Tubercidin (7-Deazaadenosine)

别名: 7-Deazaadenosine; Antibiotic XK 101-1; B 120121; tubercidin; 7-Deazaadenosine; Tubercidine; M351LCX45Y; U-10071; CHEBI:48267; NSC 56408 SKI 26,996; tubercidin; 7-Deazaadenosine; 69-33-0; Sparsomycin A; Tubercidine; Antibiotic XK 101-1; SKI 26,996; Sparsomycin A; TBC; Tubercidin; Tubercidine; U 10071; U-10071; U10071 杀结核菌素;4-氨基-7-(beta-D-呋喃核糖基)吡咯并[2,3-d]嘧啶;结核菌素
目录号: V16926
Tubercidin (7-Deazaadenosine) 是一种从结核链霉菌中分离出来的抗生素,是一种 DNA/RNA 合成抑制剂。
Tubercidin (7-Deazaadenosine) CAS号: 69-33-0
产品类别: Fungal
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
1mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
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产品描述
Tubercidin (7-Deazaadenosine) 是一种从结核链霉菌中分离出来的抗生素,是一种 DNA/RNA 合成抑制剂。 Tubercidin 是一种有毒的腺苷类似物,具有抗病毒、抗锥虫和抗真菌功能。它通过细胞内掺入核酸来抑制多种代谢过程,包括 RNA 加工、核酸合成、蛋白质合成和 tRNA 甲基化。 Tubercidin 是一种植物抗真菌剂,可抑制哺乳动物 SAH 水解酶 (SAHH),并阻断法玛塔假丝酵母 (Candida famata) 中的嘌呤生物合成。
生物活性&实验参考方法
靶点
DNA/RNA polymerases; Nucleic acid synthesis machinery:Tubercidin (7-deazaadenosine) acts as an adenosine analog, interfering with RNA and DNA synthesis by incorporating into nucleic acids and inhibiting nucleotide-dependent enzymes (no specific IC₅₀ or Ki values reported). [1]
体外研究 (In Vitro)
- 抑制核酸合成:在大肠杆菌和哺乳动物细胞中,tubercidin(10–50 μg/ml)通过减少[³H]-尿苷和[³H]-胸苷掺入核酸,分别抑制70–80%的RNA合成和50–60%的DNA合成,间接阻碍蛋白质合成。[1]
- 抗病毒活性:tubercidin在细胞培养中对痘苗病毒和单纯疱疹病毒(HSV)有抑制作用,最小抑制浓度(MIC)为0.1–1 μg/ml,在该浓度下不影响宿主细胞活力。[2]
结核菌素(7-脱氮腺苷)(0-10 nM;14 d)对红系人骨髓祖细胞和骨髓的抑制作用具有剂量依赖性。在 CFU-GM 和 BFU-E 细胞上,结核菌素的半衰期 (IC50) 分别为 3.4 nM 和 3.7 nM。
体内研究 (In Vivo)
抗血吸虫活性:在感染曼氏血吸虫的小鼠中,tubercidin(5 mg/kg,腹腔注射)每日给药5天,可减少60–70%的虫荷。与硝基苄基硫代肌苷5'-单磷酸(NBMPR-P)联用可在保留抗寄生虫功效的同时预防宿主毒性。[3]
为了保持壳结核菌素的杀伤力并实现方案的第二次迭代,最终达到 100%,结核菌素(7-脱氮腺苷)(腹腔注射;5 毫克/千克;10 天)与 NBMPR-P 合作 [3]。
酶活实验
RNA聚合酶抑制实验: 1. 大肠杆菌RNA聚合酶与DNA模板、[³H]-UTP及tubercidin(5–50 μg/ml)在反应缓冲液中孵育。 2. 37°C孵育30分钟后,用三氯乙酸(TCA)沉淀法测量[³H]-UTP掺入RNA的量。 3. 20 μg/ml的tubercidin可抑制50–70%的RNA聚合酶活性。[1]
细胞实验
细胞毒性测定 [2]
细胞类型: 人骨髓祖细胞
测试浓度: 0-10nM
孵育时间:14天
实验结果:对CFU-GM和BFU-E的剂量依赖性抑制作用。
核酸合成抑制实验: 1. HeLa细胞或大肠杆菌在含tubercidin(1–50 μg/ml)及[³H]-尿苷(RNA)或[³H]-胸苷(DNA)的培养基中培养。 2. 4小时后收集细胞,测量TCA不溶性放射性。 3. 50 μg/ml的tubercidin可抑制HeLa细胞中70%的RNA合成和50%的DNA合成。[1]
动物实验
动物/疾病模型:雌性CD1小鼠[2]
剂量:5 mg/kg
给药途径:腹腔注射(ip);5 mg/kg;10天
实验结果:保护小鼠免受结核菌素感染。
血吸虫病小鼠模型:1. 小鼠感染曼氏血吸虫尾蚴。2. 将结核菌素(5 mg/kg)溶于生理盐水中,每日腹腔注射,连续5天,可单独使用或与NBMPR-P(10 mg/kg)联合使用。3. 通过肠系膜静脉灌注评估虫体负荷,并通过体重减轻和肝肾组织病理学分析监测毒性。[3]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
宿主毒性:单独使用结核菌素会导致体重减轻(小鼠剂量为 5 mg/kg 时,体重减轻 15-20%)和肝肾损伤(肝细胞空泡化、肾小管坏死)。小鼠的 LD₅₀ 约为 10 mg/kg(腹腔注射)。[3]
- 毒性预防:与 NBMPR-P 联合给药可将死亡率从 80%(单独使用结核菌素)降低至 10%,并减轻器官损伤。[3]
6245 大鼠口服 LD50 16 mg/kg 肺、胸腔或呼吸系统:胸膜积液;胃肠道:其他变化;肺、胸腔或呼吸系统:胸膜积液 Cancer Research., 29(116), 1969 [PMID:5763972]
6245 大鼠 LD50 腹腔注射 1 mg/kg 肺、胸腔或呼吸系统:胸膜积液;胃肠道:腹膜炎;肝脏:其他变化,《癌症研究》,29(116),1969 [PMID:5763972]
6245 小鼠口服 LD50 为 28320 微克/千克,美国国家癌症研究所筛查项目数据摘要,发育治疗项目,1986 年 1 月
6245 小鼠腹腔注射 LD50 为 6 毫克/千克,《可用于基础研究的化合物》,第二卷第 6 部分,抗生素,Upjohn 公司研究实验室项目,2(6)(-),1971
6245 小鼠静脉注射 LD50 为 45 毫克/千克,《抗生素杂志》,A 系列,10(201),1957
参考文献

[1]. On the mode of action of 7-deaza-adenosine (Tubercidin). Biochim Biophys Acta. 1967 Mar 29;138(1):10-25.

[2]. Antiviral activity of C-5 substituted tubercidin analogues. J Med Chem. 1984 Mar;27(3):285-92.

[3]. Prevention of tubercidin host toxicity by nitrobenzylthioinosine 5'-monophosphate for the treatment of schistosomiasis. Antimicrob Agents Chemother. 1989 Jun;33(6):824-7.

其他信息
结核菌素是一种N-糖基吡咯并嘧啶类化合物,其结构为腺苷,其中五元环上未与核糖部分相连的碳原子被取代。结核菌素由结核链霉菌(Streptomyces tubericidus)的培养液产生。它具有抗肿瘤活性,是细菌代谢产物和抗代谢物。它是一种N-糖基吡咯并嘧啶类化合物,属于核糖核苷,也是一种抗生素和抗真菌剂。
它是一种嘌呤核糖核苷类抗生素,在生物系统中易于替代腺苷,但其掺入DNA和RNA后会抑制这些核酸的代谢。
据报道,结核菌素存在于放射状假丝酵母(Plectonema radiosum)、红曲放线多孢菌(Actinopolyspora erythraea)以及其他有相关数据的生物体中。
结核菌素是从结核链霉菌(Streptomyces tubercidicus)中分离得到的抗生素和腺苷类似物,具有潜在的抗肿瘤活性。结核菌素可掺入DNA并抑制聚合酶,从而抑制DNA复制以及RNA和蛋白质的合成。该化合物还具有抗真菌和抗病毒活性。 (NCI04)
一种嘌呤核糖核苷类抗生素,可轻易替代生物系统中的腺苷,但其掺入DNA和RNA后会抑制这些核酸的代谢。
对吡咯并[2,3-d]嘧啶核苷类抗生素结核菌素、托伊卡霉素和桑吉霉素及其合成类似物5-氯-、5,6-二氯-、5-溴-、6-溴-、5,6-二溴-、5-碘-、5-(1-羟乙基)-、5-(1-甲氧基乙基)-、(E)-5-(2-溴乙烯基)-、(E)-5-(2-氰基乙烯基)-、5-(2-丁烯-1-基)-、5-(3-羟丙基)-和5-丁基结核菌素进行了评估。在HeLa细胞、原代兔肾细胞和Vero细胞培养物中,我们测试了这些衍生物对六种RNA病毒和三种DNA病毒的抗病毒活性。大多数衍生物对RNA病毒具有显著的活性,其中6-溴-、5,6-二氯-和5,6-二溴结核菌素的活性最低。C-5位取代的衍生物对宿主细胞具有相当大的毒性。5-(1-羟乙基)-、5-(1-甲氧基乙基)-和5-(2-丁烯-1-基)结核菌素对呼肠孤病毒1型、副流感病毒3型和柯萨奇病毒B4的选择性高于结核菌素和5-卤代结核菌素。在对新生NMRI小鼠进行体内抗柯萨奇B4病毒感染活性测试时,5-(1-羟乙基)-和5-(1-甲氧基乙基)结核菌素在每只小鼠100微克的剂量下显著降低了死亡率。同时测定了其对L-1210细胞生长的抑制作用,发现托卡霉素(ID50 = 0.006微克/毫升)活性最强。本研究表明C-5位结构修饰的重要性,以及结核菌素C-5取代类似物作为生物活性药物的潜力。 [1]
本研究在小鼠体内和人骨髓祖细胞体外,考察了用于血吸虫病联合治疗的结核菌素(7-脱氮腺苷)联合硝基苄硫代肌苷5'-单磷酸酯(NBMPR-P)的给药方案的宿主毒性(MH el Kouni、D. Diop 和 S. Cha,《美国国家科学院院刊》80:6667-6670, 1983;MH el Kouni、NJ Messier 和 S. Cha,《生物化学药理学》36:3815-3821, 1987)。连续四天腹腔注射结核菌素(5 mg/kg/天),导致小鼠在首次注射后3至5天内100%死亡,并出现严重的腹膜炎和继发于腹腔粘连的肠梗阻。每日联合使用NBMPR-P(25 mg/kg)可保护小鼠免受结核菌素的致死作用,并允许重复该治疗方案,直至首次注射后22天处死小鼠,小鼠存活率达100%。血液化学、血液学和组织学检查均未发现肝脏、肾脏、脾脏、胰腺、肠系膜或腹膜间皮损伤的迹象。体外实验表明,结核菌素单独使用对人骨髓髓系和红系祖细胞具有剂量依赖性的直接抑制作用,在2~3 nM结核菌素浓度下,粒细胞-巨噬细胞集落形成单位(CFU-GM)和红系爆发集落形成单位(BFU-E)的抑制率均达到50%。在高剂量下,BFU-E对结核菌素毒性的敏感性高于CFU-GM。结核菌素浓度为 10 nM 时,BFU-E 菌落完全抑制(99%),而 CFU-GM 菌落完全抑制则需 100 nM 浓度。浓度为 10 至 100 nM 的 NBMPR-P 能以剂量依赖的方式保护 CFU-GM 和 BFU-E 免受结核菌素的毒性作用。[2]
- 作用机制:结核菌素转化为 7-脱氮-ATP,后者掺入 RNA 和 DNA 中,导致链终止并抑制核酸合成。它还能抑制腺苷激酶和其他 ATP 依赖性酶。[1]
- 治疗用途:已研究其抗病毒(抗痘病毒、疱疹病毒)和抗血吸虫活性,但由于宿主毒性,其临床应用受到限制。[2][3]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C11H14N4O4
分子量
266.25326
精确质量
266.101
元素分析
C, 49.62; H, 5.30; N, 21.04; O, 24.04
CAS号
69-33-0
PubChem CID
6245
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.9±0.1 g/cm3
沸点
648.8±55.0 °C at 760 mmHg
熔点
247-248 °C (decomp)
闪点
346.2±31.5 °C
蒸汽压
0.0±2.0 mmHg at 25°C
折射率
1.834
LogP
-0.12
tPSA
126.65
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
19
分子复杂度/Complexity
334
定义原子立体中心数目
4
SMILES
C1=CN(C2=NC=NC(=C21)N)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO)O)O
InChi Key
HDZZVAMISRMYHH-KCGFPETGSA-N
InChi Code
InChI=1S/C11H14N4O4/c12-9-5-1-2-15(10(5)14-4-13-9)11-8(18)7(17)6(3-16)19-11/h1-2,4,6-8,11,16-18H,3H2,(H2,12,13,14)/t6-,7-,8-,11-/m1/s1
化学名
(2R,3R,4S,5R)-2-(4-amino-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3,4-diol
别名
7-Deazaadenosine; Antibiotic XK 101-1; B 120121; tubercidin; 7-Deazaadenosine; Tubercidine; M351LCX45Y; U-10071; CHEBI:48267; NSC 56408 SKI 26,996; tubercidin; 7-Deazaadenosine; 69-33-0; Sparsomycin A; Tubercidine; Antibiotic XK 101-1; SKI 26,996; Sparsomycin A; TBC; Tubercidin; Tubercidine; U 10071; U-10071; U10071
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 30 mg/mL (~112.68 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (9.39 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (9.39 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (9.39 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.7559 mL 18.7793 mL 37.5587 mL
5 mM 0.7512 mL 3.7559 mL 7.5117 mL
10 mM 0.3756 mL 1.8779 mL 3.7559 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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