XMD17-109

别名: XMD-17109; XMD 17-109; XMD17109; XMD 17109; XMD17-109; XMD-17-109 11-环戊基-2-[[2-乙氧基-4-[[4-(4-甲基-1-哌嗪基)-1-哌啶基]羰基]苯基]氨基]-5,11-二氢-5-甲基-6H-嘧啶并[4,5-B][1,4]苯并二氮杂卓-6-酮;XMD17-109

目录号: V0467 纯度: ≥98%

COA 产品数据产品说明书 SDS

XMD17-109 是一种嘧啶二氮杂酮类似物，是一种新型、有效、特异性、细胞渗透性和 ATP 竞争性的 ERK-5 抑制剂，具有重要的生物活性。

XMD17-109 CAS号: 1435488-37-1
产品类别: ERK

产品仅用于科学研究，不针对患者销售

规格	价格	库存	数量
10 mM * 1 mL in DMSO
1mg
2mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
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Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

Nat Neurosci 2024, 27:1468-1474.

Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

Cell Stem Cell 2024, 31:106-126.e13.

Nature 597, 119–125 (2021)

Cell Stem Cell 2020,26(6):845-861.e12.

Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

STTT 2023,8(1):91.

Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

Immunity 2024,57:2651-2668.e12.

J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022:8,eabm9427.

Nature 2021,597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

纯度/质量控制文件

批次：

纯度: ≥98%

COA

MSDS

NMR

产品说明书

产品描述
生物活性&实验参考方法
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计算器
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产品描述

XMD17-109 (XMD-17-109) 是一种嘧啶二氮杂酮类似物，是一种新型、有效、特异性、细胞渗透性和 ATP 竞争性的 ERK-5 抑制剂，具有重要的生物/抗癌活性。在 HEK293 细胞中，它的 EC50 为 4.2 μM，并抑制 ERK-5。在细胞测定中，XMD17-109 能够防止 ERK5 发生自磷酸化。 XMD17-109给小鼠口服和静脉注射的药代动力学特征如下：口服生物利用度为90%，口服清除率为15745 h*ng/mL，血浆清除率为8.64 mL/min/Kg，T1 /2 为 8.2 小时。

生物活性&实验参考方法

靶点

ERK5 (IC50 = 162 nM); LRRK2[G2019S] (IC50 = 339 nM)

体外研究 (In Vitro)

XMD17-109（化合物 26）阻断细胞中表皮生长因子诱导的 ERK5 自磷酸化，EC50 为 0.09 ± 0.03 μM，并通过生化方式抑制 ERK5，IC50 为 0.162 0.006 M。此外，XMD17-109 阻断 LRRK2[G2019S]，IC50值为 339 nM[1]。通过显着剂量依赖性地降低山梨醇刺激细胞的迁移率迁移磷酸化 ERK5 带，XMD17-109 表现出低纳摩尔细胞活性。在 30 M 和 EC50 为 4.2 μM 时，XMD17-109 完全阻断 ERK5 介导的 AP1 转录活性[2]。

体内研究 (In Vivo)

不适用

酶活实验

在含有 200 ng 纯活性 ERK5 和指定量抑制剂的激酶缓冲液（50 mM Tris-HCl，pH 7.5，0.1 mM EGTA，1 mM 2-巯基乙醇）中，在 40 μL 测定体积中评估激酶活性。添加 10 mM 醋酸镁、50 μM [γ-32P]-ATP (500 cpm/pmol) 和 250 μM PIMtide (ARKKRRHPSGPPTA) 作为底物以开始反应。测定在 30°C 下进行 20 分钟，然后将反应混合物涂在 p81 纸上，并如前所述测量掺入的放射性。

细胞实验

HeLa 细胞维持在 10% FBS、2 mM L-谷氨酰胺、50 U/mL 青霉素 G 和 50 μg/mL 链霉素补充的 DMEM 中。使用前，HeLa 细胞在补充有 2 mM L-谷氨酰胺、50 U/mL 青霉素 G 和 50 μg/mL 链霉素的 DMEM 中进行血清饥饿 16 小时。之后，将 HeLa 细胞暴露于指定浓度的 ERK5-IN-1 中 1 小时，然后用 0.5mol/L 山梨醇刺激 30 分钟。 Triton 裂解缓冲液，每孔含有 20 μg 蛋白质，含有 50 mM Tris-HCl，pH 7.5、1 mM EGTA、1 mM EDTA、1 mM 原钒酸钠、50 mM 氟化钠和 1 mM 焦磷酸钠，以及使用0.27 mol/L蔗糖和1 M微囊藻毒素-LR来裂解细胞。使用标准程序在 8% 聚丙烯酰胺凝胶上运行样品。将蛋白质转移到硝酸纤维素膜上，并使用免疫印迹法发现特定蛋白质。

动物实验

参考文献

[1]. Structural determinants for ERK5 (MAPK7) and leucine rich repeat kinase 2 activities of benzo[e]pyrimido-[5,4-b]diazepine-6(11H)-ones. Eur J Med Chem. 2013;70:758-67.

[2]. X-ray Crystal Structure of ERK5 (MAPK7) in Complex with a Specific Inhibitor. Journal of Medicinal Chemistry (2013), 56(11), 4413-4421.

[3]. Extracellular signal-regulated kinase 5 promotes acute cellular and systemic inflammation. Sci Signal. 2015 Aug 25;8(391):ra86.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式

C36H46N8O3

分子量

638.81

精确质量

638.369

元素分析

C, 67.69; H, 7.26; N, 17.54; O, 7.51

CAS号

1435488-37-1

相关CAS号

1435488-37-1

PubChem CID

71604307

外观&性状

White to beige solid powder

密度

1.3±0.1 g/cm3

沸点

831.6±75.0 °C at 760 mmHg

闪点

456.8±37.1 °C

蒸汽压

0.0±3.0 mmHg at 25°C

折射率

1.640

LogP

2.39

tPSA

100.76

氢键供体(HBD)数目

氢键受体(HBA)数目

可旋转键数目(RBC)

重原子数目

分子复杂度/Complexity

1060

定义原子立体中心数目

SMILES

O=C1C2=C(C=CC=C2)N(C3CCCC3)C4=NC(NC5=C(OCC)C=C(C(N6CCC(N7CCN(C)CC7)CC6)=O)C=C5)=NC=C4N1C

InChi Key

XVBGRTMNFNMINE-UHFFFAOYSA-N

InChi Code

InChI=1S/C36H46N8O3/c1-4-47-32-23-25(34(45)43-17-15-26(16-18-43)42-21-19-40(2)20-22-42)13-14-29(32)38-36-37-24-31-33(39-36)44(27-9-5-6-10-27)30-12-8-7-11-28(30)35(46)41(31)3/h7-8,11-14,23-24,26-27H,4-6,9-10,15-22H2,1-3H3,(H,37,38,39)

化学名

11-cyclopentyl-2-[2-ethoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidine-1-carbonyl]anilino]-5-methylpyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one

别名

XMD-17109; XMD 17-109; XMD17109; XMD 17109; XMD17-109; XMD-17-109

HS Tariff Code

2934.99.9001

存储方式

Powder -20°C 3 years

4°C 2 years

In solvent -80°C 6 months

-20°C 1 month

运输条件

Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)

DMSO: ~100 mg/mL (~156.5 mM)

Water: <1 mg/mL

Ethanol: ~100 mg/mL (~156.5 mM)

溶解度 (体内实验)

配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.91 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.91 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.91 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	1.5654 mL	7.8271 mL	15.6541 mL
	5 mM	0.3131 mL	1.5654 mL	3.1308 mL
	10 mM	0.1565 mL	0.7827 mL	1.5654 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片

Confluent monolayers of HMVEC-lung cells grown in 48-well tissue culture plates were pretreated for 1 hour with vehicle (DMSO), 1 μM XMD17-109. Sci Signal . 2015 Aug 25;8(391):ra86.

PBMCs or monocytes (as indicated) were pretreated for 1 hour with vehicle (DMSO), 5 μM XMD8-92, or 1 μM XMD17-109 before being treated with vehicle (0.9% saline), FSL-1 (10 μg/ml), or LPS (10 μg/ml) for an additional 6 hours while in the continuous presence of DMSO or inhibitor. Sci Signal . 2015 Aug 25;8(391):ra86.