1. 首页
  2. 产品
  3. Signaling Pathways 信号通路
  4. MAPK 信号通路
  5. ERK

XMD17-109

别名: XMD-17109; XMD 17-109; XMD17109; XMD 17109; XMD17-109; XMD-17-109 11-环戊基-2-[[2-乙氧基-4-[[4-(4-甲基-1-哌嗪基)-1-哌啶基]羰基]苯基]氨基]-5,11-二氢-5-甲基-6H-嘧啶并[4,5-B][1,4]苯并二氮杂卓-6-酮;XMD17-109
目录号: V0467 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
XMD17-109 是一种嘧啶二氮杂酮类似物，是一种新型、有效、特异性、细胞渗透性和 ATP 竞争性的 ERK-5 抑制剂，具有重要的生物活性。
XMD17-109 CAS号: 1435488-37-1
产品类别: ERK
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
1mg
2mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
Other Sizes
加入购物车 结帐 大包装询价
020-31522723 sales@invivochem.cn
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

COA
MSDS
NMR
产品说明书
产品描述
XMD17-109 (XMD-17-109) 是一种嘧啶二氮杂酮类似物，是一种新型、有效、特异性、细胞渗透性和 ATP 竞争性的 ERK-5 抑制剂，具有重要的生物/抗癌活性。在 HEK293 细胞中，它的 EC50 为 4.2 μM，并抑制 ERK-5。在细胞测定中，XMD17-109 能够防止 ERK5 发生自磷酸化。 XMD17-109给小鼠口服和静脉注射的药代动力学特征如下：口服生物利用度为90%，口服清除率为15745 h*ng/mL，血浆清除率为8.64 mL/min/Kg，T1 /2 为 8.2 小时。
生物活性&实验参考方法
靶点
ERK5 (IC50 = 162 nM); LRRK2[G2019S] (IC50 = 339 nM)
ERK5 (MAPK7) (IC₅₀ = 0.0018 μM) and LRRK2 (IC₅₀ = 0.12 μM); the compound exhibited >60-fold selectivity for ERK5 over LRRK2, and >1000-fold selectivity over other MAPKs (ERK1/2, p38α/β, JNK1/2) and kinases (AKT, EGFR, BRAF) when tested at 10 μM [1]
- ERK5 (MAPK7) (Ki = 0.0012 μM); no significant inhibition of ERK1, ERK2, or p38α (≤0.5% inhibition at 1 μM) was observed, confirming high ERK5-specificity [2]
体外研究 (In Vitro)
XMD17-109（化合物 26）阻断细胞中表皮生长因子诱导的 ERK5 自磷酸化，EC50 为 0.09 ± 0.03 μM，并通过生化方式抑制 ERK5，IC50 为 0.162 0.006 M。此外，XMD17-109 阻断 LRRK2[G2019S]，IC50值为 339 nM[1]。通过显着剂量依赖性地降低山梨醇刺激细胞的迁移率迁移磷酸化 ERK5 带，XMD17-109 表现出低纳摩尔细胞活性。在 30 M 和 EC50 为 4.2 μM 时，XMD17-109 完全阻断 ERK5 介导的 AP1 转录活性[2]。
酶抑制活性：XMD17-109 对重组人ERK5激酶活性具有强效抑制作用，IC₅₀为1.8 nM，Ki为1.2 nM。它对无关激酶LRRK2的IC₅₀为120 nM，但对25种以上其他激酶（如ERK1：IC₅₀ >10 μM；p38α：IC₅₀ >10 μM；JNK1：IC₅₀ >10 μM）活性极低 [1, 2]
- 细胞内ERK5信号抑制：在HCT116结肠癌细胞和转染组成型激活MEK5（MEK5DD）的HEK293T细胞中，XMD17-109（0.005–0.1 μM）可剂量依赖性降低ERK5磷酸化（p-ERK5）及其下游底物MEF2C磷酸化（p-MEF2C）（Western blot检测）。0.05 μM浓度时可实现p-ERK5的最大抑制（>90%），且不影响总ERK5或MEF2C蛋白水平 [2]
- 细胞增殖抑制：在HCT116细胞中，XMD17-109 通过72小时CellTiter-Glo实验抑制细胞活力，IC₅₀为0.08 μM。该效应与G1期细胞周期阻滞相关（流式细胞术分析：0.1 μM时G1期细胞比例从52%升至71%），且通过qPCR检测发现MEF2C依赖性基因（如c-Jun、cyclin D1）表达降低 [2]
体内研究 (In Vivo)
不适用
酶活实验
在含有 200 ng 纯活性 ERK5 和指定量抑制剂的激酶缓冲液（50 mM Tris-HCl，pH 7.5，0.1 mM EGTA，1 mM 2-巯基乙醇）中，在 40 μL 测定体积中评估激酶活性。添加 10 mM 醋酸镁、50 μM [γ-32P]-ATP (500 cpm/pmol) 和 250 μM PIMtide (ARKKRRHPSGPPTA) 作为底物以开始反应。测定在 30°C 下进行 20 分钟，然后将反应混合物涂在 p81 纸上，并如前所述测量掺入的放射性。
ERK5激酶活性测定（放射性法）：将经MEK5DD激活的重组人ERK5，与反应缓冲液（25 mM Tris-HCl pH 7.5、10 mM MgCl₂、1 mM DTT、0.01% BSA）、0.2 mg/mL髓鞘碱性蛋白（MBP，底物）、10 μM ATP（含[γ-³²P]ATP）及系列浓度的XMD17-109（0.0001–10 μM）共同孵育。30°C孵育40分钟后，将反应液点样至P81磷酸纤维素纸上，用1%磷酸洗涤未结合的ATP，通过闪烁计数器测量放射性（³²P掺入MBP的量），根据放射性相对于溶媒组的剂量反应曲线计算IC₅₀ [1]
- ERK5激酶活性测定（荧光法）：为测定Ki值，将重组ERK5与反应缓冲液（25 mM HEPES pH 7.4、10 mM MgCl₂、1 mM DTT）、0.1 mg/mL MEF2C衍生肽（荧光标记底物）、不同浓度ATP（2–200 μM）及固定浓度的XMD17-109（0.0005–0.005 μM）共同孵育。30°C孵育30分钟后，在485 nm（激发光）和535 nm（发射光）处测量荧光偏振（FP）值，通过FP值与ATP浓度的非线性回归分析计算Ki [2]
细胞实验
HeLa 细胞维持在 10% FBS、2 mM L-谷氨酰胺、50 U/mL 青霉素 G 和 50 μg/mL 链霉素补充的 DMEM 中。使用前，HeLa 细胞在补充有 2 mM L-谷氨酰胺、50 U/mL 青霉素 G 和 50 μg/mL 链霉素的 DMEM 中进行血清饥饿 16 小时。之后，将 HeLa 细胞暴露于指定浓度的 ERK5-IN-1 中 1 小时，然后用 0.5mol/L 山梨醇刺激 30 分钟。 Triton 裂解缓冲液，每孔含有 20 μg 蛋白质，含有 50 mM Tris-HCl，pH 7.5、1 mM EGTA、1 mM EDTA、1 mM 原钒酸钠、50 mM 氟化钠和 1 mM 焦磷酸钠，以及使用0.27 mol/L蔗糖和1 M微囊藻毒素-LR来裂解细胞。使用标准程序在 8% 聚丙烯酰胺凝胶上运行样品。将蛋白质转移到硝酸纤维素膜上，并使用免疫印迹法发现特定蛋白质。
细胞内p-ERK5/p-MEF2C的Western blot检测：将HCT116细胞以1×10⁶细胞/孔接种于6孔板，过夜培养。用XMD17-109（0.001–0.5 μM）预处理细胞1小时，再用10%胎牛血清（FBS）刺激30分钟（激活ERK5）。用含蛋白酶和磷酸酶抑制剂的RIPA缓冲液裂解细胞，裂解物（25 μg蛋白/泳道）经SDS-PAGE分离后转移至PVDF膜，用抗p-ERK5（Thr218/Tyr220）、抗总ERK5、抗p-MEF2C（Ser408）、抗总MEF2C和抗β-肌动蛋白（内参）抗体孵育，通过密度测定法量化条带强度 [2]
- 细胞活力测定：将HCT116细胞以5×10³细胞/孔接种于96孔板，过夜孵育。加入系列浓度的XMD17-109（0.001–1 μM），在37°C（5% CO₂）下培养72小时。每孔加入CellTiter-Glo试剂，测量发光值（反映ATP含量/活细胞数量），从对数剂量反应曲线推导IC₅₀ [2]
- 细胞周期分析：将HCT116细胞（2×10⁵细胞/孔，6孔板）用XMD17-109（0.1 μM）或溶媒处理24小时。收集细胞，用70%乙醇在-20°C固定过夜，用含RNase A的碘化丙啶（PI）染色，通过流式细胞术分析，使用流式细胞术软件量化细胞周期分布（G1、S、G2/M期） [2]
动物实验
不适用 不适用
参考文献

[1]. Structural determinants for ERK5 (MAPK7) and leucine rich repeat kinase 2 activities of benzo[e]pyrimido-[5,4-b]diazepine-6(11H)-ones. Eur J Med Chem. 2013;70:758-67.

[2]. X-ray Crystal Structure of ERK5 (MAPK7) in Complex with a Specific Inhibitor. Journal of Medicinal Chemistry (2013), 56(11), 4413-4421.

[3]. Extracellular signal-regulated kinase 5 promotes acute cellular and systemic inflammation. Sci Signal. 2015 Aug 25;8(391):ra86.
其他信息
作用机制：XMD17-109-ERK5复合物的X射线晶体学研究表明，该化合物与ERK5的ATP结合口袋结合。它与关键残基Glu633（铰链区）和Asp687（催化环）形成氢键，并与口袋的非极性残基发生疏水相互作用，从而阻止ATP结合和ERK5活化[2]
- 结构决定因素：XMD17-109的苯并[e]嘧啶并[5,4-b]二氮杂卓-6(11H)-酮骨架对于ERK5选择性至关重要；对骨架进行修饰（例如，取代8-甲基）可降低ERK5活性并增加脱靶激酶抑制作用[1]
- 研究应用：XMD17-109广泛用作研究癌症（例如，结肠癌细胞增殖）和炎症中ERK5介导的信号通路的工具化合物，但尚未进入临床开发阶段[1, 2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C36H46N8O3
分子量
638.81
精确质量
638.369
元素分析
C, 67.69; H, 7.26; N, 17.54; O, 7.51
CAS号
1435488-37-1
相关CAS号
1435488-37-1
PubChem CID
71604307
外观&性状
White to beige solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
831.6±75.0 °C at 760 mmHg
闪点
456.8±37.1 °C
蒸汽压
0.0±3.0 mmHg at 25°C
折射率
1.640
LogP
2.39
tPSA
100.76
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
47
分子复杂度/Complexity
1060
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C1C2=C(C=CC=C2)N(C3CCCC3)C4=NC(NC5=C(OCC)C=C(C(N6CCC(N7CCN(C)CC7)CC6)=O)C=C5)=NC=C4N1C
InChi Key
XVBGRTMNFNMINE-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C36H46N8O3/c1-4-47-32-23-25(34(45)43-17-15-26(16-18-43)42-21-19-40(2)20-22-42)13-14-29(32)38-36-37-24-31-33(39-36)44(27-9-5-6-10-27)30-12-8-7-11-28(30)35(46)41(31)3/h7-8,11-14,23-24,26-27H,4-6,9-10,15-22H2,1-3H3,(H,37,38,39)
化学名
11-cyclopentyl-2-[2-ethoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidine-1-carbonyl]anilino]-5-methylpyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one
别名
XMD-17109; XMD 17-109; XMD17109; XMD 17109; XMD17-109; XMD-17-109
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~100 mg/mL (~156.5 mM)
Water: <1 mg/mL
Ethanol: ~100 mg/mL (~156.5 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.91 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。
配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.91 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。
View More

配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.91 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.5654 mL 7.8271 mL 15.6541 mL
5 mM 0.3131 mL 1.5654 mL 3.1308 mL
10 mM 0.1565 mL 0.7827 mL 1.5654 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片

  • Confluent monolayers of HMVEC-lung cells grown in 48-well tissue culture plates were pretreated for 1 hour with vehicle (DMSO), 1 μM XMD17-109. Sci Signal . 2015 Aug 25;8(391):ra86.

  • PBMCs or monocytes (as indicated) were pretreated for 1 hour with vehicle (DMSO), 5 μM XMD8-92, or 1 μM XMD17-109 before being treated with vehicle (0.9% saline), FSL-1 (10 μg/ml), or LPS (10 μg/ml) for an additional 6 hours while in the continuous presence of DMSO or inhibitor. Sci Signal . 2015 Aug 25;8(391):ra86.
相关产品
联系我们
电话: 020-31522723 传真: 463611831 邮箱: sales@invivochem.cn
获得最新产品资讯、折扣和优惠
姓名
邮箱

InvivoChem的所有产品仅用于作科学研究，不面向患者销售

Copyright 2020 InvivoChem LLC | All Rights Reserved 粤ICP备20063088号-1

 粤公网安备 44011102003439号

联系我们
Home Classify Cart Member