Xylohexaose

别名: 木六糖;木六糖[木己糖]
目录号: V30408 纯度: ≥98%
木六糖是由六个木糖残基组成的低聚木糖。
Xylohexaose CAS号: 49694-21-5
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
25mg
100mg
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产品描述
木六糖是由六个木糖残基组成的低聚木糖。木六糖可用作测定木聚糖水解性质的底物。
生物活性&实验参考方法
体外研究 (In Vitro)
- 木六糖(Xylohexaose)被用作底物,评估杂合木聚糖酶(XynA1-A2)及其亲本木聚糖酶(XynA1、XynA2)的水解活性。在50°C(pH 6.0)下孵育24小时后,XynA1-A2水解木六糖(Xylohexaose)生成木糖(X1,约35%)、木二糖(X2,约40%)、木三糖(X3,约20%)和微量木四糖(X4);XynA1生成更多X1(约45%)和X2(约35%),而XynA2生成更多X3(约30%)和X4(约15%) [1]
- 木六糖(Xylohexaose)可被黄曲霉(Aspergillus flavus)来源的纯化木聚糖酶(AfXyn)在最适条件(55°C,pH 5.0)下水解。反应12小时后,AfXyn(0.5 U/mL)对木六糖(Xylohexaose)(10 mg/mL)的水解率达约92%,主要产物为X2(约50%)和X3(约40%),以及少量X1(约10%) [2]
酶活实验
- 杂合木聚糖酶及亲本酶的水解活性检测:反应体系含50 mM磷酸钠缓冲液(pH 6.0)、5 mg/mL 木六糖(Xylohexaose)和0.2 U/mL木聚糖酶(XynA1-A2、XynA1或XynA2)。体系在50°C孵育24小时后,煮沸10分钟终止反应。水解产物采用高效液相色谱(HPLC)分析,使用碳水化合物分析柱;流动相为乙腈-水(75:25,v/v),流速1.0 mL/min,柱温30°C。通过与X1、X2、X3、X4标准品的峰面积对比,对产物浓度进行定量 [1]
- 黄曲霉木聚糖酶的水解活性检测:反应体系含20 mM柠檬酸-磷酸缓冲液(pH 5.0)、10 mg/mL 木六糖(Xylohexaose)和0.5 U/mL AfXyn。体系在55°C孵育,12小时内每2小时取样一次;每次取样后煮沸5分钟终止反应,12,000 × g离心10分钟。上清液经0.22 μm膜过滤后,用HPLC(碳水化合物柱)分析;流动相为80%乙腈(v/v),流速0.8 mL/min,采用示差折光检测器检测。根据木六糖(Xylohexaose)浓度的降低计算水解率,通过峰鉴定和定量确定产物组成 [2]
参考文献

[1]. Hydrolytic properties of a hybrid xylanase and its parents. Appl Biochem Biotechnol. 2009 Mar;152(3):428-39.

[2]. Purification and characterization of a new xylanase with excellent stability from Aspergillus flavus and its application in hydrolyzing pretreated corncobs. Protein Expr Purif. 2019 Feb;154:91-97.

其他信息
木六糖(X6)是一种六聚木糖寡糖,是木聚糖酶的特异性底物,广泛用于评价木聚糖酶的水解效率和产物特异性[1, 2]
- 在参考文献[1]中,木六糖被用于比较杂合木聚糖酶及其亲本的催化特性,结果表明杂合酶继承了XynA1的高水解效率和XynA2的产物特异性[1]
- 在参考文献[2]中,木六糖有助于证实AfXyn优异的稳定性:AfXyn在60℃预孵育2小时后,其对木六糖的水解活性仍保持在85%以上,表明其具有良好的热稳定性[2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C30H50O25
分子量
810.7030
精确质量
810.264
CAS号
49694-21-5
PubChem CID
74539951
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.77 g/cm3
沸点
1142.7±65.0℃ at 760 mmHg
熔点
236-237℃
LogP
-10.2
tPSA
392.59
氢键供体(HBD)数目
14
氢键受体(HBA)数目
25
可旋转键数目(RBC)
10
重原子数目
55
分子复杂度/Complexity
1210
定义原子立体中心数目
23
SMILES
C1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@@H](O1)O[C@@H]2CO[C@H]([C@@H]([C@H]2O)O)O[C@@H]3CO[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@@H]4CO[C@H]([C@@H]([C@H]4O)O)O[C@@H]5CO[C@H]([C@@H]([C@H]5O)O)O[C@@H]6COC([C@@H]([C@H]6O)O)O)O)O)O
InChi Key
FTTUBRHJNAGMKL-HWHAXOAESA-N
InChi Code
InChI=1S/C30H50O25/c31-7-1-46-26(20(39)13(7)32)52-9-3-48-28(22(41)15(9)34)54-11-5-50-30(24(43)17(11)36)55-12-6-49-29(23(42)18(12)37)53-10-4-47-27(21(40)16(10)35)51-8-2-45-25(44)19(38)14(8)33/h7-44H,1-6H2/t7-,8-,9-,10-,11-,12-,13+,14+,15+,16+,17+,18+,19-,20-,21-,22-,23-,24-,25?,26+,27+,28+,29+,30+/m1/s1
化学名
(2S,3R,4S,5R)-2-[(3R,4R,5R,6S)-6-[(3R,4R,5R,6S)-6-[(3R,4R,5R,6S)-6-[(3R,4R,5R,6S)-4,5-dihydroxy-6-[(3R,4R,5R)-4,5,6-trihydroxyoxan-3-yl]oxyoxan-3-yl]oxy-4,5-dihydroxyoxan-3-yl]oxy-4,5-dihydroxyoxan-3-yl]oxy-4,5-dihydroxyoxan-3-yl]oxyoxane-3,4,5-triol
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O : ~400 mg/mL (~493.40 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 100 mg/mL (123.35 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.2335 mL 6.1675 mL 12.3350 mL
5 mM 0.2467 mL 1.2335 mL 2.4670 mL
10 mM 0.1234 mL 0.6168 mL 1.2335 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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