| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 100mg |
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| 250mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
Xylotetraose targets xylanase (endo-1,4-β-xylanase, e.g., family 11 xylanase, XynII) (binding free energy = -35.2 kJ/mol for XynII-xylotetraose complex via MM-PBSA analysis; acts as a specific substrate for xylanase) [3]
Xylotetraose binds to Penicillium griseofulvum family 11 xylanase (substrate specificity constant kcat/Km = 2.8 × 10⁴ M⁻¹s⁻¹) [4] |
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
- 木聚糖酶催化水解的底物:木四糖(Xylotetraose)是多种来源(芽孢杆菌属、灰黄青霉、里氏木霉)endo-1,4-β-木聚糖酶的特异性底物。它被木聚糖酶水解生成木二糖、木三糖和木糖,水解效率与酶亲和力呈正相关[1][4]
- 与木聚糖酶的结合模式:该化合物通过氢键和疏水作用结合到木聚糖酶(XynII)的活性位点。反应性糖残基在结合口袋中呈现扭曲船式(skew boat)和椅式(chair)两种构象,其中椅式构象更利于催化反应[3] - 调控木聚糖酶-底物相互作用:木四糖(Xylotetraose)含有的规则β-1,4-木糖基基序增强了分子柔性,促进其与纤维素表面及木聚糖酶活性位点的相互作用。它对11家族木聚糖酶的结合亲和力高于 shorter 木寡糖(木二糖、木三糖)[2][4] - 木聚糖酶家族特异性:木四糖(Xylotetraose)可被11家族木聚糖酶特异性识别,不与其他糖苷水解酶(如纤维素酶、β-木糖苷酶)结合,证实其木聚糖酶特异性底物活性[4] |
| 酶活实验 |
- 木聚糖酶催化活性实验:重组木聚糖酶(11家族,如XynII或灰黄青霉木聚糖酶)与木四糖(Xylotetraose)(1-10 mM)在反应缓冲液(pH 5.0-6.0,50°C)中混合,孵育0-120分钟后,采用碳水化合物色谱柱通过高效液相色谱(HPLC)定量水解产物(木糖、木二糖),计算动力学参数(kcat、Km、kcat/Km)[4]
- MM-PBSA自由能分析:在水溶液中对木聚糖酶-木四糖(Xylotetraose)复合物进行10 ns分子动力学(MD)模拟,采用MM-PBSA方法计算结合自由能,分析范德华力、静电相互作用和溶剂化能对结合稳定性的贡献[3] - 木聚糖酶-底物结合实验:木四糖(Xylotetraose)用荧光探针标记后,与梯度浓度(0.1-10 μM)的纯化木聚糖酶在结合缓冲液(pH 5.5)中混合,通过检测荧光偏振强度确定结合亲和力,从结合等温线推导解离常数(KD)[4] |
| 参考文献 |
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| 其他信息 |
化学分类:木四糖是一种线性木寡糖,由四个D-木糖残基通过β-1,4-糖苷键连接而成[1][2][3][4]
- 作用机制:作为内切-1,4-β-木聚糖酶的天然底物,木四糖与酶的活性位点结合,诱导构象变化,从而促进β-1,4-糖苷键的水解。其规则的木糖基序增强了分子的柔性,促进了与木聚糖酶和纤维素表面的特异性相互作用[2][3][4] - 生物学背景:木四糖是木聚糖酶水解木聚糖(植物细胞壁的关键成分)的主要产物。木聚糖酶在生物质降解中发挥着关键作用,因为木聚糖酶介导的木聚糖水解为木寡糖(包括木四糖)是植物生物质转化为可发酵糖所必需的[1][2]。 - 应用:木四糖可用作木聚糖酶活性测定、酶表征和木聚糖酶-底物相互作用研究的特异性底物。它还可用作研究木聚糖酶结构-功能关系和植物细胞壁降解机制的模型化合物[1][3][4]。 |
| 分子式 |
C20H34O17
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|---|---|
| 分子量 |
546.4738
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| 精确质量 |
546.18
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| CAS号 |
22416-58-6
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| PubChem CID |
101601989
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| LogP |
-7.4
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| tPSA |
274.75
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| 氢键供体(HBD)数目 |
10
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| 氢键受体(HBA)数目 |
17
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| 可旋转键数目(RBC) |
10
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| 重原子数目 |
37
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| 分子复杂度/Complexity |
714
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| 定义原子立体中心数目 |
15
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| SMILES |
C1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@@H](O1)O[C@@H]2CO[C@H]([C@@H]([C@H]2O)O)O[C@@H]3CO[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H](CO)[C@@H]([C@H](C=O)O)O)O)O)O
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| InChi Key |
JVZHSOSUTPAVII-MESLASACSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C20H34O17/c21-1-6(23)11(25)8(2-22)35-19-16(30)13(27)10(4-33-19)37-20-17(31)14(28)9(5-34-20)36-18-15(29)12(26)7(24)3-32-18/h1,6-20,22-31H,2-5H2/t6-,7+,8+,9+,10+,11+,12-,13-,14-,15+,16+,17+,18-,19-,20-/m0/s1
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| 化学名 |
(2R,3R,4R)-4-[(2S,3R,4R,5R)-5-[(2S,3R,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-[(2S,3R,4S,5R)-3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]oxy-3,4-dihydroxyoxan-2-yl]oxy-2,3,5-trihydroxypentanal
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
H2O : ~125 mg/mL (~228.74 mM)
DMSO : ~100 mg/mL (~182.99 mM) |
|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.57 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.57 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.57 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.8299 mL | 9.1496 mL | 18.2993 mL | |
| 5 mM | 0.3660 mL | 1.8299 mL | 3.6599 mL | |
| 10 mM | 0.1830 mL | 0.9150 mL | 1.8299 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。