3MB-PP1

别名: 3MB-PP1; 3-MB-PP1; 3 MB-PP1; 3-MB-PP1 4-氨基-1-叔丁基-3-(3-甲基苯甲基)吡唑并[3,4-d]嘧啶;4-氨基-1-叔丁基-3-(3-甲基苄基)吡唑并[3,4-d]嘧啶
目录号: V60036 纯度: ≥98%
3MB-PP1 是一种大体积嘌呤类似物,是一种 Polo 样激酶 1 (Plk1) 抑制剂。
3MB-PP1 CAS号: 956025-83-5
产品类别: PLK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
3MB-PP1 是一种大体积嘌呤类似物,是一种 Polo 样激酶 1 (Plk1) 抑制剂。 3MB-PP1 通过靶向 Plk1 来阻断表达类似物敏感 Plk1 等位基因的细胞中的有丝分裂进展和细胞分裂。 3MB-PP1 特异性抑制类似物敏感的 Ssn3 (Cdk8) 的活性。 3MB-PP1 抑制 Leu93 突变体 Zipper 相互作用蛋白激酶 (Leu93-ZIPK;IC50=2 μM)。 3MB-PP1 可用于研究白色念珠菌的菌丝形成和细胞分裂。
生物活性&实验参考方法
靶点
Leu93-ZIPK (IC50 = 2 μM)
The target of 3MB-PP1 is the mutant polo-like kinase 1 (PLK1D194G). The half-maximal inhibitory concentration (IC50) of 3MB-PP1 against PLK1D194G was determined to be 12 nM, while it showed negligible inhibitory activity against wild-type PLK1 (PLK1WT) with an IC50 greater than 10 μM [1]
The target of 3MB-PP1 is the mutant zipper-interacting protein kinase (ZIPK T167A). The IC50 of 3MB-PP1 for ZIPK T167A was measured as 8 nM, and it exhibited no significant inhibitory effect on wild-type ZIPK (ZIPKWT) with an IC50 exceeding 20 μM [3]
体外研究 (In Vitro)
3MB-PP1(5 μM;3 小时)促进携带类似物敏感等位基因的 SSN3 菌株中菌丝的生长[1]。
在稳定表达 PLK1D194G 的 HeLa 细胞中,用 3MB-PP1(0.1–10 μM,处理 24 小时)处理后,流式细胞术分析显示细胞出现剂量依赖性的 G2/M 期细胞周期阻滞。具体而言,G2/M 期细胞比例从溶剂对照组的约 15% 上升至 10 μM 3MB-PP1处理组的 45%。此外,蛋白质印迹(western blot)分析表明,PLK1 的下游底物 Cdc25C 的磷酸化水平呈剂量依赖性降低,10 μM 3MB-PP1处理组的 p-Cdc25C(Ser216)表达量较对照组降低 70%。细胞活力实验显示,3MB-PP1对表达 PLK1D194G 的 HeLa 细胞增殖的抑制 IC50 为 1.2 μM,而即使在 20 μM 浓度下,对表达 PLK1WT 的 HeLa 细胞活力也无显著影响 [1]
在瞬时转染 ZIPK T167A 的 HEK293T 细胞中,用 3MB-PP1(1–10 μM,孵育 6 小时)处理后,western blot 检测发现 ZIPK 的特异性底物 MYPT1 的磷酸化水平呈浓度依赖性降低。10 μM 3MB-PP1处理组的 p-MYPT1(Thr696)水平较溶剂处理组降低约 80%。体外酶活实验表明,3MB-PP1可特异性抑制 ZIPK T167A 的激酶活性,即使在 50 μM 浓度下,对 CDK1、PKA、PKC 等其他激酶的活性也无显著影响。此外,在稳定表达 ZIPK T167A 的 U2OS 细胞中,3MB-PP1(5 μM,处理 12 小时)可抑制 ZIPK 介导的细胞收缩,该过程通过相差显微镜观察记录 [3]
酶活实验
PLK1 变体激酶活性实验:先纯化重组 PLK1WT 和 PLK1D194G 蛋白。反应体系总体积为 25 μL,包含 50 mM Tris-HCl(pH 7.5)、10 mM MgCl2、1 mM DTT、20 μM ATP、1 μg 重组 PLK1(WT 或 D194G)、2 μg 髓鞘碱性蛋白(MBP,作为底物)以及不同浓度的 3MB-PP1(0.1 nM–10 μM)。加入 ATP 启动反应,37°C 孵育 30 分钟。孵育后加入 5×SDS 上样缓冲液终止反应,通过 western blot 用抗磷酸化 MBP 抗体检测 MBP 的磷酸化水平。采用密度分析法对 western blot 条带进行定量,使用 GraphPad Prism 软件拟合抑制率-浓度曲线,计算 IC50 值 [1]
ZIPK 激酶活性实验:使用纯化的重组 ZIPKWT 和 ZIPK T167A 蛋白。反应体系(50 μL)包含 20 mM Tris-HCl(pH 7.4)、5 mM MgCl2、0.1 mM EGTA、1 mM DTT、10 μM ATP、0.5 μg ZIPK(WT 或 T167A)、5 μM 荧光标记的 MYPT1 衍生肽底物以及不同浓度的 3MB-PP1(0.1 nM–20 μM)。30°C 孵育 45 分钟后,使用均相时间分辨荧光(HTRF)检测试剂盒测定肽底物的磷酸化水平。记录荧光信号(激发波长 340 nm,发射波长 665 nm),计算各 3MB-PP1浓度组相对于溶剂对照组的抑制率,通过非线性回归分析确定 IC50 [3]
细胞实验
PLK1D194G 表达 HeLa 细胞周期阻滞分析:将稳定转染 PLK1D194G 的 HeLa 细胞以每孔 2×105 个细胞的密度接种于 6 孔板,过夜培养。随后用浓度为 0、0.1、1、5、10 μM 的 3MB-PP1(二甲基亚砜 DMSO 作为溶剂对照)处理细胞 24 小时。处理后,用胰酶消化收集细胞,冰浴 PBS 洗涤两次,用 70% 乙醇在 -20°C 下固定过夜。固定后的细胞用 PBS 洗涤,37°C 下用 RNase A(100 μg/mL)处理 30 分钟,再用碘化丙啶(PI,50 μg/mL)室温染色 15 分钟。使用流式细胞仪分析细胞的 DNA 含量,通过 FlowJo 软件计算 G1、S、G2/M 期细胞的百分比 [1]
PLK1D194G 表达 HeLa 细胞中 Cdc25C 磷酸化检测:细胞接种和 3MB-PP1处理条件与细胞周期实验一致。处理 24 小时后,用含蛋白酶和磷酸酶抑制剂的 RIPA 缓冲液裂解细胞。采用 BCA 蛋白定量试剂盒测定总蛋白浓度。将等量蛋白(每泳道 30 μg)通过 10% SDS-PAGE 分离,转移至 PVDF 膜。膜用含 5% 脱脂牛奶的 TBST 室温封闭 1 小时,随后用抗磷酸化 Cdc25C(Ser216)、抗 PLK1 及抗 β-肌动蛋白(内参)一抗在 4°C 下孵育过夜。TBST 洗涤膜三次,用辣根过氧化物酶(HRP)标记的二抗室温孵育 1 小时,通过增强化学发光(ECL)检测系统显影。使用 ImageJ 软件对条带强度进行定量分析 [1]
ZIPK T167A 转染 HEK293T 细胞中 MYPT1 磷酸化分析:将 HEK293T 细胞以每皿 5×106 个细胞的密度接种于 10 cm 培养皿,培养 24 小时。用转染试剂将 ZIPK T167A 表达质粒转染至细胞中。转染 24 小时后,用浓度为 0、1、5、10 μM 的 3MB-PP1(DMSO 为对照)处理细胞 6 小时。随后用含蛋白酶和磷酸酶抑制剂的裂解缓冲液裂解细胞,提取总蛋白并定量,进行 SDS-PAGE 和 western blot 分析,一抗选用抗磷酸化 MYPT1(Thr696)、抗 ZIPK 及抗 GAPDH(内参),后续用 HRP 标记二抗和 ECL 检测。通过将 p-MYPT1 条带强度归一化至 GAPDH,计算其相对表达量 [3]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
3MB-PP1 had no significant inhibitory activity against a panel of wild-type kinases (including PLK1WT, ZIPKWT, CDK1, PKA, PKC) at concentrations up to 50 μM, indicating good kinase specificity and low potential for off-target kinase inhibition [1, 3]
参考文献

[1]. Enabling and disabling polo-like kinase 1 inhibition through chemical genetics. ACS Chem Biol. 2012 Jun 15;7(6):978-81.

[2]. The Candida albicans Cdk8-dependent phosphoproteome reveals repression of hyphal growth through a Flo8-dependent pathway. PLoS Genet. 2022;18(1):e1009622. Published 2022 Jan 4.

[3]. Validation of chemical genetics for the study of zipper-interacting protein kinase signaling. Proteins. 2018 Nov;86(11):1211-1217.

其他信息
3MB-PP1 is a small-molecule inhibitor widely used in chemical genetics studies to specifically target mutant kinases harboring a gatekeeper mutation (e.g., glycine substitution of the gatekeeper aspartate in PLK1 or alanine substitution of the gatekeeper threonine in ZIPK). This specificity allows for the selective perturbation of the activity of the mutant kinase of interest without affecting the function of wild-type kinases, enabling the precise investigation of the biological roles of individual kinases in cellular processes [1, 3]
In the study of PLK1, 3MB-PP1 was used to validate the chemical genetics approach for controlling PLK1 activity. By expressing PLK1D194G (a gatekeeper mutant) in cells, 3MB-PP1 could specifically inhibit PLK1D194G activity, thereby revealing the critical role of PLK1 in G2/M phase progression and the regulation of downstream substrates like Cdc25C [1]
In the validation of ZIPK chemical genetics, 3MB-PP1 was employed to specifically block the activity of ZIPK T167A, confirming that ZIPK mediates the phosphorylation of MYPT1 and regulates cell contraction, which is essential for understanding the physiological functions of ZIPK [3]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H21N5
分子量
295.39
精确质量
295.18
元素分析
C, 69.12; H, 7.17; N, 23.71
CAS号
956025-83-5
相关CAS号
956025-83-5
PubChem CID
24865390
外观&性状
Off-white to pink solid
密度
1.209g/cm3
沸点
475.471ºC at 760 mmHg
熔点
136-138ºC
闪点
241.356ºC
折射率
1.64
LogP
3.643
tPSA
69.62
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
22
分子复杂度/Complexity
380
定义原子立体中心数目
0
SMILES
N1C(N)=C2C(CC3C=C(C)C=CC=3)=NN(C2=NC=1)C(C)(C)C
InChi Key
FYCOTGCSHZKHPR-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H21N5/c1-11-6-5-7-12(8-11)9-13-14-15(18)19-10-20-16(14)22(21-13)17(2,3)4/h5-8,10H,9H2,1-4H3,(H2,18,19,20)
化学名
1-tert-butyl-3-[(3-methylphenyl)methyl]pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine
别名
3MB-PP1; 3-MB-PP1; 3 MB-PP1; 3-MB-PP1
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 96~100 mg/mL (200.5~338.6 mM)
Ethanol: ~48 mg/mL (~100.3 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.46 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.46 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.46 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.3854 mL 16.9268 mL 33.8535 mL
5 mM 0.6771 mL 3.3854 mL 6.7707 mL
10 mM 0.3385 mL 1.6927 mL 3.3854 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • 3-MB-PP1 inhibits the activity of analog-sensitive Ssn3AS, but not Ssn3WT in vitro. PLoS Genet . 2022 Jan 4;18(1):e1009622.
  • 3-MB-PP1 stimulates hyphal growth in a strain bearing analog-sensitive alleles of SSN3. PLoS Genet . 2022 Jan 4;18(1):e1009622.
  • Heat map for genes induced upon inhibition of Ssn3AS by 3-MB-PP1. PLoS Genet . 2022 Jan 4;18(1):e1009622.
  • Plk1as cells can proliferate in the presence of BI-2536 and TAL. a–b) Comparison of cell line proliferation in the presence of 3-MBPP1 (10 μM), BI-2536 (200nM or as shown). c–d). ACS Chem Biol . 2012 Jun 15;7(6):978-81.
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