XMD8-85 (ERK5-IN-1)

别名: ERK5 IN 1; ERK5-IN-1; ERK5IN1; XMD 8-85; XMD8-85; XMD-8-85; XMD 885; XMD-885; XMD885 ERK5-IN-1
目录号: V20691 纯度: ≥98%
XMD8-85 (ERK5-IN-1)是一种有效的 ERK5 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 87±7 nM。
XMD8-85 (ERK5-IN-1) CAS号: 1234479-76-5
产品类别: ERK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
XMD8-85 (ERK5-IN-1) 是一种强效的 ERK5 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 87±7 nM。ERK5-IN-1 也能抑制 LRRK2 [G2019S],IC50 为 26 nM。
XMD8-85 是一种选择性强效的细胞外信号调节激酶 5 (ERK5) 抑制剂,ERK5 又名 MAPK7,在酶活性测定中 IC50 为 87 nM。它也被称为 ERK5-IN-1。 XMD8-85 对 ERK5 的选择性高于酪氨酸非受体激酶 2 (TNK2,IC50=959 nM),但也能抑制亮氨酸重复序列激酶 2 (LRRK2) 突变体 LRRK2G2019S (IC50=26 nM),该突变体已在帕金森病患者中发现。该化合物还能抑制 Brd4/BET 家族溴结构域,后者是 Nanog 表达所必需的转录调控因子。XMD8-85 被用作研究 ERK5 生物学及其在癌症和其他疾病中作用的工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
ERK5 (IC50 = 87 nM); LRRK2[G2019S] (IC50 = 26 nM)
XMD8-85 targets extracellular signal-regulated kinase 5 (ERK5/MAPK7), a member of the mitogen-activated protein kinase (MAPK) family involved in cellular proliferation, differentiation, and survival. It acts as a selective ERK5 inhibitor with an IC50 of 87 nM in enzyme assays. The compound also inhibits the leucine-rich repeat kinase 2 (LRRK2) mutant LRRK2G2019S with an IC50 of 26 nM, and has activity against tyrosine non-receptor kinase 2 (TNK2, IC50=959 nM). Additionally, XMD8-85 inhibits Brd4/BET family bromodomains.
体外研究 (In Vitro)
化合物 5,ERK5-IN-1,EC50 为 0.19±0.04 μM,可抑制表皮生长因子 (EGF) 刺激的细胞中 ERK5 的自身磷酸化[1]。体外酶活性测定显示,XMD8-85 能有效抑制 ERK5 激酶活性,IC50 为 87 nM。它能抑制 HeLa 细胞中 EGF 诱导的 ERK5 自身磷酸化,EC50 为 0.19 μM。XMD8-85 还能抑制 LRRK2G2019S 突变体(IC50 为 26 nM)和 TNK2(IC50 为 959 nM)。该化合物可调节 ERK5 介导的参与细胞增殖和存活的信号通路。
体内研究 (In Vivo)
公开文献中关于XMD8-85体内活性的数据有限。该化合物已在癌症模型中进行了研究,以评估其抗肿瘤疗效。作为一种ERK5抑制剂,XMD8-85可能调节肿瘤生长和转移。需要进一步的体内研究来全面阐明其药理作用和治疗潜力。
酶活实验
XMD8-85 的体外激酶抑制试验包括测定其对 ERK5 激酶活性的抑制作用。激酶活性测定在 40 μL 的反应体系中进行,该体系包含激酶缓冲液(50 mM Tris-HCl,pH 7.5,0.1 mM EGTA,1 mM 2-巯基乙醇),其中包含 200 ng 纯活性 ERK5 和指定量的抑制剂。反应通过加入 10 mM 乙酸镁、50 μM [γ-32P]-ATP (500 cpm/pmol) 和 250 μM PIMtide (ARKKRRHPSGPPTA) 作为底物启动。试验在 30°C 下进行 20 分钟,通过将反应混合物点样至 p81 滤纸上终止反应,并测量掺入的放射性。IC50 值由剂量-反应曲线计算得出。
细胞实验
XMD8-85 的体外细胞实验包括用不同浓度的化合物处理癌细胞系(例如 HeLa 细胞)。采用磷酸化特异性抗体通过蛋白质印迹法检测 ERK5 的自磷酸化水平。使用 MTT 或克隆形成实验评估细胞增殖。使用 Annexin V/PI 双染法通过流式细胞术检测细胞凋亡。评估该化合物对 ERK5 介导的信号通路和细胞活力的影响。
动物实验
XMD8-85 的体内动物实验通常采用人源肿瘤的小鼠异种移植模型。荷瘤小鼠将接受不同剂量的 XMD8-85 口服或腹腔注射给药。定期测量肿瘤体积。评估肿瘤组织中 ERK5 抑制及其下游信号通路。然而,公开文献中并未广泛记载 XMD8-85 的具体体内实验方案。
药代性质 (ADME/PK)
公开文献中尚未对XMD8-85的药代动力学(PK)特性进行全面表征。该化合物的分子量为459.54 (C25H29N7O2)。作为一种小分子激酶抑制剂,预计其具有良好的生物利用度和组织分布。然而,包括半衰期、Cmax和代谢途径在内的具体PK参数尚未得到充分阐明。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
XMD8-85 已被用作临床前研究的工具。作为一种激酶抑制剂,其潜在的不良反应可能包括脱靶激酶抑制。该化合物的选择性表明其安全性良好。治疗开发需要进行完整的毒理学研究,包括急性毒性、重复给药毒性和遗传毒性评估。
参考文献

[1]. Structural determinants for ERK5 (MAPK7) and leucine rich repeat kinase 2 activities of benzo[e]pyrimido-[5,4-b]diazepine-6(11H)-ones. Eur J Med Chem. 2013;70:758-767.

其他信息
2-[2-甲氧基-4-(4-甲基-1-哌嗪基)苯胺基]-5,11-二甲基-6-嘧啶并[4,5-b][1,4]苯并二氮杂卓属于哌嗪类化合物。
XMD8-85(CAS号:1234479-76-5)是一种选择性强效的ERK5抑制剂(IC50=87 nM),也称为ERK5-IN-1。它还能抑制LRRK2G2019S突变体(IC50=26 nM)和TNK2(IC50=959 nM),并抑制Brd4/BET溴结构域。XMD8-85抑制HeLa细胞中EGF诱导的ERK5自磷酸化(EC50=0.19 μM)。该化合物尚未获准用于临床,目前仍作为研究ERK5生物学的科研工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H29N7O2
分子量
459.55
精确质量
459.238
元素分析
C, 65.34; H, 6.36; N, 21.34; O, 6.96
CAS号
1234479-76-5
相关CAS号
1234479-76-5
PubChem CID
46844147
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
2.962
tPSA
80.45
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
34
分子复杂度/Complexity
703
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O(C([H])([H])[H])C1=C(C([H])=C([H])C(=C1[H])N1C([H])([H])C([H])([H])N(C([H])([H])[H])C([H])([H])C1([H])[H])N([H])C1=NC([H])=C2C(=N1)N(C([H])([H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C(N2C([H])([H])[H])=O
InChi Key
DDTPGANIPBKTNU-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H29N7O2/c1-29-11-13-32(14-12-29)17-9-10-19(22(15-17)34-4)27-25-26-16-21-23(28-25)30(2)20-8-6-5-7-18(20)24(33)31(21)3/h5-10,15-16H,11-14H2,1-4H3,(H,26,27,28)
化学名
2-[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)anilino]-5,11-dimethylpyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one
别名
ERK5 IN 1; ERK5-IN-1; ERK5IN1; XMD 8-85; XMD8-85; XMD-8-85; XMD 885; XMD-885; XMD885
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~92 mg/mL (~200.2 mM)
Ethanol: ~11 mg/mL (~23.9 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.75 mg/mL (5.98 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 27.5 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.75 mg/mL (5.98 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 27.5mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.75 mg/mL (5.98 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 27.5 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1760 mL 10.8802 mL 21.7604 mL
5 mM 0.4352 mL 2.1760 mL 4.3521 mL
10 mM 0.2176 mL 1.0880 mL 2.1760 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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