VER-246608

别名: VER246608 VER 246608 VER-246608
目录号: V27971 纯度: ≥98%
VER-246608 (VER246608) 是一种新型有效的 PDK(丙酮酸脱氢酶激酶)抑制剂,具有抗癌活性。
VER-246608 CAS号: 1684386-71-7
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
VER-246608 (VER246608) 是一种新型高效的丙酮酸脱氢酶激酶 (PDK) 抑制剂,具有抗癌活性。它对 PDK-1、PDK-3、PDK-2 和 PDK-4 的 IC50 值分别为 35 nM、40 nM、84 nM 和 91 nM。
VER-246608 是一种高效、细胞渗透性强、可逆且 ATP 竞争性的丙酮酸脱氢酶激酶 (PDK) 泛亚型抑制剂。它是研究细胞代谢的宝贵工具,并具有作为抗癌药物的潜力。通过抑制 PDK,它激活丙酮酸脱氢酶 (PDH),从而使细胞代谢从糖酵解转向葡萄糖氧化,破坏许多癌细胞中观察到的瓦博格效应。它已成为研究 PDK 抑制后果的关键化合物。
生物活性&实验参考方法

VER-246608的体外细胞实验采用PC3等癌细胞系进行。培养细胞,并用浓度通常为1至50 µM的VER-246608处理不同时间点。以乳酸生成、葡萄糖消耗和ATP水平作为糖酵解活性的指标进行测量。同时评估细胞活力和凋亡情况。
靶点
IC50s: 35 nM (PDK-1), 40 nM (PDK-3), 84 nM (PDK-2), 91 nM (PDK-4)[1]
VER-246608 targets all four pyruvate dehydrogenase kinase (PDK) isoforms: PDK1, PDK2, PDK3, and PDK4. It is an ATP-competitive inhibitor, meaning it competes with ATP for binding to the kinase's active site. By inhibiting PDK, it prevents the phosphorylation and inactivation of pyruvate dehydrogenase (PDH), keeping it in its active, dephosphorylated form.
体外研究 (In Vitro)
VER-246608 是一种全新的 ATP 竞争性泛亚型 PDK 抑制剂。在基于 DELFIA 的酶功能分析中,VER-246608 在低于 100 nM 的浓度范围内对所有四种 PDK 同工酶均表现出相当的抑制效力。VER-246608 的 IC50 值为 266 nM,它能抑制 E1α 在 Ser293 位点的磷酸化,而该位点可被所有四种 PDK 同工酶磷酸化,从而影响细胞生物标志物的调控。用 9 μM 和 27 μM VER-246608 处理 PC-3 细胞一小时后,培养基中 L-乳酸含量分别下降了 21% 和 42%。在抑制 L-乳酸合成的相同浓度下,VER-246608 也能降低 D-葡萄糖的消耗。当浓度达到 10 μM 及以上时,球体体积减少了近 50%,表明 VER-246608 的效力高于单层细胞生长 [1]。
体外实验表明,VER-246608 对 PDK1、PDK2、PDK3 和 PDK4 的抑制作用 IC50 值分别为 35、84、40 和 91 nM。它对 PDK 的选择性高于 Hsp90(IC50 > 10 µM)以及 10 µM 浓度下对 97 种激酶的选择性。在 10 和 20 µM 的浓度下,它能降低 PC3 细胞中 L-乳酸的生成。
体内研究 (In Vivo)
在体内,VER-246608 在临床前模型中显示出抗癌活性。它能干扰瓦博格代谢,并诱导癌细胞发生依赖于环境的细胞抑制。在葡萄糖/谷氨酰胺耗竭的条件下,用 VER-246608 处理四种癌细胞系(PC-3、SW-1088、UM-22B 和 MEF)后,细胞生长几乎完全受到抑制。
酶活实验
VER-246608 的体外酶/受体结合(非细胞)测定包括使用纯化的重组 PDK 同工酶测量 PDK 的酶活性。将酶与底物(例如丙酮酸脱氢酶)和 ATP 在不同浓度的 VER-246608 存在下孵育。通过 ADP 的生成或底物的磷酸化来测定激酶活性,并计算 IC50 值。
细胞实验
采用磺基罗丹明B (SRB) 法测定单层培养细胞的化合物细胞毒性。对于球状体生长实验,将PC-3细胞(500个细胞/孔)接种于96孔圆底板中,培养基为含2.5% (w/v) Matrigel的RPMI-1640培养基。接种48小时后,用VER-246608(2.5、5、10、20和40 μM)处理所得球状体。使用蔡司Axiovert 200 M倒置显微镜拍摄图像,并借助axiovision软件[1]测量球状体的直径,从而确定球状体的体积。
动物实验
VER-246608 的体内动物实验在异种移植小鼠癌症模型中进行。实验中,给予小鼠 VER-246608,并评估肿瘤生长、PDK 抑制、代谢标志物和生存情况。疗效与载体对照组进行比较。
药代性质 (ADME/PK)
VER-246608 具有良好的生物利用度和全身暴露量。临床前研究已提供了详细的药代动力学参数。它适用于体内疗效研究。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
VER-246608在临床前研究中,有效剂量下耐受性良好,未见明显的脱靶毒性报道。它对PDK具有选择性,优于其他激酶。
参考文献

[1]. VER-246608, a novel pan-isoform ATP competitive inhibitor of pyruvate dehydrogenase kinase, disrupts Warburg metabolism and induces context-dependent cytostasis in cancer cells. Oncotarget. 2014 Dec 30;5(24):12862-76.

其他信息
抑制丙酮酸脱氢酶激酶;结构见第一篇文章。
VER-246608 是一种用于癌症代谢的研究化合物。它是研究 PDK 在代谢重编程和肿瘤生长中作用的重要工具。该化合物尚未获准用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C28H23CLF2N4O4
分子量
552.956432580948
精确质量
552.137
CAS号
1684386-71-7
PubChem CID
86280454
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
5.5
tPSA
116
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
39
分子复杂度/Complexity
810
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClC1=NC=C(C)C(C2C=CC(=CC=2)N(C(C2C=CC(=CC=2O)O)=O)CC2C=CC(CNC(C(F)F)=O)=CC=2)=N1
InChi Key
LCGNLQSOSJFLKR-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C28H23ClF2N4O4/c1-16-13-33-28(29)34-24(16)19-6-8-20(9-7-19)35(27(39)22-11-10-21(36)12-23(22)37)15-18-4-2-17(3-5-18)14-32-26(38)25(30)31/h2-13,25,36-37H,14-15H2,1H3,(H,32,38)
化学名
N-[4-(2-chloro-5-methylpyrimidin-4-yl)phenyl]-N-[[4-[[(2,2-difluoroacetyl)amino]methyl]phenyl]methyl]-2,4-dihydroxybenzamide
别名
VER246608 VER 246608 VER-246608
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~180.84 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.52 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.52 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8084 mL 9.0422 mL 18.0845 mL
5 mM 0.3617 mL 1.8084 mL 3.6169 mL
10 mM 0.1808 mL 0.9042 mL 1.8084 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们