VBIT-4

别名: VBIT-4; VBIT4; N-(4-chlorophenyl)-4-hydroxy-3-[4-[4-(trifluoromethoxy)phenyl]piperazin-1-yl]butanamide; N-(4-chlorophenyl)-4-hydroxy-3-(4-(4-(trifluoromethoxy)phenyl)piperazin-1-yl)butanamide; N-(4-chlorophenyl)-4-hydroxy-3-{4-[4-(trifluoromethoxy)phenyl]piperazin-1-yl}butanamide; SCHEMBL18641899; QYSQXVAEFPWMEM-UHFFFAOYSA-N; EX-A5330; VBIT 4 电压依赖性阴离子通道 (VDAC1) 低聚物抑制剂
目录号: V2258 纯度: ≥98%
VBIT-4 是一种新型、有效的 VDAC1(电压依赖性阴离子通道 1)抑制剂,VDAC1 是线粒体外膜蛋白,也是多种细胞生存和死亡信号(包括细胞凋亡)的汇聚点。
VBIT-4 CAS号: 2086257-77-2
产品类别: VDAC
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
1mg
2mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
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产品描述
VBIT-4 是一种新型、有效的 VDAC1(电压依赖性阴离子通道 1)抑制剂,VDAC1 是线粒体外膜蛋白,也是多种细胞生存和死亡信号(包括细胞凋亡)的汇聚点。 VBIT-4降低系统性红斑狼疮小鼠模型中mtDNA释放、IFN信号传导、中性粒细胞外陷阱和疾病严重程度。使用MST方法分析VBIT-4与重组纯化的VDAC1、VDAC2和VDAC3的相互作用。VBIT-4以相似的结合亲和力与三种重组亚型结合,尽管比从大鼠肝线粒体纯化的VDAC1低3倍。VDAC1是大多数细胞类型中的主要亚型,并且没有VDAC2或VDAC3低聚的报道,可以合理地假设VBIT-4的抗凋亡作用主要通过其与VDAC1的相互作用介导。 VBIT-4 提供了一种治疗与细胞凋亡增强相关的不同疾病的治疗策略,并指出 VDAC1 作为治疗干预的一个有希望的靶点。
生物活性&实验参考方法
靶点
Voltage - dependent anion channel 1 (VDAC1), mtDNA release, IFN signaling, neutrophil extracellular traps
体外研究 (In Vitro)
使用MST方法分析VBIT-4与重组纯化的VDAC1、VDAC2和VDAC3的相互作用。VBIT-4以相似的结合亲和力与三种重组亚型结合,尽管比从大鼠肝线粒体纯化的VDAC1低3倍。[1]
- VBIT - 4可抑制VDAC1寡聚化,防止与细胞凋亡相关的线粒体功能障碍。它能在多种细胞系中,恢复由不同凋亡诱导剂诱导的消散的线粒体膜电位,减少活性氧的产生,并防止与线粒体结合的己糖激酶脱离以及细胞内Ca2 + 水平的破坏[1]
- VBIT - 4可迅速抑制PlVDAC1表达的INS - 1细胞中ATP的流失,这种ATP流失是由VDAC1过表达导致的VDAC1易位到质膜所引起的
体内研究 (In Vivo)
VDAC寡聚化抑制剂VBIT-4在系统性红斑狼疮小鼠模型中降低mtDNA释放、IFN信号传导、中性粒细胞外陷阱和疾病严重程度。因此,VDAC低聚抑制是一种潜在的治疗与mtDNA释放相关疾病的方法
VBIT-4可改善MpJ Faslpr小鼠的狼疮样症状。VBIT-4阻断了皮肤病变的发展和伴随白细胞浸润的表皮增厚,并在不影响死亡率或体重的情况下抑制了面部和背部脱发。VBIT-4还降低了脾脏和淋巴结重量。[2]
- VBIT - 4可减轻MPJ - Faslpr小鼠的狼疮样症状。它能阻止皮肤病变的发展以及伴随白细胞浸润的表皮增厚,抑制面部和背部脱毛,减轻脾脏和淋巴结重量,且不影响死亡率或体重。还可减少线粒体DNA(mtDNA)释放、I型干扰素(IFN)信号传导和中性粒细胞胞外陷阱,从而降低疾病严重程度[2]
- VBIT - 4可减轻暴露于过量醛固酮的大鼠的心房纤维化负荷,但对短阵起搏诱导的心房颤动发作的易感性没有显著影响
酶活实验
鉴定VDAC1低聚抑制剂的高通量筛选使用96孔形式的细胞进行筛选,以增强BRET2信号,从而鉴定VDAC1-低聚抑制剂。转染具有低VDAC1水平的T-REx细胞以表达rVDAC1-GFP2和rVDAC1 Rluc,并以9000个细胞/孔的密度接种在96孔板中。将化合物(1μl的2mm储备溶液)添加到100μl中的最终浓度为10μm(1%的DMSO最终浓度)。将细胞与NCI化合物预孵育1小时,然后与凋亡诱导剂再孵育3小时(STS,1μm;亚硒酸盐,30μm;As2O3,60μm)。通过机器人系统将测试的NCI化合物分配到96孔板中。处理后,除去培养基,并如上所述测定BRET2信号。液体处理是用Tecan(Männedorf,Switzerland)Freedom 150 Robotic&MCA液体处理系统完成的,尽管荧光素酶发光和荧光读数是通过机器人集成的Tecan Infinite M1000阅读器获得的。[1]
细胞实验
交联实验PBS中的细胞(2.5–3 mg/ml)在适当处理后收获,并与交联试剂EGS(pH 8.3)孵育15分钟。使用抗VDAC1抗体对样品(60–80μg蛋白质)进行SDS-PAGE和免疫印迹。使用FUSION-FX对免疫反应性VDAC1二聚体、三聚体和多聚体带进行定量分析。[1]
采用96孔板中的细胞进行高通量筛选。将低VDAC1水平的T - Rex细胞转染以表达rVDAC1 - GFP2和rVDAC1 - RLuc,以每孔9000个细胞的密度接种。将1 μl 2 mM的VBIT - 4储备液加入到100 μl体系中,使终浓度为10 μM(最终DMSO浓度为1%)。将细胞与VBIT - 4预孵育1小时,然后再与凋亡诱导剂(STS,1 μM;亚硒酸盐,30 μM;As2O3,60 μM)孵育3小时,检测BRET2信号变化,从而筛选VDAC1寡聚化抑制剂[2]
动物实验
系统性红斑狼疮 (SLE) 动物模型
制剂:VBIT-4 新鲜溶解于 DMSO 中,并用水稀释(最终 pH 5.0,DMSO 浓度为 0.05%)。
剂量:20 mg/kg
给药途径:随饮用水服用
系统性红斑狼疮 (SLE) 动物模型。所有实验均经美国国立卫生研究院/国家心肺血液研究所 (NIH/NHLBI) 动物护理和使用委员会 (ACUC) 批准。雌性 MRL/MpJ-Faslpr/J 小鼠(品系编号 #000485)被用作系统性红斑狼疮 (SLE) 病因学研究的模型。MRL/MpJ 小鼠用作 MRL/MpJ-Faslpr/J 小鼠的对照。所有小鼠均购自杰克逊实验室 (The Jackson Laboratory)。将VBIT-4新鲜溶解于DMSO中,并用水稀释(最终pH值为5.0,DMSO浓度为0.05%)。MRL/MpJ-Faslpr/J小鼠从11周龄开始,每天在饮用水中加入新鲜稀释的VBIT-4(20 mg/kg)或溶剂(最终pH值为5.0,DMSO浓度为0.05%),持续5周,直至16周龄处死。在小鼠16周龄时采集血液和尿液样本。分别在VBIT-4给药前后(11周龄和16周龄)测量小鼠体重。同时采集皮肤、肾脏、胸腺和淋巴结组织。[2]
VBIT-4被用于治疗MPJ-Faslpr小鼠,以观察狼疮样症状的变化;也被用于治疗醛固酮过多的大鼠,以观察心房纤维化的变化[2]
参考文献

[1] Novel Compounds Targeting the Mitochondrial Protein VDAC1 Inhibit Apoptosis and Protect against Mitochondrial Dysfunction. J Biol Chem. 2016 Nov 25;291(48):24986-25003.

[2] VDAC oligomers form mitochondrial pores to release mtDNA fragments and promote lupus-like disease. Science. 2019 Dec 20;366(6472):1531-1536.

[3] VDAC1 in the diseased myocardium and the effect of VDAC1-interacting compound on atrial fibrosis induced by hyperaldosteronism. Sci Rep. 2020 Dec 16;10(1):22101.

其他信息
细胞凋亡被认为在多种病理过程中发挥着关键作用,例如神经退行性疾病(如帕金森病和阿尔茨海默病)以及各种心血管疾病。尽管细胞凋亡机制已得到充分阐明,但目前仍缺乏有效的治疗策略来阻止甚至减缓这一过程。因此,迫切需要能够阻断或减缓神经退行性疾病和心血管疾病中细胞凋亡的治疗药物。线粒体外膜蛋白电压依赖性阴离子通道1 (VDAC1) 是多种细胞存活和死亡信号(包括细胞凋亡)的汇聚点。最近,我们证实VDAC1寡聚化参与了线粒体介导的细胞凋亡。因此,VDAC1寡聚化是设计用于调节细胞凋亡的药物的重要靶点。本研究采用高通量化合物筛选和药物化学方法,开发出能直接与VDAC1相互作用并抑制VDAC1寡聚化的化合物,同时还能抑制多种诱导方式和多种细胞系中发生的细胞凋亡。这些化合物能够保护细胞免受凋亡相关的线粒体功能障碍的影响,恢复耗散的线粒体膜电位,从而维持细胞能量和代谢,减少活性氧的产生,并防止己糖激酶从线粒体上脱落以及细胞内Ca2+水平的紊乱。因此,本研究描述了具有明确作用机制的新型候选药物,其作用机制涉及抑制VDAC1寡聚化、细胞凋亡和线粒体功能障碍。化合物VBIT-3和VBIT-4为治疗与细胞凋亡增强相关的多种疾病提供了一种治疗策略,并指出VDAC1是一个有前景的治疗靶点。[1]
线粒体应激会将线粒体DNA(mtDNA)释放到胞质溶胶中,从而触发I型干扰素(IFN)反应。线粒体外膜通透性增加是mtDNA释放所必需的,这在凋亡细胞中已被广泛研究,但其在活细胞中的作用却鲜为人知。我们发现,氧化应激的线粒体通过线粒体外膜上电压依赖性阴离子通道(VDAC)寡聚体形成的孔道释放短的mtDNA片段。此外,VDAC1 N端结构域中的带正电荷残基与mtDNA相互作用,促进VDAC1寡聚化。 VDAC寡聚化抑制剂VBIT-4可降低系统性红斑狼疮小鼠模型中的线粒体DNA(mtDNA)释放、干扰素(IFN)信号传导、中性粒细胞胞外陷阱(NETs)形成以及疾病严重程度。因此,抑制VDAC寡聚化是治疗与mtDNA释放相关的疾病的潜在方法。[2]电压依赖性阴离子通道1(VDAC1)是线粒体功能的关键参与者。VDAC1作为“守门人”,介导离子、核苷酸和其他代谢物跨线粒体外膜的流动,以及启动细胞凋亡的促凋亡蛋白的释放。VBIT-4是一种VDAC1寡聚化抑制剂,最近的研究表明,它在狼疮和2型糖尿病小鼠模型中能够预防线粒体功能障碍和细胞凋亡。在本研究中,我们探讨了VDAC1在人类和大鼠病变心肌中的表达。此外,我们还评估了VBIT-4治疗对暴露于过量醛固酮水平的大鼠心房结构和电重构的影响。对市售人类心脏组织进行免疫组织化学分析显示,心肌梗死后患者以及慢性心室扩张功能障碍患者的心脏组织中VDAC1表达显著升高。与此一致,暴露于心肌梗死或过量醛固酮的大鼠的心室和心房组织中VDAC1均显著增加。免疫荧光染色显示VDAC1呈点状分布,这是线粒体定位的典型特征。最后,VBIT-4治疗减轻了暴露于过量醛固酮的大鼠的心房纤维化程度,但对快速起搏诱发的心房颤动易感性没有显著影响。我们的研究结果表明,VDAC1 过表达与常见病理条件下的心肌异常相关。我们的数据还表明,抑制 VDAC1 可以减少心房肌的过度纤维化,这一发现可能具有重要的治疗意义。这种有益作用的确切机制尚需进一步研究。[3] 细胞凋亡在许多病理过程中发挥着关键作用,例如神经退行性疾病和心血管疾病。线粒体外膜上的 VDAC1 是各种细胞存活和死亡信号的汇聚点。VDAC1 寡聚化参与线粒体介导的细胞凋亡,因此 VDAC1 是调节细胞凋亡的潜在靶点,而 VBIT-4 为治疗与过度细胞凋亡相关的疾病提供了一种策略。[1][2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H23CLF3N3O3
分子量
457.8738
精确质量
457.138
元素分析
C, 55.09; H, 5.06; Cl, 7.74; F, 12.45; N, 9.18; O, 10.48
CAS号
2086257-77-2
相关CAS号
2086257-77-2 (racemate);2086268-69-9 (R-isoemr);2086269-51-2 (S-isomer);
PubChem CID
126697666
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
3.9
tPSA
65Ų
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
31
分子复杂度/Complexity
560
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClC1C([H])=C([H])C(=C([H])C=1[H])N([H])C(C([H])([H])C([H])(C([H])([H])O[H])N1C([H])([H])C([H])([H])N(C2C([H])=C([H])C(=C([H])C=2[H])OC(F)(F)F)C([H])([H])C1([H])[H])=O
InChi Key
QYSQXVAEFPWMEM-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H23ClF3N3O3/c22-15-1-3-16(4-2-15)26-20(30)13-18(14-29)28-11-9-27(10-12-28)17-5-7-19(8-6-17)31-21(23,24)25/h1-8,18,29H,9-14H2,(H,26,30)
化学名
N-(4-chlorophenyl)-4-hydroxy-3-(4-(4-(trifluoromethoxy)phenyl)piperazin-1-yl)butanamide
别名
VBIT-4; VBIT4; N-(4-chlorophenyl)-4-hydroxy-3-[4-[4-(trifluoromethoxy)phenyl]piperazin-1-yl]butanamide; N-(4-chlorophenyl)-4-hydroxy-3-(4-(4-(trifluoromethoxy)phenyl)piperazin-1-yl)butanamide; N-(4-chlorophenyl)-4-hydroxy-3-{4-[4-(trifluoromethoxy)phenyl]piperazin-1-yl}butanamide; SCHEMBL18641899; QYSQXVAEFPWMEM-UHFFFAOYSA-N; EX-A5330; VBIT 4
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 90 mg/mL (~200 mM)
Ethanol : 40-90 mg/mL
Water : < 1 mg/mL (Insoluble)
溶解度 (体内实验)
~4.5 mg/ml (9.8 mM) in 5% DMSO: 40% PEG300: 5% Tween 80: 50% ddH2O 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1840 mL 10.9201 mL 21.8403 mL
5 mM 0.4368 mL 2.1840 mL 4.3681 mL
10 mM 0.2184 mL 1.0920 mL 2.1840 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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