1
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COA
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