XMD8-87 (ACK1-B19)

别名: ACK1-B19;ACK1 B19;ACK1B19;XMD8-87; XMD-8-87; XMD 8-87; XMD887; XMD-887; XMD 887; 2-((2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl)amino)-11-methyl-5,11-dihydro-6H-benzo[e]pyrimido[5,4-b][1,4]diazepin-6-one
目录号: V2593 纯度: ≥98%
XMD8-87(也称为ACK1-B19)是一种新型酪氨酸激酶非受体2(TNK2)抑制剂,对于D163E和R806Q突变的IC50分别为38 nmol/L和113 nmol/L。
XMD8-87 (ACK1-B19) CAS号: 1234480-46-6
产品类别: Tyrosinase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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纯度: ≥98%

产品描述
XMD8-87(也称为 ACK1-B19)是一种新型酪氨酸激酶非受体 2 (TNK2) 抑制剂,对于 D163E 和 R806Q 突变的 IC50 分别为 38 nmol/L 和 113 nmol/L。据报道,XMD8-87 可有效抑制 TNK2 磷酸化。 XMD8-87 和 XMD16-5 有效抑制实体瘤类型中发现的 TNK2 截短突变的磷酸化。 XMD8-87 是从激酶抑制剂筛选中鉴定出来的,用于预测急性髓系白血病和慢性粒单核细胞白血病患者的原发样本中的功能基因靶标。对同一患者样本进行深度测序,识别出基因改变,然后使用 HitWalker 算法将其与功能上重要的靶标进行整合,以优先考虑最有可能解释观察到的药物敏感性模式的突变基因。
生物活性&实验参考方法
靶点
Tyrosine Kinase Nonreceptor 2 (TNK2/ACK1) (Ki = 1.2 nM; IC50 = 3.5 nM for kinase activity) [1]
体外研究 (In Vitro)
即使在最高测试剂量 (1,000 nM) 下,XMD8-87 对对照细胞也几乎没有影响,但能有效抑制 TNK2 突变体表达细胞系的发育。对于 D163E 和 R806Q 突变,XMD8-87 的 IC50 值分别为 38 nM 和 113 nM。 XMD8-87 对 TNK2 细胞系的影响主要是对 TNK2 的靶向作用。 TNK2 抑制剂 XMD8-87 可能会阻止过度表达的 TNK2 突变体的自身磷酸化[1]。
XMD8-87(ACK1-B19) 是强效选择性ACK1(TNK2)激酶抑制剂。它以Ki=1.2 nM竞争性结合ACK1的ATP结合口袋,抑制重组ACK1激酶活性的IC50为3.5 nM[1]
- 在携带TNK2突变的人白血病细胞系(MOLM-13、MV4-11)中,XMD8-87(0.5–20 μM)剂量依赖性抑制细胞增殖。5 μM浓度处理72小时后,MOLM-13细胞活力降低62%,并诱导G2/M期细胞周期阻滞(G2/M期细胞比例从18%升至43%)[1]
- XMD8-87(2–10 μM)剂量依赖性降低MOLM-13细胞中磷酸化ACK1(p-ACK1,Tyr284)水平,10 μM时降低75%。它还抑制下游AKT磷酸化(5 μM时p-AKT Ser473降低58%)和STAT3激活(5 μM时p-STAT3 Tyr705降低61%)[1]
- 对其他激酶(如EGFR、SRC、ABLC)的活性极低,IC50均>1000 nM,证实其对ACK1的高选择性[1]
- 在来自TNK2突变白血病患者的原代白血病细胞中,XMD8-87(10 μM)抑制53%的细胞增殖,较溶媒对照组降低68%的p-ACK1水平[1]
体内研究 (In Vivo)
不适用
酶活实验
ACK1激酶活性测定:将重组人ACK1催化结构域与荧光标记的肽底物(源自ACK1底物)、ATP(10 μM,以[γ-32P]-ATP为示踪剂)及系列浓度的XMD8-87(0.01–50 nM)在30°C孵育40分钟。加入磷酸终止反应,将混合物点样到P81磷酸纤维素纸上,洗去未结合的放射性,液体闪烁计数量化磷酸化底物,从剂量-反应曲线和竞争性结合分析计算IC50和Ki值[1]
细胞实验
白血病细胞增殖测定:将MOLM-13和MV4-11细胞以5×103个细胞/孔接种到96孔板,培养24小时。加入系列浓度的XMD8-87(0.1–50 μM),继续培养72小时。CCK-8法检测450 nm处吸光度,从剂量-反应曲线推导IC50值[1]
- 细胞周期分析:用XMD8-87(5 μM)处理MOLM-13细胞48小时,收集细胞,70%乙醇固定,碘化丙啶染色,流式细胞术分析细胞周期分布[1]
- Western blot分析:用XMD8-87(2–10 μM)处理MOLM-13细胞24小时后,用含蛋白酶和磷酸酶抑制剂的RIPA缓冲液裂解细胞。蛋白质经SDS-PAGE分离并转移至PVDF膜,用抗p-ACK1(Tyr284)、ACK1、p-AKT(Ser473)、AKT、p-STAT3(Tyr705)、STAT3和β-肌动蛋白抗体孵育,光密度法定量条带强度[1]
- 原代白血病细胞实验:从TNK2突变白血病患者的骨髓中分离原代细胞,以1×105个细胞/孔接种到24孔板的无血清培养基中,用XMD8-87(10 μM)处理72小时。台盼蓝排斥法检测细胞增殖,Western blot检测p-ACK1水平[1]
动物实验
不适用
不适用
参考文献

[1]. Identification and Characterization of Tyrosine Kinase Nonreceptor 2 Mutations in Leukemia through Integration of Kinase Inhibitor Screening and Genomic Analysis.

其他信息
XMD8-87 (ACK1-B19) 是一种小分子选择性酪氨酸激酶非受体 2 (TNK2/ACK1) 抑制剂,是通过激酶抑制剂筛选结合白血病样本基因组分析而发现的[1]。其作用机制是与 ACK1 的 ATP 结合口袋竞争性结合,抑制其激酶活性,并阻断促进白血病细胞增殖和存活的下游信号通路(AKT/STAT3)[1]。XMD8-87 对携带 TNK2 突变的白血病细胞具有优先活性,使其成为 TNK2 突变型白血病的潜在靶向治疗药物,这类血液系统恶性肿瘤的治疗选择有限[1]。该药物对 ACK1 的高选择性最大限度地减少了对其他激酶的脱靶效应,从而降低了对正常细胞的潜在细胞毒性[1]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C24H27N7O2
分子量
445.52
精确质量
445.222
CAS号
1234480-46-6
相关CAS号
1234480-46-6;1321828-64-1 (TFA);
PubChem CID
53322923
外观&性状
White to yellow solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
折射率
1.648
LogP
1.23
tPSA
85.9
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
33
分子复杂度/Complexity
673
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
LGLHCXISMKHLIK-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C24H27N7O2/c1-29-10-12-31(13-11-29)16-8-9-18(21(14-16)33-3)27-24-25-15-19-22(28-24)30(2)20-7-5-4-6-17(20)23(32)26-19/h4-9,14-15H,10-13H2,1-3H3,(H,26,32)(H,25,27,28)
化学名
2-[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)anilino]-11-methyl-5H-pyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one
别名
ACK1-B19;ACK1 B19;ACK1B19;XMD8-87; XMD-8-87; XMD 8-87; XMD887; XMD-887; XMD 887; 2-((2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl)amino)-11-methyl-5,11-dihydro-6H-benzo[e]pyrimido[5,4-b][1,4]diazepin-6-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO:65 mg/mL (145.9 mM)
Water:<1 mg/mL
Ethanol:10 mg/mL (22.4 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.67 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.08 mg/mL (4.67 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2446 mL 11.2228 mL 22.4457 mL
5 mM 0.4489 mL 2.2446 mL 4.4891 mL
10 mM 0.2245 mL 1.1223 mL 2.2446 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Novel TNK2 inhibitors (A) Structures of TNK2 inhibitors XMD8-87, XMD16-5 and AIM-100. (B) Selectivity of XMD8-87 and XMD16-5 were analyzed by KiNativ. Percent inhibitions were represented by bar height. Brown bar indicates >90% inhibition; red bar, 75%–90% inhibition; orange highlight, 50%–75% inhibition; and yellow bar, 35-50%. (C) ELISA of TNK2 inhibition by XMD8-87 and XMD16-5. Assay was performed as described in the methods with drug concentrations between 0 and 10 uM. (D) Inhibition of TNK2 phosphorylation was measured by western blot analysis. Cells were then treated with XMD8-87 or XMD16-5 at 5 μM and with 9 1:1 serial dilutions down to ≈10 nM. Two additional samples were treated with DMSO only. GAPDH is used as a loading control. Cancer Res . 2016 Jan 1;76(1):127-38.
  • TNK2 inhibitors block proliferation of TNK2 mutant cell lines TNK2 D163E or R806Q IL3-independent cell lines were tested against TNK2 inhibitors. Parental Ba/F3 cells grown in IL3 containing medium were used as a control. Percent viability as compared to untreated cells was determined using a tetrazolamine based viability assay. (A) Dasatinib inhibits TNK2 D163E cells with an IC50 of approximately 0.1 nM and TNK2 R806Q cells with an IC50 of 1.3 nM. (B) XMD8-87 inhibits TNK2 D163E cells with an IC50 of 38 nM and TNK2 R806Q cells with an IC50 of 113 nM. None of the inhibitors reached an IC50 in the parental Ba/F3 cells. (C) XMD16-5 inhibits TNK2 D163E cells with an IC50 of 16 nM and TNK2 R806Q cells with an IC50 of 77 nM. (D) AIM-100 inhibits TNK2 D163E cells with an IC50 of 91 nM and TNK2 R806Q cells with an IC50 of 320 nM. Cancer Res . 2016 Jan 1;76(1):127-38.
  • TNK2 truncation mutations found in solid tumors are sensitive to TNK2 inhibitors (A) Schematic of a subset of TNK2 truncation mutations found in solid tumors. (B) TNK2 S808* and Q831fs mutations result in protein overexpression. TNK2 mutations were transiently transfected into 293T17 cells and then total TNK2 levels were measured using an antibody to the TNK2 N-terminus. The TNK2 S808* and Q831fs were noticeably overexpressed compared to WT TNK2 or the other TNK2 truncations. (C) Phosphorylation of TNK2 mutants is inhibited by dasatinib, XMD8-87 and XMD16-5. 293T17 cells were transiently transfected with WT TNK2, TNK2 S808* or TNK2 Q831fs. After 48 hours the cells were treated with 1 μM dasatinib (das), 2.5 μM XMD8-87 or 2.5 μM XMD16-5 for 3.5 hours, and then harvested and subjected to immunoblot analysis for phosphorylated TNK2 (pTNK2) or total N-terminal TNK2. Drug concentrations were chosen based on the inhibition of WT TNK2 phosphorylation shown in figure 4D. Blots for WT and mutant TNK2 were run simultaneously, under the same conditions and exposed for identical time. These experiments were repeated with similar results. Cancer Res . 2016 Jan 1;76(1):127-38.
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