| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 100mg |
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| 250mg |
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| 500mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
Fluorescent dye; 5(6)-TAMRA itself does not target specific biological receptors or enzymes. Instead, it functions as a fluorescent probe by covalently coupling with biomolecules. Its carboxylic acid group can be activated by carbodiimide (e.g., EDC) to react with primary amines on biomolecules (proteins, peptides, nucleic acids), forming stable amide bonds that enable fluorescent labeling and tracking of target molecules. TAMRA's fluorescence properties arise from its rhodamine core structure, which absorbs light at a specific wavelength and re-emits it at a longer wavelength—a process called fluorescence.
5(6)-TAMRA does not have a biological target. It is a fluorescent labeling reagent used to modify amino and hydroxy groups. Its utility is based on its photophysical properties: it produces conjugates with absorption/emission maxima of approximately 555/580 nm. It is used for fluorescence resonance energy transfer (FRET) studies, cell tracking, and fluorescence-based assays. |
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| 体外研究 (In Vitro) |
储备液配制
1. 蛋白质配制 为获得最佳标记效率，请将蛋白质（抗体）浓度调整至 2 mg/mL。 1) 蛋白质溶液的 pH 值应为 8.5 ± 0.5。如果 pH 值低于 8.0，请使用 1 M 碳酸氢钠溶液进行调节。 2) 如果蛋白质浓度低于 2 mg/mL，标记效率将显著降低。建议最终蛋白质浓度在 2–10 mg/mL 范围内以获得最佳标记效率。 3) 蛋白质必须溶于不含伯胺（例如 Tris 或甘氨酸）或铵离子的缓冲液中，因为这些物质可能会干扰标记效率。 2. 染料配制 将 5(6)-TAMRA 染料溶解于无水 DMSO 中，配制成 10 mM 的储备液。使用玻璃管或涡旋振荡器充分混匀。 注：建议将 5(6)-TAMRA 储备液分装后避光保存于 -20 °C 或 -80 °C。使用前，必须先用偶联缓冲液 (500 μg/mL) 活化染料，然后再进行标记反应。 3. 染料工作液用量的计算 标记反应所需的 5(6)-TAMRA 染料的量取决于待标记蛋白的量。5(6)-TAMRA 染料与蛋白的最佳摩尔比约为 10。 例如：要标记 500 μL 浓度为 2 mg/mL 的 IgG（分子量 = 150,000），需将 1 mg 5(6)-TAMRA 染料溶解于 100 μL DMSO 中。所需的 5(6)-TAMRA 体积为 2.88 μL。计算步骤如下： 1) mmol (IgG) = mg/mL (IgG) × mL (IgG) / MW (IgG) = 2 mg/mL × 0.5 mL / 150,000 mg/mmol = 6.7 × 10⁻⁶ mmol 2) mmol (5(6)-TAMRA) = mmol (IgG) × 10 = 6.7 × 10⁻⁶ mmol × 10 = 6.7 × 10⁻⁵ mmol 3) μL (5(6)-TAMRA) = mmol (5(6)-TAMRA) × MW (5(6)-TAMRA) / mg/μL (5(6)-TAMRA) = 6.7 × 10⁻⁵ mmol × 430.45 mg/mmol / 0.01 mg/μL = 2.88 μL 实验方案 1. 标记反应 1) 将计算体积的新鲜配制的 10 mg/mL 5(6)-TAMRA 染料缓慢加入 0.5 mL 蛋白质样品溶液中。轻轻混匀，短暂离心，使样品沉淀于反应管底部。避免剧烈混匀，以防止蛋白质变性及活性损失。 2) 将反应管置于避光处，室温下轻轻摇晃孵育 60 分钟。每隔 10-15 分钟，轻轻颠倒反应管数次，以充分混匀反应物，提高标记效率。 2. 蛋白质纯化和脱盐 以下方案使用 Sephadex G-25 柱纯化染料-蛋白质偶联物。 1) 根据制造商说明制备 Sephadex G-25 柱。 2) 将反应混合物上样至 Sephadex G-25 柱顶部。 3) 当样品流至顶部树脂表面下方时，立即加入 PBS 缓冲液（pH 7.2–7.4）。 4) 继续加入 PBS 缓冲液（pH 7.2–7.4）洗脱目标样品。收集含有目标染料-蛋白偶联物的馏分。 在体外，5(6)-TAMRA 广泛用于生物分子的荧光标记。在细菌标记实验中，5(6)-TAMRA 用于标记鼠伤寒沙门氏菌，从而可以使用 Cy3 滤光片在荧光显微镜下观察和计数黏附的细菌。在蛋白质-肽相互作用研究中，使用 TAMRA 标记的肽（浓度范围为 10 nM 至 5 μM）来检测 SH2 和 PTB 结构域蛋白微阵列上的结合亲和力。 TAMRA 具有荧光特性，激发波长约为 541-560 nm，发射波长约为 565-583 nm，消光系数 >90,000 cm⁻¹M⁻¹。 在体外，5(6)-TAMRA 可用于标记生物分子，例如肽、蛋白质和寡核苷酸。标记后的缀合物可用于各种基于荧光的分析应用，包括显微镜、流式细胞术和基于 FRET 的检测。其强荧光性和光稳定性使其成为检测和追踪分子的可靠工具。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
5(6)-TAMRA 用于研究体内分子分布和靶向作用。在神经科学研究中，TAMRA 标记的食欲素 A 用于通过监测 TAMRA 标记配体的结合和转运来观察食欲素-1 受体的共内化。在肿瘤成像研究中，TAMRA 荧光标记与 IL-13 肽偶联的 Gd₃N@C₈₀ 纳米颗粒 (TAMRA-IL-13-f-Gd₃N@C₈₀) 结合，用于对小鼠胶质瘤肿瘤上 IL-13Rα2 的表达进行 MRI 研究。
5(6)-TAMRA 不作为体内治疗药物使用。其应用仅限于体外和离体实验室操作。它不用于动物药理学研究。其用途仅限于研究实验室的标记和检测。 |
| 酶活实验 |
5(6)-TAMRA主要用于无细胞体系中的生物偶联技术。典型的蛋白质标记方案包括：将目标蛋白（例如I型胶原蛋白）在0.25 M碳酸氢钠标记缓冲液（含0.4 M NaCl，pH 9.5）中透析过夜；将10 mg/mL TAMRA溶液与透析后的蛋白质混合，并旋转孵育过夜；通过透析去除过量的游离染料；将标记产物避光保存于4°C。在蛋白质微阵列分析中，将TAMRA标记的肽段（10 nM-5 μM）与固定化的蛋白质结构域在含有20 mM Hepes、100 mM KCl、0.1% Tween-20（pH 7.8）的缓冲液中孵育1小时，并通过荧光扫描检测结合信号。
对于体外标记，5(6)-TAMRA通过碳二亚胺活化其羧酸基团与伯胺偶联。该反应通常在适宜pH值的缓冲液中进行。然后纯化标记的缀合物，并将其用于所需的应用。标记效率可通过测量缀合物的吸光度或荧光强度来评估。 |
| 细胞实验 |
5(6)-TAMRA广泛用于细胞水平的荧光标记和追踪。在沙门氏菌感染实验中，用5(6)-TAMRA标记的细菌细胞感染MDCK-1细胞单层或微组织，在37°C、5% CO₂条件下培养3小时。感染后，用3.7%甲醛固定样品，并使用配备Cy3滤光片和40倍物镜的Leica荧光显微镜采集图像。手动计数每个视野中的黏附细菌。在小胶质细胞吞噬作用实验中，用5(6)-TAMRA SE染色经紫外线照射的海马神经元，然后与成年小鼠小胶质细胞在37°C下共培养2小时。用 2.5% PFA 固定后，通过 Iba1 免疫荧光染色和共聚焦显微镜分析吞噬效率。
对于体外细胞实验，使用 5(6)-TAMRA 标记的探针进行细胞染色。将细胞与标记探针（例如抗体）孵育，然后使用荧光显微镜或流式细胞仪观察探针的结合和定位。该染料的橙色荧光使其可以与其他荧光染料进行多重标记。 |
| 动物实验 |
5(6)-TAMRA及其衍生物用于动物模型中的分子示踪。在蛋白质-肽相互作用研究中，TAMRA标记的肽用于SH2和PTB结构域微阵列上的结合分析。将不同浓度（5 μM、3 μM、2 μM、1 μM、500 nM、200 nM、100 nM和10 nM）的肽孵育1小时，扫描荧光信号以确定结合亲和力。在益生菌定植研究中，将TAMRA标记的益生菌口服给小鼠，并通过监测粪便荧光强度来评估肠道存活率和定植情况。
5(6)-TAMRA不作为治疗剂用于动物研究。它可用于标记体内成像研究的探针，但这并不常见。染料本身不用于动物实验。 |
| 药代性质 (ADME/PK) |
5(6)-TAMRA 是一种小分子荧光染料，分子量为 430.45 g/mol。其荧光光谱特性为激发/发射波长约为 541-560/565-583 nm，在 pH 7-9 的缓冲液中稳定。在溶解性方面，它在 DMSO 中的溶解度 ≥23.83 mg/mL，在乙醇中的溶解度 ≥4.45 mg/mL（需要温和加热和超声处理），不溶于水。作为一种小分子染料，TAMRA 可在水性环境中自由扩散，并可能在体内快速排泄或代谢。当与蛋白质或核酸等较大分子偶联时，其 ADME 特性更多地受到偶联分子特性的影响。储存条件：粉末在 -20°C 下可稳定保存 3 年。溶液在-20°C下可稳定保存6个月，应避光保存以防止光漂白。
5(6)-TAMRA的分子量为430.45，是一种小分子染料。它不是药物，也不具有药代动力学性质。它以粉末形式保存，并需避光。 |
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
根据全球化学品统一分类和标签制度（GHS），5(6)-TAMRA 不属于危险物质或混合物。本产品仅供研究使用，不可用于诊断或医疗用途。文献报道的细胞和动物研究表明，在实验条件下，TAMRA 标记的分子未表现出明显的毒性作用，但具体的毒性特征取决于所标记的分子和实验体系。5(6)-TAMRA 在标记浓度下被认为是无毒的。它是一种实验室试剂，不可用于人体。处理该染料时，应遵守标准的实验室安全操作规程。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
5-羧基四甲基罗丹明是一种在5位具有羧基取代基的四甲基罗丹明化合物，可用作荧光染料。
5(6)-TAMRA（CAS：98181-63-6）和5(6)-TAMRA SE（CAS：246256-50-8）是不同的产物。TAMRA含有羧酸基团，需要EDC活化才能与伯胺反应；而TAMRA SE含有琥珀酰亚胺酯基团，无需额外的活化步骤即可直接与伯胺反应。TAMRA是PROTAC连接子合成中常用的荧光标记基团，可用于PROTAC分子的荧光标记和细胞摄取研究。这种染料对光和温度敏感，必须在严格的避光和低温条件下储存，以保持其荧光特性。 5(6)-TAMRA 是一种广泛应用于生物医学研究的荧光染料。它可从多家供应商处购买，但仅供研究用途。它尚未获得任何治疗批准。 |
| 分子式 |
C25H22N2O5
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|---|---|
| 分子量 |
430.45
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| 精确质量 |
430.15287
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| CAS号 |
98181-63-6
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| 相关CAS号 |
5(6)-TAMRA SE;246256-50-8
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| PubChem CID |
2762602
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| 外观&性状 |
Brown to black solid powder
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| 熔点 |
≥300ºC(lit.)
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| LogP |
9.059
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| tPSA |
194.1
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| 氢键供体(HBD)数目 |
1
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| 氢键受体(HBA)数目 |
6
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| 可旋转键数目(RBC) |
3
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| 重原子数目 |
32
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| 分子复杂度/Complexity |
875
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
CN(C)C1=CC2=C(C=C1)C(=C3C=CC(=[N+](C)C)C=C3O2)C4=C(C=C(C=C4)C(=O)[O-])C(=O)O
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| InChi Key |
YMZMTOFQCVHHFB-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C25H22N2O5/c1-26(2)15-6-9-18-21(12-15)32-22-13-16(27(3)4)7-10-19(22)23(18)17-8-5-14(24(28)29)11-20(17)25(30)31/h5-13H,1-4H3,(H-,28,29,30,31)
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| 化学名 |
3-carboxy-4-[3-(dimethylamino)-6-dimethylazaniumylidenexanthen-9-yl]benzoate
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| 别名 |
5-carboxytetramethylrhodamine; CHEBI:51657; RefChem:537820; 91809-66-4; TAMRA Acid; 5(6)-TAMRA Acid;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： 本产品在运输和储存过程中需避光。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ≥ 20.83 mg/mL (~48.39 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: 2.08 mg/mL (4.83 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80+，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.3232 mL | 11.6158 mL | 23.2315 mL | |
| 5 mM | 0.4646 mL | 2.3232 mL | 4.6463 mL | |
| 10 mM | 0.2323 mL | 1.1616 mL | 2.3232 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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