Vps34-IN-2

目录号: V32664 纯度: ≥98%
Vps34-IN-2 是一种新型、有效的 Vps34 抑制剂(对于酶和细胞测定,IC50 分别 = 2 和 82 nM)。
Vps34-IN-2 CAS号: 1523404-29-6
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
Vps34-IN-2 是一种新型高效的 Vps34 抑制剂(酶学和细胞学测定的 IC50 值分别为 2 nM 和 82 nM)。
Vps34-IN-2(CAS 1523404-29-6)是一种新型、高效且选择性的Vps34(液泡蛋白分选34)抑制剂。Vps34是一种III类磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K),在自噬和内体运输中发挥关键作用。该化合物的分子式为C18H25F3N4O3,分子量为402.41。在酶活性测定中,Vps34的IC50值为2 nM;在GFP-FYVE细胞活性测定中,IC50值为82 nM。Vps34-IN-2通过抑制Vps34活性,破坏自噬体的形成,使其成为研究自噬通路及相关细胞过程的重要工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
Vps34 (vacuolar protein sorting 34), a class III phosphatidylinositol 3-kinase. Vps34-IN-2 is a potent and selective inhibitor of Vps34 with IC50s of 2 nM in enzymatic assays and 82 nM in GFP-FYVE cellular assays. The compound exhibits selectivity against mTOR (IC50 > 10 microM) and class I PI3Ks with IC50 values of 2.7, 4.5, 2.5, and >10 microM for PI3K alpha, beta, delta, and gamma isoforms, respectively. By inhibiting Vps34, the compound disrupts autophagosome formation and endosomal trafficking.
体外研究 (In Vitro)
使用 GFP-FYVE 细胞测试和 Vps34 酶活性测定时,Vps34-IN-2(化合物 31)的 IC50 值分别为 2 nM 和 82 nM。Vps34-IN-2[1] 表现出对 I 类 PI3K(对 PI3K α、β、δ 和 γ 亚型的 IC50 值分别为 2.7、4.5、2.5 和 >10 μM)和 mTOR(IC50 > 10 μM)的选择性。
体外实验表明,Vps34-IN-2 对 Vps34 具有强效抑制活性,酶活性测定中 IC50 值为 2 nM。在 GFP-FYVE 细胞测定中(该测定用于检测 FYVE 结构域(PI3P 结合结构域)的细胞内定位),该化合物的 IC50 值为 82 nM。该化合物对 mTOR 和 I 类 PI3K 亚型具有优异的选择性。Vps34-IN-2 可用作化学工具,用于研究 Vps34 在自噬、内吞作用和其他细胞过程中的作用。
体内研究 (In Vivo)
根据动物的不同,静脉注射Vps34-IN-2(化合物31)后,可在6、8和24小时(最晚采样时间)内测定其浓度。口服Vps34-IN-2后吸收迅速,生物利用度为85%,0.5小时达到血浆峰浓度。口服给药后4小时和8小时,血浆浓度略有回升,但原因尚不明确。静脉注射3 mg/kg剂量的Vps34-IN-2后,观察到急性血浆清除率为2.3 L/h/kg,相当于该物种肝血流量的44%。稳态分布容积适中,末端消除半衰期较短[1]。
Vps34-IN-2 的体内研究已在动物模型中对其药代动力学特性进行了表征。静脉给药后,根据动物种类不同,化合物浓度可在 6、8 和 24 小时内进行定量检测。口服给药后,Vps34-IN-2 吸收迅速,0.5 小时即可达到血浆峰浓度,生物利用度为 85%。口服给药后 4 小时和 8 小时观察到轻微的浓度反弹,但原因不明。静脉注射 3 mg/kg 后,血浆清除率中等(2.3 L/h/kg),相当于肝血流量的 44%。
酶活实验
Vps34-IN-2 的体外酶活性测定旨在评估其对 Vps34 脂质激酶活性的抑制作用。该测定使用重组 Vps34 酶和磷脂酰肌醇作为底物,并在 ATP 存在下进行。将化合物在测定缓冲液中进行系列稀释,并与酶预孵育。加入 ATP 和脂质底物启动反应,孵育后,使用放射性方法(33P-ATP)或非放射性方法(HTRF 或 AlphaScreen)测定磷脂酰肌醇 3-磷酸 (PI3P) 的生成量。IC50 值由剂量-反应曲线计算得出。使用类似的测定方法和合适的底物,对其他 PI3K 和 mTOR 进行选择性分析。
细胞实验
细胞培养于含10%胎牛血清的RPMI-1640培养基中。细胞在含去污剂的裂解缓冲液中经超声破碎,离心去除细胞碎片,收集上清液用于化合物处理。裂解液的最终蛋白浓度为4 mg/mL。取5 μL Vps34-IN-2(化合物31)的DMSO 100倍浓缩储备液,加入445 μL裂解液中,每个样品重复两次。另取5 μL DMSO加入445 μL裂解液中,作为对照,每个样品重复四次。孵育15分钟后,向每个样品中加入5 μL ATP探针I的100倍浓缩水溶液(ATP探针I的最终浓度为0.5 μM)。 5分钟后,向每个样品中加入50 μL 10倍浓度的ATP探针II水溶液(ATP探针II的最终浓度为20 μM)。所有样品随后继续孵育10分钟[1]。
Vps34-IN-2 的体外细胞检测采用 GFP-FYVE 细胞检测法来测量细胞内 Vps34 活性的抑制情况。表达 GFP-FYVE(一种结合 PI3P 的融合蛋白)的细胞用不同浓度的化合物处理。通过荧光显微镜或高内涵成像监测 GFP-FYVE(通常与含有 PI3P 的内体膜结合)的细胞内定位。Vps34 的抑制会降低 PI3P 的产生,导致 GFP-FYVE 弥散分布于细胞质中。该效应的 EC50 为 82 nM。此外,还可以通过蛋白质印迹法检测化合物处理细胞中的自噬标志物(LC3-II、p62)。
动物实验

Vps34-IN-2 的体内药代动力学研究在啮齿动物(通常为大鼠或小鼠)中进行。动物通过静脉注射(3 mg/kg)或口服给药。在不同时间点(0-24 小时)采集血样,并采用液相色谱-串联质谱法 (LC-MS/MS) 测定血浆浓度。计算的药代动力学参数包括 Cmax、Tmax、AUC、清除率、分布容积、半衰期和口服生物利用度。该化合物配制于合适的溶剂(例如,DMSO/PEG400/生理盐水)中进行给药。所有动物实验均遵循标准动物操作和伦理准则。
在PK/PD研究中,将3×10⁶个H1299-GFP-FYVE肿瘤细胞与50% Matrigel混合,皮下注射到SCID小鼠背部,每只小鼠注射一个肿瘤。当异种移植肿瘤体积达到约200至400 mm³时,小鼠分别接受载体(98% PEG200/2% PS80)或单次灌胃给予Vps34-IN-2(化合物31),剂量分别为100 mg/kg和50 mg/kg。在每个时间点,分别处死3只接受载体治疗的小鼠和3只接受Vps34-IN-2治疗的小鼠;收集肿瘤组织进行免疫组织化学(IHC)分析,并采集血浆样本以测定Vps34-IN-2的浓度[1]。
药代性质 (ADME/PK)
Vps34-IN-2 的药代动力学已在临床前动物模型中进行了表征。口服给药后,该化合物吸收迅速,达峰时间 (Tmax) 为 0.5 小时,口服生物利用度为 85%。静脉注射 3 mg/kg 后,血浆清除率中等 (2.3 L/h/kg),相当于肝血流量的 44%。稳态分布容积中等,末端消除半衰期短。该化合物可溶于 DMSO (10 mM),呈白色至类白色固体。建议储存于 -20℃。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
Vps34-IN-2 的毒理学数据仅限于临床前研究。作为一种研究用抑制剂,其全面的毒性特征尚未得到充分记录。该化合物仅供研究用途,不得用于人体治疗。处理化学品时应遵循标准安全预防措施。目前尚未系统地报告其急性毒性和慢性毒性研究。体内研究通过监测体重、临床症状和组织病理学结果来进行药代动力学和药效学评估。
参考文献

[1]. Discovery of (2S)-8-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-1-(3-methyl-2-oxobutyl)-2-(trifluoromethyl)-3,4-dihydro-2H-pyrimido[1,2-a]pyrimidin-6-one: a novel potent and selective inhibitor of Vps34 for the treatment of solid tumors. J Med Chem.

[2]. Genome-wide CRISPR screening identifies TMEM106B as a proviral host factor for SARS-CoV-2. Nat Genet. 2021 Mar 8.

其他信息
Vps34-IN-2 是一种研究级高效选择性 Vps34 抑制剂。其 IUPAC 名称为 (8S)-2-[(3R)-3-甲基吗啉-4-基]-9-(3-甲基-2-氧代丁基)-8-(三氟甲基)-7,8-二氢-6H-嘧啶并[1,2-a]嘧啶-4-酮。同义词包括 (S)-1-(3-甲基-2-氧代丁基)-8-((R)-3-甲基吗啉基)-2-(三氟甲基)-3,4-二氢-1H-嘧啶并[1,2-a]嘧啶-6(2H)-酮。纯度为 99%。该化合物在 Vps34 酶活性测定中的 IC50 为 2 nM,在 GFP-FYVE 细胞活性测定中的 IC50 为 82 nM。它被用作研究自噬、癌症、神经退行性疾病以及其他与自噬相关的疾病的工具。尚未获准用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H25F3N4O3
分子量
402.411314725876
精确质量
402.187
CAS号
1523404-29-6
PubChem CID
72709284
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
466.4±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
235.9±31.5 °C
蒸汽压
0.0±1.2 mmHg at 25°C
折射率
1.581
LogP
1.73
tPSA
65.4
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
28
分子复杂度/Complexity
705
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C[C@@H]1COCCN1C2=CC(=O)N3CC[C@H](N(C3=N2)CC(=O)C(C)C)C(F)(F)F
InChi Key
ITCIAOUZMPREOO-OCCSQVGLSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H25F3N4O3/c1-11(2)13(26)9-25-14(18(19,20)21)4-5-24-16(27)8-15(22-17(24)25)23-6-7-28-10-12(23)3/h8,11-12,14H,4-7,9-10H2,1-3H3/t12-,14+/m1/s1
化学名
(8S)-2-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-9-(3-methyl-2-oxobutyl)-8-(trifluoromethyl)-7,8-dihydro-6H-pyrimido[1,2-a]pyrimidin-4-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
Ethanol : ~50 mg/mL (~124.25 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.21 mM) (饱和度未知) in 10% EtOH + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL 澄清 EtOH 储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL 生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.21 mM) (饱和度未知) in 10% EtOH + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清乙醇储备液加入 900 μL 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.21 mM) (饱和度未知) in 10% EtOH + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清乙醇储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4850 mL 12.4251 mL 24.8503 mL
5 mM 0.4970 mL 2.4850 mL 4.9701 mL
10 mM 0.2485 mL 1.2425 mL 2.4850 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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