VZ185

别名: VZ-185; VZ185; VZ 185
目录号: V4707 纯度: ≥98%
VZ185 是 BRD9 及其密切同源物 BRD7 的有效、快速和选择性降解剂。
VZ185 CAS号: 2306193-61-1
产品类别: New7
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
VZ185 是 BRD9 及其密切同源物 BRD7 的有效、快速和选择性降解剂。开发 PROTAC 来重定向 E3 连接酶的泛素化活性并有效降解细胞内的靶蛋白可能是一个漫长且不可预测的过程,并且目前尚不清楚 E3 和靶蛋白的任何组合是否可以有效降解。基于 VHL 的降解剂可以通过系统地改变缀合模式和连接体并监测细胞降解活性、动力学特征和泛素化以及三元复合物形成热力学,在两轮中从次优化合物中进行优化。
生物活性&实验参考方法
体外研究 (In Vitro)
VZ185 的功效通过一系列其他人类肿瘤系(EOL-1、A-204)(BRD9 的 DC50 主题在 2 至 8 nM 之间)的降解研究得到验证。 VZ185 在这些溶液和微粒体中的显着流体动力学溶解度(高达约 100 μM)和稳定性得到了外部 PK 数据的进一步支持 [1]。
参考文献

[1]. Iterative Design and Optimization of Initially Inactive Proteolysis Targeting Chimeras (PROTACs) Identify VZ185 as a Potent, Fast, and Selective von Hippel-Lindau (VHL) Based Dual Degrader Probe of BRD9 and BRD7. J Med Chem. 2019 Jan 24;62(2):699-726.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C53H67FN8O8S
分子量
995.211295366287
精确质量
994.478
CAS号
2306193-61-1
PubChem CID
138454768
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
5.1
tPSA
207
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
14
可旋转键数目(RBC)
20
重原子数目
71
分子复杂度/Complexity
1850
定义原子立体中心数目
3
SMILES
S1C=NC(C)=C1C1=CC=C(C(=C1)OCCCCCN1CCN(CC2C(=CC(C3=CN(C)C(C4C=NC=CC3=4)=O)=CC=2OC)OC)CC1)CNC([C@@H]1C[C@H](CN1C([C@H](C(C)(C)C)NC(C1(CC1)F)=O)=O)O)=O
InChi Key
ZAGCLFXBHOXXEN-JPTLTNPLSA-N
InChi Code
InChI=1S/C53H67FN8O8S/c1-33-46(71-32-57-33)34-11-12-35(27-56-48(64)42-26-37(63)29-62(42)50(66)47(52(2,3)4)58-51(67)53(54)14-15-53)43(23-34)70-22-10-8-9-17-60-18-20-61(21-19-60)31-41-44(68-6)24-36(25-45(41)69-7)40-30-59(5)49(65)39-28-55-16-13-38(39)40/h11-13,16,23-25,28,30,32,37,42,47,63H,8-10,14-15,17-22,26-27,29,31H2,1-7H3,(H,56,64)(H,58,67)/t37-,42+,47-/m1/s1
化学名
(2S,4R)-N-[[2-[5-[4-[[2,6-dimethoxy-4-(2-methyl-1-oxo-2,7-naphthyridin-4-yl)phenyl]methyl]piperazin-1-yl]pentoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2S)-2-[(1-fluorocyclopropanecarbonyl)amino]-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxypyrrolidine-2-carboxamide
别名
VZ-185; VZ185; VZ 185
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~200 mg/mL (~200.96 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (5.02 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 50.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.0048 mL 5.0241 mL 10.0481 mL
5 mM 0.2010 mL 1.0048 mL 2.0096 mL
10 mM 0.1005 mL 0.5024 mL 1.0048 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • VZ185 induces strong and rapid degradation in a time- and dose-dependent manner. (A) Western blot analysis of BRD9, BRD7, and β-actin after treatment of RI-1 cells with six different concentrations of compounds 46 and 51 for 2 and 8 h before harvesting. (B) Chemical structures of 51 (VZ185) and 46. (C) Quantification of protein levels relative to DMSO control after treatment with different concentration of VZ185 and DC50 values. (D) Time-dependent experiment in RI-1 cells after treatment with 10 nM and 100 nM 51 at the desired time points. Intensity values and DC50 were quantified as described in the Experimental Section.J Med Chem . 2019 Jan 24;62(2):699-726.
  • Quantitative live-cell kinetics of VZ185 induced degradation of BRD7 and BRD9. Degradation profile (A), calculation of DC50 values (B), and initial degradation rate (C) across concentration series indicated of VZ185 using continual luminescent reading of CRISPR/Cas9 endogenously tagged HiBiT-BRD7 or HiBiT-BRD9 in HEK293 cells. Error bars are expressed as SEM taken from n = 3 experiments. J Med Chem . 2019 Jan 24;62(2):699-726.
  • Effect of BRD7/9 degradation on viability of BRD9-sensitive cancer cell lines. Cell proliferation activity assessed in EOL-1 (A) and A-204 (B) cell lines after treatment with 1a, 1b, VZ185, 7, 21 (dBRD9), and doxorubicin for 7 days. J Med Chem . 2019 Jan 24;62(2):699-726.
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