5(6)-TAMRA

别名: 5-carboxytetramethylrhodamine; CHEBI:51657; RefChem:537820; 91809-66-4; ...; 5(6)-TAMRA Acid; 5(6)-羧基四甲基罗丹明; 5(6)-羧基四甲基罗丹明内盐
目录号: V28609 纯度: ≥98%
5(6)-TAMRA 是一种荧光染料试剂分子,广泛用作肽和蛋白质的标记。
5(6)-TAMRA CAS号: 98181-63-6
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
100mg
250mg
500mg
Other Sizes

Other Forms of 5(6)-TAMRA:

  • 5(6)-TAMRA SE
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产品描述
5(6)-TAMRA 是一种荧光染料试剂分子,广泛用作肽和蛋白质的标记。 It 其Ex/Em 为 520/600 nm.
生物活性&实验参考方法
靶点
Fluorescent dye
体外研究 (In Vitro)
母液制备
1. 蛋白准备
为获得最佳标记效果,请将蛋白(抗体)浓度调整为 2 mg/mL。
1) 蛋白溶液的 pH 值应为 8.5 ± 0.5。若 pH 低于 8.0,请使用 1 M 碳酸氢钠溶液进行调整。
2) 若蛋白浓度低于 2 mg/mL,标记效率将显著降低。建议最终蛋白浓度范围为 2–10 mg/mL,以获得最佳标记效率。
3) 蛋白应置于不含伯胺(如 Tris、甘氨酸)及铵离子的缓冲液中,否则可能影响标记效率。

2. 染料准备
使用无水 DMSO 将 5(6)-TAMRA 染料溶解,配制成 10 mM 储备溶液。通过玻璃管或涡旋振荡充分混匀。
注:5(6)-TAMRA 储备液建议分装后于 -20 ℃ 或 -80 ℃ 避光保存。使用前需先用缩合液(500 μg/mL)活化,方可进行后续标记实验。


3. 染料工作液用量计算
标记反应中所需的 5(6)-TAMRA 染料用量取决于待标记蛋白的量。5(6)-TAMRA 染料与蛋白的最佳摩尔比约为 10。
示例:如需标记 500 μL 浓度为 2 mg/mL 的 IgG(分子量 150,000),将 1 mg 5(6)-TAMRA 染料溶于 100 μL DMSO 中,则所需 5(6)-TAMRA 体积为 2.88 μL。具体计算步骤如下:
1) mmol(IgG)= mg/mL(IgG)× mL(IgG)/ MW(IgG)= 2 mg/mL × 0.5 mL / 150,000 mg/mmol = 6.7×10⁻⁶ mmol
2) mmol(5(6)-TAMRA)= mmol(IgG)× 10 = 6.7×10⁻⁶ mmol × 10 = 6.7×10⁻⁵ mmol
3) μL(5(6)-TAMRA)= mmol(5(6)-TAMRA)× MW(5(6)-TAMRA)/ mg/μL(5(6)-TAMRA)= 6.7×10⁻⁵ mmol × 430.45 mg/mmol / 0.01 mg/μL = 2.88 μL
使用方法
1. 标记反应
1) 取按计算体积新鲜配制的 10 mg/mL 5(6)-TAMRA 染料,缓慢加入 0.5 mL 蛋白样品溶液中,轻轻混匀,短暂离心使样品聚集于反应管底部。切忌剧烈混合,以免蛋白变性失活。
2) 将反应管置于避光处,室温下轻轻摇晃孵育 60 分钟。每隔 10–15 分钟,将反应管轻轻颠倒几次,使两种反应物充分混合,提高标记效率。

2. 蛋白纯化脱盐
以下方案以使用 Sephadex G-25 柱纯化染料-蛋白偶联物为例。
1) 按照生产说明书制备 Sephadex G-25 柱。
2) 将反应混合物加至 Sephadex G-25 色谱柱顶部。
3) 当样品流至顶部树脂表面下方时,立即加入 PBS(pH 7.2–7.4)。
4) 继续加入适量 PBS(pH 7.2–7.4),完成柱纯化。收集含有目标染料-蛋白偶联物的组分。
参考文献

[1]. Pathway for polyarginine entry into mammalian cells. Biochemistry. 2004 Mar 9;43(9):2438-44.

[2]. Insertion and organization within membranes of the delta-endotoxin pore-forming domain, helix 4-loop-helix 5, and inhibition of its activity by a mutant helix 4 peptide. J Biol Chem. 2000 Aug 4;275(31):23602-7.

[3]. Automated, solid-phase coupling of rhodamine dye acids to 5' amino oligonucleotides. Nucleic Acids Symp Ser. 2000;(44):257-8.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H22N2O5
分子量
430.45
精确质量
430.15287
CAS号
98181-63-6
相关CAS号
5(6)-TAMRA SE;246256-50-8
PubChem CID
2762602
外观&性状
Brown to black solid powder
熔点
≥300ºC(lit.)
LogP
9.059
tPSA
194.1
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
875
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CN(C)C1=CC2=C(C=C1)C(=C3C=CC(=[N+](C)C)C=C3O2)C4=C(C=C(C=C4)C(=O)[O-])C(=O)O
InChi Key
YMZMTOFQCVHHFB-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H22N2O5/c1-26(2)15-6-9-18-21(12-15)32-22-13-16(27(3)4)7-10-19(22)23(18)17-8-5-14(24(28)29)11-20(17)25(30)31/h5-13H,1-4H3,(H-,28,29,30,31)
化学名
3-carboxy-4-[3-(dimethylamino)-6-dimethylazaniumylidenexanthen-9-yl]benzoate
别名
5-carboxytetramethylrhodamine; CHEBI:51657; RefChem:537820; 91809-66-4; ...; 5(6)-TAMRA Acid;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 20.83 mg/mL (~48.39 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.08 mg/mL (4.83 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80+,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3232 mL 11.6158 mL 23.2315 mL
5 mM 0.4646 mL 2.3232 mL 4.6463 mL
10 mM 0.2323 mL 1.1616 mL 2.3232 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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